Os10g0408700

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os10g0408700

Description

Similar to GAMYB-binding protein (Fragment)

Version

NM_001189215.1 GI:297727560 GeneID:9268744

Length

7131 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os10g0408700, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:14452495..14459625

Sequence Coding Region

14454239..14454240,14454327..14454454,14454616..14454710,14455034..14455118,14455207..14455211

Expression

GEO Profiles:Os10g0408700

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008403:14452495..14459625 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>agctgttgctgtttagggtcaactaggaggaagtgtctgtgtggtgattcatcacagttgcggcggtctcgacctacagcatatgtccatgatcgatgcgtgacaagagccgaaaaggatcatccattgttgatgcagtttttcaagcaagtggataagagcagcaagtattatgaatttcgctgcaaaactagattagtgaaaccatcaatcctccactttcagaacctatacaaggaagggctcttggagcaactgctacagtcaactgctctactggttagttggtcacttggtcgtcacttgtcagcctga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>SCCCLGSTRRKCLCGDSSQLRRSRPTAYVHDRCVTRAEKDHPLL MQFFKQVDKSSKYYEFRCKTRLVKPSILHFQNLYKEGLLEQLLQSTALLVSWSLGRHL SA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1745..1746#1833..1960#2122..2216#2540..2624#2713..2717#gtccctctccctctccagcgccgccaccgagcggctcgcgccgccgccgccgccgccgccacccctcgcgccgccatctccaccatcgccgtcgccgtcgcctcgcctcgtcacggccgcctccgccatcgcctccgccacctccaccatcgtcgtcgtcgtcgtcgtcgccacccctctcccaccatcgtctccgccatcgttgtcgccgtcgcctcgcgccaccacggtcgctgccgcctccgacttccccgtcgcctcgcgtcgtcgtcgccgtcgcccgcccccgccaccatctccggccccccaaaccctagccgccgccgcccgctcgttccgacggggattcggagggggtcgaagggaggaagaggcggtggcggtcggcgaagaggacgacgatggcgacggcggcagcggcggaggaggcagacgcggcggtgggagatggagacggtggtgatggcggtcggcgaagaggacgacgatggtgacggcggcggcggaggaggaggcggatgtggcggcggagagcgagacggtggtgatggcgacgacccccgcactctctcatggcaatctcgggggaggtgtcggggaccacggcaacgctggtggtcatcaatggattcacggtcacggtggagtcagtcggggactcgcggtgcatcctggacacgcagggtggtgaggtgcagttgctgaccgtcgacaactgcctggagaagaatgccgaggagcgggagcgggttagcgccagtggtggggaggtcggccggctcaatctcttcggtggtcaggaggtaccaattcgctcccgagaggccagattgaaaaagagaggcttcctttgtgatgcattgctgtgtgacgctttgttttcagtcggccatgtcctgctttgtgatgcattgttgtttgatgcagttctaggttggccctctccggtgctagacaggtggcatgtgcctttcaagatctattggggacctcttcctgccgctcccatcatccctcgttgcccgccccacatcccatcatcgacggcggcgtggattttggtggtcgcgcaggtctggctgacgagctccatggcggctcgaagcagatggcgacctcaacggcaacgtggatccaggctagagcttgataatggcactaatctgccaacgagcttggcggcaacatgcccggcggccgccgttagttccttacccagcgccgtctccaccgtcttcgctgcctccacggtcatggccagcggcggttgaccatggcatatgctccggcaggcaaaagcagagagatggccttcctcccctttctctcccatctctccttagattaatctttctctctctcaggctgccattgttgttcttttcatggataaaattgttagggatcggcaatatttcctattctaattgtgtcttgactgaaaattagttcgattatattcagagcccgtggttaggtgatccgagattggtgcttgctggctggattagtcaattagaaaaaggtagattttgatatgcagtattaatttgatcttgtgatgatcttagttcttgtaccctgccttcccttgaggctacttccggatacccaaggccctagcgcgaagacgtgtgagggggctgcaggtgagtcgggctatcgccgtggagcgaccgtggtgaagcagcagctctacagcggccggatcagtgcggtggtccggtggctttacggttgctagaggtgtgaatccttgcttcaatggttagagaaacttagatgcacctttgctgcatgtttcttccatgtttcatgtcttctttctgcagctgttgctgtttagggtcaactaggaggaagtgtctgtgtggtgattcatcacagttgcggcggtctcgacctacagcatatgtccatgatcgatgcgtgacaagagccgaaaaggatcatccattgtgtgagtgtgctctatgcggctgctaagcaaacaaccaattatgtttcactgttaaagtttggctgtaatattcgattaaaaataccttgataattttacctccaaggatctaaatgttttgcctttgatttaaattgtttttcccctgatggctgatgcagtgatgcagtttttcaagcaagtggataagagcagcaagtattatgaatttcgctgcaaaactagattagtgaaaccatcaatcctccactttcaggtgagttataattcattattccatttaatgcaggataggctatttttcctaagctattagcatttggattattctgtatcatcacggagttgctacaccttatttcattgatcgtatgtatttgtccatgtcaatagaactaagaagttcaaaaaattgtatgaacaataatagccttaataaagggacctctaagcaagaaatctactatcccaggggaaaaaatttgtaatattttgaaggaaatgctatggtggttaaatacttaaatgtttgcatgttgaactgttaaaaacactcataacttgatgatctcttgacagaacctatacaaggaagggctcttggagcaactgctacagtcaactgctctactggttagttggtcacttggtcgtcacttgtcaggtagtatgcacaaccttttgtggtatatcatctgctttatctaaattagtttggctcatttttactaatgttataactgtgtgtgcagcctgacagtgcagcatctaaaagctaacttatacagtgtgctttatctctggtatggctgacctcagttgtaagttctgaattttgagtggtgttggttagaaccatttatctgattgctcttgttcatgatgaatggcaatataatgggattactcttaggcattgatggaaagtttcaagatttgtgcagtcaatgatggcatcataaattgcgtggatatggtaaaaatatatcatttaccagttttctcttttgctgaatcattgattgatctactatatttgatcttgatcaaatcatatttttgaactaatgtagttctttgacatgaaaaaagcttgatgttaagtacagaagaaccaggtatgcataatcattgtgtgggttcattttcttttttcttctatagagttgcatgcattttcctttttgcttcgcccccgccccctgaatagaaatgtatacggagaactactgatctttagaatatcagagaaaaggtctaatctgatttgtatgatctctataaggatttggaactcaccagaaacatccaatttccatttctaagatagacaattatctttaccttaccctgtaattttttcgtttgaccaccgataattctgattccacatggatcttttatgtactttcttcatccgccatctttattcttgtaacagtggaaatgtacatcagagaagcccctagaactgctcctattacaaataagaccgtaacaagtcattaagctaatgtcttaagggatatattatgtactcactttataaatcaatgcagttcttagctaatacgtgctcatgtgatgaaatatttttgtgccttttcctttgctttctgcttgattgatgatttctagataaaagttttagatgatactaacaacagttttttcactctagaacaaactattaggtagtaatacaatgcttaagaaacactccattatggtgtaatgtcttcatttcctgactgcttatccttctatacctcttaaacctagccattttatttgtttataccgaaacctagacattcaattttgtccggtacttttactataagtggttagtagatgatgccatgtatgttatcttgggacaaaagtaagataattcagtggcttgatgaaactgtacaggaatatccccttttttagtaatctattgtgaaatcagttgctagatgtttcactaatcatgacgggtgggttagtaaatatgtgcggattattaccgggtaatacatttatccacatactgatcataattaagaggaacaaaatatattggcattgattatttattctgattgtgaggttaaagagtattcagcgtgcaagtaataaaattgtactactacatttgtacctaggaagtcagctctttctggtaaaaattttagcatccttttattctaaatatgttttatatcttctagatttatttctttttcagggcaagtcactaactttatggtattggagttggagtagaagatcagcagctccatcatcgacgatggcctgatccacaaagatggattttggtggtgatacttccagggaggtaaaatattgtgctatttgacacatgctgatggggtgcaatgtcgtctgtgccaaatggacctaaaaatattgttagctagcctgacttaactgcaggcaagaccaagaggaaatctggttactacttggtccagatacgacctgatttgattaatcttatgagttgccgacttggaatttcactttgaggagattttagttcagaatctaatcatgcaattggcttaggcgacatgaacattttttatctgtttatcttttatttgtagctgaactgtcgtggtgcacacttcctaaagtttgaaacttactatctttgttaccaaactaatctatgtttatatgattatgtcctacaaattgctgagtctgttacatcattgttacatctgttttcaaactatttgctaatatgaatactatgacaggatagtgcctttgcttaactatttgtttgggtaaatctgaaaatactaaactggttctcaaaaaaaaaagaaagaaaatactaaactgaactaattttgttttgttgagttcatttagaagttttggagctcgtcatatatcaccagagctcatctttttcagataatatcttaggatgatcctgcattttgca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External Link(s)

NCBI Gene:Os10g0408700, RefSeq:Os10g0408700