Os09g0468000

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os09g0468000

Description

Multi antimicrobial extrusion protein MatE family protein

Version

NM_001069963.1 GI:115479668 GeneID:4347324

Length

7477 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0468000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:18430862..18438338

Sequence Coding Region

18430949..18431218,18436363..18436904,18437059..18437145,18437257..18437313,18437414..18437652
,18437730..18437848,18437956..18438042,18438120..18438167

Expression

GEO Profiles:Os09g0468000

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MASVPLLAEWPAGKEKEEGRVRRRLPALAREAWEESKKLWEIVG PAVFLRLVLYSFNIISQAFAGHIGDLELAAFSIANNVITGLNFGFLLGMASALETLCG QAYGAKQCSMLGIYLQRSWIILFVFAVLLVPTYVFTAPLLEALGQPAALARKAGMVSV YMLPSHFQYAVLLPLNKFLQSQRKNWVTVVTAAAAFPVHIAVSWLLVSRLRFGVLGAA MSLGVSGWLVTLLQLAYVVGGGCPVTWSGFSPLAFVDLWGFVKLSVSSGVMVCLETWY YKILILLTGHLKNSELAVNALSICMSFQSWEMMIPVGFLAGTGVRVANELGAGNGKGA KFATIVSTTTSFLIGLFFSALALAFHDKIALVFSSSNAVIDAVDNISFLLAVTILLNG VQPVLSGVAIGSGWQAAVAYVNIGCYYFIGVPIGVLLGWSFNLGVFGIWAGMIAGTAI QTIILAHMTIQCDWNKEVLQASERVQRWGNPK</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>88..357#5502..6043#6198..6284#6396..6452#6553..6791#6869..6987#7095..7181#7259..7306#tggctagctgctgcgcgctgaccagctagctgccaattgctccctgtgagctgcgtgctgcgagaggtcaagctagctgtagtggtcatggcgagcgtcccgctcctcgcggagtggccggccgggaaagagaaggaggaggggcgcgtccggcggcggctgccggcgttggcgagggaggcgtgggaggagtccaagaagctgtgggagatcgtcggcccggccgtgttcctgcggctggtgctgtacagcttcaacatcatcagccaggccttcgccggccacatcggcgacctcgagctcgccgccttctccatcgccaacaacgtcatcaccggcctcaactttggcttcctggtaagtggaaattaattaactccctaagctaatcatatatcttgctgcattacgactatattctgtttattagtatattcttgcactccggacaatcactgttgctcgatctttgcgagtgtatatatgtatgcccctctgaactttaacttgcaaattttgggagcatttaccatttagattacacttacatatgtttgtatacatgggtgaaactgtctcggtaattggtgatgaaattaataatcatacactatattttgaaacatacaagccattttctaattgacaacatgcatacttgtgtttgttaattaattgaggcacattcatataccacggcgtgacgcatttattttgcaatattcaagatcaagaatgtgcttctgccagttgatcccgtcctacgatatttgcaaaaacacgaacaaaagaatgctctcgtggaaggactcatggtgtatatcatacttatacaaggtacaagtaaaacagaagaaaactgaatgcgtgactgttaccccttagaaaaatgggcacggtgatcaggtcttgctgcaaacaattgccactagttctatacaaacatggccaaataaaagaagccaattgaagttaaataaatccgtcgagtcaacttaactgatctggttttttctccaaaaaaaaaaaactgatctgattttgtggttggttcaaaacttcaaacaaaactattcggttcgtacaacatgtgagctgttgcgaatttgtgcgcttcatgtagcatttgtagcgtgcaatttacactagctgcacactccaggaaaagcaagacgccatgactaatagcatcaccaaccaccaacagatgcctaaaaatgtatcccctaattaattctgattcctaatcagattttatatgaatagattctctcctctaacatatatcttaaaaattgactcaataataaaaaagtacattcaccatgccaatagaagtaacaaaaatagctctccacctcctccaggacgcgatccaacccccacgcatcactcggttagcaccacatcagctatattagaagtcggcgtgctttcttactaggagagagtgatcagaaggacagggaaggggattccaattttttagcaccatttttgagcacctaacaagggaaattatcgcagactaacttttatagaaacatgaaaattaaggattggaaagcatattgggcatttgttaatgatgttctcaatacacgcgttaaaaccaaactaggaaggtggcccgcgcgtatgcgcggacacttatattattaaaagataagattattgtttgttcatagattaagggcaaagtaaagtttggatgatgctattttataataatttaaaggatctatttttcttaagatatcttaaaaaaccattcacaaacttttgagtaggagatggtttaagtacttacgatttttgaatcatgtttcttttttctcgagtaaataagaaactattgctagttaattatcatatagtccatctatatacataccgtgtagtatggccgcaaatgaaaaatgtaagtgcaagatactcaaaattcttttgattaaatcgtctcatgaaggagtatgatataggaataaagggagggaagcatatgcatgggaaaaaaagaaggagaaaaaatgaaaaaaaagggaggggaagcgtacgtacccatgcacgtaggtgcgtacctatgccgcgggaggagaggtgggacctcgtagtatttagtttgttctaagatcaatttaatctaatggtttataatattggacctaacgatttaagtgaaaatcaagaaatagatactttgatttttttttcttagaatttctaatatttgccctaatttattagagcaccacgtcgcatcttgagagcattttaatgaattttaaatgacttaacacatgtaattagaatattaactgcgcaatatatatgtatgggacgtatggtaatatttgttccagcttcgtccatctttatatacatgtagagtgaaattaattttgtggcttgcaagccattagatgtctaattaatagaaattaattttgacacctatttacaattgttcagagtagctcttacatattcattttacgactttaatgatttatcaccatgactcgcatgaaaaaaatatgtagtacttaaggtttaggatagctgaaattaatgaattatataatttatgtgatagctatttaagggtataaacaaatgaattgacttctaaaaagttagaatattgtttaaagaagacactatttaaaaactttaaaagcgtgcaaacaaaaatccaaaatatggaatcgggaaaaaaaagaaagggccttaaactccctttatcacccttatcgtagtaagagttctattaatattcgtcaatattacgctcacatttataacataatgattcctttcgcctttacgaacaaatagtacaaaatccaaatacgacataacataaatacattataattattatctaatcaactctcggtttcaacttaaacagagctaattagtgttgagaaaaacacaacccatggtgcttaattattctctcgctgcatcatacctttaattttcttttcatgttattaacaaaattaatcatctccatatatgatttgatgtgtggcaaagtggtagctctacaacggttgtgatcaccttatatgtctcagatactacaccttgtcacacatgcgaaaggcaaaaggtgcagacgtgcattgtgcagcgggcaaaaagagaattccgggcgctttatttattagcaaacaatagatccgatgattataataataagtccaccagttctagtgtaagtgtacattagttaatatagattttaaattgttaatttaatgggtacacaatataatggtgtagaccttattttaaaacagtgcattacttgagaataatataccaacgtaacataaagtaaatccgatgatttatataatggggccatcagtttaagtgcacgtataaattagttaatatagatatagtttatattaagatgggaggaggataggtgggacccatggtatttagtttgttttaagatcgattttatctaacggtgtataatattggacccatcaatttaagtaaaaattaaggggcatatatttttcttttttcttagaatttctaggattttctctattttattagagcgccacttgatggcttgagagcgtttgtaagaagtctcatggacttttagtatataatagattcatgtctccactactattttctagttgtcttttagaaactactatttattggaacttgtacccctgatattttgaaaactatttttccatgctggcttttttagattttagtctttttaaaacttattttataaataaatctctgaaaaaacttatttaaaaaatggactatttttctcggcaccagggttttaatgtcttggtaccgataacctcgtcccgcgtggtggctaagttgctgacttggaggggttgtcgtcgaggacctattgtaaattatttctttttgaaaatagtcgaaatgtaaggattttttttacgaataggcccttggctctagcctcttttgcatcgagggcctatctgcattcttaccctttccataaaaattattctataaatgggtcttggcaccgacccttctacatataggctgctagggggtcaagggtgtcagcacaagtgttgtgggctctgagatgttggacatcagcagatgaaataagtttgtcaagagatctatttataaaataagttttcagaataagccaaaatgtaaaaaatcaaatcctaccatgagggtgcactccataaatacttcacaaatctttaactatgtataatttataacataagtgttttaaaaacatgaagaccatatgcatagatttttattaaaaggtacttcaacaaaataacatatttattgatatctaatatattgaaataaaaaattagtggtcaaagttgattctttagagattgtgttcttatccaaaatgataaggattatcaatccggaaggagtagaagataatattgtactttagagtttagacgaagatgattatatttagattgatttatagttcttgaacagtacggggaaataccatcataattttaaatgttactaacaccgtcataggttgaacattggtattaagaacttgataaaattaaataaggatatgttgtgattggttaagaaaaccaaatttgaatggcgaaaggctatgattggaatggaggtgaaaaggttgatatattttgtgatactttttgaagattttaagttgttatattttgaaatagagggagtactattatgtgttaccttgtgcaaacttagggctggaggtatcggagatatcaaaactttatactgcgttagaaaatgtcccggtaccttacgttctttttttaatagatgatgctgttaacttttgactatatagttgatcaaag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External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0468000, RefSeq:Os09g0468000