Os11g0293900
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os11g0293900 |
|---|---|
| Description |
UBX domain containing protein |
| Version |
NM_001074245.1 GI:115485138 GeneID:4350306 |
| Length |
9050 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0293900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:10783027..10792076 |
| Sequence Coding Region |
10783258..10783499,10783629..10783901,10785403..10785913,10785996..10786208,10788157..10788224 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:10783027..10792076 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008404:10783027..10792076 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggagagggcacttgattccttgacgtacaaaggctccattccagacgctatccttcagtcaagaagggataacaaactctttgtagtgtacatatcaggtgaagatgagacttcgagtagtttggaacagtcgacacttgttaatgaaagtgtggctgaagtgataggcaactgttgcgtattcctgcatctaaaacaaggcaacgtcgatgcatcccaattttcagctatatatccacagaaggctatcccaagtatatctgtcattggacagaatggtgttatgctatggtgtcatgagggatacatcagctcgaaagatctgaaagaaaatattgagaaagcttgggctacccttcacctgcagggtacagcagcagcctttctgactgcatcacttgcttcaagaatgactgaacctgtgaataccaccccgaccactctacctactcaaggaggctcatctgctgcagagaatccctctacttcatcaaatcaatctacaggaacttctggagccagtgggtttgctaatcctactgattcggtggcacagccacctagaagcacaagccgtgatgaaactcccagcataagtgaaaaagaatcctcaaatttggattcaagtccaggtaatagaactgttcaagaaaggccagattcagatagtgcgcaagttaaaggttctttgcctgatcatccaaggagctcaaatatagaaggttgtgcaaatccagttcaatcaggcaatacagcatcactaaaacagaaaaataaagtggatgatggtttcaccaaagtttcctcagagtcagttcctaccagagtagctagtagaggtaaatcgtcaaaggtagctgtggatcaagacaaggcaacaaccactagcacccctattgaacctgcccctgtgaggtcaaatgatattcagctggtcgttcgcattcctgatggacctagtctgcagattaaactgacaaaagatgataacttaaggaaggtgaagaattttgtggatgaaaaccgtgctaatggggctggatcttacgatcttgctatgctttatccaagaaaagttttcactgaacaagacatggaagccacgttgcatgaactgggtattgaaacccggcaggctctcactattgttccacatcataaaaccattcgagcagcaaagcgccaatcatcatcatcaccccatgaaggggataacaatatggatgcagacagctcaggtggttcgggatatttcggttatctgagaactgccctatcgtttgtgaatccactgtcctacttgagagcaaatgctgctccatcaaaccctgatcagttggcaaatcaggggtcgccacagtacagaccgagcactggaccctggaatcgtcctggagaggacactgcttcggaaagccgtattcctgatagtgcgaggcaacaggctgctagggatactagctccgggagcaccttgaggaggcggccgagacaattcggtggcaacgttcacagtttgagaagtgatgaccaaggcccatctgatgataggaatgtttactggaacgggaattctacagagttcggaggcgaagataagaaatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MERALDSLTYKGSIPDAILQSRRDNKLFVVYISGEDETSSSLEQ STLVNESVAEVIGNCCVFLHLKQGNVDASQFSAIYPQKAIPSISVIGQNGVMLWCHEG YISSKDLKENIEKAWATLHLQGTAAAFLTASLASRMTEPVNTTPTTLPTQGGSSAAEN PSTSSNQSTGTSGASGFANPTDSVAQPPRSTSRDETPSISEKESSNLDSSPGNRTVQE RPDSDSAQVKGSLPDHPRSSNIEGCANPVQSGNTASLKQKNKVDDGFTKVSSESVPTR VASRGKSSKVAVDQDKATTTSTPIEPAPVRSNDIQLVVRIPDGPSLQIKLTKDDNLRK VKNFVDENRANGAGSYDLAMLYPRKVFTEQDMEATLHELGIETRQALTIVPHHKTIRA AKRQSSSSPHEGDNNMDADSSGGSGYFGYLRTALSFVNPLSYLRANAAPSNPDQLANQ GSPQYRPSTGPWNRPGEDTASESRIPDSARQQAARDTSSGSTLRRRPRQFGGNVHSLR