Os11g0549635

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os11g0549635

Description

ABC-1 domain containing protein

Version

NM_001189662.1 GI:297728454 GeneID:9268625

Length

7571 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os11g0549635, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:22202453..22210023

Sequence Coding Region

22202453..22202605,22202722..22202805,22203528..22203668,22205225..22205269,22206152..22206229
,22206969..22207035,22207218..22207252,22208408..22208458,22208720..22208767
,22209991..22210023

Expression

GEO Profiles:Os11g0549635

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008404:22202453..22210023 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgctccgccgccgccgcggcccgctcctcctcgccgccgccgccgccgccgcggcgggcgccgtggcggctgcgctcccctccggagaaggccgcggcgcagccccctccgtgctccacgccgtcgcccgctcctcccgcgccgtctacacgattggcttcgtggtagtggactacaagtactcgctccgtgggctggctcatgggtcggcggattaccgggataagctctccgaggttcatttgcgttcagcaaaaaagatactcaaactatgtgaagcgaacagagggttttatgtaaaggctggtcaatttgtttcgtcaataagacaagtaccaaaagaatactcatcaacactctcttgtctgcaagatcaggttcatcgaggtcggttgaataataatcaggaagtagctgtgaaggttcaatatcctgggcttgagcggcgcatgaagatagacataatgactatgtctttcttgtcaaaatctctctcttggatttttcctgattataggtttgagaagttattgactgagtttgagagaaccatgtcaatggaactagtttgcctgctcctttcaaggaatcaaagatcaacagaactaacaagcaaggaggttttgacaatggaattttgttctggctacaaggttgataacttgaactccctaaggaaagcagatatcagtccaacaaagtgctgcttgatcatggaatttataaagaattag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MLRRRRGPLLLAAAAAAAAGAVAAALPSGEGRGAAPSVLHAVAR SSRAVYTIGFVVVDYKYSLRGLAHGSADYRDKLSEVHLRSAKKILKLCEANRGFYVKA GQFVSSIRQVPKEYSSTLSCLQDQVHRGRLNNNQEVAVKVQYPGLERRMKIDIMTMSF LSKSLSWIFPDYRFEKLLTEFERTMSMELVCLLLSRNQRSTELTSKEVLTMEFCSGYK VDNLNSLRKADISPTKCCLIMEFIKN</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..153#270..353#1076..1216#2773..2817#3700..3777#4517..4583#4766..4800#5956..6006#6268..6315#7539..7571#atgctccgccgccgccgcggcccgctcctcctcgccgccgccgccgccgccgcggcgggcgccgtggcggctgcgctcccctccggagaaggccgcggcgcagccccctccgtgctccacgccgtcgcccgctcctcccgcgccgtctacacggttcgcccccaaatttgagagacgctaacctctatctctgtgtgtgtgtgtgtgggtgggtgggtgggtaattcggatgcttctcgtgctcattgctgcggatttggttgttccagattggcttcgtggtagtggactacaagtactcgctccgtgggctggctcatgggtcggcggattaccgggataagctctccgaggtttgtatggttgcgctggcggtttgcggattgcacgcgtaagctggttaatggcgatggaaaactgtaatttgtttttttgtttctctctcatggattattaggtaggtaggaatgaagtcattgatttcttcaatgtggaaaatgaacttgtaggattgtgggaagaaggatttattttgatacatgtgaccatgtgacctattgctcctggcctcctaacactgtttcagttggcaaaggaagaacggatatgaggaactttggggataggagaagctgtctcacaatttcttttttttttcctgtacggcatcaaaccaaccgttgttaacagccttatctattctaattatgaattcaacatcgtggtttggtaccaaacagcgtcattgatagctattgcttcttttagaactcaacacttttagttggacagcttccttgacataattttagtttttcgtttcatttgatattttactttagaaggccatcaatcagatatctcaagcttttcccatgtcttcgtattttgatggaaacaaagttgcacaatgtgggtgctctgatgctcatttgaatagattatgtttccaggagttccatcagagttagcataacttgattaaacatgcggcatttcgaatgcagttacaaatagcaagagctccagatggttatagatctgtaaatccttaatgtttacttgtatattgtaggttcatttgcgttcagcaaaaaagatactcaaactatgtgaagcgaacagagggttttatgtaaaggctggtcaatttgtttcgtcaataagacaagtaccaaaagaatactcatcaacactctcttgtctgcaagatcaggtttactagttaatttctatcttaatgttagtgtacactgtatagcctcattagtttttttttatttaacatttttgtaataattcaggcaactccatgcaactttcaagatatcaaaatagtgatagagcagaaacttggcaaggatttacatagcatgtaagtattaaaggttcatgattttttaaacttgattgtgttatctgtagtatgcagagctgtggttataggcaggttcggaggatagcgtggacttaacagggttgtggtcccccagaaaattttcctttagctactatgcagcagcaattggcacacaagcccatgtgtggtagctagtagtatgcagcatagcagctgggccgtgtctcagtcccagtgtggctgatcatcctctcggaccagctactcaacagttaggcttagttcgtgaattttgatggacttgccatattaattgctcactgctgcttatctttgtttcttgtgtggtgactgatgagagagctacacaccgtggaaagaagtaacaggatctgtgagagcaatgtccattaagcatgtggcagttaggcctgatattagtgtgtaatagattcgtagtgtatttttagtactaaatttggtattttaatagtgtgttaatgaataccattaactttttggtcccccattggtagttcactcaaactccatcactggttataggaagtgaggttttctccattttgtttcttttaaaaaaaaatctgtgtcatatgtctttatgttggcattttatggtctcttaaaagattatctaagttcaacatcaaatcttccttaggtatagctaaaaaagggtatcataaacttgttctctactgtatgcagagtgctgaaaagtagagtttgcatgcttttcattgcataaaactatcatataacctgtgatgtacctgatggttactctggtgtggttcattgtcgtcagagtagattgtgcatgagtttgcttcttagctggttcaatctagacatgccatgggctcttcggtttacttttttaccctttgtcagcctgtgatgtgtgtccttgatagcttgtgtaccatcgcaattggctgctaggatgcttagctaaggttggttgacattagtgctagtgtcatctccttgccatttgcattaagcaatggctatatgaatgcactgactttataacactgttggaccaatttgttcacgtttagctagtagtggtgggttgagtttcccatggttagctctagctgcattcgaactttcatggaccacctgtatcaactaagattaaacttttaggctgagtgggggtgaatgcatgtgttcttgcaagcaggacttacccagggctgtatatttaaaagttgatagctcttgtcagctgtacaaatagctcgtaattttattgaaattttctgttgattagttgcatagtttccaaattcaggcaaaaagtgtttaagatttaatacttgagtatcagattcctggaatttgatgaacatccgattgctgctgcatcaattgctcaggttcatcgaggtcggttgaataataatcaggaagtagctgtgaaggttggttgctgtgaacatgtatctcttacctgtcccattattgttctcaaagatattttagtgattgtttgatcctatactgttatgtcttcaccattcaaatgaagcagggtgtaatgtcctgtgctctgcaatacatttatgtaaaccattgaaaatatgtccagcttgatatcatcacactgcatgctcacagtttcaagacagaagtcagagagattgcatttatgtgaaatccaccatccagagttataacttgcacagggacctaacaaatttatatccaccatcccagttctaccttatagctttgcacatctatcaaatttatggatgcttgtcaacagaacttttaatttaaggatggacaactgccaatttcaaactttagtaatttatccaactctttacacaaattacaagttggagtattcttctaaatttcacagccaatgagaaagttggattacctgaaaaattttttgattattaacttaggctacaacaatttctaactttagcttagccatatgaaatgtttatacactaattttacatggaagcagctaagccatccaatatccattgatgtgaacatgaatttttcatctcaattcttttgactcagagcatagcataaactgatctcttgcacctttttttttaaaaaaaaatatagcgatatggttttatcataattttgctagcagaattgtggaaacggacagaagtgaatatttcccctctctttactggagatatccttttatattcaatttgaaatgccatttcattatttccctataatgtcttgctacattgtctttcttggtgtgcatgtatattaatctagaggacctccatcttaactgtgtcatataggttcaatatcctgggcttgagcggcgcatgaagatagacataatgactatgtctttcttgtcaaaatctctctcttgggtatgttacatgtttcaattttgcgatttccattgatttgcaaaattgtattttgtgcatgtagctcattttacatgaaaactattttttacccatgtaatttattactatcatctacacaatattctgaaagaagagcaggtaatgagcacagttcaattatattgtcaactgtcagcttttttaacatcaagattgttactaaaattctaaaaataaaccattcttgaagcactagtgtccctggcaaaatttttgtaaaaaagagagtatgcaatcctaagcaagcaattgtttttttttgttgattagcttgactcttaactgttttaagtggcagttgccataaatgtacaacgtaaaattttcattgattgtaaagcttgacatgtgccatgatatgtttaaggaatgttatcagtgttttagtttgtggcatcattaatgaaaagttgatttggggttatttcttaaatccaaagcaaaccactgatttcttattagcgtgatgctacttctgtttttgacactgtttagccttttatggtagttgccataattggataactttaaaaagtaaagtacttactgactacaattggtacaataattgacttttccagtgtggtaaactattcttattttcttttctcatgccttatgtttattgaagttcagatctaagaaattagagtaatttattggtggaattgaaaatttgatggttttctatttgcagatttttcctgattataggtttgagaagttattgactgagtttgagagaaccatgtcaatggaactaggtaaatgcatggaagtttctttatttctaataaatattgtgttacttttatgtattatcagttgaaataattttctttgatgttctggtttcatgatgtatagagccatctattattttgctcgagccatagtattgcattcagtaaagctagttgctgttgtcttttttttttttaatcagtttgcctgctcctttcaaggaatcaaagatcaacagtacagatctcgtgtttgttcaaatcaatcaatacatgctttttttaaaagaaaagttcaatgtactctatataacacgattggacatagttatatcagttaaattcattatacgttttcttttcaatttctttaaataattcatgatgtgttaaaacatcaggtgtatctcacccctttgtgcacttctctgtgcattttactagcatcaaactttggttaatctgtgtatgtggattttggacactgaaaatatttccgggcccctgtagctgattttaggcacttaaaaagtgaggacccctatagctgcactgtgcactcaatttgttgtttctattgtatagaacttacagttgttgtattgcagattttatccaagaggctaagaattctgagagaacagctagctgcttcaggaaaaataatgttgtcaaagtaccttgcgtgttttgggtatggagcctgtccaacctttattcttagagcatctccaaccagttgtacttagcttatgaaaacagttatatctaaagcccttcacatgatctagtgcttatttgagagagattacaagctagtactattttggccatcatctagtgcttattttgcacctagcttataaaaccagtaagccaagaatgtgtgcattcagagaaatttgttcactagaaccctagttttctattgaacaacaaagaaattaatgtcttgctacatcatgcaagaaatgagcatccaatgttgaacttcgaacaacagcttgattgcattttgagaagtgtaaattaatactttataggattaaacaatgaacaagcaattggctaccataaaaaaaaatgactgcctgaaaccaaaagaaaattaaaagaatcatttagttctatcagttttccatgctatctatcggttgaacttttgtgatactaaatgttttccattggctaaacttttgtgctattgaagagaagttttctattggataaattttgtgctactgaagtaaaattttctttgacagacttattcaactcattgctaatattttgggtcatcagttgttatatcacattttaatctgttgctgcatacagtgctaataattttggtttgtgtatataactttgactaaagttaaagctgttataggaactaacaagcaaggaggttttgacaatggaattttgttctggctacaaggtaaattgctatttcttggtgatatttataaagtttatattggagcttcattcatcaatcaattggatctcatccattatcgaaacatactctgttaagtgtaaactccataaagatatggaaaaggaaagagagaaattctgcatagagaaaggaataggaaggaggtggaggacattacctccagttgctattgtatctgaaaattctgtaatgcaaaaatagatggaacatattacatctttcttacttttgtgacaggttgataacttgaactccctaaggaaagcagatatcagtccaacaaaggtttctttttagttcttggcaccaaacatttgtttatcactttatcctgaatgatttcctgagaaattttcttgcatgaatccatattgttgatttgacaaaaattagaaagggtttccaaatagacaagcacataagtgtgtacctacataagattggtacaagtaatatggcatgcccagcccaaataaggtttaatgatttggattgttcatgcataagacatggaagatctattgctacacttctatttatctggtgtcatagtttttggtcacctttagctaggaagtcattcaaatgtgtagagaattgttgatataatattcttgtcttatgacttgtaagcattttagatttcacaatttgaaattgttgcttaacaccttacagacagatctgtggcatggttagtttagaaaatgctgtgcatttttcactatttggtccacatatttttatataacacagattgtacaagtgtattcttgtcggaagtataattggtacttgtttatgtattacctaaggagattgcagaatctgaagttctgaacaaagaaggatattaatttattctaattttgcttgttatacttgatattaaaattttattcactgactagctaattgatttttctctgtttttggtacctttctatgcttatcattcaggtagctaaagcattaattgaactgtttggcgaaatgatttttgtacatggttttgttcatggcgatcctcatcctggaaatatattagtttctcctcaaggccaagggaaattttcattaggtgctcttttttgcttaaaaacatggcatttcctgcatgtctatatgcatatatttatattgtaggattaggtcctcatcgtttgcccatatttcttaataagctaaaatggcttattagggaacaaaaattaatttgtaggtaaaacttttatatatgtgttcatatcgacttaaaagccatctgaaaaagaaactatgtttaaaatatcttaaaatcaacttcaaaattaagtttgaaaaatcaaattttggcttttgctttggcttattagtgcaaagcaatggggctctaagaatgtacggtatggtgagaagcacatggtttgaagagagtagacacttaatatattccagtcattagattctattttgtaaagtgagctttaaattatttttagttggttaagtgatccatatttttgcagtgctgcttgatcatggaatttataaagaattag</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os11g0549635, RefSeq:Os11g0549635