Os10g0485000
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Structured Information
| Gene Name |
Os10g0485000 |
|---|---|
| Description |
WW/Rsp5/WWP domain containing protein |
| Version |
NM_001071428.1 GI:115482599 GeneID:4348939 |
| Length |
10650 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0485000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:18778325..18788974 |
| Sequence Coding Region |
18778499..18778783,18779244..18779366,18779458..18779604,18779689..18779832,18780939..18781050 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:18778325..18788974 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:18778325..18788974 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgacgccggcgacggccgcctccgacgcgaccaacccggaggcggcggaagtgccgtccgctgccccggcgtcggaatcggaaggaccgttcgattccggcgtcgtcgcggcggcaacgacaccggcggtggtggatagtgcggtggagggagacgccccggccgctcccgctcctacctccggctccggtcctgcggcgccgtctatgccggcgaatccggcgtctcctgcaactccagggcccccgcggccgcagttcgccgggtcgcccgcttacgcgagccccccggcgccggcgttctcgtacaacgttcttccgaggccgtcaccccggccgcaggtgggcagtggtgcggcccagcagcagctagcttcccctccggccatgatggctccttcagtggctgctgcagctcttcagcctcctgtcccagggcaatattttgggaacaggccgtctttttcatataatgtagtctcgcatgctaatgctggcttgcctactggtcagcagtttcaacttgacaccggcacaaaccatgctgtccaagtttcacggtttgttccaccatcatccttgcaacctccagctcctatgaatttagctcgcccaagttcagcatttccaggagcaggagctatgccaccaaatcctcctggatctattcgcttgccatttccaggtccacccagaccatccatcaatacttttgttgcaagcccacaacaggcacagccccaggcatctcagttaccttcaaacagtgggagctcagatgttagcacttccaggtctgatactcgaagtgtcccagaggctagtccccagaccatgcagttgtcgacaggcccaccatcaacaagtactgctggaagtccttcaatcactgttcagatgccaacaaatccatcacttccaactcgcccggaggtttttggggccattggtgcttctgtacctggacaaccttccacaatcttgtctgctccaccaagcctccttgggagacctatgactccatctgcttctccttttccccaaacatcgcagtctccaactgcttttcaacagcctggtcagcaacagttgtacccctcctatccttcagcacatggggttcaacctcagcctctatggggatatcccccacagcctactggttttcagcaaccccccttccaatcatacccatctggtcttctagggcctcttggtaggccgatggttgggagttcttctgtgactgcatacttgccaagcatacaaccacccggtgtctcaacaactgacagggattccaaggagctatcatcagcaaatcctggatctgagcagcccactcaacagggaagccaaaacagcgatcagctcgaggacaaaagaactactgccattcaggattcagattcatggtctgcacacaagacagaggctggtgttgtatattattacaatgccttgactggagaatcaacttatcaaaaaccacctggttataaaggggagcctgagaaggtcgcagcccagccagttccagtttcttgggacaaactggctggcactgactggagcatagtaacgacaagtgatggaaagaaatattactatgataataagctaaaggttagcagctggcagcttccaccagaggtggctgagctcatcaagaatgccgagtctggtccattgaaaggaagttcaacttcgctgcaagatgctggcacgatagggaataaagaggaaataagtattgatattgatactcctgctgtacagacaggtggccgtgattcgttgccacttcgacaaacagttgcccctgcatcgtcttctgctttggatttaataaagaagaaattgcaggatgctggcgcttccagtgtgccttcacctcttgctactccatctagtgcatccgagctgaatgggtctaaaacaactgatgctgcacctatgggacatcaagtctcaattagcggcgagaaatcaaaagataacagtggtgatggtaatatgtcagattcctcttcaaattcagatgatgaggaacatggcccaagtgaagaggagtgtactcgtcagtttaaggagatgttaaaggaaagaggtgtattgccattttcaaagtgggaaaaggaactcccaaaaatagtgtttgatccacgttttaaggctattccaagtcactcgaggagacggtctacatttgagcagtatgttcggacacgtgctgacgaggagcggaaagagaaaagagctgctcagagagctgcagtggaggcgtataaacagttactagaagaagcatccgaggacatcaactccaataaggattacaaggaattcaaaagaaaatggggcactgatccaaggtttgaagccttggaccgaaaagaaagggatgctcttttcaacgagaaggtgaaatcgattgaagagaaagttcaatcagtgcgcaatgctgtgatagctgagttcaaatcaatgcttcgagaaagtaaagacataacctctactagccgttggaccaaagtgaaagaaaatttccggagcgatgcaaggtacaaagccatgaagcacgaagaaagagaggttgcttttaatgagtacatagcagaactaaaatccgctgaaaaggaagcagagcaagctgccaaggccaaactggatgaacaagccaagttaaaggagagggagcgcgagatgcggaaaaggaaagaaagggaagaacaggaaatggagagagtaaaattgaagatccgaagaaaagaggccgtgtcttcatatcaagctttacttgttgaaatcataaaagatcccaaggcatcatggacagaatccaaaccaagacttgaaaaggatccacaaggccgtgcagtaaatcctgatttaggtaaaggtgatgcagaaaagttatttcgtgaccatgtcaaggacctgtatgagcgatgtgttcgggatttccgtgcgctcctatctgaggtgataactccagagatagctgctcgaacaacagatgaaggaaagactgcaattaactcctggaccgaagcaaaaggtcttctaagatctgatcctaggtacaacaaactggcaagtaaagaccgggagtctatttggcggcgctatgcggacgacatgaagacaaaacttaaacagtcagatatgaaggagagatcagatacagatggaaagcagcgtaggtcctctgatccgccaaggcggagatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATPATAASDATNPEAAEVPSAAPASESEGPFDSGVVAAATTPA VVDSAVEGDAPAAPAPTSGSGPAAPSMPANPASPATPGPPRPQFAGSPAYASPPAPAF SYNVLPRPSPRPQVGSGAAQQQLASPPAMMAPSVAAAALQPPVPGQYFGNRPSFSYNV VSHANAGLPTGQQFQLDTGTNHAVQVSRFVPPSSLQPPAPMNLARPSSAFPGAGAMPP NPPGSIRLPFPGPPRPSINTFVASPQQAQPQASQLPSNSGSSDVSTSRSDTRSVPEAS PQTMQLSTGPPSTSTAGSPSITVQMPTNPSLPTRPEVFGAIGASVPGQPSTILSAPPS LLGRPMTPSASPFPQTSQSPTAFQQPGQQQLYPSYPSAHGVQPQPLWGYPPQPTGFQQ PPFQSYPSGLLGPLGRPMVGSSSVTAYLPSIQPPGVSTTDRDSKELSSANPGSEQPTQ QGSQNSDQLEDKRTTAIQDSDSWSAHKTEAGVVYYYNALTGESTYQKPPGYKGEPEKV AAQPVPVSWDKLAGTDWSIVTTSDGKKYYYDNKLKVSSWQLPPEVAELIKNAESGPLK GSSTSLQDAGTIGNKEEISIDIDTPAVQTGGRDSLPLRQTVAPASSSALDLIKKKLQD AGASSVPSPLATPSSASELNGSKTTDAAPMGHQVSISGEKSKDNSGDGNMSDSSSNSD DEEHGPSEEECTRQFKEMLKERGVLPFSKWEKELPKIVFDPRFKAIPSHSRRRSTFEQ YVRTRADEERKEKRAAQRAAVEAYKQLLEEASEDINSNKDYKEFKRKWGTDPRFEALD RKERDALFNEKVKSIEEKVQSVRNAVIAEFKSMLRESKDITSTSRWTKVKENFRSDAR YKAMKHEEREVAFNEYIAELKSAEKEAEQAAKAKLDEQAKLKEREREMRKRKEREEQE MERVKLKIRRKEAVSSYQALLVEIIKDPKASWTESKPRLEKDPQGRAVNPDLGKGDAE KLFRDHVKDLYERCVRDFRALLSEVITPEIAARTTDEGKTAINSWTEAKGLLRSDPRY