Os09g0307800

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os09g0307800

Description

Nuclear protein SET domain containing protein

Version

NM_001069362.1 GI:115478463 GeneID:4346677

Length

7580 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0307800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:8605019..8612598

Sequence Coding Region

8605843..8605869,8606906..8606971,8607055..8607106,8607517..8607720,8607837..8607917
,8608003..8608174,8609280..8609358,8610514..8610613,8610960..8611059
,8611590..8611707,8612450..8612473

Expression

GEO Profiles:Os09g0307800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008402:8605019..8612598 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgcctcggccggcgaaaatcaggaaaaaacatgagaatgtgtttgatcaattgatcaaggcgataaaagctcctgtggactttgatctgccgcctgtattgaaagaatggaagtcaaattactatgtgccaattaagcggaatgcttatattactcggaaacgcgttgaggatgatggcattttttgttcctgtaccccttctggatcatccgcaacttgtgacaaagattgccaatgcgggatgttgttctcttgttgttcgtcgacctgtaaatgtgagaataaatgtgctaacaaaccgttccagcataggactttgaggaaaaccaaattaattaagacagagaaatgtggcaatggggtggtagctgaggaagatattaaaaaaggagaatttgtaatcgaatatgttggagaagttattgatgacagaacatgtgagcagagactatggaaaatgaagaggcagggtgacactaatttctatctttgtgaggtcagtagtaatatggtgatcgacgcgaccaacaaaggaaacatgtcgcgcttcataaatcatagctgtgagccaaacacagagatgcagaaatggactgttgagggagagaccagagttggaatttttgctcttcgtgacataaaaacgggggaggagctgacctatgattacaagtttgtccaatttggagctgatcaagattgtcactgtggatcttcaaactgtcgaaaaatgcttggcatcacaaagcctgttaactcaattgtacttcataatggaaatctgtcacaagatcagcatgtccggaagaaaagaaagacatatttggagaattgtattggggagattgtccgtttgtggcatcgacgtcacagcatgtatctcgcagcaagtatatatgacttcaatgagcgcaatggaatacatacattattgtttaccgatgcaactattgaagaatttgatttgagagaggaagattgggacttcttaccggatccagatggtcctgaggaagtgtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPRPAKIRKKHENVFDQLIKAIKAPVDFDLPPVLKEWKSNYYVP IKRNAYITRKRVEDDGIFCSCTPSGSSATCDKDCQCGMLFSCCSSTCKCENKCANKPF QHRTLRKTKLIKTEKCGNGVVAEEDIKKGEFVIEYVGEVIDDRTCEQRLWKMKRQGDT NFYLCEVSSNMVIDATNKGNMSRFINHSCEPNTEMQKWTVEGETRVGIFALRDIKTGE ELTYDYKFVQFGADQDCHCGSSNCRKMLGITKPVNSIVLHNGNLSQDQHVRKKRKTYL ENCIGEIVRLWHRRHSMYLAASIYDFNERNGIHTLLFTDATIEEFDLREEDWDFLPDP DGPEEV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6730..6756#5628..5693#5493..5544#4879..5082#4682..4762#4425..4596#3241..3319#1986..2085#1540..1639#892..1009#126..149#ttctgctccgacctcacctcgcctccttcctccgccgactccctcccctccgccattgcagcctcgcctacggccttgagctcgtcgccgatccccgccaccgccgcgacctctgcctgccccccatgcctcggccggcgaaaatcagggtacacttcctcccatgcttgcacctcttcccctttccgcgtaaaccctaaacccgaaatttcctgcaatttttttttaaaaaaattttggtcgaatcttcgctagggaaccgcatctctaccgtttttgttgtgccttgcaaaggtttgtctccccttcgagagaagcagcaaggggagttatggagtatatggattaggggttcagggtctcagatgcgttcttgtgctaccttggaaggagtattttgttcattagattttttttcttttttttttttgcggggaaaagttgttgatcagacttgggatggctacagtggaaattacaggagcgatgtggtgttaggtctctaacctgcaggaaacagggcgagtattttgaattggaatacgatggcctaagtgagtgaagctttgttgggactgctagtgttgaccaggactgttggattaatccgttgaaatgagtgaacacatgactggactcttattgaccaaacgtatcttatattcgatgggattataacatggcacggccaatactctacacccattacttcattgcttttatttctccgttgttgcatacacgtgcatgacagaaaagaggctacaccatatctgagtagactgattctgttactatctctatttttgttttatatgcttgttacctcattttttgttggttaactcataattctatatgcttatttatcttcatgtctctatgctgcagaaaaaacatgagaatgtgtttgatcaattgatcaaggcgataaaagctcctgtggactttgatctgccgcctgtattgaaagaatggaagtcaaattactatgtgccaattaagcggagtatccttacccaccattgcatttaatctgtttcctttctcggagcagcaatgatttgcgtcctcctcatttatacttgcaatgtctctggttaaaatttcattccttggagcaatcattctacaaacttgagtgtatatttatcagtctctgctgtagcattctagattgattgtatatccgaaaatttactaaatcctaatgtactacaaagtataatatagcataggaaagtcagtggtttgttttttcaataatgtgtcttgtcacagggatgcatttaacaacggcttcaacaacgtgttttcacatggggttgtatttcaaaattgcttaagatggtatcttcaatattccaatctgttgaatctcatttttataacatagccatccaattactcgtttacaattgcatggctggaacatcttaatttcacaatgtaaacagaggacttgccttttactgctgtaaaatttctgtttgtctaaaattttatttagcattacggttgtccttaattctacgtaagatgcttatattactcggaaacgcgttgaggatgatggcattttttgttcctgtaccccttctggatcatccgcaacttgtgacaaagattgccaatgcgggtaatctctctctcccccctctctgctccaacttgcatccatcatatagccatgatactattatgaatatagctcgtattgaataatagcctcaaggaggcaatatatagagtgcatatagcgttaggactctaacctatagcatgtaaagggataacccatatatgcaaaagactttatattcctaactgatacaacctagagtgtttgagtctgctcttttttttttttttgtcttgaacctaacctcattaataaaatggtaagtttcttattagaataacctgtaaactttattggtattgagtgttgaggcattctaaaatactgtatttttgtgatgcaggatgttgttctcttgttgttcgtcgacctgtaaatgtgagaataaatgtgctaacaaaccgttccagcataggactttgaggaaaaccaaattaattaaggtatgattgaatcaagtttctaccattgttgagttggcagattaccatttaagctgactgtggataaatatgccattgctgtagctgatgctaataaagttttgatgcaataaatgttataaaaatagtctttcaactatgtgttccttgttaaaaatgtcagcttttcttgtgtaaagtgtaaactgtaaagtaatataggagtataggacacttgttaaaaatgtcagcttttctcgtggaaactataaagtagtatacgagtataggacgctgtgaatgataaaggaaatgttagccatatgaaataaatgagaagaaaaacttaaactatgaatccagttatggtaggatagatctcaatcagattatggtagattattaatttctttcaaaactttccgtataatatcgatacgattgggaataaacctccttgtttgggcattccttcttaagtaatgtctattatatacccctcaagtacggtaaccaggtaaaacgcccccccccccccctaggcagaatccaacctgattttaatggtgattttcatgattttaacatccattaatctggttgtctgctctcctagtttcataatgcattcctacttcctagtatagcatgattccttggtgtcctgtgaatattccactgttatgcttcttcggatttgaccaggacagggatgggttatttcttacccaatagtgctaggtcagtgtggtcaggaattctcttcatcctgctgcccatgctccttatttgtctggcctgtttgtttcacaattttcaaatcctcgttctatcatttacaactcataatacagtgcctttttacttgcttaataatcagacattttagaaacattatatccatatccctttatattttctgtatgtttggccttatgtctatgtacaatacgcgattaactaatttgtagtataccttccaacatcgccttcatatagaggcatattctatcgtcagcatatcctgtaccatagccatccaaattcctttatatctttgtgatctcatgattgacattcataatctactttcccatgtttctatactgtatttagtatttagtacagatttatccctttttatctataccctaaatgactaacagtttcttctagacagagaaatgtggcaatggggtggtagctgaggaagatattaaaaaaggagaatttgtaatcgaatatgttggagaaggtatggttttctacatcctgtgcacatacgtaaactttatttgtaagtacgtaaggatcaaaacaattcaactttattattacttctatacaaaagtatactcactccttaccatagtataagggttattgggtggatgtgacacatcatagtacaatgaatctggacagacggtctgtccagattcattgtactaggatgtgttacagccatccaaaatcacttatattatgggatggagggagtataccgaatccacagtaatacttatttttttactttttatttttttcatttttaattattaaacaattagaattaatatatacaatggtttacttgtcacggagtcttaatttttgtttgtccttgatttttttttttgcaagatatgaattgtagtactgagattcgaaagtaatgaataaaagctttacatacaaagctgtaactggtttaagtctcaaaattcaattttggtaagtcgtattctgtcccaaaatatagctacctttgtagttcaaggctatgttttgggacagggagtataaatttgttgtttgtacgtagttctaatcttatttgttcttgatgaaacaaattctaagtttggaattaatatagaagttgtacttgtcttggagttgcaatttgagtttttttatatttagtaattccaaaactcagaattcataaatattgtatctgtcttggaatctcaaccttctatcctgttaatttagttatggatttagaaattactaaaaagcaagttgtaacttacttcacttggactcttcttttaattcaagtcgtcatggtttagtcccacctagattaatgaccagatttttatccactactgtgcttaaacgtgagattttcctcagagtgtccgattagtataggtatagatagatcgataattcgatctattgatatgagttctcacattgaacatattggtaatcaaactaaagtccagaatccagattgtgggttggagggctatcatatcctccagtaaatctttttcaaactgttacaatatacaataacttggagctaaaaactaatatccacatatcttgcaaacatattgtagttattgatgacagaacatgtgagcagagactatggaaaatgaagaggcagggtgacactaatttctatctttgtgaggtcagtagtaatatggtgatcgacgcgaccaacaaaggaaacatgtcgcgcttcataaatcatagctgtgagccaaacacagagatgcagaaatggtaagttatactcttgtcagctcattcatatatgctgttcttctaacatcaccctgatatatgactagtatttatattgtttcaggactgttgagggagagaccagagttggaatttttgctcttcgtgacataaaaacgggggaggagctgacctatgattacaagtatttttgttctagttctatccttgacttcttttcatttcactcgggcataatgattcatcattttctgtatatggaactactcctggtatttaatttctcggct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External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0307800, RefSeq:Os09g0307800