Os11g0186400

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Structured Information

Gene Name	Os11g0186400
Description	Similar to DNA polymerase delta catalytic subunit (EC 2.7.7.7)
Version	NM_001073937.1 GI:115484522 GeneID:4349968
Length	10297 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os11g0186400, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 11
Location	Chromosome 11:4370722..4381018
Sequence Coding Region	4371045..4371132,4371239..4371326,4371407..4371480,4371812..4371972,4372045..4372134 ,4372218..4372292,4372381..4372452,4372531..4372703,4372776..4372890 ,4373086..4373199,4373394..4373473,4373567..4373654,4373753..4373809 ,4373923..4373988,4374066..4374161,4374271..4374378,4374753..4374851 ,4374920..4375039,4375752..4375838,4376088..4376159,4376255..4376321 ,4377267..4377358,4377443..4377520,4377597..4377734,4377841..4377976 ,4378064..4378259,4378502..4378661,4378762..4378868,4378961..4379071 ,4380662..4380971
Expression	GEO Profiles:Os11g0186400
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008404:4370722..4381018 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008404:4370722..4381018 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgagctcaggcggacgcggcggcaagcggcgaggggcgccgcccccggggccatccggggcggcggcgaagcgggcccaccccggtggcaccccgcagccgcctccgcccgccgcgacggcggcggcgcccgtggcggaggaggaggacatgatggacgaggacgtcttcctcgacgagaccatcctggcggaggacgaggaggcgttgctgctgctcgaccgggacgaggccctcgcctcacgcctctcccgctggaggcgccccgcgctccccgccgacctagcgtccggctgctcgcgcaatgttgcttttcagcagctggagatagattatgttattggtgagagccacaaagtactgctccccaactcatctggtcctgcagctatactcaggatatttggcgtaactagagaaggtcacagtgtatgctgccaagtgcatggatttgagccatatttctacatcagttgtccaatggggatgggccctgatgatatttcacgcttccaccaaacactagaggggaggatgaaggattcaaataggaacagcaacgtgccaaggtttgtgaagagaatcgaacttgtgcagaagcagacaatcatgcattaccaaccacagcaatctcagcctttcctcaagatagtggttgctttgccaacaatggttgctagttgtcgcggcatcctggaaaggggcataacaattgaaggccttggttcgaagagttttctgacatatgaaagcaacattctttttgcacttcgcttcatgattgactgcaatattgttggtggtaattggattgaagttcctgccggaaagtatatgaaggcagctcgtatcatgtcctattgtcagctagagttggattgcctatattcggatttggtaagccatgctgctgaaggagaacattctaagatggctccatttcgcatattaagttttgatattgaatgtgccggtcgcaaaggtcacttcccagaaccaactcatgatcccgttattcagatagctaacttggtcacccttcaaggagaaggacaaccttttgtacgcaatgttatgacgcttaaatcatgttctcccattgttggagttgatgttatgtcatttgacacagagagggatgttctacttgcttggagggatttcatacgtgaagtggaccctgatattattattggatacaatatctgcaaatttgacttaccctatcttattgagagagctgaagttcttaagatagtagagtttccaatacttggacgaatcagaaatagtcgtgttcgtgtccgtgacacaactttctcttcaaggcaatatggtatgcgtgaaagtaaagatgtagcagtggaaggaagagtacaatttgatcttctgcaggctatgcaacgggattacaagcttagttcttattcattaaactctgtatctgcacatttcctcggggagcaaaaagaggatgttcatcactcaattatatctgatcttcaaaatgggaattcagagacacgaagacggcttgcggtttattgtttgaaggatgcctatcttccacaacgactgctagataagttgatgtatatctacaactatgtggaaatggcaagagtcactggagttcccatttcatttcttctttcaaggggacagagcattaaggtcctctcacagctactcaggaaagcaaaacagaaaaaccttgttataccaaatataaagggtcaagcgtctggacaggatacctttgaaggtgcaactgttttggaggcaagggctggattttatgagaaacccattgcgactttggactttgcttcgttgtatccatccatcatgatggcatataacctatgctactgtactttggtcccccctgaggatgcccgcaaactcaacctgcctccagaaagtgtcaacaaaaccccatctggtgaaacatttgtgaaaccagatgtgcaaaagggtatacttcctgaaatccttgaagaattgttggctgctcggaaaagggcgaaagcagatttgaaggaagcaaaggatccatttgaaagggccgttcttgatggtcgtcagcttgccctaaaaataagcgcaaactctgtctatggttttactggagcgactgttggtcaattaccttgtttagaaatttcttcaagtgtgaccagctatggtcgacagatgattgaacatacaaaaaagcttgttgaagataaattcacgacacttggaggctatgagcacaatgcagaggtcatctatggagatactgattctgtaatggtacagttcggtgtttctactgttgaggacgcaatgaagctaggaagagaagctgcagactacattagtggaacatttattaagcccatcaagcttgagtttgagaagatctatttcccttatctactgattagcaagaagagatatgctggtttgtactggacaaatcctgagaaatttgacaaaatggacacgaaaggtattgaaacagtgagaagggacaactgtttattagtaaagaacctggttactgagtgccttcataaaatactagtggacagagatgttcctggtgcagttcaatatgtcaagaacaccatttctgatctactaatgaaccgtgtagacttatctcttctagttataacaaagggtttgactaaaacaggagaggattatgctgtcaaagctgcccatgtggagcttgctgagagaatgcgaaagagggacgctgctactgctcctactgttggtgaccgggttccttatgttataatcaaagcagcaaaaggggcaaaggcatatgagaggtcagaagatcctatttatgttttggataataacataccaatagatccccaatactaccttgagaaccaaatcagcaaaccacttttgaggatctttgagccgattctgaagaatgccagtagagagctgcttcatggaagtcacaccagggctgtttcaatctcaactccttcaaatagtggaataatgaaatttgcaaagaaacaattgacatgcctcggatgcaaagcagttataagtggttccaatcaaacgctttgctttcattgcaagggaagagaagcagagttatactgcaaaactgtaggaaacgtttctgagctggagatgctctttgggaggctctggacgcagtgccaggagtgccaaggctcccttcatcaggacgttctctgcacaagccgggattgtcctattttctaccgccgaagaaaggcgcagaaggatatggctgaagctagagtacagcttcaacgttgggacttctga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MSSGGRGGKRRGAPPPGPSGAAAKRAHPGGTPQPPPPAATAAAP VAEEEDMMDEDVFLDETILAEDEEALLLLDRDEALASRLSRWRRPALPADLASGCSRN VAFQQLEIDYVIGESHKVLLPNSSGPAAILRIFGVTREGHSVCCQVHGFEPYFYISCP MGMGPDDISRFHQTLEGRMKDSNRNSNVPRFVKRIELVQKQTIMHYQPQQSQPFLKIV VALPTMVASCRGILERGITIEGLGSKSFLTYESNILFALRFMIDCNIVGGNWIEVPAG KYMKAARIMSYCQLELDCLYSDLVSHAAEGEHSKMAPFRILSFDIECAGRKGHFPEPT HDPVIQIANLVTLQGEGQPFVRNVMTLKSCSPIVGVDVMSFDTERDVLLAWRDFIREV DPDIIIGYNICKFDLPYLIERAEVLKIVEFPILGRIRNSRVRVRDTTFSSRQYGMRES KDVAVEGRVQFDLLQAMQRDYKLSSYSLNSVSAHFLGEQKEDVHHSIISDLQNGNSET RRRLAVYCLKDAYLPQRLLDKLMYIYNYVEMARVTGVPISFLLSRGQSIKVLSQLLRK AKQKNLVIPNIKGQASGQDTFEGATVLEARAGFYEKPIATLDFASLYPSIMMAYNLCY CTLVPPEDARKLNLPPESVNKTPSGETFVKPDVQKGILPEILEELLAARKRAKADLKE AKDPFERAVLDGRQLALKISANSVYGFTGATVGQLPCLEISSSVTSYGRQMIEHTKKL VEDKFTTLGGYEHNAEVIYGDTDSVMVQFGVSTVEDAMKLGREAADYISGTFIKPIKL EFEKIYFPYLLISKKRYAGLYWTNPEKFDKMDTKGIETVRRDNCLLVKNLVTECLHKI