Os10g0446200
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os10g0446200 |
|---|---|
| Description |
Conserved hypothetical protein |
| Version |
NM_001071250.1 GI:115482243 GeneID:4348750 |
| Length |
9648 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0446200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:16578484..16588131 |
| Sequence Coding Region |
16578619..16578787,16579310..16579368,16580261..16580369,16580820..16580929,16581354..16581422 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:16578484..16588131 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:16578484..16588131 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggcggcgagacgggcgaaggtggcggcggcgctgggagtggtggtgtggtggtggtggtggtgggcggtggcggtggtgggctgcggggcgcagccggtggtggtggggagctacgggcagccgaggctgtggctgaagccctacgactggagctacctgcgcgttgaattgccgccgtcgttttcttccgtcaccatggatttcgcgactgacagagacattcagagggagcacttgaaggatctgccaagaagagatcttgctatcatttgtttgatgaattccaaccctcctattcctgatatatctgattcttttctggacactttattatcaaactttctcgttgttgggtcttttggcagtaccaataatcagtcagatctggcgcaatgcataccatttcagaaaaacacgacgattgtgttaagaaatgaccagatatctccaggaatatggtacattggttactttaatggccttggacctgctcgcacgcaatcaaagatgattagccgaggcagggcacgttctgtgagcactagtataactgtagaaggatgtccaacttcagcactatggggaccatattgtaaccaaacaatagaaatgattagttgttctcagtcttcaggatataacaactcgagaaatcttatgggtttgaatattgacaagaggaaaactttgaataccagagagcacacaaggcgtattaattttctgtcgcagtggaaccatttagaagaaaagggagttggctccaacagtacaacctattcgagaatggacaactcgatcacttgtgccatttcaaatggctcattatgcttaaggcagggtgatatgaagttctacttcttggatgtggttgacctagcattgcaatttgaaattacagctacgaattttgggttagctcaaaggtcatccttaatttgttacctgcgctacaatgcctttcctcggagagatttgcatgattattcaggtgacatcagcagtgctcctttggttttaaagttgccaaatattggacggtggtatatcgctattgagactgtaaatataacacagatgaatagcacagcatcaacacctttactggatacgacatgcttctcattagagtggcaagtgactggatgcctgaatggaaaagctggaaccaattgctcatgggaggcatatgtgctccagagggttcctaaacgaagtccttctgtccctttcgagtcatattatgttcctagtgatggaaaggcatccctggagtatagtcacttctccctggaacaatttttaagcaactcatcttttgagccatttgcatggacttatttctttctggatattcccgaaggttcagccggtgcgcttatccatgtccagataaaatcagataaagaattgaattatgagttgtactcgagatatggtggtttaccatcaaatgagagttgggattattatgcaagcaggacaagcagcagtaatggctcagtatatttttcattacaaaattccacaaattcagatatggatctatctattttctatgcaaaggagggaacttggtgctttggtgtgaaacatccaagtgataaatcaaattctcagacgtacatgtccatatctcttcagggatgccataagaactgcaatcagaaaggagcgtgtcattcctcaattgatgaaagtgggctaacgttctacagcttctgcacgtgcgatcgtgatcatggtgggtttgattgcaatgatgaattagtttcacctaatgggcacatctggcagtctgtctttctaattgcatcaaatggtgcagcaattttacctgccttttgggctctccggcaaaaggcatttgcagaatggattctttacacttctagtggaatttctagtgctttataccattcatgtgatgtgggtacctggtgcatactatctttccgtgtattacagtttttggatttctggctttcctttatggctgttgttggtacgttcatatatatggctacaattgatgaaacttcaaagcgagccatgcataccgctgtctttattctcacagctcttttagctgcaacaggtgctaccagatctgcaaatattggtattgtcattgctattggttctcttggcctgcttattggatggctattggagttctctacagcaagaagattcgtatgctggccgtggcgaattaatcttaatgtacctcaaagctggccaaacctcaggagtttattttcgaacagtctggatttgctgaacaaacgattccgttggttctatttacttctgggtttcatcacattagcatttgcgggtacaagctggaagctagaatcaaatcgtagctattgggtttggcacagcctgtggcatattactatttacacgtcctcattcttcttcctgtgctcaatgcgcatcaatacgcttactggacctaccctggaagaagagttgaatgccatattctttttgacagtgtgcatgcaccggcctcttcaggtaggtatatatggcttccatgatttttggggtgtaattccatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAARRAKVAAALGVVVWWWWWWAVAVVGCGAQPVVVGSYGQPR LWLKPYDWSYLRVELPPSFSSVTMDFATDRDIQREHLKDLPRRDLAIICLMNSNPPIP DISDSFLDTLLSNFLVVGSFGSTNNQSDLAQCIPFQKNTTIVLRNDQISPGIWYIGYF NGLGPARTQSKMISRGRARSVSTSITVEGCPTSALWGPYCNQTIEMISCSQSSGYNNS RNLMGLNIDKRKTLNTREHTRRINFLSQWNHLEEKGVGSNSTTYSRMDNSITCAISNG SLCLRQGDMKFYFLDVVDLALQFEITATNFGLAQRSSLICYLRYNAFPRRDLHDYSGD ISSAPLVLKLPNIGRWYIAIETVNITQMNSTASTPLLDTTCFSLEWQVTGCLNGKAGT NCSWEAYVLQRVPKRSPSVPFESYYVPSDGKASLEYSHFSLEQFLSNSSFEPFAWTYF FLDIPEGSAGALIHVQIKSDKELNYELYSRYGGLPSNESWDYYASRTSSSNGSVYFSL QNSTNSDMDLSIFYAKEGTWCFGVKHPSDKSNSQTYMSISLQGCHKNCNQKGACHSSI DESGLTFYSFCTCDRDHGGFDCNDELVSPNGHIWQSVFLIASNGAAILPAFWALRQKA FAEWILYTSSGISSALYHSCDVGTWCILSFRVLQFLDFWLSFMAVVGTFIYMATIDET SKRAMHTAVFILTALLAATGATRSANIGIVIAIGSLGLLIGWLLEFSTARRFVCWPWR INLNVPQSWPNLRSLFSNSLDLLNKRFRWFYLLLGFITLAFAGTSWKLESNRSYWVWH SLWHITIYTSSFFFLCSMRINTLTGPTLEEELNAIFFLTVCMHRPLQVGIYGFHDFWG VIP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>136..304#827..885#1778..1886#2337..2446#2871..2939#3053..3742#4007..4524#4620..4684#5905..5984#6789..6893#7924..8063#8152..8280#8798..8950#9081..9144#9294..9413#agtggcgccgcgtgggaggaaagcaaagcctcctcttcttcctctccccccctcgccgtcgtcgtcgatctccggagcagccgcggcgggagggttttaggttttagagcggtggtggtggtggtggtggagtccatggcggcggcgagacgggcgaaggtggcggcggcgctgggagtggtggtgtggtggtggtggtggtgggcggtggcggtggtgggctgcggggcgcagccggtggtggtggggagctacgggcagccgaggctgtggctgaagccctacgactggagctacctgcgcggttaggagccctggaatctctgctcgcggttgcggtggggtttgggtttgcttcggcttgagctccctcgtgtgattatcatgccgcgtgcgccttttccgccgtgatgatcgccgccgcgggattccgtttgtttttttttttggtcacgcttttgtgttgcggtttgggagattttgtgttcgtatttagagatttcttcccaggtggtggtgttcgtctcacttcccccctaaactagaagtgcgattttgagtggaattagctgctgcgactgctctaatttttgcttaagttaagtttgcttaagttaagttaattaagctcgctagatgctttgcttacctaggtaattaaagaagattggtgcatctaggctcggttgtgagttttcacatgcaacatgttcacctttaagcgtgcagcgaaaccacggattttgtcgcatctgtatttggatttcttttgtttttttgttttcatcttggatttaccctcatactttgctttcgttgctcgcagttgaattgccgccgtcgttttcttccgtcaccatggatttcgcgactgacagagacattgtaagtgaagattctggccttctgagaactatattttctgtctaataataaatacaatattctttttatagattcgttggtttatggatatgctagtattcttataatcagtgagcagtgtgggttttctgagttgacctggtagattgggccgtggttagtacaagaagtatctaaacattaagatattgtgacctgaacatttggtggcagtagtagttcattttgtcagctatccttggttggtatgaatatgctgattgttttgaagctaacttggggtatcattttgagtgtgaatttactaaggcatgatgtttttttttcgagtttcgagcacctccatggatgcaaggacatggtgttttcttctgttatggatgaaaaaaaaattggaaatccccattttttactttaaaaatattttcttttcatgatcttatcatcccatatgaaagtatgtgtgctgtaatgttcatattgattccccagaatctatacataacacaccacacagggattcatgtattcctttttggaaatagtatatcaagatagaggagcaagggttgatgaatatggtcttcatctaaaagtgggcaagcagcttgtttgtttaacctttactttccaaagaaaatttaggtggtacagcagtttagctcggtgccttctatgtgtagtgcagtgaaaagaatatgaaatgctgatcggtgagtagttatgtgtaatagagtgagctgcattattctgttttatgaactctttaacttgacgtagaacagcattttggtattgcatcatctgtttagtttatatctgactatattgtacagaagattgcacagttgacttatgtatagtttgtgcaatatttctttggaaaatacagcagagggagcacttgaaggatctgccaagaagagatcttgctatcatttgtttgatgaattccaaccctcctattcctgatatatctgattcttttctggacactttatgtgagtaccaaatacattgtcttatgtgatgattaacacctttgaggtcttaaataactttttgtataattgtattcagataatcctgcatgcatggttaattgcaagataaatttgttaaatgagtaatagatatacgatttaagaatattgtctttcaaattgggaatggagtatactatgtagttctcaacccaataataattagtgttatattttatatgtgaaaatccattacaattccttgcaaataaaagagaactgagaaaataaataaaccacatgacagataggcatgattaggagttcattagctccataaaaaaagttcattttgagggcatttttctagtgagttgttcttttggttcttcttattggatccttattatcaatgtttagataactttctgattaaaccaattttgacaggaaggttctttgttgcagtatcaaactttctcgttgttgggtcttttggcagtaccaataatcagtcagatctggcgcaatgcataccatttcagaaaaacacgacgattgtgttaagaaatgaccaggttaacaatcctgatgctgtaatttgtaaatcgatatgctgttcttacctttttacagtaataacagtcttagtagcagatttgacactgatgcagaagtgcacatcggtggttatcttgattgagttacaaatagttgtatgattacacgtaaactaataatgacatttggatccttataattgaaagtcaacttccacaccgcataaacctgttaggtctatttattgagttcttctgtgcccttagtgctggaattttctcaagtcaaatgattgattctgcccatacagttctatttacttgtgttatccattggccttatctgatcattaagtgcaagaaatgtattgttgtcccctgatgtaacagctccatcttccgttgtagcatcttatggtttgtcaaccattgttctgtgcagatatctccaggaatatggtacattggttactttaatggccttggacctgctcgcacgcaatcaaagatggtatgcctcatttctaactagggaatgtgtagtttactgcactatcatctattttatttttcagcatgaatgcatcaagcaaattttgaattgttgataatatacttctgcagattagccgaggcagggcacgttctgtgagcactagtataactgtagaaggatgtccaacttcagcactatggggaccatattgtaaccaaacaatagaaatgattagttgttctcagtcttcaggatataacaactcgagaaatcttatgggtttgaatattgacaagaggaaaactttgaataccagagagcacacaaggcgtattaattttctgtcgcagtggaaccatttagaagaaaagggagttggctccaacagtacaacctattcgagaatggacaactcgatcacttgtgccatttcaaatggctcattatgcttaaggcagggtgatatgaagttctacttcttggatgtggttgacctagcattgcaatttgaaattacagctacgaattttgggttagctcaaaggtcatccttaatttgttacctgcgctacaatgcctttcctcggagagatttgcatgattattcaggtgacatcagcagtgctcctttggttttaaagttgccaaatattggacggtggtatatcgctattgagactgtaaatataacacagatgaatagcacagcatcaacacctttactggatacgacatgcttctcattagagtggcaagtgactggatgcctgaatggaaaagctggaaccaattgctcatgggaggcatatgtgctccaggtaggatgagaagttatggaatttacttttgttatcgactgtagccacacatgttttgacctttcaatctccggtttctatgatgtgatgattttaaagttgaaataaaccaaacactttgctacccatgaattgccatctgactgattttgtagtttttccatcacaagttcttttttgtgctggcatctgcatgctttgttaggtaaaacctagtttctgcaaagacatctttattaattaatcactgttcttaaaatgcagagggttcctaaacgaagtccttctgtccctttcgagtcatattatgttcctagtgatggaaaggcatccctggagtatagtcacttctccctggaacaatttttaagcaactcatcttttgagccatttgcatggacttatttctttctggatattcccgaaggttcagccggtgcgcttatccatgtccagataaaatcagataaagaattgaattatgagttgtactcgagatatggtggtttaccatcaaatgagagttgggattattatgcaagcaggacaagcagcagtaatggctcagtatatttttcattacaaaattccacaaattcagatatggatctatctattttctatgcaaaggagggaacttggtgctttggtgtgaaacatccaagtgataaatcaaattctcagacgtacatgtccatatctcttcagggatgccataagaactgcaatcagaaaggagcgtgtcattcctcaattgatgaaagtgggctaacgttctacaggtaattccacaagatgtttccctatagcgtgaaaatatttgtttctctttttttgctctttgcgctgtaacgatatttttttcttcattttctagcttctgcacgtgcgatcgtgatcatggtgggtttgattgcaatgatgaattagtttcacctaatggtaaactccctcgtatttagtttctaaattttctcagctaatgcatactacagcagtagtagccctatttctgggtagaaatcacaaatgtatctaatatactccctccttcccaaattgatcatcatataagtttatgcaccaagaccaagggcaatttaaatcacatcaatcaagacaccatgcacacattctcccacaatgcatgcatcaattaaaaccctatgccaattacaccctagcatacacacattctctcatactgcattaattgtatttcgatgaaatccgtgtccatgcagttatatgatgatcaatttgagaaattttggattctattacatgatgttcaatttgggaaggagggagtaattctttagcagcagcagactttaatatttttctacactagggcattttgtggtaactgagattaccttggttgctagttagacttcatgtacgtgtaagtgtaactccgtagtagtaagcaattcaaagtatgtgcttatttggagttttctgttccaaacacactctacttaatacacattttgttcattacaaacttgatatggctggaacttttgggttaatcccctttagatatgtatttttgcttgaggacagaatacaatactaggctacctttatactgaggtgcctctagataagggaaaatgaaacaaactagtaatataatactaataggactctgttgacaaaataaaactaggaaactctaacagaggaataagaaatatgacatctcttagcctattaggattctccaactgctgcagaacttgcttatcctgaattaatgttatgccgacgcaccataatgtccatccataacaaactactgaaatgttgttctgtgcagactttttagctgcagagaggcaactgaatatccaaactattgttgtttgtaggaagtaatttattccatagatttttagaatgacccagagttaacaaagctgagacaaactgtcctacgtaaacttctttggcggatgaaaagtacaaaaaattatgatccagtgtataccaagttcttgacatatgtagttggaattcttcaaaaaaaaaaagagagagagagagagaagtggttggaacttcctttccaaccttgcttaatgttagttgcagcttattttccagggagtgaatctactttatgcaataaatattgttgtatctatgcacagggcacatctggcagtctgtctttctaattgcatcaaatggtgcagcaattttacctgccttttgggctctccggcaaaaggtatgttcttatccagagtgatgattttattaaataatttgtttcggtcttttagatactagccagcctttttttcttgagtaaattgcaccagtttcctaaaatttcgtcagtaaggtgcaggagctcatgtggtgctggtgcctctcctcctctatctagtggcatgaggaactcatgtcagccaggcttccccaggcgtacctatgtttacaacttatttgatccacatgaacaattttaggagttgtcagaaagattaatgagctacatgcaattagagggatttcataatttcttctgaccatcggcatctcatatttgaaacatgttgtatgaaccaagtgcataatatgtatttcttcttaactcaaaagggaatgcccattcaatttagatggcctaactgaatggattaaaaaaattctatctaatcttatatctaacatagctagcatctagattgtcctgacatatctagtagactagtctacacaaccaggcctgcccaacagcctaaactgatcttatctcaaacactagtaaatagatggaatgttcagcgtacgcctgtcttgctggttggcagtcagtcctctgcagccatgatgcacatggcagttggtatccctgtccaaaagaaaatgccatgcttacagccgctttctgtcttgaattattgatattcaattatcaaatatgtccccatttaagaagctaaatttatgttttcttttgctctttgatatgaatgaattagatctgttcaatgtcatcttaaccttttttccttttgccacccaggcatttgcagaatggattctttacacttctagtggaatttctagtgctttataccattcatgtgatgtgggtacctggtgcatactatctttccgtgtattacaggtgagctactcgccacataagattctttaatggaatttctagcccattataccattcatgagatgtgggtacctggtgcatactatcttgttcagaggggaggagaaagttgtatagtgctagatgggatggtaccagttggctctcttagttggatttatcagattgtaccttctgttggttggatgcgctagatgatacgtgaatggttttatttgctttaaatatatgcgttatgtcaacacatattttgttttattatgtaaacactattttttatgcttatatagtaattaacaagcacacatagctgcagtaattgttagtaattattatagttaaacccaacttagtcatagctaatcatcgctaactacctgcaattataaagttatatctgggctctccgtcccacaaacacttggtctttagcaattctcagacagattagtgtggagtaataggcttaggttccctatcattattcctgttagcttaactcccacgtgtgctgattgggtggcgtcatttttgttagccagagcccgttaattgcacatgcattagccaaaggaaacaagcttcaaataaactctgtgggacaaattttggatgctaaaaataaactatttatgggcggagggagtaacatttaatggcaactaatgtatgacaaactctttaatctccattatgttgtgtgtgcaacccatgctttacacacccattgattatgtcaaatcattgcttatttattttctaacacaagtcaaacgtagacactcatgccacgcaagtccttgcgcctactgcatatttaggaatttcgcataggctccagggcctctccgagcatgggcagcttttccactgtatgtcactggtgtgtactctgattaaatggttcacaccatctcaatccaattgtcacctgaccattagtgcatcctttcttgctctattatttacactctaaaatgctgttgataaattatcaagccttgaccactgagctcttatctgcatacagtttttggatttctggctttcctttatggctgttgttggtacgttcatatatatggctacaattgatgaaacttcaaagcgagccatgcataccgctgtctttattctcacagctcttttagctgcaacaggtgctaccaggtatgcaaatcgctagctaccatttttcttttcatgtaccacatgagcgcaggacatacaagtaataaggtttgagttaccatctcagatctgcaaatattggtattgtcattgctattggttctcttggcctgcttattggatggctattggagttctctacagcaagaagattcgtatgctggccgtggcgaattaatcttaatgtacctcaaaggtaaagtgattgtactccttttcttttgggggctagggaagtgattgtacttacagtacaacgacaattaataaacaacaattaataacgggctcttagggttcttaacaaggtaagtttgctgacatgaaagagagatgagaaaggagagagaaacatcgttgttaagcttaacaacagcttaaaaagaaagaaatgtaatagtaaaaagaaacttgatgcatgaagatagtaaaaagaaagaaatgtaatagaaaattatttttgtgcatttattgttagtctcggtcatctcaactattgtaagaagataatctctaaatagactaagagcctataccgggctctagctttaaatatgcctcacgattatatggtttccatataatcttagtccaaaacagtttttagtgcgtatgccctctgtgcctaagattatggcaagcaccatcaaaatgtctagcatttcctttggtaagctgacacatttttcccatattgccattcttccctacagctggccaaacctcaggagtttattttcgaacagtctggatttgctgaacaaacgattccgttggttctatttacttctgggtttcatcacattagcatttgcgggtacaagctggaagctagaatcaaatcgtagctattgggtttggcacaggtgtgtggcttcctcatccatactaacttccaaaataacttagttttcatgtccaccgatgttatatcttcttgctatcactcaaaactcatcacatattgtgtttttttttcttttccttctcgtgcagcctgtggcatattactatttacacgtcctcattcttcttcctgtgctcaatgcgcatcaatacggttaatcatagtccggagccaagctacgagttgacgaggcaaaattcattgccaagatcagagccgagagaaacctaacgaacccaagacaccacaaatgtacatctgcctgttcacgttatcggcttgggtgttttatggccaaacagcttactggacctaccctggaagaagagttgaatgccatattctttttgacagtgtgcatgcaccggcctcttcaggtaggtatatatggcttccatgatttttggggtgtaattccatgaacaattaaaggggatagattttgtaactagtacatgtaccattagaggagatctgctgcatcgcatccgaactgtaaatagagtgggtgcagagaacggaaaatatatactcctactattggcacgatctttgtctggatgatacggatcccggataattgatacccatcggagttgggtattctgtagcaatgcaacttttaagatgtgataccgcccctatattttttttccc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
