Os11g0545300

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os11g0545300

Description

Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2 family protein

Version

NM_001074590.1 GI:115485828 GeneID:4350688

Length

11021 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os11g0545300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:21932287..21943307

Sequence Coding Region

21940220..21940249,21940326..21940486,21940593..21940689,21940765..21940956,21941043..21941104
,21941173..21941319,21941647..21942460

Expression

GEO Profiles:Os11g0545300

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MFGGKFRRSKVCSKCGMLSNSEEDFTLLMFNIPHREQVVAATLE DCLDHIVEENVHDSLSRCESCMNDQKSTSKCTFHETRDVVIVLQRFEPLTLGGYRKIG ELINFPTELDISPYMSGVVTDKHIYELFGIIVHEGGVIGGHYRSYVKTNCWYEVSDRD VKRVNENFVLGAQAYILFYNRKEEAKSFDEVLAFAATAMSSSDAVPTSTSKDYTERTL SPEVSSAALSCWIDAARVLEPKSYSDQDILEKYIICMDRDSSDVSERIRNAMRNCNES RQEYHFNLPTTDGPFYDDNLGQYCLLRGARFRTISTSSNVEAKRDRAVRMHFLLSEIL KLLQLKKVIDVGAIGYLEKFKFGNYSRSALLRRINDACMLLGTNRLSLNISVMSRGSI IGPVLFKVGEDVMIDASLRAVQIPHDIHLVDHIKLKKPVSFVLVVEKLSIFNMLVNLN FHVTHNCIIITGCGKPDMATRGAVFKLNYCLPVKVYILADLDLDGLQIYL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7934..7963#8040..8200#8307..8403#8479..8670#8757..8818#8887..9033#9361..10174#atacgcgacacagaacacgggcttccctccatgaactcctcctcctttgtcgaagaatatcttccagcaggtgagacattggatctgtccctgtcaatagctacgagcaagatttatcgatgcagcgttggtcaggggcctctccgtctatctgttcctatggaacctgccggccgggggctgcttccatgggagagaaaaaaaatagtctggcggtggttcgttccatagaagcacggcggaagtagtctggctgcggttcgtcccattgaaccggatctgacctggtacgttactgttctttttttcagttttcgagtatgttttttaatgttaccacaacggccggcgatatccatggatctctttctgctgtcaatagcaatgggtgagatcgatgccgcagttacccgccacaggccagatcgatctaccggcgtcagtgatatcgccgtcgaacagttcccatgttcgagatcgagatgaactaacggcggtcgggcgagatcgatctaccggcgtcagtgatatcaccggcggacggggttctgatctccaaggggagtaaagtctgtcctgtctggtggtgttttttacgatattgtatagaacaacggcgacggcaatgatatcgatgaaaataatttgtcgccctgtttctattcttcagatagatcgtcgccatgatctctccaaggagggggtaagttactatttcttgttcagtcagttttccttaactccgttttctagcatttaattacctatagcggcagtttgcgtgcagtggcttcctacactgtacgattttgactggagattgtgctctgcatcttcaatacagattgggtggttagcatcgtcgaatccaggataaaaattgagggtaggctggactgaaagtcttaagtctaagttaacaatgctaatatgaggcatacaccattatcaagtcaaatgttacacttacatgattaaatagaaaaacatagttataaaagaagtaacttgacttaccagtaagttgctaattttcttagatcttagcaaagagttaagtgagaagcctcctggatatataaatgagcaaagttagtaatgcataaatggtagaagtaaacaaatattaactaaagaaagcaacatactgctaagttgttgcattttgttcacgaggcaaggatactttacaggatactttacaggttttcagggcttggaatcgcttcatgattacattatcattgatacttttaaatatctctattacaaatctaccaacaaatcaaatattaggaaatgtaaatgataaatcccctcacttgccacgagttagtactcactaacaagtagtaacaaataacaatgaagtaaagaacagtatagcttactcactctgtcacttagagactcactggaagcagccaagtagcaagccgagcagtagcaggcaagcaactccggcggcctgctgtgctgctctgcgcttgctgccgcggggccaccagccgtgcgcccgcgccgccgcgcgcaggccccttccccttgcagcttgcgccttgtcggctttgccgcttgcgctgtgcggctgtgccgctgccgcaatcgctcgtcgcccgcagctgccacgcggccgcaatcgcacgccgccgcagcgccacgaaaaatccccacagggcaaaggttagcagccacacggtccaaactccaaaaccctaagccaagacaaaacagacacaatgggccaagtgggcttttgctaaagtgataaatgggccattttacgcgtaccggtttagctacatgacttccatggctcctgttcttcttcctcgccgccagagacggagttcttcgcctcttctcttcttcctgccttctccagctgtttccatggaagagatgctatatacttaaattttttttgcaaaaattggagggtaggctagagcctgatggagcctacatgctagaatcgccactggttagcattgctataatctttctcataatagcacatatactttcacattttattattaaaaaatattagaaacagcaatatgattttaacagcattaggatactgcataacttgaccaatatgattttatatgtctgatatctgattgttaatgtaagtcctatgtccataaagcaaatatcatggatataaaccatggtaggtggaagatcaccattaaatactacataaggtcattatcttcgctatcattaaaaatttaaattattagtggcttctctttgctatctgtagtgatatccttatacctactaaagatgatatgtcatatcttatgttcatatacgggttataaaaagtgttcataacatagtggaacagttataaaatattttatatcgtattttataagttatgaacactttttcattgtcacgttagtatagggttggacaatccattctcatctgttgtagttataattttatacagcttagacaatctagcctttatacaacttattaacacgtgaattcaaagaattttcaattaaaatgaaaacatcgatgtattattaccctctagaattaatgtatcactcctagtaaatcctccaattaatttaagtaagaatatactctactctcaatattatttacctagatttaaaaaagttgtcctcattcatgaactattttccttaaatttaaaatatttttaaattataatacttacttttaatctaattttaaaatacttttaagagtaaattttactttggaccatctttattgaccgaaatttcacattgggctagggctaggctcatgttttcacttaacaccacgtatagttaccgttgtttgcactttggacctggttttatagttaccattacatgagttgttgtctaggtgcttagcattttacaagaaacaatgatatggaaatctttgccatgcaaatatgcttagcacaagaacaatgattgtaaatgttataggatatcctatcatcagattaatgggacttcattactactacatatgaacattcacaacccttatactatagagacaaaattggagaaatattgagtttaagaactatttttctacaaaagatattacatgttttataatacccaactgtagtgttagtacaaattattgaattctaagttttctaacacaaaaaagaaatgagatcagatctacagtcattatattatgtgtaatttgtgaaacttggtccaaagtgcaaatgatggtaactatatatgttaagtgaaaatataagtcttaactctagtccaatgtgaaaatttggtaaataaaggttgaccaaagtgaaatttactctatttttaaattatatactcctacataaacttatttctccactctatttattatagtgaattacgctttgggctacattttattacacaagttttactctggaccacgcttaaacctaccttctcactttgaaccaggtaagtttgtcattgttgcggtttggaccaccccgaatgatttttttcactacacaccaatgaccttaaacacattgcgatctcctccatgtatgtctacatggcgagaaaagttattcagggtagttcaaattgaaaagataggtaaaggtggtccaaagtgaaacttgggtaataaaaggtggcccaaagtgcaatttattctatttattttctagttccaaatttagatatctctaaattgtatttctatgtgcactcttttccttaatagtatttatttttaatctaattttcacatataaatttctttttctacgttgattcttgtctctattattatttttcagtttttaatccaaaatttggatttttccaaaattgtatttctacacgtactattatgtcaatatttactattatttgatccactgcgatgctattattttattatgatatattcttatgtagactcattagtcataatattatttaattttaatccaaatctaaaatatttcaaaattatacttctccatggaatcgcttatctatatatttattttttaattcaaattttagatatgtcaaaattgtattttgacctagactctcttaatattatttttatccaaattttaaatatttctgcatttccacacggactctactcccaatattaattattttttacgatattgtatagaataacggtgatggcaatgatatcgatgaaaataagttgtcgccatgcatccattcttcagatagatcgtcgccatgacctctccaatgaagggggtaagttgctatttcttgttcagtcagttttccttatttgtgttttctaacgtttagctatagtggcagtttgcgtgcaggggcttgggacatctttatgtaggattttggctgggtattgcgctctgcatcatccatgcatcgccgtcctaggtctagaacttataagaaagctgagatgaaatcggctatccctacatgagagggaagtccggttcggggtgtctacaattttccctccacgtcgaaagaacagaacatttggtaattttttatttgttttactcaatttgtcaagttatagtacatagtacttttgagaaacaatacatgtattttcatagatttcagtccattgtggagtcgttccttctaaggatatgaaggtagaatgtttcaaggtttattcacggtctattgcctgtttaatgtgcttgtatgctaatattgtgaatgccgttttttaaccctatttgaattttcttagtacatacaatcctttcttttatggctctaaattttcgaagtacatacaatgtttttttaccttttttaaatctgaattttgaaatgccattttatcaagaacagatatgttattctgacctcacattttttttgtttt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External Link(s)

NCBI Gene:Os11g0545300, RefSeq:Os11g0545300