Os09g0497100
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0497100 |
|---|---|
| Description |
Similar to Pumilio RBD (Fragment) |
| Version |
NM_001070093.1 GI:115479928 GeneID:4347460 |
| Length |
7049 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0497100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:19874229..19881277 |
| Sequence Coding Region |
19874596..19874642,19874749..19874920,19875300..19875494,19875687..19875797,19875881..19876093 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:19874229..19881277 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggctacagagagtgctcggccgttgagtggaggaactggagcagggaagtggccaccaagcaaggacacgggttcctatgattctattccagctagcctttcagaagatgagttagcggagttggccttcatgccaaatagtggcggcatttttgggaagtggaggggttctgtcctggaacgcagtggaagcgctcctcctaccatggaaggttctttagttgcacttggtcacctcacaggtcaaccgagtggcaaccttggggccatactgccaaacttgggcactgaagctaacaattcagagtctaaggagaatatatattatgattcggcatgcgtcaaatactatatgtccaaggtgaatttgaacccaaggtttcctccaccactcgtttcaaggaaccagtttggcaagtctgaagaacgaaagccgttctcccttgatgacagcagcagcaggtccttacttcttggtcatcctactctgccaacacacaaggaagaacctgaggacgaaaagtcaccaagtttggattcaagttcagcagacgatgctcaatgtgattctgcccaaagcacatctaacttagggggccacagtccaaatcttgtagattcaattaaggaaaactttcatcggagcaatggtttgtatgataattcttccgatcttttaaatgcaaactctggtgatggagggtcgatttattctggcattagttcattgaagaattcctcactttatgttgtccagtcatcagacttgaatggatttccaccagatgctcatcagcgttcccctagacctattaggactccagtcagtacaaaacttactagcgacagtctgccagcttcatctcctcccacttcatcctgttctgactacagtactattactgaagcttgtcagcaaagaaatccaagcatggccgttaaacctggtgaaccagttggtaccatgcttgatagttcagacttcagtctgaagaatttgaatattagtccggatatcctaagtagttcatatgtcatgcaacagtggcagaaaaatgccccagtgtggaatggcctatcaaatgtagtccatggcgatcatgtgccaatgattcctccaggaattaatcttcctcaagttccatttgtggacaattccggttttggtcatatgaagttccctggtgatgttcaactgatgtcccagatcgggatggcaacacctttttgtacaccaaattcttttgggataccatgttatcctaatttgcagtcgcctagtgtttgggttcctccattcggaatcggcggctatggtttgcctggtccatttgtcccacctgttataactaacttcactcctcaacttcctggttttccttcagcagtaaatcttgctgcagcaactgacttatttcacccatataagatgtatgagcatcttggggtacctatgccatcccctgttcctgatcagagccttacgcattattttcaacagccccctatccatccgtatggtgttggaaatccatatgatacaatggtttcaagtaataattttgtagggaatcctgctggcgtttttggttcaccaatcattgacccatcagagcagaagtttcagataccggttactactgtagctgctaatgcctctactcccatcaaaggtggaaagcccattgggaattatgagactgcctcaccttactttggcgtaccgatgccttatccagcaggtccaacattacatgggcaacctgcttctggaacatctcctcgtgacaaaaggaacgatgtcaagggattccaaccccctcgaaaaaatatgcctgttagttccgagatacaaggtcagaaagggagggagaagtttgatgatcccaaggcacacttttctgttgaagaactaatatccagcagaactcatagggttgagctggctgacatcaaaggacagatagtgaaatacagctcggaccaaaatggtagccggttcattcagcagaaactggagaattgcaccattgaagaaaaggatttactttttgccgaggtccttcctcatgctttggaattgatgactgatgtattcggaaattatgttattcagaagttcttcgaaaaggggagcccccagcaaaagagagaaatagctaataagcttgccggtcatgtgttttctttgagccttcagatgtatggatgcagagtaattcagaaggcccttgaagtaattgatcttgaacagaaaattgttcttgttggtgaactcgatggacatgtgctgcgatgtgttcatgaccaaaatgggaatcatgttatacaaaaatgcattgaatgtattccattggaacatattggttttctggtgtcatcttttcagtgccaggttgccaaactgtcaatgcatacatatggatgtcgtgttattcagagaatcctcgagcgttgcagcaataattctgaatgcctttgcataattgatgaaatcttgcagtctgcttgcatcctcgcacaagatcagtatgggaactatgttgtgcagcatgttttggagaaagggaatgaacatgaaaggggccaaatcatcactaaattggctgggcaggtagtgcccatgagccaaaacaaatttgcgtctaatgtcatagagaggtgttttgaacatgggggcagtgcagagcgggaacttttggtcaaggagattctgaagcaaactgagggcaataactatttgctggtgataatgaaggaccagtatgctaattatgtggtacagaagatgcttacaacatgcaatgaacaacataaggagatccttctcagtcgtgtgaaaatccatttgccattattgaagaaatacacctatgccaagcacatcgtcagcctagtcgagcgcctctgcggtgacggagctgtgcagtccgaatccaaaaaaactgtaaccaagggctgctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATESARPLSGGTGAGKWPPSKDTGSYDSIPASLSEDELAELAF