Os11g0132600
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os11g0132600 |
|---|---|
| Description |
Similar to Arabinoxylan arabinofuranohydrolase isoenzyme AXAH-II |
| Version |
NM_001072196.1 GI:115484004 GeneID:4349687 |
| Length |
7679 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0132600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:1465944..1473622 |
| Sequence Coding Region |
1466573..1466746,1467222..1467276,1467927..1468123,1468479..1468600,1468685..1468832 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:1465944..1473622 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008404:1465944..1473622 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggtttcgaagaaacatatttttctgccttctgttacttgcttcttttctctgtcagctggaaatgccaagctgcagaactggacatggctcagacagcagtactcgaagttgatgcttcatggaacctttctcgaaagatccctgacacgctatttggattgtttttcgaggaaattaaccatgccggagctggtgggatatgggcggagcttgtcagtaacagagggtttgaagctggagggccccacaccccttcaaatattgacccatggtctatcattggagatgaatcctctatatacgtcacgactgattgctcatcttgtttccgccaaaatattgttgctctaaggatggagattctctgtgataattgtccagccggcggtgtcggcatttacaacccaggattctggggcatgaatatagaagaaggaaaagcctataatctagtcatgtatatcagatcattagaatcagtcgaattgacagcttcgctcacatgctcagatggaatgcaaaatctggcatcagtttctatacaaggtattgatctgtcaaattggacaaagatagagttgcaattactagctgaaggaacatgcagaacttcaagacttgaattaacaagtatgaaaaagggaataatttggtttgatcaagtgtcactcatgccttcagacacatacaagggccatggctttcgcaaggaactactatacatgcttttggaattaaaaccacagttcctacgctttcctggggggtgctttgttgaaggcgattggttaagaaatgctttcaggtggagggaaactattggtccctgggaacagagacctgggcactttggagatgtttggaattattggaccgatgatggcctaggatattacgagtttctccagctttctgaagacctgggtgctgcccctatttgggtgttcaatgttgggatcagccaccatgatgaagtcgataccaccataattgaaccttttgttaaggatgtattggatagtcttgaatttgcaagggggagagcagaatcgacatggggttctgttagagctgcaatggggcatccagaacggttcccactgaagtatgttgctattggaaatgaagattgtgacaagggattttaccgaggaaattacctcaagttttatgatgctatacgcaaggcctatccggatattcaaatgatttcaaactgtgatggatcatctaggccacttgatcatcctgctgatttatacgatttccatgtctataccagtgctgctaatctttttatcatgaagaataagtttgataggacatcacgcattgggtctaaggtatttgtcagtgagtatgctgtcaatgaacaaagggatgctggtaaaggaagccttcttgcttcactggctgaggctgctttccttactgggttagagaaaaatagtgatcttgttcagatggcaagctatgcaccgctcttcgtaaatgacaatgaccgcacctggaacccagatgcaattgtattcaattcctggcaacagtatggcactcctagttattggatgcaaacatatttccgtgaatcaagtggttctgtgattcatccaattacgatcggttccagctactccgattcactggctgcatctgcaatcacctggaaagacacacatgatatctttctgagaataaagatagtaaactttgggccaaatgctgttaacctcgcaatatcttcaagaggacttcaagctggcgtcaatacggcaaaatcaactgtgactgttctcacatccggcaatttgctggatgaaaattcatttgctgaaccaaacaaagtcgtaccggttaaaagcgagctgccagatgcttcagaagagatggaagcagcgctctctccttattcattcacttcatttgacctcgctctagatcagtacagcaagctcgtggcagagatgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGFEETYFSAFCYLLLFSVSWKCQAAELDMAQTAVLEVDASWNL SRKIPDTLFGLFFEEINHAGAGGIWAELVSNRGFEAGGPHTPSNIDPWSIIGDESSIY VTTDCSSCFRQNIVALRMEILCDNCPAGGVGIYNPGFWGMNIEEGKAYNLVMYIRSLE SVELTASLTCSDGMQNLASVSIQGIDLSNWTKIELQLLAEGTCRTSRLELTSMKKGII WFDQVSLMPSDTYKGHGFRKELLYMLLELKPQFLRFPGGCFVEGDWLRNAFRWRETIG PWEQRPGHFGDVWNYWTDDGLGYYEFLQLSEDLGAAPIWVFNVGISHHDEVDTTIIEP FVKDVLDSLEFARGRAESTWGSVRAAMGHPERFPLKYVAIGNEDCDKGFYRGNYLKFY DAIRKAYPDIQMISNCDGSSRPLDHPADLYDFHVYTSAANLFIMKNKFDRTSRIGSKV FVSEYAVNEQRDAGKGSLLASLAEAAFLTGLEKNSDLVQMASYAPLFVNDNDRTWNPD AIVFNSWQQYGTPSYWMQTYFRESSGSVIHPITIGSSYSDSLAASAITWKDTHDIFLR IKIVNFGPNAVNLAISSRGLQAGVNTAKSTVTVLTSGNLLDENSFAEPNKVVPVKSEL PDASEEMEAALSPYSFTSFDLALDQYSKLVAEM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>630..803#1279..1333#1984..2180#2536..2657#2742..2889#3320..3389#3973..4118#4215..4260#4361..4413#4569..4713#5189..5307#5423..5494#5924..6030#6343..6399#6491..6683#6872..7015#7334..7459#gtcacgttatgatgtagctcagctcacacttgtcttgttcatagcatgagcatcgcacgcctatttaaagatgctatagcttcgattccctcctgagctctaacactatcgaagcttcacaaattcagttgacgaattgtagctgttctctctcgtctccaagtgttggaggcaaaggaatccttcgatccataggttcaaatctctctctcctccactcttctgaccctgatcttgttgtgcggttgaaatgttcgacgaaatgcctgagagaaccactctgctttcccttctgctgttggttctctgcatgatagattcgtctctgtttcttcttttctaaggaaaattttgtggggtttcactgaaatttggatggtttactggtgactactgacgcttttttggagttccctttgtaagtgcttggttgtggatttatgtttctgtaactggcagtttcgattttcatgtaggtctgatccaatgatacctattgttttctcttcagtttcttgctgttaaacgattcaatctatattgttctcatccctttattgttactgcgcttactctatgatctatgggctgaattagtgtttatcggcaggcaggacgcaggacagagaatgggtttcgaagaaacatatttttctgccttctgttacttgcttcttttctctgtcagctggaaatgccaagctgcagaactggacatggctcagacagcagtactcgaagttgatgcttcatggaacctttctcgaaagatccctgacacgctatttggattgtttttcgaggtcaggctttgcttatttagcttctggttcagtacatccttctcgcatcactcccacgggcactagaactgatatcaggatcggctcaataacttaatgaaccttacctgggggatgcataaatgcatctagtattttcagtcgaatttaccgttgttcacacttcacactgcagcacgttgtactagctatgatgagatttaataaatcttcatgcccatcttctgcttggtttcagaaaataactcctattctgtacatgttttctcctgcgccggtgtattatagttccattttcttctgtggatggcggtgttgaaatttttatgcattacttgggaagaggagggattggggtggggtgtgtgaagatttcttttgttggcccttgttatattcattacatgttcgctgcaatttgaatattctagattatcctcgacagtcatgataactggatcggtgaacatcacaggaaattaaccatgccggagctggtgggatatgggcggagcttgtcagtaacagaggtaactgtcagcttgataatcatgcctcttggttcccttggaagctatgagaaatgaatggatgcacttgactaagttgcagatttgttacatggaaatagatatatcagtcctaaaaagcaatgagtcattgtactgcctacttgtcagagagagagagagagagagtagcattttaccagtggcatacagtgtagatttacttcataatagatgttcttaggttaataggtctaatagtcaatgaaggaaaataaattataaagtgaaccttttcatgtgatagacaactcctcttttacaaggacaatatagaactccatgtcaggatccagaaccatggtattatacttcttgtaaaagagattaagagcaaacttccctcctaaatgaaatgatatgcatcactcctccttattcatgagaaaaaaatatcaactctcgtcaagagtatttattatgtttatccttattcatattgataactgaaatcagtttgcctaacttctattggcttctagctagagaacagaataggctaaagctcagcactaaaacctagaaaatgaaacaaaagaatctgtgctttataaatttccattaacattgaagtattgccttcactgactaatgcaaaatttatacttcagggtttgaagctggagggccccacaccccttcaaatattgacccatggtctatcattggagatgaatcctctatatacgtcacgactgattgctcatcttgtttccgccaaaatattgttgctctaaggatggagattctctgtgataattgtccagccggcggtgtcggcatttacaacccaggattctggggcatggtatgagactctgtcaacgaaaaataactcacagtccaaataatcttttcttctaaatgacagtttacactgtacacactgtcacttacagaaaatacagcaaaattatcatttatcttccaaaaagtgaaactaacaaatagctaagctaaccctttttttttttggtttcagttcatgttgatctttttctgacgtagtgttggctttctatccaatggttgcatgttgcttacttggaaaatgaataactgttctagttttttcttcaaaccatttccacttttatcttctgtttgttttctgggattttaccttctgattatttgaagaatctgttcatttcaacttccagaatatagaagaaggaaaagcctataatctagtcatgtatatcagatcattagaatcagtcgaattgacagcttcgctcacatgctcagatggaatgcaaaatctggcatcagtttctatacagtatgtatctttgccatagaaataaataattgttaatgtcttctttgtttaagattgaaaggattgcatattgaaatgttgcagaggtattgatctgtcaaattggacaaagatagagttgcaattactagctgaaggaacatgcagaacttcaagacttgaattaacaagtatgaaaaagggaataatttggtttgatcaagtgtcactcatgccttcagacacatacaaggttcatcgcattttcatcttgctagtggctactgaccatcatagaagcatgctttgctctgggagcagccactgaatatatatatatatatatatatattttttgactgggcagccactgaatattcatgaagaaaatatagtaactagaatactcgaaaagataaagcaacgatgcactgctttgagatgcagatatgtgtactagcagaattataaagtattcataagtacataacaaacatgttggttcaatctcattgctaattaataagtcataataaaattttatattcattttgaaaaaaaactggaaataaaatctatccctcctttctttattggcagaccatgattattagtttacaacattttttaatgggaattttctagcaatatttgttaatgggcattttctgctatatgtacagggccatggctttcgcaaggaactactatacatgcttttggaattaaaaccacagttcctacgctttcctggtatttcttgttccctaaccaaaataaactattaggggctttgaacatatgccttggtttttcgcatatttacgatcactgtattatatccagttatttctcgttaaacttcaaccctatattcctttttaaaaaattcgaggtcatattctaactagaattaggaaaaaaaaactaatatccaggtaactaaaaataaatcaaacgtgcactttatgatgtctgccagaggaattaataaggacttgctatcataatataacagaaatacattgtattttactttgtgatgttaatctaaatcattgctgggataggaacaagcattaataatcaagactctagagtaaagcattaaaaagttgaattagtacaaaacagcatgttagacatatatacatataatttttagataacataacatatagataactgttcgtctgtttgtccctaacagttatagatttacctatatttgcatatgatttccataatatcctagatagtgataacttgtagtaactaacttctgaacaagtccatatatgtctcaatcaaaaactttatatgacacttttgataggggggtgctttgttgaaggcgattggttaagaaatgctttcaggtggagggaaactattggtccctgggaacagagacctgggcactttggagatgtttggaattattggaccgatgatggcctaggatattacgagtttctccaggtgtatgttagttaatgccatctgagtgtttttttttcatctcttctgctatcaacatatctaacgaaatatttctaccgaaattttcatggaaagctttctgaagacctgggtgctgcccctatttgggtgttcaatgttggtaatacattattcttatttatatttttcttgttttaccatatgttttcttatcgctagcatgcccattaactgcttacagtttttatcttgaaatttagggatcagccaccatgatgaagtcgataccaccataattgaaccttttgttaaggtacgttaaatgcccaagtaagaatagtcatccaaatataactgggtagagggttactacggttccatttttccttattgcagatgccatcattgcaaaacaaaatgttgttctatgcatatgccattgtttcaagtttttttttcttattataggatgtattggatagtcttgaatttgcaagggggagagcagaatcgacatggggttctgttagagctgcaatggggcatccagaacggttcccactgaagtatgttgctattggaaatgaagattgtgacaagggattttaccgaggtatatttttattaaccagagcttgtcatgctaatgatcccatttgttgtcaatgccatagttgttctcattagttttcaatagacacatctataggctaaaatgatgtgatggccaagtataattaacacaaaatctcttatcatttatgtctgcatatctaaaaccgcttattttccttcttcgttcccctttttctttgtttgtatgccatcattacttggagtcaactacagttatgaaaaaataatttcacccttacaaataagcataataaaaatataaacatttgtaataaataatagatgaaaatagaatgtatgtaacttttagccatttattgtaccagtttccgaggatacattttctttgcacatgaagttataattgctcataaccttcagagttactatagccttcactaatttcatgaaagtactagagagccatgacggttttcaatcctattgtacaggaaattacctcaagttttatgatgctatacgcaaggcctatccggatattcaaatgatttcaaactgtgatggatcatctaggccacttgatcatcctgctgatttatacgatttccatgtaatcttctttcatcagaaaatattctccattttcactttttaaatactgtttcatgatttcgacatacttctcattgtgttttcattaagatgcattctgacatttttttcaggtctataccagtgctgctaatctttttatcatgaagaataagtttgataggacatcacgcattgggtctaaggtattttttaatccttatttggatagtatgggtctctgggatttctggccatcatggtccatccaaaacatgacctttgtttttgtgatttattctggcaatagatatatccttaaaatactgatataaaggttggccttaaataggcctatcttcctaattttggtagaatatttttaggacattgtttcttccatattattctacctgaagttggtttcttcatttatttaagtttctttagaaattatattgaagtcataattttatacgtgcaaattcaatcaatggtgttgtagtgtcaactgtcacaacactctggaaggctttgtttctctgtaccattacagttctcttgcatctcgacatcctaggatattggatacacagaaagtagtcattaatgactatgctataatcttattccaggtatttgtcagtgagtatgctgtcaatgaacaaagggatgctggtaaaggaagccttcttgcttcactggctgaggctgctttccttactgggttagagaaaaataggtgatctccttcacttcatactttccttgaataatctctctctccatattcttgggctagctgaaatgctgaatcatgcatgcggctgtatttagatcatccatgacttttccaggataaatgtcaatattgtcatgaataattactagtttatgaccctgtttagataattaaatttgaattgaggggataaaagtttgtttttcagaaattacaagataacatgtacacatgttgtaaatactaatactgagcagcaaaaatactctccatcatgaataaattaaaagtttctgtcatgtttctttgcagtgatcttgttcagatggcaagctatgcaccgctcttcgtaaatgacaatgaccgcacgttagtacctttggctttgccttttttattttctaacattcttcttgttcacaagtgcttgagtttgactagctctgaatgtgatgatcagctggaacccagatgcaattgtattcaattcctggcaacagtatggcactcctagttattggatgcaaacatatttccgtgaatcaagtggttctgtgattcatccaattacgatcggttccagctactccgattcactggctgcatctgcaatcacctggaaagacacacatgatatctttctgagaataaaggtagttaaccattccatttttttcctaacttgcataccattgcagcaattcattagcgaattacctaaatgttttgaatgatttagttacaacaatataaagcgatataaaactgattgagccactgcatacttgcacatctgtttggattttagaagatatattcatcttcaaaagatcttctgcagatagtaaactttgggccaaatgctgttaacctcgcaatatcttcaagaggacttcaagctggcgtcaatacggcaaaatcaactgtgactgttctcacatccggcaatttgctggatgaaaattcatttgctgaaccaaacaaagtaagacaaccattggttggatcacaagttatttgtttcataactatgcactgaattagtgaatttagcagagggtaagtttaccattacaactttatagaatgcacacatatgcaagccgtatgtcgtaagcaaactctgtctttcagctttatttgtaagcttttaagaaattgtttatttagctgtctggaattattctctagtctttctcgataattttttcgcagacagggtcaatctcagtgtggcacacgatattctcaggtgttggcgagttcatctaacgtacaagtatcttgtgaacgatggatgcaggtcgtaccggttaaaagcgagctgccagatgcttcagaagagatggaagcagcgctctctccttattcattcacttcatttgacctcgctctagatcagtacagcaagctcgtggcagagatgtgaagcaatgatgcacacttataccagagaatagaacacaggatgattacgtgaggtgtggtacctgaatttcagaaagctaacagagtgtatatactgcattctggcatttgctaatcacacttcgtgtgaccctgttgtttatgacgctgtaagagtagtttaaggttgtcacattatcgaacctagcggtaacgctaattaatatcattgtcaataagct</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
