Os10g0485600
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Structured Information
| Gene Name |
Os10g0485600 |
|---|---|
| Description |
DEAD/DEAH box helicase, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001071433.2 GI:297610683 GeneID:4348944 |
| Length |
12266 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0485600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:18817685..18829950 |
| Sequence Coding Region |
18817685..18817813,18817890..18818066,18818164..18818277,18818768..18818902,18820041..18820172 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:18817685..18829950 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccgacgacgaggctgccgtcctcccgcccccgcctccgctgccgccgccttgccgcccccacaggcagctccgcccgagggggtctcgaccgactgctgataccacccctcgcactagccagttggtggaggtgttcgaggcggcgctgcgggggaacaccatcgcggtgctcgacacggggtccgggaagaccatggtcgccgtcatgctcgcgcgcgagcacgcacgccgggtgcgcgccggggaggcgccgcggcggatcgtggtgttcctcgcgcccaccgtgcacctcgtccatcagcaattcgaggtgattcgtgagtacactgacctcgacgtgatgatgtgctctggagcatcgcgggttggcgaatggggcgccgatcattggaaggaggaagttgggagaaatgagatcgttgttatgacgccacagatactgttggatgctctgcggcatgcttttctgacaatgagtgcagtgagcttgctaatatttgatgaatgtcatcgtgcttgtggaagccatccatatgcacgaataatgaagatatacatcgtagaagatcgaaatgagcttgagagcttttcccctcctacaacaattgtgaacaaatactatgatgcttacatggttgattttgataatctgaaatcaaagcttcagatattttctgatgagtttgattctttgttggttggtcttcaagaatcgccatctaataaatttaaagacaccgataatatcctagagacttcaagaaagagcttgtccagataccatgggaaaatattgtacagcctaaacgatcttggtccaattatcacctctgaggtagtcaaaatacatattgaaagcgttaagccattatgtgattctgaagactgcattttttctaaagctagcttgtgcttacatatgtcttattttaaagaagctttaagtctaatagaggaaattcttccacaaggatatggtgaactaatgaaatcagaatctggttctgaggaattaactaaaaggggatacatttcttcaaaagtgaatacgctaatcaacatcttcaaatcgtttgggtcatcaaatgaagtgctttgcctaattttcgtagacagaattataacagctaaagccgtcgaaaggtttatgagaggaattgttaacttctcttgtttttcaatttcttacttgactggagggagtacatcaaaagatgctctgagtccagcagttcagagatttactttggatttgttccgagctggaaaggtgaacttgctttttacaacagatgtgactgaagagggcgtcgatgtacctaactgttcttgtgtgatacgcttcgacctacccagaactgtttgtagctatgtccaatctcgtggtcgtgctagaaggaacaactcggaatttattcttatgattgagaggggaaacttgcagcagcaagaacacatatttcgtatgatacagactggttactatgttaaaaactgtgcactctatagacaccccaatgctttatcctatgacttgtctatccaagggatgtacacctaccaagttcagtcaactggagcaactataaccgcagattgctgtgtcaacctaattcgtaaatactgtgagaagcttcctaaagataggtatttcatgccaaagccttcctttgaggtgaccattgaagatggattattcaaatgcacattgacgctacctcgaaatgcagcatttcaaagtatagttggccctttaagcagttcaagtaatttatccaagcagcttgtatccctagaggcctgcaagaaattgcatcaactgggagaacttaatgatcatcttgtacctttgactgaagaacctatggatacagatttcactacagcagatgaaaaatgcatatctggaccaggaacaactaaaaggaaggagcttcatggtactacatgtgttcttgctttatcaggaacttggattcatgacagtgaaaatattacactgaatacttacagaattgattttctttgtgaccaagagggtgaaaactatgctgggtttgttctcttaatggaaccagaacttgatgatgatgtggcaccctcaaaaatggatctgttcctgatccctaataaaatggtctacaccactgtaactcctcgcggaaaagttcaactaaacaaaaagcagttaggtaaagggaaattgttccaagaattctttttcaatggaatctttggtagattatttcatggttctcgaaaaagtggagcacaaagggattttattttcaaaaagggtcatgaaatacagtggaacacggaaagcatgtacttgcttttacctttgagggattcttcatatatccaggatgacctaagcatacactgggaagcaattgaatcttgtgctggtgcagttgagcagttgtggagttcgtatcaaggagatgaaaatgtcattcctgtaaattgtattccacaaaaaagaagagggggccaagaagaaattattcatctggccaataagtctcttcattgttccagcatcaaagattcagtcgtgctatcactgcatacaggaaggatatacactgttcttgatttgatcttagacacaactgcagaggactcgtttgatgagatgtatggctccactggcaaacctctgctcatggaaaaagaacaaattcatgctcgggttccacctgaactacttatccatctcgatattttggaagctataacaactttaagatgctgtgagacattttctctggagcgtttagagctgttaggagactccgtgctaaagtatgtggtaggatgtgaccttttcctaaggtatcctatgaaacatgaaggtcagctctctgatatgagatccaaggctgtctgcaatgctacacttcataaacatggaatatggcggtcgttgcagggttatgtacgtgataatgcttttgacccacggcgttgggttgctcctggacagatatcgttgcgcccttttccttgtaactgtggaatcgagactgcatttgttccttctcatagaaggtatatccgagatgacccatctttttttgtgggaaaaccatgtgacagaggtcataggtggatgtgctcaaaaacaatatctgattgtgttgaagcactggttggagcatattatgttggtggtggcattgctgctgcactttgggttatgaggtggtttggaatcgatatcaaatgtgatatgaagctattgcaggaagtgaagttcaatgcatctcatttatgctccttatcaaaaataaatgacattgaggaactggaagcaaaactgaagtacaacttctcagtcaagggccttcttttggaagccataactcatccatctctgcaggaattaggtgttgattactgttaccagcgtcttgaatttcttggtgattctgtgctggatctacttcttacacgtcatctctatgctactcatactgatgttgatcctggagaattaacggatttacgctccgctttggttagtaatgagaattttgcacaagcagttgtaagaaacaacattcacagtcatctacaacatggatccggaatacttttggagcaaattactgaatatgtcaggtcaaatttggagtgtcaagggaaagagagtgaattccttcaacatactacatgtaaagtacctaaggttcttggtgacattatggaaagcatcgctggtgcagtatttatagacaccgattttaatgttgacatggtttgggagattttcgagccattgctttctccactgattacacctgataagcttgcattgccaccttaccgtgagttgctggagctatgcagtcacattggttgcttcttaaattcaaaatgcaccagtaaaggagaagaagtaattatagagatgtcactgcaactacgagatgagctgctggtagcacaagggcatgacagaaacaaaaagagggcaaaggcaaaagcagcatctcgtattttggcagatcttaagcagcaacagggtctttcaattaaacaatgtttgtccaaggctaaacagctggatatcgtgacttcagatcttcagtttgacttgacaagtttgtgcttccactcaaaatggagaaaggtggacctcgaagtgcgcttttcaagctatgcaagattttgcagtggccaatgccagaattcgaatttgtggaacaaaggttcaggactcctattgttatggatggggcgacaacaacaaacttcaatagctttgtttcgacaatcaccttgcacatacctgacgcaacaaccattacatttcaagtgtttggagagattaaagatacgtcttagagaaagcacttggtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MADDEAAVLPPPPPLPPPCRPHRQLRPRGSRPTADTTPRTSQLV EVFEAALRGNTIAVLDTGSGKTMVAVMLAREHARRVRAGEAPRRIVVFLAPTVHLVHQ QFEVIREYTDLDVMMCSGASRVGEWGADHWKEEVGRNEIVVMTPQILLDALRHAFLTM SAVSLLIFDECHRACGSHPYARIMKIYIVEDRNELESFSPPTTIVNKYYDAYMVDFDN LKSKLQIFSDEFDSLLVGLQESPSNKFKDTDNILETSRKSLSRYHGKILYSLNDLGPI ITSEVVKIHIESVKPLCDSEDCIFSKASLCLHMSYFKEALSLIEEILPQGYGELMKSE SGSEELTKRGYISSKVNTLINIFKSFGSSNEVLCLIFVDRIITAKAVERFMRGIVNFS CFSISYLTGGSTSKDALSPAVQRFTLDLFRAGKVNLLFTTDVTEEGVDVPNCSCVIRF DLPRTVCSYVQSRGRARRNNSEFILMIERGNLQQQEHIFRMIQTGYYVKNCALYRHPN ALSYDLSIQGMYTYQVQSTGATITADCCVNLIRKYCEKLPKDRYFMPKPSFEVTIEDG LFKCTLTLPRNAAFQSIVGPLSSSSNLSKQLVSLEACKKLHQLGELNDHLVPLTEEPM DTDFTTADEKCISGPGTTKRKELHGTTCVLALSGTWIHDSENITLNTYRIDFLCDQEG ENYAGFVLLMEPELDDDVAPSKMDLFLIPNKMVYTTVTPRGKVQLNKKQLGKGKLFQE FFFNGIFGRLFHGSRKSGAQRDFIFKKGHEIQWNTESMYLLLPLRDSSYIQDDLSIHW EAIESCAGAVEQLWSSYQGDENVIPVNCIPQKRRGGQEEIIHLANKSLHCSSIKDSVV LSLHTGRIYTVLDLILDTTAEDSFDEMYGSTGKPLLMEKEQIHARVPPELLIHLDILE AITTLRCCETFSLERLELLGDSVLKYVVGCDLFLRYPMKHEGQLSDMRSKAVCNATLH KHGIWRSLQGYVRDNAFDPRRWVAPGQISLRPFPCNCGIETAFVPSHRRYIRDDPSFF VGKPCDRGHRWMCSKTISDCVEALVGAYYVGGGIAAALWVMRWFGIDIKCDMKLLQEV KFNASHLCSLSKINDIEELEAKLKYNFSVKGLLLEAITHPSLQELGVDYCYQRLEFLG DSVLDLLLTRHLYATHTDVDPGELTDLRSALVSNENFAQAVVRNNIHSHLQHGSGILL EQITEYVRSNLECQGKESEFLQHTTCKVPKVLGDIMESIAGAVFIDTDFNVDMVWEIF EPLLSPLITPDKLALPPYRELLELCSHIGCFLNSKCTSKGEEVIIEMSLQLRDELLVA QGHDRNKKRAKAKAASRILADLKQQQGLSIKQCLSKAKQLDIVTSDLQFDLTSLCFHS KWRKVDLEVRFSSYARFCSGQCQNSNLWNKGSGLLLLWMGRQQQTSIALFRQSPCTYL TQQPLHFKCLERLKIRLRESTW</aaseq> |
| Gene Sequence |
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