Os10g0160000

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os10g0160000

Description

Similar to Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12 (EC 3.1.2.15) (Ubiquitin thiolesterase 12) (Ubiquitin-specific processing protease 12) (Deubiquitinating enzyme 12)

Version

NM_001070739.1 GI:115481221 GeneID:4348153

Length

9842 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os10g0160000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:3810569..3820410

Sequence Coding Region

3811057..3811236,3811342..3811615,3811732..3812289,3812602..3812747,3812840..3813097
,3814859..3815029,3816337..3816477,3816557..3816949,3817522..3817617
,3817715..3817774,3818600..3818744,3819296..3819520,3820106..3820254

Expression

GEO Profiles:Os10g0160000

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MTIPSAEGFLHAASCLPCTAEEERDLVVALTREAEENVKDGDLR YLVSHSWWLNWQSYVGLIKPDENDADMLPQAPSRPGEIDNSKLVSEESSSIGDEPELQ RTLREGDDYALVPQEVWRKLHEWYKGGPELSRRVICSSPTSRSYIVDVYPLRLKLFDG RDSLERIIRISRKAKVSELYSLVCSLLSVEQSKIDIWDFYQKTKGKKLINLNETVEEA QLMMDQEIIIEAKADDAWCSDLGTRSNNELALIPLEPSTSSFSIAGGPAFSNGFSSGF GSSFSQDNSFSPLLRDAEDGYSFSNGTKDDIHGLSGLHNLGNTCFMNSAIQSLVHTPP LVEYFLQDYSREINTENPLGLQGELATAFGELLRKLWSAGRTSIAPRPFKTKLSRFAP QFSGYNQHDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYIEAKDADGRPDEELAEECWNYHKAR NDSIIVDKFQGQYKSTLVCPDCKKISVTFDPFMYLSLPLPSTVTRMINVTVFSGTGDA LPMPYTVKVQKNGVCGDLIKSLSVMCCLQSCETLLLAEVYDHRIYRYWNPSEPLCHVK DEDKLVAYRLPVGSENLLRVEILHRVVDRYTSESMFNLSRKLIGSPLVTCIPSDSTRK ADIYATVSSLLAPFVRAKVHTLDESATKLNSNGPSLDGIVLTDNGVTCEEDVSTSNVD EEAADEEVLPFQLWLTDDKANKREHIDADSNGVPGSTMRLLMDWSDREHEVYDIKYMD ELSVVFKPGFMSKKNRQEAVNLFSCLDAFLKDEPLGPDDMWYCPRCTEHKQASKKLDL WRLPEILVVHLKRFSYSRFMKNKLDTFVNFPIHDLDMSRYANHSRGDQPPIYELYAVI NHYGGMGGGHYSAYAKLVEEDSWYHFDDSHVSSVGEEDIRTSSAYLLFYRRVGSSSCS VSKNVAVDTDMVDSLDT</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>9175..9354#8796..9069#8122..8679#7664..7809#7314..7571#5382..5552#3934..4074#3462..3854#2794..2889#2637..2696#1667..1811#891..1115#157..305#atcgtcttcctcctcttgtttcgcgagaaaaaaagaaaataaaaataaaggcgaggaggtctcgcgagctaccaaaccctagggctcgattcggtggcggtggggagggggctggatcggcgggatcgcgcgggcggcggcggcggcggggaggggatgacgataccgagcgccgaggggttcctccacgccgcgagctgcctcccgtgcacggcggaggaggagcgggacctcgtcgtcgcgctcaccagggaggccgaggagaatgtcaaggacggcgatctccgctacctcgtctcccacaggtcgcctccgccgccgcggcctctcctgatttagtgtcgttctattttgttttatttttttttccggcgagcatctaggtacccgtcttcccgcggtgtggcggccgtggggatcttatctatgctgcgggaaaatccaggggttcgaattggggctggggatccgacgcgtgccgtttggcgcgtgatgcggagtcgcgatccaatcttgttgtgctccggggatgtgttggttggggcgctacagtaaaatgatataatcgtcaggcaccatgctgagttgttttgtagtatatctttaataaaaatgtttttttttgcaaactcctgtattaaatattacaaactagtttatagagtaaggcatgatatatatatatctgagctgtccaagtagttcaatgcgcaggatcttctcgttggctgcaagtaaatgtcatccagcattgcttgtgggacttggtttcctgtttgatgttgatccgtttaatccgttcgcatttcatttcaattggttgctgtgcacatgttatctgaattttgtgactgataaattacatcgtgtggactttgcaaatgttgcagctggtggcttaactggcaaagctatgtgggcttaatcaaacctgatgagaatgatgctgacatgcttcctcaagctccaagtagaccaggagagatagataactcaaagctagtttcagaggaaagcagcagtattggtgatgagccagagcttcaaagaaccctgagggaaggagatgactacgctttggtgccccaggaagtatggaggaagctacatgaatggtatgcaatgttatatgtctgtttaactgccttcatgtcagaaagtttgttgtacccataaaaccacgggtttgtctctttactttttgtcatgagagaaaatggttgcctgattaaaatttgatcatataactacagttccattttgcgacatttttttagttcttattttctttaggcgctcttgttcatttggccaagcttgggctgccagggctttgatatgccacattgtagattgcatgtgctccacttaggtgcaaaccaaaaaagcctggtttgtagtcctgtttgctcagtctgttggcaattagttgttgccctattcaatttttctgtttcctgttgatatttgtttaaaacaatgatgtgctaactggtaaatgcatactgtacgcgttttcactcatgaggtcaggttgctcttcaatggattatgccagaatactagtgtaaccataacttatccctaatgtccatggcctaatgtacttgaatacattcttcttcaattgggatcatcaactcatggacacatgaatacttttcaggtacaaaggtggaccagaactctcaagaagagtaatttgtagtagtccaacttccagaagttacattgtggatgtctatcccctccgtctgaaattatttgatggaagagacagcttggagagaattatcagaattagtagaaaggtatggtatatttgatttatattgtgacattgtgcttcatatgtaattaaccgtcaataatgcgactgatgctccttgaaacttccctggtttcataatgtttggcatttcttttgggatgtagtccctccatagttatccattgatgatgaaatcaatagtgtagttattacaatgatgattccactatccagccctaatttattgcttcaaagaggttgtgtggttaacatttggttgtatttcacattagcttatcttagccatcatgcctccttgatctgtgcttattgtgtgggacaaatcggagcatttcttatatttgataggttagatgatcagtttaggcattctttataccttgatcacattgttggagagtcacatttgtcaaataaaaaccagtgcttacacatttgcattatatgaaataaagcaatgaggattccctctttgtgatgaagtgtcaaagaaatcgcatctgttcatcacctgcttgttgcgatcttctactttggtatgctgagcccttgaatttcagaatttgatctgatatttttggttgactattaccagaaggaaaaaaatgttacaaatttgatgcgcaatggcaaatactttgaatgctggttttactaactgcttgaactaatagcacttttactaaaaaagtagaaagatgaactttctactatcttctttcttagatactcttttgttgaacagtaaatttgttaactttctattatcttctttcttggatactctagtttcttgtgcaattgacttgacttattttttgacgtttgtatttggtgctttcaggccaaagttagtgagctctatagcttggtttgctcacttttgtccgtcgaacagtctaaggtacaagcatcatcatttattcatctaatatctctatctgtagtgtcagttatggttatgtatatgattctttgctccatctactttaatgcttcagatcgacatctgggatttttaccaaaagacaaagggaaaaaaactgataaatcttaatgagacggttgaggaagctcaactgatgatggaccaggaggtattatgcactatgcaattcccattcacatatctattgttttatctgctgaaacctatgattgtttcctttattctggcagcgagatggtcgctggctttttgttgttattgttgctatgcgcccttttcatctatggtctgctgtctgccttaggatgtcaccttgcacatggataatgactttgtcataaattgtctaactcctaaatattgcttaatttattatcttaatttacatttgcacttttcaagttctattatggttgacatgagaattgtttttgagttaataaagttggctcatttgtctttatcatatgaatatgcttctgatcagtgtgttttatcatatgaatatggtttacatttgcaccattgcaatgttcgggtatgaatatgtactggtatgaatatgtactattgcttctaagatgttcactatctgtattgtgggtgtcctgaatcttattattcttaacgatttacccctattttgttggcaagccaacaattttctattttctgtctgtacattaactgaagatgcaacttctttctttatgcttgcagattatcatagaggcaaaggcagatgatgcttggtgttcggatcttggtacaagatcaaataatgaactagcattaattccgttggaaccctcaacatcatcgttttcaattgctggaggtcctgcattttcaaatggtttttcatctggatttggttccagtttttcccaagataatagctttagtcctttattaagggacgcagaagatggttatagtttctccaatggcacaaaggatgatatccatggactgagtggtttacataacttgggaaatacatgtttcatgaacagtgctatacaatccttggtgcatacacctccattggtggagtactttttacaggattacagtcgggagataaatacagaaaatccacttgggctacaggtaatgcatgttgtcctattatgtagattgcgaacttatgatcttattggtgatttctgagaacatctccattgagcagggtgaacttgcaacagcatttggagaattactgagaaaactttggtcagctggtcgaacttctatagctccacgtccattcaagacaaaactttctcgttttgctccacagttcagtggatacaatcaacatgattctcaggttgctccgaatgtttctcctaaacacttcttataaatgtctgttaaatggtgctgacactgagttttgcacctttgttctgttttgtaacttccattaattagtcgtacattataaacgtatttcttactttaagataacatgctgttgtgtcccagaactatgaagttaattttcatttcaacacaccggtgcactgttagtgttaaggcacatttcagttccgaagtacatatgcattaatttcttgtgagattttattacaaaaccctaggttttgggtaataaaactcccaggtctaattcttacatgtactaaaaacaataccgcatactattttattgtacaagtgttatgcataaatagtggtataagagtgtggccaaaaatttggggttcttcgaaacaaattataaaagctgggattttgcgttacaatcgttccaaacctgaggttttgtgaaatttgttttttaaccatagtgttggttgtttatttaaattgtgtcaaactatgattatatctatgtttctcaaacttttgttataagtcgttttgacttttttcctagtcaaacttttttaagttagaccaagtttatagaaaaatgtagacacattttcaacataaaacaaacatattatcaaaatatattaaatgttagttttaatgaaactaatttggtgttgtagatgttactaaatttttatataaacttggtcaaacttaaagaagtttgactagaaaaaaagtcaacgacttgtagcata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aseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os10g0160000, RefSeq:Os10g0160000