Os11g0515500
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Structured Information
| Gene Name |
Os11g0515500 |
|---|---|
| Description |
Similar to TRANSPORT INHIBITOR RESPONSE 1 protein (F-box/LRR-repeat protein 1) |
| Version |
NM_001074503.2 GI:297611893 GeneID:4350590 |
| Length |
5536 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0515500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:20311771..20317306 |
| Sequence Coding Region |
20312800..20313573,20314633..20315128,20316439..20316875 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:20311771..20317306 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggtgttcttcccggaggaggtggtggagcacatccttgggtttctagcgtcgcaccgcgaccgcaacgcggtgtcgctggtgtgccgggagtggtaccgcgtcgagcgcctcagccgccgctcggtgctcgtgcgcaactgctacgcggcgcgcccggagcgcgtgcacgcgcgcttccccggcctgcgctcgctgagcgtgaaggggaggccgcgctttgtccccgcggggtggggtgccgcggcgcggccatgggtggccgcgtgcgtcgccgcgtgccctggcctcgaggagctccggctgaagcggatggttgtcactgatgggtgcctcaagctgctcgcttgctcattccccaatttgaagtcgctcgtccttgttggctgtcaggggttcagcactgatgggcttgctactgtcgctaccaattgcagatttatgaaggaactggacttacaagagagtctggtggaggatcgagactctcgttggcttggatgttttcccaagccttctacattactagaatccttgaatttttcttgcttgaccggggaggtgaatagtcctgcattggaaatactggttgcaaggagtccaaatcttagaagcttgagattgaaccgttcagttccacttgatgttttggccagaattctttgtcgcagacctaggctggtggatttatgtacaggatcttttgtacgaggcaatattgttggtgcatatgctgggctattcaatagttttcaacattgcagtttgctgaagagtttatctgggttttgggatgctacaagcttgtttattccagtgattgctcctgtttgcaagaatctaacgtgcttgaaccttagctctgctccaatggtcaggagtgcttatcttattgaatttatttgtcaatgcaagaaactccaacaattgtgggtgttagatcacattggtgatgaaggattgaaaattgtagcctcatcctgtatacagctccaagagttgagagtatttcctgcgaatgcaaatgccagagcaagcactgtgacagaggaagggctagttgccatatctgcaggctgtaacaagttacagtctgtgctctatttttgccaacggatgacaaactctgcactgattactgtcgcaaagaactgcccacgattcacgtccttcagactgtgtgttcttgatccaggatcagcagacgctgtgacagggcagccattggatgagggttatggggcaatcgtacagtcatgcaaaggccttagacggctatgtttgtctggacttctcacagacacagtgttcctctacattggcatgtatgctgagaggctggagatgctttctgtagcatttgcaggagataccgacgatggcatgacctacgtgctcaatggctgcaaaaatctcaagaagctggaaatcagggacagtccttttggtgacagcgcgcttcttgcaggcatgcatcagtacgaggcaatgcgctcactctggttgtcgtcgtgtaatgtcaccctggggggttgcaagtctcttgcagcaagcatggcaaacctcaacatcgaggtcatgaatagagcagcaagtatcaatgaggcagacaatgctaatgatgcaaagaaggtgaagaagttgtatatttacaggacagttgctggaccgaggggtgatgcgcctgaattcatctcaacgttctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVFFPEEVVEHILGFLASHRDRNAVSLVCREWYRVERLSRRSVL VRNCYAARPERVHARFPGLRSLSVKGRPRFVPAGWGAAARPWVAACVAACPGLEELRL KRMVVTDGCLKLLACSFPNLKSLVLVGCQGFSTDGLATVATNCRFMKELDLQESLVED RDSRWLGCFPKPSTLLESLNFSCLTGEVNSPALEILVARSPNLRSLRLNRSVPLDVLA RILCRRPRLVDLCTGSFVRGNIVGAYAGLFNSFQHCSLLKSLSGFWDATSLFIPVIAP