Os11g0260800

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os11g0260800

Description

En/Spm-like transposon proteins family protein

Version

NM_001189539.1 GI:297728208 GeneID:9267038

Length

6579 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os11g0260800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:8639689..8646267

Sequence Coding Region

8639689..8639892,8640330..8640486,8640528..8640760,8640836..8640944,8641022..8641324
,8641398..8641591,8642228..8642400,8643303..8643785,8645465..8645672
,8645755..8646074,8646114..8646267

Expression

GEO Profiles:Os11g0260800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008404:8639689..8646267 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggatcatatgaaattggaaaacgaggaatacgtggaaggccaagatacaacagagttggacaacgaaaccaacatacccgatgattggatgaccatatcgatgagtcgtctgagggttaacgatggtttagatgcccactggtgttatgattgtcagttacaagatgtggtgaagaggttggcatttctgcagaagcatgagtttagggtgaaggtttcaaataagacgacgtatgacgtgaagtgcacaaagcctggatgtccttggagagtgcatggttacaagcctcaaaataaaaatttatgggtagcttcaagggttaagcatcatacgtgtttgttggagaacatgacaaccgcatttgtggcacaaatggtctattcaaaagtggttagaaaaacacctttgtcgcctttcacaataatgcatgacgtagaaaaagagtacgcatatgagatatcgtacgacgaggtcatgcaagcaagaaactcgggcacacacatggctattctcgacggggagaatgaaaatgtggagaatgttcttcatcgggctttctggtcatttgggtgcatgatggaggccattagaaattgcattcctttgctatgtgttaatgatactgtcatgacaggcaagtacagaggaacaatcttaactgcgatcggagtcgaggcggatgatgccaaggtcctttgtccttgtgtgaattgtagaaacagaataacacagaattatgatagagttaaaacacatttgagatgtgctggaattcttcaaagctataccaagtggattcaccatggtgagaaatatgatgcaccgtcattagtattcgctcctgtatctggcaaccctaggaatattcctatttccggtgctcataagagcaatgttgtagaagttggggatggaagattggataacatggaaggactactaaacgctgcatttggcagggaagatagctttgagtctatatcgagtgcttctatcgttgatgatggtatttattttgagtctagctatgcagaacctaatatggttgaggatgagaataatacatttggagatggccataatgggggggaacaagatatgttcacaaggatgttgaaggatgaaaaacaaaactatatcatgggtgtgataaattttcgaggtggcaaattttgttacatgggtcatcgtcgatggttgccaccggatcacaaatatcgagaattgggtagtcagtttgatggcactgaagagaaggaaattgcaccaaaaacattgaatggaacttctgttttagaaatgctgcagggcagagtatttgtatttggtaagaagaagttgtgttctaaagtaatagatgtatccgagcttgatgaacttcaacggagtattgtgatgacactatgtgatatggagagagtttttcttccttctttttttactatcatggtgcatttgttggtacacttggtggaagaagttaagctcggtggtccagtgcactatcgttggatgtatcctctagagagatcatttgttcgaataaaggcacttgtgcgaaaccgagcttacccagaaggttcaattgctgaaggttatattgcagacgagtgcctgacatactgttcgagatttttagatgaaaccacacgctttacaagaccacccagaaaccctgatccttcagataatacaaaggacttgtatatgtttgagagtgctggtgaatcaatcggcaaggctatcaccgtagcccgatttgataaccaatttctagtacaagcacatcgatatgtcttgcgacactgtgatgaacttgaagattttcgcaaagaatttctcgatgaagagaaaagaaaactgcctcatacaactagcttaacacagtccgtcattgacaggttgatcaatagaagctttgctgattggttggaacaaaaggttttagaaaatggtgcagaaatagatgaaaagacaagagcattggctgcaaaaccgaacaaaactgttgttcgctacagtggatacattattaatggtttcaggttccacactatgagccgtcaggctggccgctgcactcaaaatagtggtgttgtgaacgtcgctgatgatggtgttaattactatggcagattatcagacattgtagagctgtcatatagaaattacaaagctggtatgaaaaatgatgaatttcggttcagccttgtgaacttctctcggaagatacacactggagagaaattggatgatgatccatttgtgttttcatcccaagtggaacaagttttttattctgaagatccaaatactgaaggatggcatgtggtttgccaaatgcagggtatcaatgcaaacagaagcaagatgtccacactgccagatgatttctgtcagagtcctgatatcctcagcagtggtgttctccggcctctaggacctgaaaaccaatgctcaacaaatagcgacattttttatatgaattcccaagtgaaaatgggctacaagtattgtttgataacttttagatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDHMKLENEEYVEGQDTTELDNETNIPDDWMTISMSRLRVNDGL