Os11g0525600

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os11g0525600

Description

Similar to Alpha-mannosidase

Version

NM_001074525.1 GI:115485698 GeneID:4350617

Length

9181 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os11g0525600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:20886220..20895400

Sequence Coding Region

20886345..20886557,20886787..20886870,20887432..20887520,20887612..20887786,20888093..20888212
,20888314..20888400,20888478..20888549,20888889..20889002,20889110..20889210
,20889299..20889392,20889517..20889684,20889769..20889858,20890010..20890075
,20890198..20890254,20890431..20890650,20890738..20890874,20891296..20891364
,20891445..20891504,20891650..20891721,20891894..20891941,20892099..20892218
,20892466..20892531,20893064..20893176,20893544..20893628,20893969..20894079
,20894159..20894254,20894663..20894710,20894798..20894866,20894958..20895176

Expression

GEO Profiles:Os11g0525600

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008404:20886220..20895400 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgggcgcctccgccgcccgcctcgcggcgctgctcctgctcctcctcgccgccgccgctgccgtcggggagtgcgtgtacatcccctacaacacgtcggcgggggtggtgggggggaagctcaacgtgcacgtggtgccgcacacccacgacgacgtcgggtggctcaagaccgtcgaccagtactacgtcggatccaacaactccatccagggggcgtgcgtgcagaatgtgctggattcgctcgtgccagcgctgctcaaggatgagaaccgcaagttcgtctatgttgagcaggcattcttccagagatggtggagacagcagagcgacatgattaaggatatagtgaaggggctcatcagcactggacgattggaattaataaacgggggaatgtgcatgcatgatgaagcgaccgtgcactacattgacatgatagaccagactacgctcgggcacaggttcatcaaggaggagtttggtcagattccaaggattggttggcagattgatccgtttgggcactccgcagttcaggcttacctcctaggcacagaagtaggattcgatgctttttattttttccggattgattaccaagaccgtgacacacggaagggaacaaaagagctcgaggttgtgtggaggggctccaagaccttcggctcatcagctgacatctttgctggcatcttcccaaaaaattatgaaccacctcctggtcagttttacttcgaagttgatgatacttccccaatcgtccaggatgatccccttctttttgattataatgtggagcaacgggtggatgactttgttgctgcagctatagcacaggcaaatattacaaggacaaatcacgttatgtttacaatgggcacagacttcaaatatcaatatgcagaaagttggttcagacagatggacaaattaattcactacgttaataaggatggccgtgtcaatgctctgtattccacaccttcgatttatactgatgcaaaacatgctgaaaatgtgccatggcctctcaagactaatgattttttcccgtatgcagacaacccaaatgcatattggacaggttacttcacaagcagacctgccttaaaacgatacgttcgtgttatgagtggatattacttggcagctaggcagttggaattctttaaagggagaagcaactctgatctcacaacagatagtttagctgatgctctagctcttgctcagcaccatgatgctgttacaggaacggagaagcaacatgtcgcaaatgactatgcaaagagattatcaattggctatacacaagccgagaagctggtttcatcctctctctcttgcttgagccagtcaggctcaaaatcacattgtccgtcccaaacaacgaattttgaacagtgtccgctcctaaatattacatattgccccccttccgagatggacctttctcaagggaaaagtttggttgtgcttgtgtacaactctcttgggtggaaacgggaggatgtccttcgcataccggtcatcagtgactcaattgttgttcatgattctgagggaagagaagttgaatcacaacttctgcctatagctaatgcatctttgtacatgcgggagaaacatgtcaaggcttacctaggcatgttaccagctgcaaaacccaagttttggcttgcttttccagtttctgtaccacctcttggtttcaatacgtactttatatcaagcgggaagaaatcagcatcagtctctttgatgtccactctgcactcatctcaaggaagtgaaaatagtaacatgcaaattgggcaaggacagttgaaacttcaatacaatgcagctggagcattatctctgtactccaatagtaagacccaggttgaagcaaattttgagcagaagtacaagtattacataggacaggatggaaatggaagtgatcctcaggcttctggagcatacatatttcgccctaatggcacagttcctatcaagactgatggacaggttcctctgacagttctccgtgggtccatattggacgaagtgcatcagcagattaatccatggatatatcagatcaacagagtttacaaaggaaaggactatgtggagactgaatttatagttggaccaataccagtggatgatggaaatggaaaagaactatccactgaagtcgttacaaacatggcaacaaacaaaacattttacactgattccagtggacgtgacttcatcaaaaggatacgggattaccggtcagagtggaagatcgaagtgcaccagcctatcgctggaaactattatcctgttaatcttggcatttatgtggaagatggaagcagagagttatctatacttgtagacaggtctgttggaggtgccagcataaaggatggacagatagagctaatgctacacaggagactacttcatgatgatggtcgtggtgttgcagaggcattaaatgaaacaacctgttttgataatcaatgtgaaggactagttattcaaggaaagtattatctcaaaattgatccacaaggtgaaggagctaggtggcggcggacatttggccaggaaatatactcccctcttcttattgcttttgcagagcaggatggaggtaattgggtgaattcacacgttacaaaattctctgcaatggatccggcctacagcttgcctgataatgttgcattgcttactcttcaggaacttgaagacggaactgttcttcttcggttggctcacctatacgaggctggagagcacaaggatctttcagctctagctagcgtcgacctgaagagagtatttccagacaagaagattgtcaagattgttgagacaagcctatcagcgaaccaagaacgttcagccatggagaaaaagaggctgaagtggaaggtggaaggccctcctgctgatgaaaagatcgtccggggaggccccgtagatccttccaagctcgtcgttgatctgggccccatggagatacgcacattcctcatcaatttcgccccgcagtccggcaaacagttgatgtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGASAARLAALLLLLLAAAAAVGECVYIPYNTSAGVVGGKLNVH VVPHTHDDVGWLKTVDQYYVGSNNSIQGACVQNVLDSLVPALLKDENRKFVYVEQAFF QRWWRQQSDMIKDIVKGLISTGRLELINGGMCMHDEATVHYIDMIDQTTLGHRFIKEE FGQIPRIGWQIDPFGHSAVQAYLLGTEVGFDAFYFFRIDYQDRDTRKGTKELEVVWRG SKTFGSSADIFAGIFPKNYEPPPGQFYFEVDDTSPIVQDDPLLFDYNVEQRVDDFVAA AIAQANITRTNHVMFTMGTDFKYQYAESWFRQMDKLIHYVNKDGRVNALYSTPSIYTD AKHAENVPWPLKTNDFFPYADNPNAYWTGYFTSRPALKRYVRVMSGYYLAARQLEFFK GRSNSDLTTDSLADALALAQHHDAVTGTEKQHVANDYAKRLSIGYTQAEKLVSSSLSC LSQSGSKSHCPSQTTNFEQCPLLNITYCPPSEMDLSQGKSLVVLVYNSLGWKREDVLR IPVISDSIVVHDSEGREVESQLLPIANASLYMREKHVKAYLGMLPAAKPKFWLAFPVS VPPLGFNTYFISSGKKSASVSLMSTLHSSQGSENSNMQIGQGQLKLQYNAAGALSLYS NSKTQVEANFEQKYKYYIGQDGNGSDPQASGAYIFRPNGTVPIKTDGQVPLTVLRGSI LDEVHQQINPWIYQINRVYKGKDYVETEFIVGPIPVDDGNGKELSTEVVTNMATNKTF YTDSSGRDFIKRIRDYRSEWKIEVHQPIAGNYYPVNLGIYVEDGSRELSILVDRSVGG ASIKDGQIELMLHRRLLHDDGRGVAEALNETTCFDNQCEGLVIQGKYYLKIDPQGEGA RWRRTFGQEIYSPLLIAFAEQDGGNWVNSHVTKFSAMDPAYSLPDNVALLTLQELEDG TVLLRLAHLYEAGEHKDLSALASVDLKRVFPDKKIVKIVETSLSANQERSAMEKKRLK WKVEGPPADEKIVRGGPVDPSKLVVDLGPMEIRTFLINFAPQSGKQLM</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>126..338#568..651#1213..1301#1393..1567#1874..1993#2095..2181#2259..2330#2670..2783#2891..2991#3080..3173#3298..3465#3550..3639#3791..3856#3979..4035#4212..4431#4519..4655#5077..5145#5226..5285#5431..5502#5675..5722#5880..5999#6247..6312#6845..6957#7325..7409#7750..7860#7940..8035#8444..8491#8579..8647#8739..8957#gctccgcttcttcttcttagctcactccaccccccggcctcaccgcggccggccgcaacgacctccatccaccacctcccttctccaccttccacgccccttctagaagcttcgggaagaggcccatgggcgcctccgccgcccgcctcgcggcgctgctcctgctcctcctcgccgccgccgctgccgtcggggagtgcgtgtacatcccctacaacacgtcggcgggggtggtgggggggaagctcaacgtgcacgtggtgccgcacacccacgacgacgtcgggtggctcaagaccgtcgaccagtactacgtcggatccaacaactccatccaggttgctactactacttgcgctttcgatcgagagcgcgagctgcgcggcgcagtcctcggaatttccgcgattttttccccgttttttgtggggggagaaatttctacgggtttgggggagctagtttaggcatgattgatgcgctgaattttggaaacggattatctcgtttctcgtcacgttgcttgttttgaattggatttttttttctgggtgtttttggttgcagggggcgtgcgtgcagaatgtgctggattcgctcgtgccagcgctgctcaaggatgagaaccgcaagttcgtctatgttgagcaggtaacatatactccctccgtttcgaaatgtttgacgcagttgactttttagcataagtttaaccgttcgtcttattcaaaaaatttaagtaattattaattcttttcctatcatttgattcattgttaaatatatttttatgtaggcatataattttacatatttcacaaaagtttttgaataagacgaacggtcaaacacgtcttaaaaagtcaacggtgtcaaacattttgaaacggagggagtatttttttggggggtaaatcccgcctttggaagtttgtccttgtcagcaattgaattttgagccgcttggaggagtggaattggaactgcggcgggtaggaagcaatgtagtactatctgtaaccatattggtgtttctacaagcaatttctggctgacaattgtaggagttgaagttatagaagctattctatctacatccaaaatggtcaattctgcaatgtcgggagtccttttttggttggataggaagcaatgtgcaaccacttgtagacacattgactgaaattgaccaatggtttctttggtttttaggcattcttccagagatggtggagacagcagagcgacatgattaaggatatagtgaaggggctcatcagcactggacgattggaattaatgtagggtttaaatcgaatatcgctatgtatgctgcattggtagtcatgtctgtgttgtatagagaatgacatgcttcttttgctgttgcagaaacgggggaatgtgcatgcatgatgaagcgaccgtgcactacattgacatgatagaccagactacgctcgggcacaggttcatcaaggaggagtttggtcagattccaaggattggttggcagattgatccgtttgggcactccgcagttcaggcttacctcctaggcacagaagtaatccactgaactcattgatgccgtccttccagtgtttaattcgacttaaatgtaaaatgctgttatcatagtaactagttatcagcccggcgatagtaactagttatcacccatcataggtagttatgtgctgagatacaaaaatgtcattatgtataccttgctatcccctaaagagtgatgccacagagagcttttgttgacaacacaatgtagctactgaatctacacaatccaattgtttaagtgaaattagatttaccagaaaagtaattgctcagctagcattttattatgtttcaggtaggattcgatgctttttattttttccggattgattaccaagaccgtgacacacggaagggaacaaaagagctcgaggttgtgtggaggggctccaagaccttcggctcatcagctgacgtaagtgacctctttttttcacggttaatgttatgcctcaatttgatgttcttaaactctggggattccatatttcatatgaaacacacattttcttacagatctttgctggcatcttcccaaaaaattatgaaccacctcctggtcagttttacttcgaagttgatgatacttccccaatcgtccaggtaaactaatgagtactctactaatgcatatcattcaacaccagacatgaacttatacattccttgcctctatgcaggatgatccccttctttttgattataatgtggagcaacgggtggatgactttgttgctgcagctatagcacaggtacattaaactgtatgttcacacttttttcatgctgatgtagaccctctatggagccatatgcattgcatggaaatccattagtcatgttgattgatgctactgcaaagtgcaaacatcttattcaatttagactgcctttctggatgttgtagtgttaagtgtttgtcacaaattgagaatgcagttttggtgttccgtattccatgatatgtcgatcattctgctcttaatattcaaagatattagctaaatgacaacgttttaacttgaagttattgttctactcagcaatgagttgttcatcctaattcatgctcctttctttcttttctctaggcaaatattacaaggacaaatcacgttatgtttacaatgggcacagacttcaaatatcaatatgcagaaagttggttcagacagatggacaaattaattcactacgttaataaggttaagatcagcatggatattacaaatgctgactattgtttaactaatttagtttcaccatgaagttgtaatgatgatgatttcaacatgttgttccattacctcaggatggccgtgtcaatgctctgtattccacaccttcgatttatactgatgcaaaacatgctgaaaatgtgccatggcctctcaagactaatgattttttcccgtatgttctaaccttatatttcataattgatataattaacttcatttttgttgctttcacatgcaaatgactgtatttcttccatcaggtatgcagacaacccaaatgcatattggacaggttacttcacaagcagacctgccttaaaacgatacgttcgtgttatgagtggatattacttggtaaattttcatctttcattactctagcattcagatgtgcagtttcagtattatatattttcatggttacttggtactttgtggtgttcatatgcttaatattttatttgttttcacttttcaggcagctaggcagttggaattctttaaagggagaagcaactctgatctcacaacagatagtttagctgatgctctagctcttgctcagcaccatgatgctgttacaggaacggagaagcaacatgtcgcaaatgactatgcaaagagattatcaattggctatacacaagtgagttcccaagagtactgttaattcatagatgatgttctcttttggggtttgatcgcttcaatgagttcgatttttttataggccgagaagctggtttcatcctctctctcttgcttgagccagtcaggctcaaaatcacattgtccgtcccaaacaacgaattttgaacaggttggtttatatctttgtgtgtgtgagtgtctaccctggcactggttagagccaactcccttcccctgtaatgcgtggggtctgctttctcaacatgcattgtaattatacatgatgcagtatttcctttatcattatatctccttttcagtgtccgctcctaaatattacatattgccccccttccgagatggacctttctcaagggaaaagtttggtgagttctgttcttaacacaacacacaactcttttcaagatgaactacctgtttgtagttgattgatatttttaagaaaaaaacatatagctttatttttttcccaccttttatgttacaggttgtgcttgtgtacaactctcttgggtggaaacgggaggatgtccttcgcataccggtatgcaaatgttattccctgaaaagcaacatattttgttgttttaatttgctcggcatatatcaatcggaattttctgcttgtgcataagatgtgtgatgcactgatgcattgtgctactaccatgaaactgcttttgctttagatggttaattaatatgccaatttatcaacaggtcatcagtgactcaattgttgttcatgattctgagggaagagaagttgaatcacaacttctgcctatagctaatgcatctttgtacatgcgggagaaacatgtcaaggcttacctaggcatgttaccagctgcaaaacccaagttttggcttgcttttccagtttctgtaccacctcttggtttcaatacgtactttatatcaagcgggaagaaatcaggtgaattaatttctttcttcaccaaaacttagttaagagttgccatgaagtttgacgatttttcttaattcactgcatatattgcagcatcagtctctttgatgtccactctgcactcatctcaaggaagtgaaaatagtaacatgcaaattgggcaaggacagttgaaacttcaatacaatgcagctggagcattatctctgtactccaatagtaagacccaggtaatgtgccaaaggttaatcactacctccaatctggaaccttttcttctcttacaggacttgcctttgcttccattgtaaaggtataaagtagtgtactcgtaagatttgttgttgctagtagctagctaagaagtactccctccatcccattttaagtgcagccatgattttccgtgcacaactttgaccgttcgtcttatttgaaattgttttgaaaaatttaaaatacataagtcacacataaagtactattcatattttatcatctcataacaataaaaatactaattataaaacggagggagtaagaaccagtatgttatttgccctagaaaaccatgtgttcattgcttcttgctttaattattgcatatgatctaaactcacttgtactctaacaccattaacacattccaaggttgaagcaaattttgagcagaagtacaagtattacataggacaggatggaaatggaagtgatcctcaggtgcagtacaaattatataattaatttattcagcaacatttactattattggcatttatttgctctttcctgtaccctaggcttctggagcatacatatttcgccctaatggcacagttcctatcaagactgatggacaggtatgaagaagatatctaattcagtaatttgccttaagaatttccattgttttttttccgagaataacatttacactgcagcatctgttgagagattttaaaattgcacgtaagtcttacttgaagttatgttgcccacttcaaggttcctctgacagttctccgtgggtccatattggacgaagtgcatcagcagattaatccatggatatatcaggttatttctatgataattgcttgtctaaatcatcaatcattaccttttcttaactcctttctgttccacacctaaagtttattctgctctctcaatctttgtgaatgaatgggaaattatgctgctgctgttgctcatttcctgatgccttgtttttcaattctttgcacagatcaacagagtttacaaaggaaaggactatgtggagactgaatttatagtaagtgctatgccaatatgatgtaccttcattgctaaagatggtttctttaaagtcttcacattttgcaatttgcatgatgatttctttatatcctgtttatttctctttggatgagatttcggacatgtgcttaaataattgttcttacggataggttggaccaataccagtggatgatggaaatggaaaagaactatccactgaagtcgttacaaacatggcaacaaacaaaacattttacactgattccagtggacgtgacttcatcaaaagggtatgatgtgttctcactcttctttctggtaaagcacatctacactccgcactatacatctacaatgaaaataaacatagtactggaaaaaaaatccctgaattaattatgtgaatgccctcctatctctagttttggaaggggacaaggactaaacaatgcacagaagaggactgcaacagaaaatgcatcgcataattgtaaatgattatcacaatttatgctaatatataaggtgtttttgcagatacgggattaccggtcagagtggaagatcgaagtgcaccagcctatcgctggaaactattatcctgtgagcctttgtcttctccagcctctttatatatattcacaagtgtagaagcactgagaaattggtttcttccatgtctttttatcatcaaatcaatatccgaaactagtcaggagttaggtttgagttatcctcttagtttatgactttattcacgtatggctggcttctttttaaaggaatttgggttttgtttggttatttattccattgagatatgataacaataacatttagtgctagcgtaagaagttcagtgatctttacaatagaaatttttttctctttacaatacttcgatgcactaaggattatgaatgatcggaaaatgaaaatttgacatgtacgagtgagactgtcttaaagttcactcaatccttaatgtttgatgaacttacaatgttttcaattcttatttattgtgtgatgttaaaattgaaaggatccagtcatagttttctgtgtagcttcacagatagtttattttggggctgatttatgcatttgttgatgattttatatctactttcaggttaatcttggcatttatgtggaagatggaagcagagagttatctatacttgtagacaggtctgttggaggtgccagcataaaggatggacagatagagctaatgctacacaggtatatcttcaactcaaacaacatagtacaatactttgttgcttctttcatatttttctttgggggcatatcagttgataatgtggtacaaattccagtaaaataaaatacatgtctaagatggtgcatatttatcatttggtatctcgcagaagatatgagtcattgtcttgaacttttccatgaatgtatgtcatgtccttctatatagctaataattgtgtttgaggatttttttagtagctataatttttgctgtagtggaacttgcaccggttcaaaaatgtttttatgtgacatgccctttttttaactattccctttttgtgtacctctgaatggtttaaatccttgtcactctttgtaggagactacttcatgatgatggtcgtggtgttgcagaggcattaaatgaaacaacctgttttgataatcaatgtgaaggactagttgtaagtaaacagagcttattcttgaatccctgttctggatataagtcaaaataagatgtcagctactgagatcctatcagcaaaagaatatgggatcccttgtttttgaagaaaatttagagcatacttaaataaaataagttagtgctataaagtaatatatcgtttctgccctcttgaaatattttcttatctataacaaagtcctcttggagtataaagagaagatatatatgttgtgccaactgtcactagagatgtttttgttctataatgttttcaaatacattgattgtgtgcaaaaatactgtggaaaacatcttattatggtatttcacagattcaaggaaagtattatctcaaaattgatccacaaggtgaaggagctaggtggcggcggacatttggccaggaaatatactcccctcttcttattgcttttgcagagcaggtataaactggaacttatttataaaatagttgaccaaaaggttatgctagttctgagcatgtccttgctgtttactcaggatggaggtaattgggtgaattcacacgttacaaaattctctgcaatggatccggcctacagcttgcctgataatgttgcattgcttactcttcaggtatctgcgtgctatggaccactgttgtttctcttaaaagtaaaaatgaaatgcttgtctttgcactaacaactacattgaaagccctgatggattacttgattctagaggtgggaaccagaattattcccatctttggttatcgactacccaactatcgctgatttggttcacctttatgcagtataatatttatattatttttaaccatttgcaatggtgcaagctagttctttgtcctgccccaatcctgcttgatatcattgattacaaacagtaatgagccagttagctaaaaatgtgctcatgtacaaaattgatgaaaatgctttctaaatctgtatcgggcaagtgttgcacgatgtcgctttaaaagttatatgtgtcaaatgcccctgcgttggacaggaacttgaagacggaactgttcttcttcggttggctcacctatacgaggtcttgtgctatcatccttacttttccttggtataccttgatcttcctttttatttattttctgagtcttgccctgtgtaattataggctggagagcacaaggatctttcagctctagctagcgtcgacctgaagagagtatttccagacaagaaggtgatcatcatcacattttctgatatacatctatgtttgatatacatgaccattatcaacttattcgatcattccatcctcacctctccagattgtcaagattgttgagacaagcctatcagcgaaccaagaacgttcagccatggagaaaaagaggctgaagtggaaggtggaaggccctcctgctgatgaaaagatcgtccggggaggccccgtagatccttccaagctcgtcgttgatctgggccccatggagatacgcacattcctcatcaatttcgccccgcagtccggcaaacagttgatgtgaggggtgacatggccttggcaccaatgttttatttttagcttgagttcttctcatggtgatgagcaataagaaataatgtggccatggtgattggtgaccgaatgcagagatgcactggtagcatccaaccactgagccctgtttgtagcttgtaaatgaatttggcttcaccttaagttgagctcggtttcagtgaagataagtgactgaaacttttggtctcc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os11g0525600, RefSeq:Os11g0525600