MPNSGGIFGKWRGSVLERSGSAPPTMEGSLVALGHLTGQPSGNLGAILPNLGTEANNS ESKENIYYDSACVKYYMSKVNLNPRFPPPLVSRNQFGKSEERKPFSLDDSSSRSLLLG HPTLPTHKEEPEDEKSPSLDSSSADDAQCDSAQSTSNLGGHSPNLVDSIKENFHRSNG LYDNSSDLLNANSGDGGSIYSGISSLKNSSLYVVQSSDLNGFPPDAHQRSPRPIRTPV STKLTSDSLPASSPPTSSCSDYSTITEACQQRNPSMAVKPGEPVGTMLDSSDFSLKNL NISPDILSSSYVMQQWQKNAPVWNGLSNVVHGDHVPMIPPGINLPQVPFVDNSGFGHM KFPGDVQLMSQIGMATPFCTPNSFGIPCYPNLQSPSVWVPPFGIGGYGLPGPFVPPVI TNFTPQLPGFPSAVNLAAATDLFHPYKMYEHLGVPMPSPVPDQSLTHYFQQPPIHPYG VGNPYDTMVSSNNFVGNPAGVFGSPIIDPSEQKFQIPVTTVAANASTPIKGGKPIGNY ETASPYFGVPMPYPAGPTLHGQPASGTSPRDKRNDVKGFQPPRKNMPVSSEIQGQKGR EKFDDPKAHFSVEELISSRTHRVELADIKGQIVKYSSDQNGSRFIQQKLENCTIEEKD LLFAEVLPHALELMTDVFGNYVIQKFFEKGSPQQKREIANKLAGHVFSLSLQMYGCRV IQKALEVIDLEQKIVLVGELDGHVLRCVHDQNGNHVIQKCIECIPLEHIGFLVSSFQC QVAKLSMHTYGCRVIQRILERCSNNSECLCIIDEILQSACILAQDQYGNYVVQHVLEK GNEHERGQIITKLAGQVVPMSQNKFASNVIERCFEHGGSAERELLVKEILKQTEGNNY LLVIMKDQYANYVVQKMLTTCNEQHKEILLSRVKIHLPLLKKYTYAKHIVSLVERLCG DGAVQSESKKTVTKGC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6636..6682#6358..6529#5784..5978#5481..5591#5185..5397#4281..4388#3966..4107#2521..3869#1161..1790#gactcaaagcagagagaggagaaaaaacacaaaaggcagcgaagcggccgcgaaaagctcgactcggagataaaagggaaagcgagcgagaaagagagaggagaagcattggtggcgtgaggcggttggagcggggcacgcgcgcggccgaaggggggagaggagagaggaggcggggtggcgccgacgccggcggcaaaggttggttgtcctagggttcctgtcgttgctcgcgggaagggtcagcgaaggtgagggcctttggttacccctaactcaattatgtgtgaacagtgcttctccgtttgtgctctgtttatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttattgaggctttgagtttttttttcttgagggggttgcttttgctgtacaggagaagatgatgtttaagtttaatttaatttaatttattttttttactcgctgcggtttgagcgttcgtggagtggtatgtgttgcgagcacacgggtgggtttgtggttatggatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgattctgtgcaatgcttgatcaggtggcgagttcctcacttcggtatgttttaaatttatcctttttcgggcttcgtttgatgttgctctgcggtctgcaccctctagcttggtttaggcatgagattgtatgcaaggtgttttctttttaaccaatttcgtgatttttgggctagttggagacttgtttctgttcagtaataagtatttggggcagtaaacttttcttttttggaagatgtaatttctgttttcgatgggcgaatgtgtgcgtgatctcaccagcaagtccccgcctttggtgtgcttcacgtggtgtcctccatggcctcatggggcaggtttctctaggcggtggattttatctgctgtgctggatcacaaaaaccatgggtaaaaactaaaaaatcgcatttatttggcattttgctatgatgatttcgatggttaaagttcttgagttttttttttctttttgggtaatggagcttgcatatttgcttgctttgtagcattacatgtgtagttagtctgtactcgtataggttctaaaattgaactgaacttacagaattcagttgagaaattatcactaaaaatgatcaccttttgttgtccagcaaaatggctacagagagtgctcggccgttgagtggaggaactggagcagggaagtggccaccaagcaaggacacgggttcctatgattctattccagctagcctttcagaagatgagttagcggagttggccttcatgccaaatagtggcggcatttttgggaagtggaggggttctgtcctggaacgcagtggaagcgctcctcctaccatggaaggttctttagttgcacttggtcacctcacaggtcaaccgagtggcaaccttggggccatactgccaaacttgggcactgaagctaacaattcagagtctaaggagaatatatattatgattcggcatgcgtcaaatactatatgtccaaggtgaatttgaacccaaggtttcctccaccactcgtttcaaggaaccagtttggcaagtctgaagaacgaaagccgttctcccttgatgacagcagcagcaggtccttacttcttggtcatcctactctgccaacacacaaggaagaacctgaggacgaaaagtcaccaagtttggattcaagttcagcagacgatgctcaatgtgattctgcccaaagcacatctaacttagggggccacagtccaaatcttgtagattcaattaaggtaattcccgtattaattcaagaactagctctgattgttttttccacatgcactcaaacaaacttcgtggcgctgttcggttgtgggttttgcagcagctgcacctggtttctgcggctgtggtgcacagctgtggctactagtagcagctgcagccgcagccaaaaaaatggcagccggagaaggctaatgttttcatccgtgacataactccatctttgtatcctcaaatattaaagtcaagaaatctttatgcacggctatacagtagcagtcggcttcacagaccacaagaatggcagtcagctaagacttagtaaggtgaaataatacagtacaacatatgattaatgccccctgtgatatacaaacaaacatttccaatattcagtggctaagacgttttccaaaaactcacttatttgaaatagtaactggaaattctgatttaaactaattgatctttattatgtagtatctgctaaataaaatcaaaacatgtttttgtttcaaggaaatgtgatgggaatcgcactaaaccttgcaattccttaatacaagtacgacaagaaaagaagtattgattgtactcctccataaacattgttatttaccaactctcatgcatgcagatgaactccctaatatcttataatcatgttctgttttgctacagagtttgttgctgcagtctgcagatacttattgataatgatttctttttgtttaggaaaactttcatcggagcaatggtttgtatgataattcttccgatcttttaaatgcaaactctggtgatggagggtcgatttattctggcattagttcattgaagaattcctcactttatgttgtccagtcatcagacttgaatggatttccaccagatgctcatcagcgttcccctagacctattaggactccagtcagtacaaaacttactagcgacagtctgccagcttcatctcctcccacttcatcctgttctgactacagtactattactgaagcttgtcagcaaagaaatccaagcatggccgttaaacctggtgaaccagttggtaccatgcttgatagttcagacttcagtctgaagaatttgaatattagtccggatatcctaagtagttcatatgtcatgcaacagtggcagaaaaatgccccagtgtggaatggcctatcaaatgtagtccatggcgatcatgtgccaatgattcctccaggaattaatcttcctcaagttccatttgtggacaattccggttttggtcatatgaagttccctggtgatgttcaactgatgtcccagatcgggatggcaacacctttttgtacaccaaattcttttgggataccatgttatcctaatttgcagtcgcctagtgtttgggttcctccattcggaatcggcggctatggtttgcctggtccatttgtcccacctgttataactaacttcactcctcaacttcctggttttccttcagcagtaaatcttgctgcagcaactgacttatttcacccatataagatgtatgagcatcttggggtacctatgccatcccctgttcctgatcagagccttacgcattattttcaacagccccctatccatccgtatggtgttggaaatccatatgatacaatggtttcaagtaataattttgtagggaatcctgctggcgtttttggttcaccaatcattgacccatcagagcagaagtttcagataccggttactactgtagctgctaatgcctctactcccatcaaaggtggaaagcccattgggaattatgagactgcctcaccttactttggcgtaccgatgccttatccagcaggtccaacattacatgggcaacctgcttctggaacatctcctcgtgacaaaaggaacgatgtcaagggattccaaccccctcgaaaaaatatgcctgttagttccgagatacaaggtcagaaagggagggagaagtttgatgatcccaaggcacacttttctgttgaagaactaatatccagcagaactcatagggttgagctggctgacatcaaaggacagatagtgaaatacaggttagttttgattttggttgtttcattcactatctagatgcacataacccaatgaaaagcttgagatattaattgttattatgttcttgtcctcagctcggaccaaaatggtagccggttcattcagcagaaactggagaattgcaccattgaagaaaaggatttactttttgccgaggtccttcctcatgctttggaattgatgactgatgtattcggaaattatgttattcagaaggtatagtatttccttttcttatatgattcattttatggtaatttttttatgaatagtacacctattgaacttgaacaattgtacccccttttaagatattacagtatcatagcagcaattatgaaaaataatttatatttgtatgaaatgaaaataacatgtagtacatgcagttcttcgaaaaggggagcccccagcaaaagagagaaatagctaataagcttgccggtcatgtgttttctttgagccttcagatgtatggatgcagagtaattcagaaggtagtcttgacttctttatgggaagtataactttatttctgcttaatgttttggataccatatcatgaaaaccttttcagtggcacactatagcatgtattgtctgaggcggtctgagcaaattttcttcacactgttatgctatccatagacttatttattctcaatatcagttggcaaagtattatctgagtaaaatttcttcagactgttattctatccatagaattgtttattctgaacatcagttggtaagttttaaagtggttagcctgtgggacatcatttctcatattatgcatggtaatcagcatacattcttttaataagttgcaatcccactgtagccagctattcatggattagcatgtgttggaaatgaaaaataatgtgacttataagttgcaatcccattatatcccgttattcacacattttacttgctatattcctggagaactcattttcagatgagttttgtgttattctcatatataat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|
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