VCKNLTCLNLSSAPMVRSAYLIEFICQCKKLQQLWVLDHIGDEGLKIVASSCIQLQEL RVFPANANARASTVTEEGLVAISAGCNKLQSVLYFCQRMTNSALITVAKNCPRFTSFR LCVLDPGSADAVTGQPLDEGYGAIVQSCKGLRRLCLSGLLTDTVFLYIGMYAERLEML SVAFAGDTDDGMTYVLNGCKNLKKLEIRDSPFGDSALLAGMHQYEAMRSLWLSSCNVT LGGCKSLAASMANLNIEVMNRAASINEADNANDAKKVKKLYIYRTVAGPRGDAPEFIS TF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3734..4507#2179..2674#432..868#gaagaaaaaccctcacctccactcccccctcgccggagccacggcgaccctctccaccccctgccttgccgccggcgagtgtccttgcgtgcgccgccggtgagcgggtgtggatcccagcggcggcgcgatcggccttcgaatcgaactgaaaggtattgggctcttctctctcgtaactggggatcgattagatcggtgttagattggcctatttgcgtccaattagccgatcctatttcgtcccgatttcatttatatgatccgtggtgcgtgctgcagtactaattgcaattttgtttttatttttttttgcaaaataattggggctcagctgaaccctcgttgccactgctgtgaacatgtcccaaattgagaagatcgtatgagctatggggaattattaggattcttggaggcggcggcggcatatggtgttcttcccggaggaggtggtggagcacatccttgggtttctagcgtcgcaccgcgaccgcaacgcggtgtcgctggtgtgccgggagtggtaccgcgtcgagcgcctcagccgccgctcggtgctcgtgcgcaactgctacgcggcgcgcccggagcgcgtgcacgcgcgcttccccggcctgcgctcgctgagcgtgaaggggaggccgcgctttgtccccgcggggtggggtgccgcggcgcggccatgggtggccgcgtgcgtcgccgcgtgccctggcctcgaggagctccggctgaagcggatggttgtcactgatgggtgcctcaagctgctcgcttgctcattccccaatttgaagtcgctcgtccttgttggctgtcaggggttcagcactgatgggcttgctactgtcgctaccaattgcaggtgagactaatgcaagcttctagattttgtgtcgtaatgatctgaatttaggagtcctccattagatattgactttgttggctctgactgtttaagttaatcttgcatagccattttaattagctatgctttacctattgttaggtactcaggttttcaaccttcttgatgttcagtttatggcaatgctcaagtctagttcacatcatggaacctcattcgtccttgtgtacttcgtttcagtttaggctatatctatctattacaggtttagagatcataatcgcgtaactaaaactgtcaaacacaatgcacaagctcctcacaaaatttaggggcaatctaagttttgcataatttagtttgaatctccagttaaatacttacactatttttttgcattagttgttattagttaacactcttttattcatatcaaatcgtgtgatatgatttgcttgtctatttattgggattttgtgtgacttatgtcagaagataattattgaaatcacgaaaatatcacatattcatttttccatgagcacttaactgaaatacttcaagattcctttatccatagttctcaatgtttatgtgaactccatatagcaaggtggaaacaccaagaacaaccatgtaatgttggaaaattgagcaagtcactgctactagtatattgttattgcaattttaaggagcactggaaacacttcattgtatacttacacatgtttgggaaatgttttgactaataaccaagaaacagtgctggagggtggagaactggagatcaacaaaaattatacttcctaaatccatcctaaaggactaaagaaatttaaactattcactgttttactttttcctatctaatagcttttgcatttctcagtttcacagtttcatttataagccgtctcatgtttttttaataacatctattgaccttttactccaaattgaattatgataagttgtttggttatttggatgatatcatctttaagggtgttcaccatccagtattttgtgcactacctgtttgtttttggtggaactggtggtcagtgctcaagaggcaccagtgctaagcatatttcatcggcttgattaccttgatagtcatttaatcatagtagctggcaacaatttggacaactttaaatttgtgatctcatacttctgttctgttacataaagctaactttagatttattttcacctctactgtctctagtttttctgcagaagtattttggctgacacaatgcatcttatgaattttatttataactcttcgctcttagatttatgaaggaactggacttacaagagagtctggtggaggatcgagactctcgttggcttggatgttttcccaagccttctacattactagaatccttgaatttttcttgcttgaccggggaggtgaatagtcctgcattggaaatactggttgcaaggagtccaaatcttagaagcttgagattgaaccgttcagttccacttgatgttttggccagaattctttgtcgcagacctaggctggtggatttatgtacaggatcttttgtacgaggcaatattgttggtgcatatgctgggctattcaatagttttcaacattgcagtttgctgaagagtttatctgggttttgggatgctacaagcttgtttattccagtgattgctcctgtttgcaagaatctaacgtgcttgaaccttagctctgctccaatggtcaggagtgcttatcttattgaatttatttgtcaatgcaagaaactccaacaattgtgggtaagacttactagaagtaatgcaaatgatttgctagggatttatttaagtaatctagttatgaagtgtgatactgtgttggttgtttatattttcaacttacaaaatttataggggttgctggcgaatgggaaaaaatataggtgtttttttgcgaggttaagtacactgttaacgttcctgcagtcgataggtgcatttgttgtgacttgtgaggttgattatactgtttccctgtttacaagaccgttgcactggaagtatatggaatgacagtgtagatgggatatcattttcttcttatttggaacttctgttttggcaatcatatcctacttcaatcagcttatggtttgagttacatgcttagtaggcaagaatttcatatacttaaacaaaccaaaattcattttagtccactttctagtaactctcactgtttagcagaggtgaattgcacccctctgagttaaataaaaaaccacaaatttgtttgtgcgaatgttgatctgtttgtgcaaatgttactaaaatatctagatggtgagatagatttacaaatgttctagaattttgaaataacaacgttttgaattttcctgtatctttagtaatgctaccatggttttaatgttctgatttgtgttttggtcgcatcatatacagttcaacgtttgtgtcaacatggtactgattccttgatattggaagattgttaattgataacttgataaaactagtctggatccacttcataccagggaaaaagggaataatgccaaatatttgttggactagagtatcaatgtgacctaatcagttcactgtgtgattagtgcacataatgacacaataaatcaagtataataataattggggtgttatactcaggttagataagctttgtatgtgggttgtgttaacaactatttgaatagaagttaaagcttactaactgcagtagaatgctatccctatgtttcttctatttgtgatgcagttgttggttgtttcttcataaatgtgttttggttacctaggccttatccttggtttcaggtgttagatcacattggtgatgaaggattgaaaattgtagcctcatcctgtatacagctccaagagttgagagtatttcctgcgaatgcaaatgccagagcaagcactgtgacagaggaagggctagttgccatatctgcaggctgtaacaagttacagtctgtgctctatttttgccaacggatgacaaactctgcactgattactgtcgcaaagaactgcccacgattcacgtccttcagactgtgtgttcttgatccaggatcagcagacgctgtgacagggcagccattggatgagggttatggggcaatcgtacagtcatgcaaaggccttagacggctatgtttgtctggacttctcacagacacagtgttcctctacattggcatgtatgctgagaggctggagatgctttctgtagcatttgcaggagataccgacgatggcatgacctacgtgctcaatggctgcaaaaatctcaagaagctggaaatcagggacagtccttttggtgacagcgcgcttcttgcaggcatgcatcagtacgaggcaatgcgctcactctggttgtcgtcgtgtaatgtcaccctggggggttgcaagtctcttgcagcaagcatggcaaacctcaacatcgaggtcatgaatagagcagcaagtatcaatgaggcagacaatgctaatgatgcaaagaaggtgaagaagttgtatatttacaggacagttgctggaccgaggggtgatgcgcctgaattcatctcaacgttctaaatccatatatttttgaagttgaaggtttgttcttcgacaaccaccttttgtttatatcatactctgctacgtcgagttgatctacatgttctaaagatctatctatcttcacggtcgaagggatcttctaggattattttgtgtaaattcctttgctatcacctctgctatgtcattatcttccagcagtgctacacttatgattaatctccaaaattgaaactctatagttatggttaacttggcagattgattacacatcatggtaacatctaagccttgtaataccataattctagcaagtcatatgcgtggttcatcttcatgtatatacgatttcatatcgatgctctcatgtaatgtctgggaaatttgaagtgccaaattgttacttttctgagtcgaaagatatgatcagttaagcctgatgaacagctgattcagtagt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