Os11g0295000
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Structured Information
| Gene Name |
Os11g0295000 |
|---|---|
| Description |
Similar to HIT family protein |
| Version |
NM_001189556.1 GI:297728242 GeneID:9270866 |
| Length |
6266 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0295000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:10870167..10876432 |
| Sequence Coding Region |
10872476..10872512,10875199..10875254,10875604..10875657,10875779..10875907 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:10870167..10876432 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgccattttccatcactggaagcaacaccaccacatattcatttaacatggtggttaataatggagcagctgcaggacaagttattttccatacccatttccacataattcctcgaagatctggcgacaagttgtggcctacagagagtttgagaaggcgctccatcgagcctaacgaaactccaggccttgttagctgcatcaaagagcagctctattcttcaccagaaggctgtaaagccgaaccaccatcttcactgcccaaggaacggtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPFSITGSNTTTYSFNMVVNNGAAAGQVIFHTHFHIIPRRSGDK LWPTESLRRRSIEPNETPGLVSCIKEQLYSSPEGCKAEPPSSLPKER</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2310..2346#5033..5088#5438..5491#5613..5741#atagaccacgctttcatccccaccttgtctcccacacaaatgtcgccggcgcggcgcctcgccgtgctccgctcccacctccagcccgccgcccctgccggcgaaggcgaccgggacgtcgtcgtgtgcgcggagcaagccgcgggggtctcgacctccccttgctccgccgccgccgccgggggcgggcgggaagccgaggggaagagctgcgtgttctgccggatcatccgcggcgaggcgccggccttcaaggttcggtcgttctagtccccctcgccttagctcccgctccccccgcgagtagtagtgctcttcttccgctgagaatttgggggtgaatagaaatcgcaaccgcacatattttttttataattattattttctggttcgtaattgcattgcgtctcttggcgcataattctagttgatttggtcggcttagtgatttcttctctaactttaaggagtctagtgtatgattgcaaaaaaccctgactcggggggttatttgattcagcaacagtgacaagtgcttaaatttcaggtgcgttataattaaacgagcagccattaattctggaagtcataggagtaacacataagctgctgtttatttattttttggataatgtctatgctattgttaccatcttgtgtcaccagctattatccacagctttaattcgtcatcaagttttctgttattttgaaaccgtgcttcgaggttcctggcgctcatagctttccactgagcccttaaagtcgataaacctccaattgggtcgtcagtctactcctttgtagaatttgttttgattctgttgactggctggccctttgaaggaattcgtgctgattagaggttgcaaatttcttgagatagtctttagaatcgcggcctcagataacattcacttttggaacttgctggtctagattcatctgaacttgagtgcagacaagatatttgaataaatgcactttacactcctgaaattgagtgcagacaatatttgaggttgccccctgtgcactgtcgggtcatattgttgtgtcagttgatcgttgatctttggatccatttagtgaaattgaattaaaggtactgaggatcgatgcttcatgaaatgaattgtcgcgtgtttttttagtataacctaaaaccattattatttcatttcaaaacgcgctgaaggtaatgtctccatgaaaagcagtaggggcaggagaaagcaagagtaatagtgagggggagaaccagaactggaatctataagtgcactagtggactggtggatgttattcagaagttattatgttttcgcaatatatgttcagattctgtaactagacaagcaactgatactttggagagatcgatgagctcagtgacactgaaaaatatttttgagctttgttgtatatgggaactttacaactgtcaaatgagttgcttatcggtgttttagtgttcatatttgtctttcttactacatggaggtgctcagcatgaaggagactttaaattcgttacttaaaaaaatacattagttgatgaaatatttacacatttttgaaatgttgaatgtctatttccttttatcagccttatttgttatttgcaggtctatgaagatgatgtatgcctgtgcatattggattctcatccattggcgcctgggtaaattgcttctctatcttctccatattgtcactgtattgtactgttgtacgattggtagggaggatttctatctggatcaaaatcctctactgtgttagcttcccacaagttctggcagaagggagagagatatattggattcagtggctaagttagttatcaagaagaagaacttcatcagaggatgacatgtgggttcttagtatttcttttaatataaaaaaaactatttgctgatttacaaactaacaaagttgtatctatgtgccatccttgtcagcatagcatgagcacataggtgccatatcagcctaaattggttttgcgtatgatgaatgggtgttttcctttggctttgagaactcgaggatatcaaatgcttgatttcggaattgaatttgaggattggtccggatttataaaaaaaaattgacaggtgtaaactgaagtatcgttaattaattggcaccccttttgcttatttttgtgataatactgcatcatgttcaatatattgaataaaagagtctttaccttttctcgttacttcatcctagctttttactccatggtatcttgttaacattttttccctctacaggcattccttgattattccaaaatgccattttccatcactggaagcaacaccaccacatgtaagccatctgtcactgttggcacattccctttgtttggacttgaatttgtagattggtgagcatttctaagagattctgtgcattttgtcactctatgcttccattcaagataattaatggatatgaatgcacatgagcttgcagtatccaaatgaataagtggttcaatatgccatttacaaattggctttctgttaaatcaatcataatggtacaagctggtcaacaatcaagtaatcaacattgcattactttgtgaagtatgaacaatgcaaaatttgtagttatttatataactgattagtataatgtatacagtaataatcagctgtggtgtagcacaaaggccttcaagaaacccacatttttgcatcatagaagcactgtccaatatcctctgcccattaacctaagcaaaccatagtcatcacagatgtaagccacaactagcaaatatgcagctttagttggtactttattcatttcttaaggtatgcccatctcgtttgtaaatggacacattcaagcacatgctgaattaggcaaacgatacctagtgatatataagtcgaacatttatgtaaggaccatgagcattggaaaaggttcacctagcaccctcaactgcaaaactaggcactgaacacactcaaagcatacaaaactggctcactacaccatatggtgtctctagggagcacttttgataacatgtatccaactcaaggcggtttacgctattagcagccatattgttgttttttgttgaggagaccgacccaactaaaggttgttcatctctcttctcctctagcactctctagctgtgcattatattctttattttgtctatcttcatcttatttggacgcagttcaagttttgggcttaaataagatgaagatttaagcaattttatattgcatggttaggtggactttttgtaaagttcatgggtgtgaaatgtacttaaatcatacgtagtatatattactcctatatatactgttgagtacttattggtgtgtcatgtctcatgtcaaactaattcctcctgttctttggtcatctggccatcttccaaacaaaatattgcatgctaatagttgcgagaaacatggctaatcatttactcccaacatcgttgaaaatgtttcaagtcattgtcttgtttttgagccaggtagtagcagccatgtgttccaaagtgccatttcttagtaatgcaattatgaaggctactcaatgtggtaggtaaactttgccacaatattttgttaattgctgtgacaaatgatttctaattttgttcacataataacgtgacactatttatcccataagtatcctgcatttagacggaaatgcattcatcttaatgttttttttttttttggtttttgcatttgtctgaatgttatttttcgttttagcattgtgaatctcaataaccaatctcttgtgcatagattagatctgcattattttttttaggctctattggatcgtcctgttcattcaagattagcagtactacaatcttatacctccacttctttattttcttgaaaaaaattggagaacacttccactaccattgtggaacccaaagatgtgccctgtgccctttgtcctctttcttcagtacctgctaactaaaattcttggctgctttaatgaattacatggaaaaggttgcctgtctaaataatttgcaaaatcggcagttaggtcagatattttaggactcaagtttttagggcaatatgtttagtttacttgtcactgcacaagaaacaatatttttaaaagttcatagtagtaaatttctacagtctacctgttattctgttgagttgctagatctttctggaattctggtcattcttttgctgttatgcacccacaacttttattatctatttgcacagataggcgaatagttgtttgttttttctctaggaatctatagattggccaggattcaatatgctctgaggactaatatgatcatacatagtaattttgaattactgtactgcccctttggttccaaatataagtcattttaacttctcaaacacttccccaaatacaagtcgtttgaaacttctaggtacttgttgttcttttcttcaatgtttgcccttaccaaacaaatgatatcactttcacaaatgaatggcttgtctttttcaactcagtataaatgaaaggcaacaaagtcatttgaattgtttccttaagtctaaaatgacttatttctggaatcacagaagtattctccttggattttgaaggaacattttgattctttcgagtgttacttgtcccattagtccatattgaccatttctcttccatttgcttatttgcctacatggctgcatctttgctacctgtagccaccaactaaggcacaatccaacccaacagcaaatgcatgtgtgttcagttttttttaatctgtgttaataagaaatggatggacatatgagctgatgagaagcctaaatttattctcagttaccaatatatttgaatgacgcagctgtttcattcaatctctgctttggtttggttgattgatcaa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|
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