Os10g0478500
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Structured Information
| Gene Name |
Os10g0478500 |
|---|---|
| Description |
TRAF-like domain containing protein |
| Version |
NM_001189281.1 GI:297727692 GeneID:9271695 |
| Length |
11645 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0478500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:18402493..18414137 |
| Sequence Coding Region |
18402493..18402647,18402824..18402990,18403411..18403708,18403974..18404057,18404498..18404614 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:18402493..18414137 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:18402493..18414137 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgacggttctacccctcctcctcgtctgcttcacctccataaaacccccacttgtgcccagggcttcacctcccacgtctgcgaggaagaggcgctgctgtgattgcgagtgcgagattattaagaatcctatagaattaggattcttaataaagatatgcactgttgttgaggatcctcatgttacaaacattttttttctttctgaaatgtgcaatattgttcaagttcctagctctgcgttattggctgaagatggatttcatttacaggttattcccaagaagacgaagtgctgggaaaccatctggtccaggagctttattatgctccatcgcaaaaatggcttctttcacttcttccgaaaaaggagcaccgatgcactgctggtaaagatccataatccagtgttcttatggaaggtttatggcttctcagcgctacttcagaggggagctttagcagccaagtctgctgcatttcattgctctggatacaactggtacttgaaagtgtctccaatgcataaaacccttggtgatggaactccacatgttgctctttctcttgtgctgtcccgactaagctttaagccagattacaccatgaatgcagtgttcgtgctgtcaatgtacaaccattcgaagggaaattttcttgtagtcaaagaggttctcttcctccagaagaagaagtttgtctctgttcagaatctcttcctccagaagaaggatttcactaaaggggattacacctggaccatgaacaacttccctgagttggatttgaagccatcggtcctttcacctgcatttgaaattggcagacgcaaatggttcatcagaatgtatccgcgtggtgatgagtacagcactaattccctttccatgtacttgttcccgcaatcctgggacaagctccttccagagcctgggatgatgatcgaactgacactatccatcctgaaccaaaacaatgcgcaacttcacaaagtttcaggtcgctttgtctttgctagtaagaatggctggggatggtccaacttcatcgcgctcaacaaactcaaggatcttgtcggatcaagctgcattgtcaaggcagacatcaccatcatcgggtcatccagtgagagtcagattgtgtatatgctgaggttaatttactggagacgggatctaaaaagggagctcgaagagagaaccatgggcaacgttgctggacgtgctgcaggtgctttgctcttctgcattacggcagacgatccggatccaagatttatggcttctctgcgttatttcagcgaggagccacatcagtcacctctgatttgttccactacggtgggcacacctggcttgaaggaggatatcgtggtggacacgacattcgagctgtcaatttataaccattcaagaagaacacaccatggaacaagagcgagctacaagttccattatccaaagtactactcagagtacacatacctcattcccctttcgaagctacaggatggttcagatttccttgctgatgatacatgtgtctttggtttggatatattgagagcaagaaaatttaaacctacgaggaatgctaagggtgttactattcagcatgtctttctccagacaaaggggttcatgcaagggaactatacatggaacattgaggactccaaattggacttaaagtccataatctgttctccaaagtttgatattggtgaacataaatggtaccttcgtgttgatccatatggtgattatcgcaaccgtgactatgtctccatctacttatgccttgatgataactccaacatgcctccaattgagtccgcgatcatggcagaattcatcatatccatcctgaaccaaaagaacggaaaacactcgcaacagaaagcccggaccgtgttttcttgcaaaggaattgcttggggatggcacaaattcattcggagagatcagatgaagaacacaaatgcaggatttgttgttggatcgagctggacagttcaagcagaagtcactgtcatcggctcatccagccatgcatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTVLPLLLVCFTSIKPPLVPRASPPTSARKRRCCDCECEIIKNP