SDDQGPSDDRNVYWNGNSTEFGGEDKK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8578..8819#8176..8448#6164..6674#5869..6081#3853..3920#3679..3744#2973..3054#2604..2656#1676..1775#cggctcacatctgaaccaaatcgtgctcggtctccgtctccacctccgcatatcatcctccgcttcgcttccgctcgatcgattcctcccccccatcaccaccactcctccgccgcgtcgccgtcgccgtcaccgacaagcctcgcctctcctcgccggttcgccgtcgcggccgcctcctttgtccgctccagcgccctcctcggcccggatcggcccttccccaggtgagtcttgactcttgacagtctgactgacttgactgactggttagctagctagccctaatcattccccctcaaatcttgattcctcggggagtgggacgaatcttgctgggcgatggattggccttgctggtctcaggaaactacgtagtttactgctagtgaatccctccgttccgtgcctgtgtgggcaaggccaatcgatccatggaatttcagctagcctatgattgtgtttgtgattgttcgtggtcattccaagcggttctttgctggtatggcaactattctgtgtgcttgtttgttgctggtatggagtagtctagaacttccgtcaattcctaggctgtttgacctgcagctatatctccttggaaaatctgagtaaatttcataaaactacggatactttgaccaaattatcgcaaaactatagatttaaggtcatatatatcatagaactacatatttagcaacacatttatcacaaaactacaggtttaagactaagtataacaaaactacatttttaatgataaaattatcacaaaactatagattttgggtctaaatcctttgcactaatgttatgcttgagttataaatgtccaagttttgtgattaaattgatattaaacctgtaattttgtgataactttgttactgaatctgtagttttgcgatattttaccttaaatttgtagttttgtgataaaattagtattaaatctgtagttttctgataatttaaccgaagtatctgtagtttttgtagttttgtgaaatttactttcatattcggtctaagaggtaatgaaaaggacctgtgatgttttttgtggtccttgtatttggacatgcttacggtagatagctatgcagatttgccgggctaacatgtcaaattggtattagtattttcaatccgttacttatcagtatgtgctccccacaaccaaagaaaaaaaaaagaaagttatcattatgtgcctgcgtggtgtttggtcaacaggattcagagttttttttttgaaccatacattttcactgtttttgccattcaattgaaattacagtacgcctactgttagatgaattgcttgggtaattgaatgcatttatgattctgtttttttggggtgtaaactcatgtaatctatgaatcagttcttaaaatcaaagatcttattgtgtctttcacttggtggtgattagaaagtgaacaccttacttttagaaggctagtataagtttgctgtcagcatattttctttcattacttgggtatacatgactttaacttgtaataacacaatgcatattatgattttgattaataaggaagatactaaaagaaaggaagaaatgcataatggatacgttgtattttcacacttgattctttgtattttccatgtaatgatgcaccatttctttgtctaacttagatggagagggcacttgattccttgacgtacaaaggctccattccagacgctatccttcagtcaagaagggataacaaactctttgtagtgtacatatcaggtcagcttgctaatcctagcagctcgttgttatgctatctaccttactaattgtctgatgatatccatgatttatgctgcaaaagtcaaatataggaggcaaacattttattttatttggaacaaaattagtgatgcacaatcagacagatattataacctcaggttgaaattagtcatgctaattacttttctgttcagttattctctagatcagccaaatattaattttctcacgagacttgtttattctgattcaatggggaaattactggaacactaataatttctcttgttaacttggaattgatttgcactgaatctagtacatgcccaatttgcaacaacataacaaaaattctttgcatgcactctttttcaaaaaaaaaaaccagaaatttaaattcaaatttcaaatatgtgaaatttgtctggtttagtgagttctgatcttagacatcagtgaagtttgggaaatccattaacccctgaccaggaggtaaatcacattctgtagaaacaaatctaatcctttttcttaaaggatagcatgagcatgtctcctatctggaggggcttctaacgttgtatctagaggcaaatgaaagtaaaacctattgacagtatgcaattcaactaaactacttacttttctaccaaaataattttctgttggcgcatgctgcaatatgcagtacattatccccttatgcaacacaaatgtgcattatagcacattgttcaatacctcttatgttgtaattgacaatatgcagtacattgatcagtccaggatattgacagaacatcatatattgctgcatttcaggtgaagatgagacttcgagtagtttggaacagtcgacacttgttaatgaaagtgtaggtttctttcataattgcctggataattctgttttggtgaaagtccactctggatccttcaaatttcgttacaattttttttcagtcttagctttaatatcgattaattacatccctcaagtgtcaaattatggggttttttggggggttgggggagggggggaggtggggtttattacgcaccgaacactgaggttaagggtaaaaattagactcctaacaggactggagggaccagagatggacttattttctgtgattgttatatattgaagttaccaagttgctcttgtgtctttatgtatgtgcacaggtggctgaagtgataggcaactgttgcgtattcctgcatctaaaacaaggcaacgtcgatgcatcccaattttcagctatatgtatcctttgtacacatgcattttttttactgtaactttatgtttgctttggattggccagagacaattcactcttgattttacacttcagtgccaaggggtattagtgcttgtcctgattccgatttaaaatgaatgggcagatgtccttgcatccattttaaaaacaattatttgatgatgttcacatttgaacttcatgccataatttgttgtggtgaaatacatttgtttaacttaaaactttaattgcaagggtatcttactgacatcatggattgttagtgctccgatatgaatagaatgttgaaacattttgatttgattatcatttgctgatggttgaatgtgatgagataggttcatcatattttcttatacaacagtagaactgcatcatgattgttataacggtagaactacatgataagcattcaattatatccaggaggttatctgtaagtatatgttataactttatctcatttccatactttacatttggtacttaaaatggttaatcaggagttagttctgttatcttgcacaggaaatgttttattatctataatcacgagtcttatttgtgcgtgcagttttatccttaacatactttttgattagatccacagaaggctatcccaagtatatctgtcattggacagaatggtgttatgctatggtgtcatggtatgaatacttcagaaaagtagttttaaagtttagcagtagaacctttctttcataaggtcaagctattgcaacagtgctatttttttttttttttgcttttcttagagggatacatcagctcgaaagatctgaaagaaaatattgagaaagcttgggctacccttcacctgcaggtactccattccagaaaaaaaattgacattcaattgtgataatttatttatttgttttcaactgctacttttgaataccacttggctagttcacttcacaatggattttaatacatgatgtttgagtaatttttttagtaaatttcacaaaactactggtatcttgcacaatttatcacaaaactacatatttaagagcttgtttcacaaaactacagatttagtgtctccgtttatcacaaaactacatgtactttgtataatcgatcacaaaactacatatttaagaacttgtttcacaaaactatagatagattagcgtattcatttatcacagaactacacatttcatatcttcatttatcacaaaactacaggtatagtgtctccgaatgctaaaacctgtagttttgtgataatgaaaacactaaacctgtgtagttttgtgatgaatgaagatattaaacctgtagttttgtgatatataatgcaaagtacctatagttttgtgataaacgaagacactaaatctgtagttttgtgaaacaagttcttaaatatgtagttttgtgatagatcgtgcaaagtatatgtagttttatgaaatttactctttttttattaaccactatctgtttttctattttatgtccaaatgccccacatatgtttttgaagttattttatactctctccataaggctttattgaaaaaaaaatgttatcattaagtggttgaggtgacacatccgtagaccttcttttcttttatgtatattcaaattgcaaagtaaaatttgttagataatagaaacatatgctctatgcaaataaaggtctagtgagacttgtgaattaccatgtcaaatgctccatttcctttcacatctggaagcagcagatgaagaggtggcatgcctatgagttggacactgtagcccactggtgagctgggggcagcagtgtgtgacgagttgagttctcctctctatgatatgctgcaggcattggccatgaaattggtgttttttctgttgtatccaggctgtttataccttccttcaagcccaagccactgattagtcactgcataagagcaagtttaatagtatagccaactaatagctccaatttatctatagccaatctaataactcattcatacaatagttacatactacactattaatacctggtctcacctgtcatacacacatgtgtcttggagttcgtgctacagctggctatacatctgtagtccgctgctcttctctctcctcatttatatccttaaaatatgtttgcagctggcttatagcgtgctattgtacctgctctaagctgacttcgtcactgtggctgaggaattgccgagttggcctgtctgactaacttgccacctactccctccatcccaaaatataagtatttctagcatttctcgagagagattaaggatgaagggaaaagactatgatgcctctcattaaacaaggggtggttgaagagtgggagggtgaagattaaatgagtagtggttggtgggggaagtagtactctagaaaatatagttatattttgggataaattttgaatgctaaaagtaactacattctaggacagagagagtagttccaaattgtgttgcagctagattcttgactagctggcaaaccttttctggcttccccggcactgatcacatgtgtttaacttgtaagaatcctgtttaaaaaccacctcaacgaagcatgaaatcatgttcttacagcctgccatttctgaatgtatcgaatttactggtaaatatcataagttaaagaaaagaaaaaaaagagtggttgtttgctttttaagtaattatgagttagttacttggttgtatgttttatgtacttccactagtggtttagctccaataaatatgacctgttgtcaaatattgcagggtacagcagcagcctttctgactgcatcacttgcttcaagaatgactgaacctgtgaataccaccccgaccactctacctactcaaggaggctcatctgctgcagagaatccctctacttcatcaaatcaatctacaggaacttctggagccagtgggtttgctaatcctactgattcggtggcacagccacctagaagcacaagccgtgatgtatgttttctcccatttcatagaatattatcttctcatttgaggattgccttgtgcatcttatcacttctttgtgcaacaggaaactcccagcataagtgaaaaagaatcctcaaatttggattcaagtccaggtaatagaactgttcaagaaaggccagattcagatagtgcgcaagttaaaggttctttgcctgatcatccaaggagctcaaatatagaaggttgtgcaaatccagttcaatcaggcaatacagcatcactaaaacagaaaaataaagtggatgatggtttcaccaaagtttcctcagagtcagttcctaccagagtagctagtagaggtaaatcgtcaaaggtagctgtggatcaagacaaggcaacaaccactagcacccctattgaacctgcccctgtgaggtcaaatgatattcagctggtcgttcgcattcctgatggacctagtctgcagattaaactgacaaaagatgataacttaaggaaggtgaagaattttgtggatgaaaaccgtgctaatggggctggatcttacgatcttgctatgctttatccaagaaaagttttcactgaacaaggtactgggtcttttccttcacagtaagattatcattttattctctattcactcaaagcttgttggctgggtggacattgcagccaaggcatggatggataaaataatgtcttttactcctggaacttgacaagagattaatcctatgccattctttacttcaatgaaatacttttagctgccatgtttttgcattggtgctattctattctcataatatcattttggtcaaatgatattctattcttcgatgttttagtaattacaaagtatccttcctgctccagcaggacaataaaatgaaattggcttaggacatcagacattagtagagagtagactgaccgaaaaagaaatgtgaagcatgaaaaatgcggtatttattttcttaatcagctggaattttagttcatagatgatctttggttttgttggatgatttgattacatgactaagttataatttgtaactcaaagatggagtggtggtactacccccataacatgcatttcatatagacatgggacagtaacctttctagaatcattacaccagatgtttttatgcagtactatgaagtttgcacatgcttcattccgcttgtttagtttgttatcgtattcttgcttcatttagttcacggattatcaatcagaaatgttaagcttcctctatgtttgtttttagccactaccgcctgccttcatgttcttacacatatatgtacctattctttcttaccccaaaatgctgcatccgaatttccaaaggttatttgatgaactgataggaattaagaataactgcagcttgtaagaaacttttgaagtagtttagtaacacattgactcaattttcacgtttgcaatgtcattgtttgagtaacattcctttgtgatacaattgaacaaattaactctgatttttcttgtcgcctgctaataatatactataatgattttgaaatatcttatatgaaaaacccgcgcatatcctttagacctttacagctgaaatacatttcctatggtgctcaagtgttctgggcttcaaaaacaaaccatgctcaataagccgtaaacaaattacctggacgtctaccaaataggctaaatgatgcactatcctatctatccaatccaatgtgtggagattgatgtgacctttcaaaattaaccaacatcccatcttgtctctaataattttatgtactttgtgcagatctgaaagcatttttcaatggataataaacatccagatatgtaatatatgtaaaaataaagtttgtagcacatgtttagagcatctttagaacaagcttatcaagtaaccttcatttatgcatgtaatttgctccaatgatatcatttgtcaaatatggcaattctataagcatgttgagtgttaaccttttcggtttctgattggagcatttcattcattttgtgttacttcattgactgttctctatgtttggactgattatcaaaattttattcagacatggaagccacgttgcatgaactgggtattgaaacccggcaggctctcactattgttccacatcataaaaccattcgagcagcaaagcgccaatcatcatcatcaccccatgaaggggataacaatatggatgcagacagctcaggtggttcgggatatttcggttatctgagaactgccctatcgtttgtgaatccactgtcctacttgagagcaaatgctgctccatcaaaccctgatcagttggcaaatcaggggtcgccacagtacagtatgttttcttactctttagtctcgaatttctaaagatgaggtgttaacgattccgtggagtttcacctttttcagccttgctattcatggttgctagttcagaaatgtctatatttccatgaaacaggaccgagcactggaccctggaatcgtcctggagaggacactgcttcggaaagccgtattcctgatagtgcgaggcaacaggctgctagggatactagctccgggagcaccttgaggaggcggccgagacaattcggtggcaacgttcacagtttgagaagtgatgaccaaggcccatctgatgataggaatgtttactggaacgggaattctacagagttcggaggcgaagataagaaatgagagctgagcaccggcaatatcatggcagagttaaatatatacttggacaaataacacgatctaggtaaataaatacaaacaaatttgagatgttaaattcagtggtaccagtaccacaacatagacttctagtgtaaaatgataatacatctgatgattggctgtgatggttcgtttccgggagccgattcttcgtcagtttgggtagtatggagagatattttcgtttgc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |