Os10g0488300
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Structured Information
| Gene Name |
Os10g0488300 |
|---|---|
| Description |
Vps52/Sac2 family protein |
| Version |
NM_001071446.1 GI:115482635 GeneID:4348958 |
| Length |
10254 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0488300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:18943678..18953931 |
| Sequence Coding Region |
18944106..18944179,18944501..18944558,18944995..18945090,18945356..18945457,18945986..18946069 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:18943678..18953931 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MVVVHGQRAEDSFGGFFSFDEDAASEDMSLDGLDEELEEHKDYD VLISILANGEKQRDMATLVEGNLGHAEQDLIQDYVEDSDNLVLLHDQIHDCDIILSQI GSLLTGFQVHIGSINSELRSLQERSLDISVRLKNRKLVETKLAKFVEEIVAPPSLVTV IIDGEINDGYAKSLEILSKKLRFSQVDPMINASNSLKDIKPELERLLQKALCKVSDYL TELFFSMRKPGTNIQILQQNMVQKYRYLILFLREHGSKVYTDVRATYADTMNKVLSAH FQVYIEALEKLKLDIGVSSDLTGYDTNIIDLISRGREHLRNHRFMFSLGERASILKEI DRPGLVPHISEVNPVKYPYEVIFRSIQKLLMDTASSEYLFIKAFFGEESLFYQVFQGP FKVINGHLDHTLRNYHDAVCLMLMICITRKHQLVMLNRRLPCLDAYLDKVLIYLWPRF KTVFDMYLQSLYRCDTKLLWVDGSHPHHIVRCYVEFTASLIQLNAECGDGQLDMNLER LRLAVDNLLGRLAENFANPKTQHLFLLNNYDMTISVLKEAGDEANKLQSYFEEKLESN MISFADELLMEHFKDLIKFVRSRVSEDLILYTECPSIADVEPIVKNFAVTWKTALELM HNEVVTSCSNLLAGMEILKAAMVQLLNDYNRLSECVKIIPGGSTLNRNLVSITSISYE MRKYSITL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>429..502#824..881#1318..1413#1679..1780#2309..2392#3009..3089#3633..3776#3923..4014#4703..4784#5523..5705#6065..6180#6260..6318#6895..6995#7755..7805#7893..8072#9017..9151#9233..9307#9595..9652#9740..10041#gtctccttctcggacaagcctcctccactcccggcctcccgatcgatcgcgactagttccaagcagagatcatcagcagcaggtgggggccgaccgccttagctccccctccccgccgcctggttctcatctggcgtggtatgcgttgagattttgagtaatttgcaccgctgtgaccgactagggctttttttttgatgatttttctctgattccgttgatggagaggcgcgatgtgttggggattggggaggagcaccttcctttttacggatgggaaagtaattgcgctatccccattgcgagatttgcaggcattatccccattgcggaatttgcagtggttgtttttttgttgttgttgttgttttgatcatttgttggtacaactaagaggaaatgtgaccgcagcaacttgtagcagcggcatggtggtcgtccatggacagcgggctgaagactcgtttggtgggtttttctccttcgatgaggacgctgccaggtactacaatcccagttgctttggagtaataatatgtattgtagttcactgcaattctagttttacttctttttttttttcaatataaattgcttggaataaattggtgtaaatgaccatacatgcaaaaatgctttaatctccaaagggtaattctgtggagcttatattaatgcatgtaagtggcatttagccttaaggtctatcaccaagagaaatcgattctagtacataattagtacctctttctcctgtaatctacattttctgtagttgaagtttcctctaactgttggctgtttgttggaacaaatataacagtgaggatatgtcattggatggtttggatgaggaacttgaagagcacaaggattatgatgtaagtttaatggcctttgatatttctccatctccatctgagtatgagagataactgtatagttaccatactttggacccggcgagagttaccatactttgctcagtgctcacattagcatgctagcttcagtcgcttgtttctgagtatgagaaatagatgtatagttaccatatgtcctgctggatataaagtacttattgtgtcatccttagatattatttgatcatttgttcctgtagacacatttattagtagccacaccttccaacaaaattatgtgtggtattttaaggtaaagaagttagtaatcctgcaccttgtttattaaatacctaaatttaacccttagctcaatttcaacatacaattccatgaaaattctttttccatatgcaatcatatcaaatacaatattcttctctgtgttctccaggtattgataagtattctagcgaatggtgaaaaacagagagatatggcaaccttggttgaaggcaacctaggccatgctgaacaggatctgattcaagtatgtgtttctgaaatctaagcatgtgtttgtatgtctgtacgtgtgaattgtgacttacttatggctaccttctattcagtaattgtgtgacatatctaaagggaaatgatcgcactatgattacatcactgtttgttttttcaccactgagataaccgaactgtgatatattgcatatttcaattcctcatttatgatcttttatacatggatatttgcatagagacatctatgtcttagatatgtgtctttacttctacaggattatgttgaagatagtgacaacctggtattattgcatgatcagattcatgactgtgacattattttgtcacagataggatcacttcttactggattccaggtatagtcttgattacatgtttagtaagtgtataataaatgaaaaaagagttatttatgtgactaacgctaggtttgtgtggtatgtttttggatatatgaagtccttgtgcatttgtatgataaagcagtgcttcattattttttcaaagatcataaagctagaattgtttagtcaaagttgcctcttaaaactgatagcttgttagtctggtttacttggtcatacttgcgacacatttacataatcatgtttacggcattacactatattatggcctagaatacagggagtcaggaatccaactgtcactaaaatacttctgagtcaaatgccatttcttcacgggttatttcattttccttttgctacactaggaacttctgattgacttgagagagtgccatttctttacggattacttaattttcttttgttatgctaggaaatacaagttcaatggtatctagaatgagcttgccactacaataaaatcactgcaatatgtgttaataattcaccttgcaggttcacattggttccattaactcagaactaagaagtctccaggagagatccttggatataagtgtcagactgaagaaccgcaaggtacgaacaatcctatatgggcaccctaggacaaaatactgtatttcatttgtgaaaaaacacttggtgtcttgggggatggccgtccgcattacaaatatagattgaatccaacatgtttcgatgcttcaaaacttcccaaataaataacgagtattctaatatttaaaaaacctgcaaaaagtcaatttcatattcatcctacatgtaaagatccaaaaagataagttatactgctagtgtatgataaacaatcccaattgattgctttttttttaatatttctgggtatctagagagaattttacattcagtttttgcaggtttgtataaattatgtgtctacactcgcacattttttaggaattatttaatcattgcaacgtgctgaattcgataggggacctgggcacccatgggcacaaagctgcattcattaatttgttgagaataattagctcaggaatagctagaattggcttagaaattcagttgatcttttttgcttagacattgagtaataaactcccggttaagcatatttgatgaattgatgtggtttagctttgatgattgtttgctaaatacaatgtgcttactgagcttaaatgtacagttggttgagacaaagcttgcaaaatttgtcgaagagattgttgctcctcctagtttggtgactgttattatcgatggagaggtaaacattggacaaatgactttgttactgtggttttgcagtatgataggttccatttgaatgttgcttgcataccacaagtagaagtactccttccgtctcaaaatataagggattttggtgggatgtgacatatcttcctgttcagattcataatactaggatgtgtcacatcccacaaaaatcccttatattatgggacggagggagtaatacatagtaaagatagtatcacttgcatattaagcacacagacattttgtcaaaacgtggcatgtaggtaatggctacttgctttaattgtacacgattgtccaaggagcacaatattagcaacatcccttcaatttctagaaagattccatgttatttagttctcatcaaattactgtagttcttccaaattgttgtgtgttgtattatccatttattctgctgttttagatatgcattaaaacgccaggtacttgttcaaaaaggctttatccctgaattgtaaatatgctagttcaaatgacttgttattctagtttatttttccagataaatgatggttatgctaaaagtttggaaattttgagcaaaaagttgagattttctcaagttgatcctatgattaatgcatcaaattctctgaaggatattaaaccagaactggaaaggcttctacaaaaggcattatgcaaggttacctcaggaacacactcttgggttgctttattgtgcccagagttaatagaaatctgtttgcattcatcataatttatgcctgttatgcactgcttacgttatgatgcttctcactcttttttctatctcatttaccttttcaggtgtccgactatctcactgaattattcttttccatgagaaagcctggaactaatatccagatactgcaacaaaatatggttcaaaaatataggtacacacgatgggaactcttcttctagacagacaagtatgaattatcttttgtgctattaaccagtggcggacgcagctttaaaatatagatggtgcagagagcggagatgttcactcaataagagcaatcaaacataatacatatcgtattggtagttcattcacataactgcctcaattttttaggtgttcacactttgttatacctaattttaatggcccattactactataagggggtaagggggtcttgagagtgtggggtgacacgagttgtagctgagtcggtcgacccaccctgcctaatgggtagatccgcccctgctattaacgttgtttccggtcatatgaagaatctcattgacggtcttcaatgcttgtctcatacttttccttttgatagaactgtactgttacaccatggagctttcaagcattttatcctttaattatttaatgagtcattttcatgcttcagatctgaaactaatgggatagtagggaaaacaatctaagataaactcattaaacaaattaaaacagtacaaatgacacctgctgcaatgaatgctaacatttctattgtcgtcaaaatttgttttttttttcagacggtcatatcacagttccctctgcattttttgtttatttactacagaagcaaattgttgctgaaatggtttcaggtatctcatcctctttcttagagagcatggatccaaggtctacactgatgttcgtgcaacatatgctgatacaatgaa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|
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