Os10g0206800
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Structured Information
| Gene Name |
Os10g0206800 |
|---|---|
| Description |
Multi antimicrobial extrusion protein MatE family protein |
| Version |
NM_001070849.1 GI:115481441 GeneID:4348274 |
| Length |
5850 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0206800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:7307369..7313218 |
| Sequence Coding Region |
7307494..7307606,7307696..7307817,7309009..7309215,7309297..7309484,7309886..7310021 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:7307369..7313218 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaatggggagagcctcctcgaccgcagctcctccgccgacgccgccatgaacgacgccgtgcccggccaccgccaccaccacccgcttagcgtcttcctccgggacgccaggttggcgttcaggtgggacgagctcgggagggagatcatggggattgcggtgcccggcgcgctcgccctcatggctgacccggtcgcctcgctcgtcgacaccgccttcattggccacataggcccagttgaacttgcagctgttggtgtatctattgccgtgtttaatcaagtatcaaggattgcaatatttccccttgtcagtgtcacgacatcatttgttgcggaggaagatgctacatccagtgacagagaaaaatatgaaataaatggcgagaatgaattcaatgtttcagacagtgaaatggaagagctggtttctcatgaagaggctagtgctgctcccagtaagtcgtctttcgaaactgactcaagtgatgtcaaaattgaacataagcggaaaaacattccatcggtgtctacagcattactacttggtggggtgctcggccttttacaagcactgcttcttgttatttgcgcaaaacctctcttaggctacatgggtgtgaaacagggctctgcaatgttgatgccagcactaaagtacttggtagtcagatctcttggtgctcctgctgtgcttttatctctggcaatgcaaggggtatttcgtggacttaaagatacaaagacacctctttatgcaactgtggctggagatgcaaccaacatagttttggatccaatatttatgtttgtcttccagtatggtgtcagtggtgcagcaattgctcatgttatatcacaatatttcattgcatccattctcttatggaggttaaggctacatgttgacctacttccacccagctttaaacatatgcagttcagtcgattccttaaaaacggtttcctattacttgccagagttattgctgcaacatgctgcgtgacactatctgcatcaatggctgcacggctaggttcagttccaatggctgcatttcagatttgcttgcagatctggctggcttcgtctcttcttgctgatggattggcttttgcaggacaggctatacttgcaagtgcatttgctcgtcaagaccattctaaggccgcagccacagcttctcgtatattgcagctgggattggttttaggacttctcctaagcatttttcttggcattggcctccgtttaggatcaaggttatttactgatgaccaggatgttctacatcatatttacctaggcataccgtttgtctctctgactcaaccaatcaatgcgttagcttttgtttttgatggtatcaattatggagcatcagattttggatatgctgcttattcaatgattcttgtggcaattgtcagcatcatcttcatagtcacactagcaagttacaatggttttgtcggaatttggatagctttgacagtctacatgagcctccgaatgcttgcaggattcttaaggatagggactgcacgaggaccatggactttctatgcagctcaacgcatgcattctcatgaggtggttggactttgttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MNGESLLDRSSSADAAMNDAVPGHRHHHPLSVFLRDARLAFRWD ELGREIMGIAVPGALALMADPVASLVDTAFIGHIGPVELAAVGVSIAVFNQVSRIAIF PLVSVTTSFVAEEDATSSDREKYEINGENEFNVSDSEMEELVSHEEASAAPSKSSFET DSSDVKIEHKRKNIPSVSTALLLGGVLGLLQALLLVICAKPLLGYMGVKQGSAMLMPA LKYLVVRSLGAPAVLLSLAMQGVFRGLKDTKTPLYATVAGDATNIVLDPIFMFVFQYG VSGAAIAHVISQYFIASILLWRLRLHVDLLPPSFKHMQFSRFLKNGFLLLARVIAATC