IELGFLIKICTVVEDPHVTNIFFLSEMCNIVQVPSSALLAEDGFHLQVIPKKTKCWET IWSRSFIMLHRKNGFFHFFRKRSTDALLVKIHNPVFLWKVYGFSALLQRGALAAKSAA FHCSGYNWYLKVSPMHKTLGDGTPHVALSLVLSRLSFKPDYTMNAVFVLSMYNHSKGN FLVVKEVLFLQKKKFVSVQNLFLQKKDFTKGDYTWTMNNFPELDLKPSVLSPAFEIGR RKWFIRMYPRGDEYSTNSLSMYLFPQSWDKLLPEPGMMIELTLSILNQNNAQLHKVSG RFVFASKNGWGWSNFIALNKLKDLVGSSCIVKADITIIGSSSESQIVYMLRLIYWRRD LKRELEERTMGNVAGRAAGALLFCITADDPDPRFMASLRYFSEEPHQSPLICSTTVGT PGLKEDIVVDTTFELSIYNHSRRTHHGTRASYKFHYPKYYSEYTYLIPLSKLQDGSDF LADDTCVFGLDILRARKFKPTRNAKGVTIQHVFLQTKGFMQGNYTWNIEDSKLDLKSI ICSPKFDIGEHKWYLRVDPYGDYRNRDYVSIYLCLDDNSNMPPIESAIMAEFIISILN QKNGKHSQQKARTVFSCKGIAWGWHKFIRRDQMKNTNAGFVVGSSWTVQAEVTVIGSS SHA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>11491..11645#11148..11314#10430..10727#10081..10164#9524..9640#7985..8078#6926..7068#6664..6827#6043..6208#5401..5567#4941..5067#4305..4384#865..1043#1..117#atgacggttctacccctcctcctcgtctgcttcacctccataaaacccccacttgtgcccagggcttcacctcccacgtctgcgaggaagaggcgctgctgtgattgcgagtgcgaggtatgtgcattccccccacaaatctcggcccccctctcctcccttcgcttctcccgatccgtagaaaagcttcgtgcctttgagggatggagtatgcgtgctctgtttgatggtcagaggctgagaaaggagcgaatttttccaatcgttttgtgagcccagcggttacggtgtttcggggttgtttcaacagtggaggggatttcgattcatgcaggttcttggctttctggatgggattttccttttctcgtttagttgattttttcaataaaagttcctggctttctttgagtatatttgtttcatctgcctgctcgagtggaagtggggtttctaccgcttgatatttcttctctcttttttttccagtgtatttcttgtactccccggttattacttgcttataagataaaattctaaaaaaaaataacttggttataagatttgcagttttgatttggtctgccgttgaggattcttgtgttctatggctcgtctctgttttttatagtgtgcaagattcttcgatcaattattagctcttgatttctattggaggttattggcttgtggtttgtgtgtgcaatgtgcaatgcaagttcttggctttgttgacgttccagagtgtagtgtggttctttgatctgactgcttaagaataaagcacctgccttttgtaacatgaggatcctcaatttttcgtgtttgtgtattcttgtttcttgtggtggttacttggtcaagattattaagaatcctatagaattaggattcttaataaagatatgcactgttgttgaggatcctcatgttacaaacattttttttctttctgaaatgtgcaatattgttcaagttcctagctctgcgttattggctgaagatggatttcatttacaggttattcccaagaagacgaagtggtaaaaagctatgggcaactcctgccttagtgctcgtaaggattcccttcgagattcttaatctcttttgcttgctactaacctactagctactgaaattattgtggtagaagcacagaacacggttcaccagtggtgtcagtcgattctgtttcagatttctgatatttccatgtagaaataaaatgtcaagaaaaaattgtaattttagttcctggaaactagttacctttgtcatcgtgttgagcggtttggtctcatttatcagaaggtatagcaaatggcatagatagatatgagtttgaggcttgaactactagttttcataatcactgcctattgactctggctaggtgtaatcttggctacaatatgttggcagtggttaattacttgtgccatgggccatggcccatgaggttatggcatgtagttttgtataggaaacactttgataccatggtaatgcttgtttgctggatgatttggaaagaacaaaattcacacgtgttcaatcagtgttcccatactattggccggatcttttttagataatgaaagctttatttagacttagttaactacatcaagatgattggcatgtagttttgtataggaaacactttgataccatggtaatgcttgtttgctggatgatttggaaagaacaaaattcacacgtgttcaatcagtgttcccatactattggccggatcttttttagataatgaaagctttatttagacttagttaactacatcaagatgatacaatcaaactgagtcactcttggcctctgcataaaatgcacacagccaaaaaagaagaaagaaacaactagaacatctcccaagccccaaagtttgacagaaacatatatcttagtggctatcaatccgtaggctagaccgccacccatgctcctaggtaaaaaaactcctgtgccacctggtccaactgtcgagataccaccgtatatcttagtggctatcaatccgtagactagaccgccacccatgctcctgggtaaaaaactcctgtgccacctggtccaaacgtcaagataccaccataatagtatcccgcagtcccggttggtggaggatagcccaggtacgtagccaccgggtaattaaggtgataacctgcaaaggagaagacacatcttgttatcaaaaattactccattcctgcttagccaaatggaccaacatagagctgttgcacccatcaaaagtagattcctcatttatttggggacacatgatagccaactcccaaacatatgaccaacattgcgaggaggtttcagattagaagccaactgaattacagaccacaccaagcgagataagcggcaccgaaagaataaatgttggatagtttcatccttgtgacagaaacaacatgtcttgttgcctttccaatttctcttagcaaggttgtccttggtgagaattactccccgacgtaaataccaaaggaagattttaacttttaggggtactttcaccttccaaatccgtctattgatattcggaaccccgctatgtgttagagctagataatgagatttgaccgagaagaccccattcggggtgaggttccagtgaaactcatcttgctcctgtaccaaaatcaaatcagctatgcgaggcaataagttatgccaagcagctagttttgcaccaattaaatcccgtcgccatgaaaagcacggaggattggtttggaaaatctgtgcgatagtcgattgtttatgcctaactatgttatagagacaaggatattgttctcttaaccaggcattacccaaccatttgtcttcccagaacctaacttgggagccgtccctaatcttgaaggatccaaaacggaaaaagtcttgtttgaccttcataagactagcccaaaaatgtgaatcccccgctttccaataggcttgagataaaggttgtgatcccaaatatttattgcgtagcaattattgccatattccatcggtggtaagtagtttgtataaccacttactaatcaacgctttattctttatctcgaggtcatgaattcctagccccccttgttctttgggacgacaaataatgtcccacttagcaagccgatatttcttcttatgtccatccccttgccaataaaacctagatcgaaggtaatcaagttttttaagtaccccactaggaattgcaaggaatgacatcatatacattgggagactgctaagtactgagttaatcaaagtaagtcgtcctcccaacgaaagaagttttcttttccagctactcaatttcttctcaaatctctcgaccacttctttccattccgcatttctcaacttcctataatggatcggaatgcccagataacggaatgggaagttaccgacctggcagccaaagagctggttgtattgatcactataatcaagtgcttcaccaaaacaatacagttcacttttatgaaaattgatcttaagacccgacaactgctcgaaagctagaagcactgacttcatgttctgagctttttcaaggtcatgattcataaacagcaccgtgtcatcggcatattgtagaatgaagagtcccccatcaatcaaatgtggtatgactccatcaatttgcccttgtgttttggctctgtttatcaatgtggctagcatatcagcgataaagttgaataggattggggagagagggtctccttgccgaaggccctttttagtctgaaaaaaaggctcgacgtcatcattgactttgactaccacgcttcccccggaaatgaaagactcaatccaagatatccacttgggtgaaaaacctttcatacgcagagtttgtagcagaaaaggccatttaaccttgtcatacgccttttcgaagtcaattttgaatatcaccccactcaacttcttcctatgtagctcatgaactgtttcatgtatgatgacgactccatctaaaatgtttcgtccacgcatgaaagcagtttgggtcgggttcactaaatggtcagcaaccgagctaattcggtttgtagccaccttagtgaatattttatagctgacatttaacaagcatatgagtctgtattgttggatttgatttgcttctttaacttttggaactagagtaagtaccccaaaatttagtccgaaaattgggaggctaccagtatggaattcattaaaaaggttcatcaggtcatgcttaataatgtcccaaaatttttggtaaaattcagctgggaaaccatctggtccaggagctttattatgctccatcgcaaaaatggcttctttcacttcttccgaaaaaggagcagtaagcaaatcattttcagcttgtgaaacttgagccatatcaccaattatggactcatcaagcgaaaacgagttctcctctggtggtccaaaaagtttttcattgtcttatctttggtgacattaaggacgagatcacagtgtggaagaaagcagagtttttcattgtctctgatgactaagtgtttgtagtgtgaaggtttttgtcttcatgcctttgaggtgggattactatcaatctcacactggtttcgacaacttgtcgatgtaatattactataacctatacctccctaatcttaatgaaatttggtcggcctttttcatcagctgacttgacaaaaaatagtattatgtactaattctgactttactgcaaagaacggatagtttttcggagttgtctttgttctcatacgattagatatgctcttatatgtggacca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|
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