LVDRDVPGAVQYVKNTISDLLMNRVDLSLLVITKGLTKTGEDYAVKAAHVELAERMRK RDAATAPTVGDRVPYVIIKAAKGAKAYERSEDPIYVLDNNIPIDPQYYLENQISKPLL RIFEPILKNASRELLHGSHTRAVSISTPSNSGIMKFAKKQLTCLGCKAVISGSNQTLC FHCKGREAELYCKTVGNVSELEMLFGRLWTQCQECQGSLHQDVLCTSRDCPIFYRRRK AQKDMAEARVQLQRWDF</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>9887..9974#9693..9780#9539..9612#9047..9207#8885..8974#8727..8801#8567..8638#8316..8488#8129..8243#7820..7933#7546..7625#7365..7452#7210..7266#7031..7096#6858..6953#6641..6748#6168..6266#5980..6099#5181..5267#4860..4931#4698..4764#3661..3752#3499..3576#3285..3422#3043..3178#2760..2955#2358..2517#2151..2257#1948..2058#48..357#ctctcttcccgcgttcccctctccctccccctcccccctctccggcgatgagctcaggcggacgcggcggcaagcggcgaggggcgccgcccccggggccatccggggcggcggcgaagcgggcccaccccggtggcaccccgcagccgcctccgcccgccgcgacggcggcggcgcccgtggcggaggaggaggacatgatggacgaggacgtcttcctcgacgagaccatcctggcggaggacgaggaggcgttgctgctgctcgaccgggacgaggccctcgcctcacgcctctcccgctggaggcgccccgcgctccccgccgacctagcgtccggctgctcgcgcaatgttggtacggtcctctccttcccttctcccccacccgctctcatcctatgcgtgcttggctatctccggtatgtgcagttgggttaccgagggaggcgtaattggggttggatccaggggtgagcgactgccgctggataatttttttgtgttgtccacatctccacaatgcagggtcgattgaattgatatggtgagattcagtgctaggatttgggtattgtagctaattatgtgcaaactagcagggttttttcaggttcagctataagagttgagagcatggttaattcctaccgttttgggccagaatgatggacttttgtggtattaattaatgcgctcaattggttggtgaatttttttttgttttgtacattaggttggaacatgaatttctatgtagtgtgtgacgtagactgtgacaatgtttggtattggtattgtgcctgattcatgcatggagggtaaccaaatgtaaaccttaattttttttactgagaatctaaaccttaatttcataaattatccattctggtcatcaagagaaagctgattctgttatattcaattgaactattggtggttttgaaattggtagaccttgattttctttatacttgtactttgtgctgttttattttagaaatcattgccaattttttgttgacaaactgatgtttaagtgtaatattaatgattgcatttgcacatagactagttagtttgaccttcgtgaactcagaggtcatgtcctgttcagcctagatttctataacatcactagttacacgtgatgtatagagatggaatagtagtttattgtctgaatgtttcgatgaacaagatactccctgcagttgttaaagaaacaagttataactttcacgggcaagtctaacaaagaatgatgatgggatagtgttgtctttgtttggccacctctggtatgaatgtttcaatcttgctactccctgcattgttaaataaacaagttctaaccttcatggacaagtctaacaaagaatgatgatgtgatggttttgtctttctttggccccctatggtatgaatgtttcaacgaacaagctgctccgtgcagttgttaaagaaacatgttctaaccttaatgggcaagtccaacaaagaatgtggatgggatggttttgtgtttgtttggccacctatacccctatcaatacacatcagcatgcatgtgtatatatatttcaatttaataggtgctgttcttgacctagcaaatgccggtcacaagcttttggttgcaacttcagcactcaagtttgtgttgctagatgtgttgcaatgcataggagtgaatatggtaggatgtaataaatgctactacttaactatatcttggtacgcgagaagattcccaaaacatcatcgtttgatgactggagggactaataatcatgtgatggtcttgttttgtaaggattgtttgtcatagcatagatagtttgctagctcttttgttaggtctattttgaacaaggatctatgttgacggttcagttacaggttttatcttattcttgacactctgctcctattgttggatttctagcttttcagcagctggagatagattatgttattggtgagagccacaaagtactgctccccaactcatctggtcctgcagctatactcaggatatttggcgtaactagagaaggttatatatgtctatttaaaacctatctatctttcttcctatttttatcatatggctaatgctcatatatgatgttgtcatgttaacattaggtcacagtgtatgctgccaagtgcatggatttgagccatatttctacatcagttgtccaatggggatgggccctgatgatatttcacgcttccaccaaacactagaggtttctgtgctccattgtatcttaaaccaagatactttcacaaacgggatacattggcagtatgggttttctttacatgttttatcatactgtattacaggggaggatgaaggattcaaataggaacagcaacgtgccaaggtttgtgaagagaatcgaacttgtgcagaagcagacaatcatgcattaccaaccacagcaatctcagcctttcctcaagatagtggttgctttgccaacaatggttgctagttgtcgcggtcagtgttggtttaagagacaagatgattactattcattgttgtatattgaggtcacaatctttttacgcaatggatagcttaaatatcattttgagctgcagtaatatattattgtgtgattttatcatctttattttgtgcccatattttatgatctactgagaagctgctacaagttactttgtcatttttttgctggcttaccacaactgacataggtttgcactttgcacctataggcatcctggaaaggggcataacaattgaaggccttggttcgaagagttttctgacatatgaaagcaacattctttttgcacttcgcttcatgattgactgcaatattgttggtggtaattggattgaagttcctgccggaaagtatatgaaggcagctcgtatcatgtcctattgtcagctagagttggattgcctgtatccttttatactaagtgaatatcttcaaatttattattgaactatgatattacttttcatgtgcattcttaagtcaaataacagatattcggatttggtaagccatgctgctgaaggagaacattctaagatggctccatttcgcatattaagttttgatattgaatgtgccggtcgcaaaggtcacttcccagaaccaactcatgatcccgttattcaggttgatttcattatctacatatagttaatactttatatcatttagtttcaattccaaatgtctctatgtacacagtttcttgacttgcttctctggatgaaaatagatagctaacttggtcacccttcaaggagaaggacaaccttttgtacgcaatgttatgacgcttaaatcatgttctcccattgttggagttgatgttatgtcatttgacacagagagggatgttctacttgcttggagggtaagtaatgctggttggagtttacaacaggtacacagaacttactaaaaaccaagctgattctgattctttccaggatttcatacgtgaagtggaccctgatattattattggatacaatatctgcaaatttgacttaccctatcttattgaggtacaggattttgtaaatacaatatctgcaatacatttggcaatttgggatatcttgttacagttagatttcatacatttgcagagagctgaagttcttaagatagtagagtttccaatacttggacgaatcagaaatagtcgtgttcgtgtccgtgacacaactttctcttcaaggttacttcctagtcactctagtctatattagttttcatttatcatccatagtatattttagccatttaaatattcaccatgcgttacactaatgcctttatggtcaaatggttatactttctaattatgtttggtactttttcccccttacatgtgcaggtcatgctttcttcgtgttatttctcctattttatttggttatactattgaatttgtgcatgcatttttttatagcctggtttagctgataacaccattccttctcatttgtcaaaaagaagatgctgcttattgtttagaaattacttccaataatgagttgtgtccttggtactgtaagacatttcactccacatgttttcttgcggaagcaattttgtcctgcttagatagacactgtatttctttacctgttagcacaacctggtttagatatttgatccatcagaacttggacactgtttgttatcgcttgaatttccacaattcacatcatttagtaagataaatatttaatgttcatatccctttcattcatatgggagaaaattggagagccaatatcatgcattgtatttcacaatcccttccatttttcagtctgcattaatcatgtattactatgacattatttcctggcctgcaagctacattgatattgatgcaataccttgctgtctaaaaatctcaaagatgaaatgcaatgaagagaaaatgtatttctctccatgtaacatgaacttaaataactcgaccaacctaggtggaactaggtggctttttaattaagaagaaataggtatccaaatttgtctcaacgcggagtttaacttgggtggtctagactctggacatacatccacgcccttgaccaactgagctaggctcagttcgttat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External Link(s)	NCBI Gene:Os11g0186400, RefSeq:Os11g0186400