CVTLSASMAARLGSVPMAAFQICLQIWLASSLLADGLAFAGQAILASAFARQDHSKAA ATASRILQLGLVLGLLLSIFLGIGLRLGSRLFTDDQDVLHHIYLGIPFVSLTQPINAL AFVFDGINYGASDFGYAAYSMILVAIVSIIFIVTLASYNGFVGIWIALTVYMSLRMLA GFLRIGTARGPWTFYAAQRMHSHEVVGLC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>126..238#328..449#1641..1847#1929..2116#2518..2653#2998..3094#3225..3325#3669..3832#4054..4242#4430..4524#4614..4736#5460..5538#gtcctccaaagcaccagcgccggcaggagggccccccgccggattcgattcccggcacgtccttctcctccctttctcgcgggcgccgcacgccccttccccctcctcctcctcctcttggtctgatgaatggggagagcctcctcgaccgcagctcctccgccgacgccgccatgaacgacgccgtgcccggccaccgccaccaccacccgcttagcgtcttcctccgggacgccaggttgttaaccgagtcatcggtctatcgatttttttccctttccatctatttatctctgagtttttattttcttgggggtcctgttgcaggttggcgttcaggtgggacgagctcgggagggagatcatggggattgcggtgcccggcgcgctcgccctcatggctgacccggtcgcctcgctcgtcgacaccgccttcattggccacataggtttgcttctcttctctccttattttccttattttttttaattttttccccttactgctgacttcgttgtgaagtttccaccaccagttctgacctgctccaggtgggattggaacgtactctgttctacccttcggccttggtcgcacgatgtaattttaatactactagatttcttttcagcttggagcaaacctaacccagttcattccgttagtggtaggaattaaggtgtggtgtttggtcctgactattacgaaatttatctggctgtgctggtaatagatctcgcttccataatgtcgaacctaaaaaaatgaagcagtagtttgtaaagtagtagagtcttttgccgacatcgtggctgatggttgccattgtttagaatattgatactaaccctaatatttcattgctaagtattaaaacaaaattttaatgctttcaattcaagggttagtgtgtagttatgtagtacggtgcccttaaatgtcttaacatcaaagttgattgtcagataggttttttattgatgaattctgtaagaaagcaatcaaaaagcataaagttggataatgaccattgtttaaggtcaacgcaaactggccatattttatattcagcaagtatgtatggtaatactaatgaatcaatgtcatgtaaaatagatgtagaattaattactgaagtttagaccattactaattcgtagagaattccaattggctttgatttatatttagtttagctactttatgtcttgaaattgagtttagatcttctacggctaatttgctttcttgatgtgcttacatttgacttcaccagttagctaagaaagtgcttctacgttatcaagtagtaatttgccaagaagaaaaacagcaccccctgcagcagccacccatggcttttgtgttagtcaacccatacattttttagtttgtaatgtcaaactgcctactagatgttggcactagactacatgttcaccgttatcccaaataagattattaatgaacttaatattgctctttcatttatttttatttatacatttcagcctgctttgaattttgtatgaactttacttcttactgtattgtaatagaaaaaaagggacacattctgattttcaagtctttgacttattttgtctcaagttaatttgattccttttgttcaaaacaggcccagttgaacttgcagctgttggtgtatctattgccgtgtttaatcaagtatcaaggattgcaatatttccccttgtcagtgtcacgacatcatttgttgcggaggaagatgctacatccagtgacagagaaaaatatgaaataaatggcgagaatgaattcaatgtttcagacagtgaaatggaagagctggtttctcatgaaggtaaaacagttctaatcttcttttaagaaacattagaaattaaacaatgcttatttctttgacactcaatcttgccaccagaggctagtgctgctcccagtaagtcgtctttcgaaactgactcaagtgatgtcaaaattgaacataagcggaaaaacattccatcggtgtctacagcattactacttggtggggtgctcggccttttacaagcactgcttcttgttatttgcgcaaaacctctcttaggctacatgggtgtgaaacaggtatatgttccttcataccatttcctttgtggtaaaatcaattattttgtctaatcgtaaagatgtaaacatcaaggattgagtcatcattttttcctgtttttgaaaaatctatcaatggatgttctttatcaaaatttaataactgagaactcatctattattaagtttagctctggatagttggatgtgcacatatatattgtaagtacgaagtatcactaatggaacttaatttttcatgtatattatgatctgaatgaaattgtagcaacaaactagtgtattggtgagtttcatcattaaggacttctatgattttggttttttaattctagaatacactgtttatttattatttttcacatcggagtcctttttctactgaaattttctgatagggctctgcaatgttgatgccagcactaaagtacttggtagtcagatctcttggtgctcctgctgtgcttttatctctggcaatgcaaggggtatttcgtggacttaaagatacaaagacacctctttatgcaactggtacagtatttccttgactgcagaatggtgtatgctgtatataatcaaaccaagtgtctaaaataatgattatttaaactgtcccttcaaagtcattctacttgtggtggaatactttaatactttcttttaagttcgcaaagttaaggcaagatgacatgatatgaactggtgggatcaaacacttatgacctaccgtacattattcatgtaataaaatgcatgactgtagaacatgtgtctcttgtagatggtatatttaaatgcatgagatgttacgattagtgaataatttgcctcaggataatacatatacctaatggtgttaactctttttataccagtggctggagatgcaaccaacatagttttggatccaatatttatgtttgtcttccagtatggtgtcagtggtgcagcaattgctcatgttatatcacagtatgtagcacaattctctcttataatatcattgttttttacccgtgaagttggatgacaaactatgtccaaaagtatataatacctttcttctacctcttgtgatagtgtatggtggaaaattctgcagatatttcattgcatccattctcttatggaggttaaggctacatgttgacctacttccacccagctttaaacatatgcagttcagtcgattccttaaaaacggtaattcttttctaatatttttgggttccaactaagacatggccctttttttttgccacaaaccattttacaatacctggtcttcataggatgataattattaatatccattttctcgtatgcattcttagatttgatttttttcattgaaagtgcatacttaattcaaaacagcaaattaactatttatttccttttttacatttgggttatgcctgcttgactttcacattgttttagcacataatttcattctaaacgcaagttgcccttgcttgtttcaattattttacttgaaacatttctggttatataaaactcgttctcacttttcacacttcaggtttcctattacttgccagagttattgctgcaacatgctgcgtgacactatctgcatcaatggctgcacggctaggttcagttccaatggctgcatttcagatttgcttgcagatctggctggcttcgtctcttcttgctgatggattggcttttgcaggacaggtaagggaacagttgtctccactcactccaatgctgacaatactgaaggtttctattgaaccttcattttaatgaaaaattctacctcagtaactgcaccaaagggtatataattgagttttctaaattatctaacgttggaaacagataatgagatgtatcagcatgaactgaaatgaatttgcattttgttcttatgcatctggatcatattttgacaggctatacttgcaagtgcatttgctcgtcaagaccattctaaggccgcagccacagcttctcgtatattgcagctgggattggttttaggacttctcctaagcatttttcttggcattggcctccgtttaggatcaaggttatttactgatgaccaggatgttctacatcatatttacctaggcataccggtaaactttctttatactgatgccaaaataattacaattttaagtcatattgtagttaggattcctcagttgtgtgcgggagcctgatgttcctttatgatatctttcctactgtgcattgggatgcctgcctactgtcagagttacctggaatttttttaactaaagagttatttttcctgttcagtttgtctctctgactcaaccaatcaatgcgttagcttttgtttttgatggtatcaattatggagcatcagattttggatatgctgcttattcaatggcaagtcaactagtcaacacctatgtccttctatctgtattttcaatcctttttttttcacatatttttgttgaattcattgtcctcagattcttgtggcaattgtcagcatcatcttcatagtcacactagcaagttacaatggttttgtcggaatttggatagctttgacagtctacatgagcctccgaatgcttgcaggattcttaaggtacaatcagtcaaagcattatcttttctaacctgagtatttgattacaaacctttattacaatgacaaacaatagttataagtcttcagtaatgattgctacaaccagaatcaccaccaaa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