NKLASKDRESIWRRYADDMKTKLKQSDMKERSDTDGKQRRSSDPPRRR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>10192..10476#9609..9731#9371..9517#9143..9286#7925..8036#7725..7831#7437..7577#5589..5672#4851..5315#4657..4735#3083..3120#2809..2972#2133..2709#1819..2055#1548..1694#83..469#actgctcccctctcgcaacatccggctccgctcgcctaggccgcaaaaaccctaggccttgccccccgactcctcctctcccatggcgacgccggcgacggccgcctccgacgcgaccaacccggaggcggcggaagtgccgtccgctgccccggcgtcggaatcggaaggaccgttcgattccggcgtcgtcgcggcggcaacgacaccggcggtggtggatagtgcggtggagggagacgccccggccgctcccgctcctacctccggctccggtcctgcggcgccgtctatgccggcgaatccggcgtctcctgcaactccagggcccccgcggccgcagttcgccgggtcgcccgcttacgcgagccccccggcgccggcgttctcgtacaacgttcttccgaggccgtcaccccggccgcaggtgggcagtggtgcggcccagcagcagctagcttcccctccggtagggtatcgtgcaccctctatgcttcacatcgcaattatattatactccatacctttttgttttcaccttaactgcacgaaatgtcgttttatttttttccttgggaatgagaagcaatgttatatagcgttgttgggaccaatttgtggtgttcagctcagattatgagcggtgacttactgttgcgttaattagtgctattatttgtatacaactgcagaaaatgagaatttctgctttatagattccctatgaactcttgtgggcttcaaaagttgatatcagctgccgtttaatttgctgatcaacacattgcagcatttatagttcctagtggcggtgaagattcatatcagattttgttaactcctgtttagcttcagtagccgatggctagctcatactttatctgaagaaatttcttgtttagatatacgcagcagcagtacgagttgtgtttataatttttgttctcattttactctgcttttatcttgatctgatgataaacatgcctgcttacgttttgctctgatacaaaatgttgtgagattagtctttctcttctcatgtgaaatgttattaagctgataagttcttgcacacaaaactgttgaacctttcatatcgatatataaccaaaattggtcacaaaactgttagtaatcagttcatcataattggtcacctgaaagctgtttatgcagcagaagttacatggctctttaatgtctcagcataatctggtacttcctccatttcataatgtaagtcattctagcattgtccacattcatatagatattaataaatccaaacatatatgtgtctagattcattaacatctacatgaatgtggacaatgctagaaagtcttacattatgaaacggagggagtacaattcatataaaataacaaaacacatataaatagaggactattgttgttcctgttttattcaatcatagcaaacaactcaacaaagttaagttggattaatgtaccatatgatggctttacttgtcagagtggaatccccccatgtgaaactttcgtcttctcttttccttccaggccatgatggctccttcagtggctgctgcagctcttcagcctcctgtcccagggcaatattttgggaacaggccgtctttttcatataatgtagtctcgcatgctaatgctggcttgcctactggtcagcagtttcaacttgacaccgtaattcctcatgtctttattgctagcattaatattgaacatttttatttgtccattttacttaatgatctgaatcctcttctctgactcactgactgactgttgatgctttcttttcttccagggcacaaaccatgctgtccaagtttcacggtttgttccaccatcatccttgcaacctccagctcctatgaatttagctcgcccaagttcagcatttccaggagcaggagctatgccaccaaatcctcctggatctattcgcttgccatttccaggtccacccagaccatccatcaatacttttgttgcaagcccacaacaggcacagccccaggcatctcagttaccttcaaacagtgtatatgcttcgaccaactttcttttatatgcgtgggttataatgatcaatttactaataattttgaattattacaggggagctcagatgttagcacttccaggtctgatactcgaagtgtcccagaggctagtccccagaccatgcagttgtcgacaggcccaccatcaacaagtactgctggaagtccttcaatcactgttcagatgccaacaaatccatcacttccaactcgcccggaggtttttggggccattggtgcttctgtacctggacaaccttccacaatcttgtctgctccaccaagcctccttgggagacctatgactccatctgcttctccttttccccaaacatcgcagtctccaactgcttttcaacagcctggtcagcaacagttgtacccctcctatccttcagcacatggggttcaacctcagcctctatggggatatcccccacagcctactggttttcagcaaccccccttccaatcatacccatctggtcttctagggcctcttggtaggccgatggttgggagttcttctgtgactgcatacttgccaagcatacaaccacccggtgtctcaacaactgacagggattccaaggagctatcatcagcaaatcctggatctgagcagcccactcgtgcgttagcttaactttcatcaactgggacagttttacttaatttgatgatcagtattagtggtccagttaattcttgtgatcttttgtatgctgcagaacagggaagccaaaacagcgatcagctcgaggacaaaagaactactgccattcaggattcagattcatggtctgcacacaagacagaggctggtgttgtatattattacaatgccttgactggagaatcaacttatcaaaaaccacctggttataaaggggaggtagttgcacagaggaatagctgtatcaagtaatatgacttaattctagtctacggcatagcaatttagcatcacaatttaactaatttatttcattcgttttcctgcagcctgagaaggtcgcagcccagccagttccagtttcttggtacgttagtgtgagaacttcctatattctttgctatctttaacagattttataacagaaattatatattctcttgtgagggttgtaactggttaagtcaccttttgaaattggtttctgttttccacacaattaggagtgctacaacttatttgggacaaccgattttggtgacattgttacatgatttctggtaacctgcacaatagccaaaaagttagcaaaattcatgtttgacatggatagtaagacaagaaatccctaaagctttacttttttttaaaaaaagaaaaagatctaacattatcttgcatttttgaaactactataaatcttgctttaatttggtatttctgaaactgaaaatggtgttgactgcaagactacctaacatgcttggtactcattatttaggcttagtttgtcccaacagtttggctggagctgatgactgctaagaaaacggggcagatctaatgcacattattaattaagtgttaaccattgtaaatttgaaaaatggatttatttgatttttgtgaaaaacttctatattgaatttttttgcacaaaacacaccgtttagcagtttgggactaacagaaaacgaggaagttgccacaactagttgctctaccgaactaggccttgataagtgtagcggctgattagttgtatatctatggtgcttgtttaacaaatactttataggccacaaatgtcatcatgctcatgcaactagggacgagaatggttggaaaaatcgtttccagaaccatatttttcttgaaaacggaattgaaaacatagagatggaaatcaaaacaacattggaactattggaatataactattggcaagcaaatcacagtatgtttacattataaattcgcatcacttgcaattgttgttgaacattcaaagaagggtgtaagtaatttaaaatatgccatgatgatgcacaagggtttaggctaaggtatattttattctgatgggttgtcagaactataccgtatttttccagaattatggatgaaaatggtatactggtagtttccttttcatagtctgtacaaaacaaaacgataggcggaatggtcgggaatttcctgtaggttagccgctttctaagttacttgaccacatatgttctcattgtgttcaaaataagtctaattatgcagaatgatactatgtgagatcattttttcatttcgagcatatatgaatgatattttgttgctcaaagccttctagtagttcattcattaatgttctcatatggcaccaagttgatgaataaatttgcatgtttccttaattagctaaagaaaaaaaaaatctagaattgagctttctcaaacaggtctgtgatgtttttcaaaaagtagaagttgcaatatttatgaatgctgctattatttttggcttttgctctttccctctttacccatataaatgtcttgatctgttattctgttcttgctcataaatttcgtgccacatgaaaaattaaacacctcacttcgacagggacaaactggctggcactgactggagcatagtaacgacaagtgatggaaagaaatattactatgataataagctaaaggtaaggcctatattatgacataatctcaatattgaatgtctatgtaggtatttcaatgccacgacttcacaagaac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