Os11g0429100
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Structured Information
| Gene Name |
Os11g0429100 |
|---|---|
| Description |
Similar to NBS-LRR type resistance protein (Fragment) |
| Version |
NM_001074317.1 GI:115485282 GeneID:4350389 |
| Length |
5637 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0429100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:15567607..15573243 |
| Sequence Coding Region |
15567607..15567670,15567933..15568016,15568913..15569112,15569344..15573243 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:15567607..15573243 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008404:15567607..15573243 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggatgtggtgggggcggcgtcctggctggttcaggtcgtcctggagaagctcgtcggcgacggcatcgacgccgcctgggccgcggcgcgcgccgggggggacccgggccgcgcccacggcggcgacgtccgccgcctcggctcccgcctccagagcctccacgccctcctctccgaggcccaagagcacgcgcccatggcacgcaggcgcagcgaggccctccttcgctctctccgtagcctggagagcctcgccaccgatgctgacaacctgctcgacgaaatgctgtaccaccaaatccaccgacggctacatccggacgagcctagtacctcctccaactcttgctcctcattgtttgcagtccaactagtggagcccaataatcgcgttgccaagagggtgcgccatagtggagatggcgataccaccggtagaattaaagacatcctagagcggatgtgtgaagccggagatgatgttcgtgaggcaatcaagatggagaaactggacgtcagtgccgctgggggaggccaagatgatcgtataattcaacggaggccaacaacatcttactccactgagccaaaggtgtttgggagggacaccgtgaaggatcgcattgtggtgatgttgattagctcagagacatgtggtgctgatttggcagtccttccaattgtggggaatggtggcgttggtaaaactacactggcacagctagtctacagtgacacaagagtgcaagctcaattcagcaagcgaatatggatttcagtgtctgttgacttcgatgaagttaggcttactcgtgagctactcgattgtgtgtccaatggtgtcaataagcatggtggtatcactaacctgaataagctccaagagattcttgaggaggatcttaagtccgagcggctactccttgttttggatgacatgtgggaagacaatgataaaagccgttggaacaagctattagcacctctgagatgtagttcattgaggggcaatgcaatcttggttacaacaagaaatcactctgtagtaaagatgattgctacaatggatcctatccatttggatggtttggaagatggtgacttttggcttctgttcaaggcatgtgcatttggtgatgaaaaatatgaagggcatccaagtttgcaggttattgggaagtgcatagctaacaagttgaagggttatcccttagctgcaaaaagtgttggtgcccttttgaatagagaccttgatggtgggcattggatgagcatattgcaaagtgacgaatggaaactgcagagaggacctgatgatatcattccagcattgatgcttagttacatacacttgccttttcatctacaaaggtgtttttcttactgtgcattgtttcctaagggtcacaggtttgatggcttagatttggtccgtgtttggatatcacaaggttttgtttcttcgaacaataagaaaatggaggacattggccatcaatatttgaatgatttagtggattgtggattttttcaaagaagcacatactattctatgcacgacctgattcatgacctggcacatattgtttcagcagatgaatgccatatgattgatggttttaattcaagtggaatagctcagtcaaccattcaacatttatctattaatacaaggtatgcttataagtgggatgtatattcccagaagttttattcaaaagatgacttccagaggaagcttacttatgttggtgaaacagtgcaaaccaggaacttgagtacattaatgctatttggaaagtatgacgcagacttttctgaaactttttcccatatttttaaagaagtgcaatatcttcgtgttctgaggctacccacgctcacttatagcatagactatttactctctaacttcagcaaattgatccatcttcgctaccttgagctaatatccagtggtcctggtggacccttgccagaggttatatgtcagctttatcatctacaggtccttgatgtcgagtactgggtacacctctccactttaccaagagccatgaatgatcttgtcaacttgaggcattttgttgcccgtggtgaattgcacgcactgattgctggagttgggagattaaagtttctccaggagttaaaggaattccgagttggaaagactactgactttcagattggacagttgaatggattaagggaattgggaggatcattagcaatttacaatctagagaacatatgtagcaaagaggagtctaagaatgctggattaagggataaaatatacctaaaggatttgttgctatcatggtgtagcaaccgatttgaggtaagttctgttatcgaggaagaggtgcttgagagccttcaaccacactctgggcttaagtgtctaagtataaatggctatggaggtatttcttgcccaacatggttgagctccattaatccactcatcagcttagagactatctgtctagatagttgcacaaaatgggaggtccttccaccgcttgggcaatttccactccttagaacactgcatttgattcagttgccttcttcaagggttgtaccaactgtatccagtgacgactggactggttctgaaaaacatattatatttccatgcctagaagaacttgtgataagggattgccctgaactaaggacattaggattgtcaccatgctcttttgaaactgaaggctctcacacatttggccgtctccatcatgctactatctataactgtcctcaactaatgaatttaccacaatttggtcagacaaaatatttgtccacaatatctattgagggagtaggatcatttccttacatccgattgtttgtgcgagcattgtatatcaagggatgcgctagcccaagtaaattggatcaaatattaatgttgattgagggcaacctatgtcttcttgagaaattaacgattgagagttgcctcgatcttacatatttgccatggaaaacactcagcaaacttgtctctttggagatgctggtaattgtggactgcccaaggctttctttgactttatatccatataaccaagatgggggtaatttttctttcatgtcattgctcaacaagcttgtaatccgagcatgtagcattacagggaagcagttatctcacttgatcttacagttgcccttccttcattacttgacaattggaaagtgcccaaagataacatccttgttgcttggtgatgtgattaatgggagtgacagctcttcaacatctgattacctccaattgacaactgatggcatgttgcaaataccatctcatctcttaattcaacttcagtatttgagcatagatgactttccagatctggttctactctggaaagaaggcttccatggattcacctcacttcggaccctacacatcacaggatgcacacaacttctctcccccatgataacagaaaacaaaagatccaacaaaaactcttccctcctgccaccattactacatgaccttatggttactcatgtgcataatgagttgctacctttcttgctctcgaacctcacctcgttatccatatttgcaatatctaacagtccagagttaacatcccttgttcttcattcttgcacatctttagaaactttgatcattgagaaatgtgttgggctgtctgctctagagggtttgcattccctccccaaacttaagcatctacggatttttcaatgccctagtttggctaaaacatggggcccttcctcagtggacaggccaggtttctctttatatctagacaagcttgaaattgataccactgtgttatttaacacagaagtttgcaagaagcttccatctcttcgacatttagtgtttttcatgttgtcaatcaaggcttgtccaggaattaaatcattgccagaaaatggcctcccagcttccttacacgagctctacgtgagcagttgcagtgcagaactaaaggagcagtgcaagaagacaaaaaatgttagatgtgtttatgttgatagaaatgcaagcaaattcatagttatatgcaagctgctacgtctctattttaggatcaccaagctgggagcatggcagcgatcactatggctgcaatcaagaactgggggaagcaatgagctcatggtcctaaccaaagtcctatttactatcgccactacagttgttttcagaactggactagtcatctctgaactctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDVVGAASWLVQVVLEKLVGDGIDAAWAAARAGGDPGRAHGGDV RRLGSRLQSLHALLSEAQEHAPMARRRSEALLRSLRSLESLATDADNLLDEMLYHQIH RRLHPDEPSTSSNSCSSLFAVQLVEPNNRVAKRVRHSGDGDTTGRIKDILERMCEAGD DVREAIKMEKLDVSAAGGGQDDRIIQRRPTTSYSTEPKVFGRDTVKDRIVVMLISSET CGADLAVLPIVGNGGVGKTTLAQLVYSDTRVQAQFSKRIWISVSVDFDEVRLTRELLD CVSNGVNKHGGITNLNKLQEILEEDLKSERLLLVLDDMWEDNDKSRWNKLLAPLRCSS LRGNAILVTTRNHSVVKMIATMDPIHLDGLEDGDFWLLFKACAFGDEKYEGHPSLQVI GKCIANKLKGYPLAAKSVGALLNRDLDGGHWMSILQSDEWKLQRGPDDIIPALMLSYI HLPFHLQRCFSYCALFPKGHRFDGLDLVRVWISQGFVSSNNKKMEDIGHQYLNDLVDC GFFQRSTYYSMHDLIHDLAHIVSADECHMIDGFNSSGIAQSTIQHLSINTRYAYKWDV YSQKFYSKDDFQRKLTYVGETVQTRNLSTLMLFGKYDADFSETFSHIFKEVQYLRVLR LPTLTYSIDYLLSNFSKLIHLRYLELISSGPGGPLPEVICQLYHLQVLDVEYWVHLST LPRAMNDLVNLRHFVARGELHALIAGVGRLKFLQELKEFRVGKTTDFQIGQLNGLREL