Os10g0506200
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os10g0506200 |
|---|---|
| Description |
Similar to Valyl-tRNA synthetase (EC 6.1.1.9) (Valine--tRNA ligase) (ValRS) |
| Version |
NM_001189302.1 GI:297727734 GeneID:9267455 |
| Length |
6874 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0506200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:19811578..19818451 |
| Sequence Coding Region |
19811578..19811586,19812077..19812124,19812236..19812295,19812369..19812538,19812680..19812752 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:19811578..19818451 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:19811578..19818451 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggagaagccactcgatgagaaggagctggaaaggaagctgaagaaagatcagaaggcaagagagaaggaggagaagaggctcaaggcgaagcaaaaggaggcgattaggctacaggcacaagcagcatctgatgaaacaaagaagagcgacaagaaacaaaagaagaaaggcacaccggatgagaatcctgaggatttcgtcgacccggatactcctgctgggcagaagaagctgcttgcttctcaaatggccaaacaatataatccagctgctgttgagaaatcatggtattcttggtgggaatcatctcaatattttgtagcagatgcgacgagttctaaaccaccatttgtaataatcttgccacctcctaatgtaactggggtccttcatataggccatgcgattacagtagcaattgaggatgctatgattcgctggcggaggatgtcgggctataacgctttgtgggttcctggaatggaccatgctggcatagctacacaggtggttgtggaaaaaaggcttatgcgtgacagaaacctgtcaagacatgatctggggcgtgataaatttctattggaggtcctccaatggaaagatcagcatggtggtaccatattgaaacaattacgtacacttggagcctcacttgattggtcacgcgagtgttttacaatggatgagaagagatcaaaagctgtaacagaagcttttatcagactgcacaaagaaggcctaatatatagggataatcgcattgtgaactgggattgctcacttcgtactgcaatttcagatattgaggttgactattgtgaacttacagaagagactttgttagaggtccctggatgtagcactcttgtccagttcggtgttataataaattttgcttatcctctagaggaagggttgggtgaaattatcgttgcaacaacaagaatagaaacaatgcttggtgatactgcaatagctgttcatcctcaggatgaaagatacaagcgtttgcatggaaaacatgctctccatccctttaatggccggaaactcaaaataatttgtgactccaagttagtggatcccagttttggtacaggagctgtcaagatcacgccagctcatgatcttgatgacttcaacactggcaaacgacataaacttgagttcattaatattttcacagatgatgggaacataaatgaaaacggaggtccacaatttgaaggaatgccacgtttcactgctcgggctgctattattgatgcactaaaggcaaagggtctatacagaggcacagaaaataataagatgcgcttgggccgttgttcaagaactaaagatattgtggagccaatgatgaagccccaatggtttgtcgattgtagtactatggcaaaggcagctcttgatgctgtgaaaactaaaaggatcgagatcattccaatacaatacgagcaagactggtatagatggcttgaaaacatacgtgattggtgtatttcaagacagctttggtggggacaccgtataccagcttggtatgtaacgctagaagatgatgaggagaaagacataggttcttacattgatcactggataattgcaagaaatgaaagtgatgcaatcctggaggcaaagcagaggtatccagggaaaaattataagttagaccaagatcctgatgtgctggatacatggttttcatctggtcttttcccattgtctgtgcttggttggccagacagcacagctgatcttagttcattctaccctacttctgtacttgaaactggactggatatcctcttcttttgggtagcacggatggtgatgatgggaatgctacttggtggtgatgtgccatttcagaaggtttacttgcatccaattatccgcgatccacatggccgcaaaatggcgaagtgcctaggaaatgtcattgatcccattgatgtaataaatggtatatcacttgaagatctcgggaaaaagttggaacatggcaatcttgatccaagtgagttagaaaaggcgaaagaaggtcagaagaaggatttccctaatggcattccagagtgtggtactgatgcccttcgttttgccctgatctcctacacttctcagtctgacaaaataaatctggatatcaagagagtgcacggatacagacaatggtgcaataaactgtggaatgccgtccgttttgccatgaacaagcttggagatcaatacactccaccagcggctattgcgttgtgttctatgccacctctctgcaaatggatactctcagcacttaacaaggctgttggcaagactgtttcatcgatggaagcatgtaaattctccgaggccacatcgtctatgtactcttggtggcagtaccaactttgcgatgtatttatagaagccgtaaaaccttacttcaatcaatctcaagagttggaatctgaaagaggtgcttgtcgtgatacattatggatatgtctggataccggtttgcggttgctccacccgttcatgccttacataacggaggagctttggcagcgccttcctcagcctaaagaggcttgtaggaaagattccataatgatatctgagtacccctcagttgttcaggaatggacaaatgatcaagttgaaaatgaaatggagactgtgttggattctgtgaacaagctaagatctcttcggccacatacagatatacatgaaagacggcctgcttttatgctctgccgtggggtagacattgctgccattattcagtgctaccaggcgcagatttcaactcttgcttctgtttcatctcttaagatactgacagaggatgatccaactccacccaactgtgccacaaatattgtcaacaaagatctatccgtatacctccagctacgaggagctctaaacactgaagctgagcgtgagaagctaaggaaaaagcgagatgagattcaaaagcaacacgacaccttgtcgcagaaaatgaatgcctcaggctatcgcgagaaggctcctcagagcaagcaagatgaggacatgaaaaagattgctgcattactggaggaacttgagatcattagagaagccgaaagtgaactagaatcaaacaactga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEKPLDEKELERKLKKDQKAREKEEKRLKAKQKEAIRLQAQAAS DETKKSDKKQKKKGTPDENPEDFVDPDTPAGQKKLLASQMAKQYNPAAVEKSWYSWWE SSQYFVADATSSKPPFVIILPPPNVTGVLHIGHAITVAIEDAMIRWRRMSGYNALWVP GMDHAGIATQVVVEKRLMRDRNLSRHDLGRDKFLLEVLQWKDQHGGTILKQLRTLGAS LDWSRECFTMDEKRSKAVTEAFIRLHKEGLIYRDNRIVNWDCSLRTAISDIEVDYCEL TEETLLEVPGCSTLVQFGVIINFAYPLEEGLGEIIVATTRIETMLGDTAIAVHPQDER YKRLHGKHALHPFNGRKLKIICDSKLVDPSFGTGAVKITPAHDLDDFNTGKRHKLEFI NIFTDDGNINENGGPQFEGMPRFTARAAIIDALKAKGLYRGTENNKMRLGRCSRTKDI VEPMMKPQWFVDCSTMAKAALDAVKTKRIEIIPIQYEQDWYRWLENIRDWCISRQLWW GHRIPAWYVTLEDDEEKDIGSYIDHWIIARNESDAILEAKQRYPGKNYKLDQDPDVLD TWFSSGLFPLSVLGWPDSTADLSSFYPTSVLETGLDILFFWVARMVMMGMLLGGDVPF QKVYLHPIIRDPHGRKMAKCLGNVIDPIDVINGISLEDLGKKLEHGNLDPSELEKAKE GQKKDFPNGIPECGTDALRFALISYTSQSDKINLDIKRVHGYRQWCNKLWNAVRFAMN KLGDQYTPPAAIALCSMPPLCKWILSALNKAVGKTVSSMEACKFSEATSSMYSWWQYQ LCDVFIEAVKPYFNQSQELESERGACRDTLWICLDTGLRLLHPFMPYITEELWQRLPQ PKEACRKDSIMISEYPSVVQEWTNDQVENEMETVLDSVNKLRSLRPHTDIHERRPAFM LCRGVDIAAIIQCYQAQISTLASVSSLKILTEDDPTPPNCATNIVNKDLSVYLQLRGA LNTEAEREKLRKKRDEIQKQHDTLSQKMNASGYREKAPQSKQDEDMKKIAALLEELEI IREAESELESNN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..9#500..547#659..718#792..961#1103..1175#1335..1400#1491..1574#1756..1833#1928..2011#2368..2447#2597..2654#2739..3041#3167..3337#3820..4010#4109..4511#4767..5018#5099..5596#5879..5976#6120..6219#6459..6604#6718..6874#atggagaaggtgagtgctcgtataatatactccctccttccctaaatgtttaacgctgctgacttttttaaacatgtttgaccatttgtcttatttaaaaaattatataaaatatgtaaaactatatgtatacataaaagtatatttaacaataaattaaatgatagaaaaagaattaataattacttaaatttttcaaataagacgaacggtcaaacatttttaaaaaagtcaatggtgtcaaacattttgggatggagggagtattagattagaaatttcttgtgggagtgctcgtatgtttgtctggtacgcaagcagtaagattgaatggcttaattaataatacctacagtacacacaatagattaaaaacaaacaatgtagcttgtatttctgcgttagcattgcgctgctttggttaattcctcgcaaaaacagctctttgttttggtctgatgcatttgatatgatgttgtgtgttggtggcttggtgcagccactcgatgagaaggagctggaaaggaagctgaagaaagatcagaaggtactcactctagtaggattgctgttatgtacttctgttaacaattcaaaggaatcgtgtccagttcaccagttgtttggtgtatgaataagtgtgttatgtatgtaataggcaagagagaaggaggagaagaggctcaaggcgaagcaaaaggaggcgattaggctacaggtgttaaaaataatccctgctcagataaatgtgttttactgtcaattctttgtattgatgtggttgtctgcaggcacaagcagcatctgatgaaacaaagaagagcgacaagaaacaaaagaagaaaggcacaccggatgagaatcctgaggatttcgtcgacccggatactcctgctgggcagaagaagctgcttgcttctcaaatggccaaacaatataatccagctgctgttgagaaatcgtaccgcctctcttgctttattcctcgatttaatttattttcaatgaggatatatctttcatatcgttagaaccttaggaattcataacatgaaatttctcacttatctgtccttttttccggtatgttgttttcatgtagatggtattcttggtgggaatcatctcaatattttgtagcagatgcgacgagttctaaaccaccatttgtaatagtaagtccactataatgcaaagagtgcatgattatatatttgtattcaggataaatactttatcatgattactgtgtgagtagtatgtcctatatgaaatacacaattgaagctttatttctacttctcattttgcatttgcaatgtttatttttccagatcttgccacctcctaatgtaactggggtccttcatataggccatgcgattacagtagcaattgaggtatttattgattgattctcctgtttattcattggccatataagcatcagtattgatgtctttttggttgttgcatcgtgaacaattcaggatgctatgattcgctggcggaggatgtcgggctataacgctttgtgggttcctggaatggaccatgctggcatagctacacaggtctgtcatgcatataacatatatatggtatctgtttctaacatataacctctacaggaattattgttaacttgaatacaaattgacttttgctgaaacatcacattgattgttaaccaactttctgttttagtttttaagggtagcaggctttatgtaacaaaatttctcttcatatcaggtggttgtggaaaaaaggcttatgcgtgacagaaacctgtcaagacatgatctggggcgtgataaatttctattggaggtaatcatttttttcttacctattgcatattgtattaacttcacagttagtttcatttttatttatttttttcattcttcaatcttcttggcaggtcctccaatggaaagatcagcatggtggtaccatattgaaacaattacgtacacttggagcctcacttgattggtcacgcgaggtataatttgttttgatttcccctaaggttgtagacagccagaggagagcaccatttatatctaagcaatatattttgttgaataaatatgacaaaactccagacattatggttcagattgcacaaaaccacatgttttttggcatgttgcacataaccaaaggcattatggtcctataattggttaatggtgtggtttagtgaaatcttaataccataatatttgtggttatgtgcgatgtgccaaaactctgagttttgtgcaacttgaaccatacctggggtatataaaatgtattcatatattgttttgctttgttgttaaatagtattgattttcttgcaacttgtttcagtgttttacaatggatgagaagagatcaaaagctgtaacagaagcttttatcagactgcacaaagaaggcctaatatataggtcagtgtcaaaatatcgttgaatgtgtagtttaactttctatatttgttctgcttcagtaattttctattcgaattgtgtgtttcttagtttatgttttcttactgcagcacatcttactttgtaaattctgtatgatttacttgcagggataatcgcattgtgaactgggattgctcacttcgtactgcaatttcagatattgaggtatacgatacttctaatatgattaacattttgatttgttgatgaggaggattgtatttttatgttttgctcgctacttttcaggttgactattgtgaacttacagaagagactttgttagaggtccctggatgtagcactcttgtccagttcggtgttataataaattttgcttatcctctagaggaagggttgggtgaaattatcgttgcaacaacaagaatagaaacaatgcttggtgatactgcaatagctgttcatcctcaggatgaaagatacaagcgtttgcatggaaaacatgctctccatccctttaatggccggaaactcaaaataatttgtgactccaagttagtggatcccagttttggtacaggagctgtcaaggtaagtgtactcactgaaggagtgtctcgtatatcttaattttattttccatacctggattgattatattcatcaatcagcaagctcttatttcttttttctattttgctgttgtttccatacagatcacgccagctcatgatcttgatgacttcaacactggcaaacgacataaacttgagttcattaatattttcacagatgatgggaacataaatgaaaacggaggtccacaatttgaaggaatgccacgtttcactgctcgggctgctattattgatgcactaaaggcaaaggtattattagattatttagttttccatttccttttctaattaattcctcgatggtattgtagtctctcacaatttcagatggtttattatcatgctttttatggaatttattttacatttatcttctctctctctctctctctctttctctctctctcaatggtgcattgatgtattgtcactttgtcactttattagtttctcacaatgaaatactattgttctctatgaaaaacattatgatattgggatactgttgagtgttgctattatgttctgaaagcatctagagtatggttaagctatgaatataccattcagctttgttcttgagttggcatactgattaatcttttagttttatttggaaatttcatcttgttgcctgcttaactatctttcatgtgccaccagtactttcctgtattctattgtcttagaagaaatgccaaattacaatcatttacaccttttcaattaagggtctatacagaggcacagaaaataataagatgcgcttgggccgttgttcaagaactaaagatattgtggagccaatgatgaagccccaatggtttgtcgattgtagtactatggcaaaggcagctcttgatgctgtgaaaactaaaaggatcgagatcattccaatacaatacgagcaagactggtataggtatatcctattttcttttctttaggaaaacataattggtaaatcgcaacattggatagtagaataacccattcacttctactgttctgtggtaacagatggcttgaaaacatacgtgattggtgtatttcaagacagctttggtggggacaccgtataccagcttggtatgtaacgctagaagatgatgaggagaaagacataggttcttacattgatcactggataattgcaagaaatgaaagtgatgcaatcctggaggcaaagcagaggtatccagggaaaaattataagttagaccaagatcctgatgtgctggatacatggttttcatctggtcttttcccattgtctgtgcttggttggccagacagcacagctgatcttagttcattctaccctacttctgtacttgaaactggactggatatcctcttcttttgggtagcacggatggtgatgatgggaatgctacttggtggtgatgtgccatttcagaaggtaatatttaggttatttcattcttaaatagttcttggtcaaatctgttagattctagtgatagtgatagttcagtatgattgccttctaaaattatttgatatcattttaagtttggtaacttagcttttggtccttgtcgaatcatgttaacttttctatgctaaaaatgaatcaatcattaacacgcggttagaaacttcacaagtactagtaatttttaaaccgtgactcatgactgcttatctgtctcaggtttacttgcatccaattatccgcgatccacatggccgcaaaatggcgaagtgcctaggaaatgtcattgatcccattgatgtaataaatggtatatcacttgaagatctcgggaaaaagttggaacatggcaatcttgatccaagtgagttagaaaaggcgaaagaaggtcagaagaaggatttccctaatggcattccagagtgtggtactgatgcccttcgttttgccctgatctcctacacttctcaggtaaattttcccaccagcttttgttgttccttttactgttagtaaaaatttcttgtagtaacatttcttgtcttgttcagtctgacaaaataaatctggatatcaagagagtgcacggatacagacaatggtgcaataaactgtggaatgccgtccgttttgccatgaacaagcttggagatcaatacactccaccagcggctattgcgttgtgttctatgccacctctctgcaaatggatactctcagcacttaacaaggctgttggcaagactgtttcatcgatggaagcatgtaaattctccgaggccacatcgtctatgtactcttggtggcagtaccaactttgcgatgtatttatagaagccgtaaaaccttacttcaatcaatctcaagagttggaatctgaaagaggtgcttgtcgtgatacattatggatatgtctggataccggtttgcggttgctccacccgttcatgccttacataacggaggagctttggcagcgccttcctcagcctaaagaggcttgtaggaaagattccataatgatatctgagtacccctcagttgttcaggtaaatacatacttcgtactgactttggaaaaaaaaatgaattcttctagcttgtaacttttcagagatcagtatggtagagtcctattgcataacgattaaaagcaaaccactgtaaattctagcactataatcaatatatgtaaaaatgatgaagaaatgattaatgcattgtctgcctcagttggagagaccatagatttaagaaattctgcaatcctatgaaaaaaaaaattctgcaatgcctattttgactagaggttttcttttgacggatgacaggaatggacaaatgatcaagttgaaaatgaaatggagactgtgttggattctgtgaacaagctaagatctcttcggccacatacagatatacatgaaaggtatgcttatgttcaccagatgtatattcttttggtgtgcttcaagactgtcacttcctttttatagttttattcttattttgattcataagaatttgttcattttgaagctaataccttctgccctattttcatctggacagacggcctgcttttatgctctgccgtggggtagacattgctgccattattcagtgctaccaggcgcagatttcaactcttgcttctgtttcatctcttaaggtttgctcggtcttatacctctctggctctctcaactcggccactcacctcaagtcactgtttatgaatgccttgttcttgatggataatggcataatttctatttctatttcaattcaattcactcgagttttgtctacagatgtgcttatatttttgctaatatattttatgtctaaaatgcctaaaaagccaaaaaaaaaggagggaaaaaactgattcaaagggaacttttgcagatactgacagaggatgatccaactccacccaactgtgccacaaatattgtcaacaaagatctatccgtatacctccagctacgaggagctctaaacactgaagctgagcgtgagaagctaaggaaaaagcgagatgagattcaaaagtaagtgccctgttaaaccatctgaacataaatttgaacgaaccaatttgaacataaatgaaatttgtagttttgttagtggtaagacgttctatttcccactgtaattgcaggcaacacgacaccttgtcgcagaaaatgaatgcctcaggctatcgcgagaaggctcctcagagcaagcaagatgaggacatgaaaaagattgctgcattactggaggaacttgagatcattagagaagccgaaagtgaactagaatcaaacaactga</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
