Os10g0477000

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Structured Information

Gene Name	Os10g0477000
Description	Armadillo-like helical domain containing protein
Version	NM_001071388.1 GI:115482519 GeneID:4348897
Length	14822 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os10g0477000, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 10
Location	Chromosome 10:18235714..18250535
Sequence Coding Region	18235869..18235955,18236969..18237056,18237857..18237965,18238050..18238148,18238763..18238805 ,18239427..18239498,18239577..18239672,18239786..18240019,18240091..18240274 ,18240424..18240535,18240624..18240710,18240880..18241018,18241805..18241895 ,18241998..18242060,18242222..18242331,18242486..18242590,18243159..18243232 ,18243556..18243631,18243963..18244199,18244596..18244667,18245259..18245330 ,18245417..18245481,18245561..18245663,18245726..18245853,18245942..18246089 ,18247050..18247157,18247240..18247290,18248303..18248380,18248461..18248571 ,18249118..18249317,18249420..18249489,18249817..18250005
Expression	GEO Profiles:Os10g0477000
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008403:18235714..18250535 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008403:18235714..18250535 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgcaggggttccccggcggcgcccccgatccgcagcagctgcagtccaccatgctggccatcgagcaggcctgctccctcatccagatgcacatgagtccagctgatgcggaaaaagttataagttcactgcattcatctccaatgccttatcaagcatgcagatttattcttgagacatcccacatgccaaatgcgagattccaagctgctggagcaattggtgatgcagcaataagggagtggggaatcctttcagatgacaacaaaaaaagcctaatagtatattgcttgaactatgttatggagcatgcaagttccccggaaggttatgtgcaagcaaaagtttctgccgtggcagctagactactcaaaagaggctgggttgagttttcagaccaagaaaaagctgccatcttctttgagattgagcaatgcgtacgaggcatccatggacctaatcgacaatttgctaccatcaatttcttagaagccttggtttcggagttttcccctgggactgcttctgctatgtgcctgcctaaggaattccatgagcaatgccaatggtcacttgaagtgaagtttctgaaggacttctattgctgggcacaagctgctgtgttcaattctgcagacaggatattgaatgtaaatgcaagtgtagcagaggagaaagcatgctcagcagcatttcgccttatgttccagatattaagctggagtttcaagcacaatgtggagcatgcaaattcagaagctaagataaattctggtttgaggagtgatgccataaatctgaagaaatttgagcgttcgctggtgaagccagggtctgtgtggagtgatgttctaatatcaagtgggcatgttcagtgggttttgaacttttatactgctgcccgccagaagttctcatatgatacgctatgggttgattctcctattgctacctcctgcagacagctcatagtgcagctatgctcgttgacaggctctgtgtttcctaatgataacgcagatggacagattcaataccttgtgcgcatattatctgctgttgtacattggattgaacctcctgatgtcattgctgcatcaattcgaagtggagcaagtgaaagtgagtttgtagatggatgccatgcccttctttcaatggcgtctttgactacttgttcgctttttgacaacctcctgaagtcaacgaggaactatggcacaatcaacctactttctgctttgacatccgaagctgtcaagtcttttctggataaccagaatgaagaagaaacctggggctcggagtctcttgatatattgttagaaacatggaatgttattctgggggatgttgattccgagaaaagtcctatgtcagttgatggagcaattgctgcttcaagtttgtttaagatcatcgtggagtcacatttgaaggctgctgctgattctgcattcgaggatactgatgatgccgaatactttcatgtttctgtttcaaagcgtgatgagcagctggccttgtatgctcagattgcacgttcagctgctgacacaactataccctttcttgcacaattgttttcagagcgatttgcacggctgagtcagagaaatggtgaaaatgatcctactcagactttagaagagttgtactggctgttgctgataaccagtcatgtcctaacagattcaggcgaaggagaaacactgcttataccagaagcattgcaggttggattcccctatgtagttgaagtagcacagcatcctgtagttgcactctcatggtccataataaatttttctcgacagtgtctagatccaggaatcagggcaaggtacttcagtccgcgactcatggaggctgtgatttggttcttggccagatgggtcgcaacctatttagtaccacttgatgtgagtagggggcaagtaaacagagcagaaattgacagtgtggataaacacatgctccaacattctagaaaaatgctaaacagttttgcttgggagaataaccaaggagagcgtgttcttgattttgttgttcttatttcaatggtagcacttactacatatcagggagaaattgagctgcagacacttacatgccagaagctacttgctacagttgttcgacggaagcacacatgtacttatgttgttcagttggactcgtggcgtgatcttacaagagcttttgcaagtggacgttctttattttcattaactggacgcttacagagatctctagcagaaacacttgcctgtgcagcttcctgcatcaaagatcctgaagcatctgtgcagtatttgagggacctcatgggaccggttgctggatgcctagtagagaatgctaacaggagtgatctcaaatctgtggcacagcaagcagatgttgtttatatggtctgttgtctattggaacgactaagaggagctgctagagctacccagcctcgcactcaaaaggttctatttgagatgggtcacactgtgatgaactcgctcttgactcttctggaggtgtacaaaaatcagtctgcagtcatatacatgatactcaagttcgtcgttgattttgttgatggtcaagctgtgtttttggatgctaaggaaacatcagttttggtgagcttttgcctgaaactactccaaatatactcctctcataatattggaaaggtaatgctctcactttcttcaagtttgcgcagtgagtcacaagctgaaaaatataaggatctacgtgctttgcttcgtcttctgactaatatatgctcaaaggatttggttggtttcctatctgatagtagcattgaaggttcacaagatattgctgaggtcatctatgttggagttgatattgtgactcccttgatatctttggaccttctgaagtaccctaaactcagtcgtgattattttgctcttatctctcatttgctggaagtgtacccggagaaggttgctaacttaaataaggttgcctttgcaagaattattggaagtcttgagtttggcctgcgtaatcaggattgcgacattgtcgacaggtgccttacagcaataaatgctctcgcttcttaccatttcaaagagagacttggaggtaggggaggacttagctcacagcttatggaatcagaaggatcaaatggcaaacttcaggaaagcatatcaagtcactttttgaggctgcttctgcaattgcttctgttcgaagatttcagaatggaactagcaggttctgctgcagatgctttgcttcctttgattttatgtgaacaaccgttatatcagaggctgctgcaggagttagttgagaaacaacagaatccaacagtgaaatcaaggctgggaatggcatttcataacctcacaagctccaacaatctctccaactcgctcgaccgcccaaataggcagagattcaggaaaaacctccgcactttcttgggcgatgtctcgggcttcatgcagataaaatag</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MQGFPGGAPDPQQLQSTMLAIEQACSLIQMHMSPADAEKVISSL HSSPMPYQACRFILETSHMPNARFQAAGAIGDAAIREWGILSDDNKKSLIVYCLNYVM EHASSPEGYVQAKVSAVAARLLKRGWVEFSDQEKAAIFFEIEQCVRGIHGPNRQFATI NFLEALVSEFSPGTASAMCLPKEFHEQCQWSLEVKFLKDFYCWAQAAVFNSADRILNV NASVAEEKACSAAFRLMFQILSWSFKHNVEHANSEAKINSGLRSDAINLKKFERSLVK PGSVWSDVLISSGHVQWVLNFYTAARQKFSYDTLWVDSPIATSCRQLIVQLCSLTGSV FPNDNADGQIQYLVRILSAVVHWIEPPDVIAASIRSGASESEFVDGCHALLSMASLTT CSLFDNLLKSTRNYGTINLLSALTSEAVKSFLDNQNEEETWGSESLDILLETWNVILG DVDSEKSPMSVDGAIAASSLFKIIVESHLKAAADSAFEDTDDAEYFHVSVSKRDEQLA LYAQIARSAADTTIPFLAQLFSERFARLSQRNGENDPTQTLEELYWLLLITSHVLTDS GEGETLLIPEALQVGFPYVVEVAQHPVVALSWSIINFSRQCLDPGIRARYFSPRLMEA VIWFLARWVATYLVPLDVSRGQVNRAEIDSVDKHMLQHSRKMLNSFAWENNQGERVLD FVVLISMVALTTYQGEIELQTLTCQKLLATVVRRKHTCTYVVQLDSWRDLTRAFASGR SLFSLTGRLQRSLAETLACAASCIKDPEASVQYLRDLMGPVAGCLVENANRSDLKSVA QQADVVYMVCCLLERLRGAARATQPRTQKVLFEMGHTVMNSLLTLLEVYKNQSAVIYM ILKFVVDFVDGQAVFLDAKETSVLVSFCLKLLQIYSSHNIGKVMLSLSSSLRSESQAE KYKDLRALLRLLTNICSKDLVGFLSDSSIEGSQDIAEVIYVGVDIVTPLISLDLLKYP KLSRDYFALISHLLEVYPEKVANLNKVAFARIIGSLEFGLRNQDCDIVDRCLTAINAL ASYHFKERLGGRGGLSSQLMESEGSNGKLQESISSHFLRLLLQLLLFEDFRMELAGSA ADALLPLILCEQPLYQRLLQELVEKQQNPTVKSRLGMAFHNLTSSNNLSNSLDRPNRQ RFRKNLRTFLGDVSGFMQIK</aaseq>
Gene 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External Link(s)	NCBI Gene:Os10g0477000, RefSeq:Os10g0477000