GGSLAIYNLENICSKEESKNAGLRDKIYLKDLLLSWCSNRFEVSSVIEEEVLESLQPH SGLKCLSINGYGGISCPTWLSSINPLISLETICLDSCTKWEVLPPLGQFPLLRTLHLI QLPSSRVVPTVSSDDWTGSEKHIIFPCLEELVIRDCPELRTLGLSPCSFETEGSHTFG RLHHATIYNCPQLMNLPQFGQTKYLSTISIEGVGSFPYIRLFVRALYIKGCASPSKLD QILMLIEGNLCLLEKLTIESCLDLTYLPWKTLSKLVSLEMLVIVDCPRLSLTLYPYNQ DGGNFSFMSLLNKLVIRACSITGKQLSHLILQLPFLHYLTIGKCPKITSLLLGDVING SDSSSTSDYLQLTTDGMLQIPSHLLIQLQYLSIDDFPDLVLLWKEGFHGFTSLRTLHI TGCTQLLSPMITENKRSNKNSSLLPPLLHDLMVTHVHNELLPFLLSNLTSLSIFAISN SPELTSLVLHSCTSLETLIIEKCVGLSALEGLHSLPKLKHLRIFQCPSLAKTWGPSSV DRPGFSLYLDKLEIDTTVLFNTEVCKKLPSLRHLVFFMLSIKACPGIKSLPENGLPAS LHELYVSSCSAELKEQCKKTKNVRCVYVDRNASKFIVICKLLRLYFRITKLGAWQRSL WLQSRTGGSNELMVLTKVLFTIATTVVFRTGLVISEL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5574..5637#5228..5311#4132..4331#1..3900#atggatgtggtgggggcggcgtcctggctggttcaggtcgtcctggagaagctcgtcggcgacggcatcgacgccgcctgggccgcggcgcgcgccgggggggacccgggccgcgcccacggcggcgacgtccgccgcctcggctcccgcctccagagcctccacgccctcctctccgaggcccaagagcacgcgcccatggcacgcaggcgcagcgaggccctccttcgctctctccgtagcctggagagcctcgccaccgatgctgacaacctgctcgacgaaatgctgtaccaccaaatccaccgacggctacatccggacgagcctagtacctcctccaactcttgctcctcattgtttgcagtccaactagtggagcccaataatcgcgttgccaagagggtgcgccatagtggagatggcgataccaccggtagaattaaagacatcctagagcggatgtgtgaagccggagatgatgttcgtgaggcaatcaagatggagaaactggacgtcagtgccgctgggggaggccaagatgatcgtataattcaacggaggccaacaacatcttactccactgagccaaaggtgtttgggagggacaccgtgaaggatcgcattgtggtgatgttgattagctcagagacatgtggtgctgatttggcagtccttccaattgtggggaatggtggcgttggtaaaactacactggcacagctagtctacagtgacacaagagtgcaagctcaattcagcaagcgaatatggatttcagtgtctgttgacttcgatgaagttaggcttactcgtgagctactcgattgtgtgtccaatggtgtcaataagcatggtggtatcactaacctgaataagctccaagagattcttgaggaggatcttaagtccgagcggctactccttgttttggatgacatgtgggaagacaatgataaaagccgttggaacaagctattagcacctctgagatgtagttcattgaggggcaatgcaatcttggttacaacaagaaatcactctgtagtaaagatgattgctacaatggatcctatccatttggatggtttggaagatggtgacttttggcttctgttcaaggcatgtgcatttggtgatgaaaaatatgaagggcatccaagtttgcaggttattgggaagtgcatagctaacaagttgaagggttatcccttagctgcaaaaagtgttggtgcccttttgaatagagaccttgatggtgggcattggatgagcatattgcaaagtgacgaatggaaactgcagagaggacctgatgatatcattccagcattgatgcttagttacatacacttgccttttcatctacaaaggtgtttttcttactgtgcattgtttcctaagggtcacaggtttgatggcttagatttggtccgtgtttggatatcacaaggttttgtttcttcgaacaataagaaaatggaggacattggccatcaatatttgaatgatttagtggattgtggattttttcaaagaagcacatactattctatgcacgacctgattcatgacctggcacatattgtttcagcagatgaatgccatatgattgatggttttaattcaagtggaatagctcagtcaaccattcaacatttatctattaatacaaggtatgcttataagtgggatgtatattcccagaagttttattcaaaagatgacttccagaggaagcttacttatgttggtgaaacagtgcaaaccaggaacttgagtacattaatgctatttggaaagtatgacgcagacttttctgaaactttttcccatatttttaaagaagtgcaatatcttcgtgttctgaggctacccacgctcacttatagcatagactatttactctctaacttcagcaaattgatccatcttcgctaccttgagctaatatccagtggtcctggtggacccttgccagaggttatatgtcagctttatcatctacaggtccttgatgtcgagtactgggtacacctctccactttaccaagagccatgaatgatcttgtcaacttgaggcattttgttgcccgtggtgaattgcacgcactgattgctggagttgggagattaaagtttctccaggagttaaaggaattccgagttggaaagactactgactttcagattggacagttgaatggattaagggaattgggaggatcattagcaatttacaatctagagaacatatgtagcaaagaggagtctaagaatgctggattaagggataaaatatacctaaaggatttgttgctatcatggtgtagcaaccgatttgaggtaagttctgttatcgaggaagaggtgcttgagagccttcaaccacactctgggcttaagtgtctaagtataaatggctatggaggtatttcttgcccaacatggttgagctccattaatccactcatcagcttagagactatctgtctagatagttgcacaaaatgggaggtccttccaccgcttgggcaatttccactccttagaacactgcatttgattcagttgccttcttcaagggttgtaccaactgtatccagtgacgactggactggttctgaaaaacatattatatttccatgcctagaagaacttgtgataagggattgccctgaactaaggacattaggattgtcaccatgctcttttgaaactgaaggctctcacacatttggccgtctccatcatgctactatctataactgtcctcaactaatgaatttaccacaatttggtcagacaaaatatttgtccacaatatctattgagggagtaggatcatttccttacatccgattgtttgtgcgagcattgtatatcaagggatgcgctagcccaagtaaattggatcaaatattaatgttgattgagggcaacctatgtcttcttgagaaattaacgattgagagttgcctcgatcttacatatttgccatggaaaacactcagcaaacttgtctctttggagatgctggtaattgtggactgcccaaggctttctttgactttatatccatataaccaagatgggggtaatttttctttcatgtcattgctcaacaagcttgtaatccgagcatgtagcattacagggaagcagttatctcacttgatcttacagttgcccttccttcattacttgacaattggaaagtgcccaaagataacatccttgttgcttggtgatgtgattaatgggagtgacagctcttcaacatctgattacctccaattgacaactgatggcatgttgcaaataccatctcatctcttaattcaacttcagtatttgagcatagatgactttccagatctggttctactctggaaagaaggcttccatggattcacctcacttcggaccctacacatcacaggatgcacacaacttctctcccccatgataacagaaaacaaaagatccaacaaaaactcttccctcctgccaccattactacatgaccttatggttactcatgtgcataatgagttgctacctttcttgctctcgaacctcacctcgttatccatatttgcaatatctaacagtccagagttaacatcccttgttcttcattcttgcacatctttagaaactttgatcattgagaaatgtgttgggctgtctgctctagagggtttgcattccctccccaaacttaagcatctacggatttttcaatgccctagtttggctaaaacatggggcccttcctcagtggacaggccaggtttctctttatatctagacaagcttgaaattgataccactgtgttatttaacacagaagtttgcaagaagcttccatctcttcgacatttagtgtttttcatggtaactattaacacaattagtcaataatttcgttggaacagataaacttgctcaatatacagtggtttctcatcacttcattttttgcaggcaaagaatgtgagatccttcacagaagaagaagaaaaagcactttgtcacctcacatctctccatgtacttgatttttgttattgccctaatctcctatcactgcctaaaatgttgcattgcctttcttccctgaagcagttgtcaatcaaggcttgtccaggaattaaatcattgccagaaaatggcctcccagcttccttacacgagctctacgtgagcagttgcagtgcagaactaaaggagcagtgcaagaagacaaaaaatgttagatgtgtttatgttgatagaaatgcaagcaaattcatagttatatgcaagctgctacgtctctattttaggtattattttacagttttaaaaagattagcaattttattttgtgttttagacactcgtggaatgggtgctctctgtataattgttttaactgtatcaattgattagtatttatttttgttgaataactggtattgctaacctcagtttattttttgccaacctggttcatttgtaggaaacggaagagatgagaaaaatgagaactactagttatgaatgaaccttcagtttctcaatttataaaaggcatgcctatgcttcgcttaattgattattttttgtcacaagaggaggatagaagatattactgatgaaggttcacatgcagatgaattcaataaaccttgtgtgcactcaaccattctgtttaatatagtagtctcctcagatatctgtaactggatggagcttgaaatgaagatgccatgacttcagcagattagttaggctgcttcatcaccagctggatcaataactactgtctacatgaagtcaagacaacacaaggtgtggctacacttctttgcagaagatttgtttcaattgcgtttgccattattttgtattaaatcatcttttcataacaacaaataaatatttatttgcgatacct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