DAHWCYDCQLQDVVKRLAFLQKHEFRVKVSNKTTYDVKCTKPGCPWRVHGYKPQNKNL WVASRVKHHTCLLENMTTAFVAQMVYSKVVRKTPLSPFTIMHDVEKEYAYEISYDEVM QARNSGTHMAILDGENENVENVLHRAFWSFGCMMEAIRNCIPLLCVNDTVMTGKYRGT ILTAIGVEADDAKVLCPCVNCRNRITQNYDRVKTHLRCAGILQSYTKWIHHGEKYDAP SLVFAPVSGNPRNIPISGAHKSNVVEVGDGRLDNMEGLLNAAFGREDSFESISSASIV DDGIYFESSYAEPNMVEDENNTFGDGHNGGEQDMFTRMLKDEKQNYIMGVINFRGGKF CYMGHRRWLPPDHKYRELGSQFDGTEEKEIAPKTLNGTSVLEMLQGRVFVFGKKKLCS KVIDVSELDELQRSIVMTLCDMERVFLPSFFTIMVHLLVHLVEEVKLGGPVHYRWMYP LERSFVRIKALVRNRAYPEGSIAEGYIADECLTYCSRFLDETTRFTRPPRNPDPSDNT KDLYMFESAGESIGKAITVARFDNQFLVQAHRYVLRHCDELEDFRKEFLDEEKRKLPH TTSLTQSVIDRLINRSFADWLEQKVLENGAEIDEKTRALAAKPNKTVVRYSGYIINGF RFHTMSRQAGRCTQNSGVVNVADDGVNYYGRLSDIVELSYRNYKAGMKNDEFRFSLVN FSRKIHTGEKLDDDPFVFSSQVEQVFYSEDPNTEGWHVVCQMQGINANRSKMSTLPDD FCQSPDILSSGVLRPLGPENQCSTNSDIFYMNSQVKMGYKYCLITFR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6376..6579#5782..5938#5508..5740#5324..5432#4944..5246#4677..4870#3868..4040#2483..2965#596..803#194..513#1..154#atggatcatatgaaattggaaaacgaggaatacgtggaaggccaagatacaacagagttggacaacgaaaccaacatacccgatgattggatgaccatatcgatgagtcgtctgagggttaacgatggtttagatgcccactggtgttatgattgtaagcaggtaagagttggacagatgtttcatgactaaggtcagttacaagatgtggtgaagaggttggcatttctgcagaagcatgagtttagggtgaaggtttcaaataagacgacgtatgacgtgaagtgcacaaagcctggatgtccttggagagtgcatggttacaagcctcaaaataaaaatttatgggtagcttcaagggttaagcatcatacgtgtttgttggagaacatgacaaccgcatttgtggcacaaatggtctattcaaaagtggttagaaaaacacctttgtcgcctttcacaataatgcatgacgtagaaaaagagtacgcatatgagatatcgtacgacgaggtaaacataaagcattggagatgaggtttggaacttataaggattcttatcacaatcttccaatcttcccctactattggaggtcatgcaagcaagaaactcgggcacacacatggctattctcgacggggagaatgaaaatgtggagaatgttcttcatcgggctttctggtcatttgggtgcatgatggaggccattagaaattgcattcctttgctatgtgttaatgatactgtcatgacaggcaagtacagaggaacaatcttaactgcgatcggagtcgaggcgggtagccacactacaacaaaactattgttttaagacgttttacttaagtcgctccgtaagtagtctccgcttttacaagtaaaattaaaatagtttaagacgctttacaggttagcacaacattaaatcgtttagagatgaatattgagacgttttggaacgtctcatctgtagagatgagttttgagattgtttctaatcatcatcataaaaaccattataataatattataattatttggacactaaccaactcattaccatggacaattttggatgtaaatacacagtttttttttatattgcaactctgcaaacatgcgtcatgtggtaatcagaagtgggttggcctgccttcatgcctgtgatcgatcgtgtgtatccgcgacagggacctgtgatttttgtcccatacatgatctcttctgattttctgatctcgccgcgatcacagatcgagccgcgccgccggccaacgcttgacccggcacctggctaccccacgcggccacgccctgacgcccacgccgccacgaacggccagcaggcaggagcccccacaccggcaagcccacgccgccgccttggccgctgctgcagcctggagcgtgtgccgccgccgcgaggagccgtcgtcgagtcgatcagccgattagccgtccacaccaacaattttaggttatctatttgtgtacttttttagttactgattttatatgttttaagatgttttattaatatatcatggtaaattttgtggtgatttggtctattatattatatatacttacattatatatattagaattattagatttactgtgtttaaaaaaaatagatcggaccacccatatcctaaatcctaaatccaccactgatgagcaatggacgctaggaactgaaacaagccgtcgtctccttccttctgtctcctatccagccccaggtccaaaatgttaatctctcatttagtgatttagacatttttattccctatttatgttggttaatcgttaaatgccaagagtactgttcactacaaattggttggcttgatttaatttgttttatgctagcgagagaatacggagatcacaaatgtcagaccttcatatgatttataattcttacaactaacttgaatcaatttaaatgagagaagatataagaaccataaagattaaggtggatcgaaatgatagatataagtaccgcaaagatgaagctaccttttaccagttgtatattgaacttctactatgaaacttgcgtagtattaacataataagtttatgtatccatctttatgcccttctcaaatctcccaatcaacttctcgttctttttatttaagtcagaattggtcagtggatcaattgctagtgccagcgttaagactttacatagtgtttattcaattaattatgtgaataatagtcagagaaaaaatgatttttgtgacttggaaaatactgttcatactttatgcacattttggacatatttttgtaaagttgatgaaaataatgttaattaccaggttcatgttttttctcttattacttcagcataccatataactagtgatggatcgagattggatgagtgaacccagaacatctgcttcctataaagatggtgtagcacatttcctatccattgcattttgtgatgttccagatgatgccaaggtcctttgtccttgtgtgaattgtagaaacagaataacacagaattatgatagagttaaaacacatttgagatgtgctggaattcttcaaagctataccaagtggattcaccatggtgagaaatatgatgcaccgtcattagtattcgctcctgtatctggcaaccctaggaatattcctatttccggtgctcataagagcaatgttgtagaagttggggatggaagattggataacatggaaggactactaaacgctgcatttggcagggaagatagctttgagtctatatcgagtgcttctatcgttgatgatggtatttattttgagtctagctatgcagaacctaatatggttgaggatgagaataatacatttggagatggccataatgggggggaacaagatatgttcacaaggatgttgaaggatgaaaaacaaaactatatcatgggtgtgataaattttcgaggttatcattcttagtcaatttgtatcacctaaaatgcatacatggatggacacaagaatcttttacagcactacttggtttgctatctgatgcacttcctcaagaggcagatttaccgaataattgttatgaagcaaaaaaaatcatccgtggtttaggtcttggctatcagaaaatccatgcttgtcctaaagattgtgtgctctttcgaggtgacaaagctaaccaagagtcttgtgatgtatgtggttcctcccgctggataactgataaaaatgggtatccagttgaatcaaaaggaaagaagaaaccagctaaagtgttgcgttatttcccattaataccaagaatccaaagactattttcaactgaacaaacttcaggagagatgagatggcacgaggagggccgtacaaaagatagattgctacggcaccctgctgatggtgagggttggaatgatttaaatactcgttatcctggtttttctgctaatgcccgtaatgtgcggcttggtcttgcaagtgatggattaaaccctttcaggaatatgagttcaaagcatagtacttggccagtgatgcttattccttataatctcccgccttggatttgcatgaaacaaacatcgttaattttgtccatgatcattcctggaccacattcacctgggaatgatatagatgtatatttggagccacttgttgatgagctcttgcaactatgggagggtgtggaaacttatgatgcttctgcaaggaagaaattttctctccgagctgcattattatggacattgaatgactttcctgcattagcttacctatatggttggagcactggagggaaatatgcatgtccatcttgtgctacacttacaaaatcatttcgtcttaaaaaaggtggcaaattttgttacatgggtcatcgtcgatggttgccaccggatcacaaatatcgagaattgggtagtcagtttgatggcactgaagagaaggaaattgcaccaaaaacattgaatggaacttctgttttagaaatgctgcagggcagagtatttgtatttggtaagaaggtaagcatagccaaaatgtcaaaaaggaaaatacaagccaaaaaaaacactaatgacaaagggagcaatcggaaactcaagggtaagagaaagacgtgtaaggagaaatcaagtgataacccacgtaagtctaaaaagaaacctgaggattggttgaaaaagaggtcaatattctttaagctagaatactgggagtgcaacaaattaaggcacaatctagatatgatgcatataaagaaaaatgtatgtgataatttaattggaactttgttggatattagttcaaaaacaaaggatgatcttaatgcacgacttgacttggtaaatattggcattcgaccagaacttcaccttacaatagatgataaaggaaagcaaatattgctacctgcaccctttaccatgtcaagagaaaaaaaagagattctgtgttcagtaattcaaaacattaagactcctgatggttatgcatcaaatatttgtaggtgtgtcaacatgaaagattgcactcttaatggtctaaaaagtcatgattgccatgttttacttgaagacattcttcccatagcacttcgatcatgttaccctagcaaagatgtgatgcatatagttaacgaattggctcggttcttcaagaagttgtgttctaaagtaatagatgtatccgagcttgatgaacttcaacggagtattgtgatgacactatgtgatatggagagagtttttcttccttctttttttactatcatggtgcatttgttggtacacttggtggaagaagttaagctcggtggtccagtgcactatcgttggatgtatcctctagagaggta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External Link(s)

NCBI Gene:Os11g0260800, RefSeq:Os11g0260800