Os05g0548400

From RiceWiki
Revision as of 10:32, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os05g0548400| Description = Conserved hypothetical protein| Version = NM_001062762.1 GI:115465254 GeneID:4339512| Length = 7780 bp| Definition ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os05g0548400

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001062762.1 GI:115465254 GeneID:4339512

Length

7780 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0548400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:27290808..27298587

Sequence Coding Region

27290866..27291288

Expression

GEO Profiles:Os05g0548400

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008398:27290808..27298587 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008398:27290808..27298587 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgggaaaatccatgatcagctgcccaaattcgttttgttttacaacattactcacaaacgattggaagctactattgcagattgtcacatcaggtgtgttgtgccggcgtcaagatgttcctcctcttgggcttttgtcagaagcaagggccaaggggtcactctggattctgctgcatgatgcagcagctgttcatggagttccagccttccaggagatggtgatggtcctcgcgtttagatttcttgcacccatttccatctctagttggagagaggatgaggaaggcggcggcgatgcagggattatgctgctgatcagtggaccttcaatcgtagattcaccacctcagaacaatttggatggaagagtttcaaattttgtgcagcattacgaactgcaaagttgttgcgtgacttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGKSMISCPNSFCFTTLLTNDWKLLLQIVTSGVLCRRQDVPPLG LLSEARAKGSLWILLHDAAAVHGVPAFQEMVMVLAFRFLAPISISSWREDEEGGGDAG IMLLISGPSIVDSPPQNNLDGRVSNFVQHYELQSCCVT</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7300..7722#aaaagtttactacgaccacgaagtcctccttcctccccttcgcctccaaaggctcaaaggctccgcgacgaaaggcgaggcgaccgccgctgccgccgcccgccgccgcagtcctcgccgccgccggaaccgaccgtacggcgtccgctgcattccgagtctccgtagtcttcgcgccgcctgatgaagtaagtagtatccggcctctcgcagcgcgtgttctaaatccctttttaagctgtgatttctgcttgcgaatagatgtggttataagcgtgaattgttaccgttggctgttgtagattcctcttgtgctatgctagttgggatcatatttactgagtttttgatgctttgaagtagtgtcacatagatgaaattgtagtttgtaggggaggagtaagcagacgagcaggaaatttctaatcctgcgtcgctattagcatttttggtcttgtagccatctaaatttggtgtctactactccagattccagagcaagtgactagagaagatatttgctgttaaatgttaagttcaagagttatttgaataaaaaatattttcaagcaaccaattagctgcagatacaatgcgattcttaggccttgagatcaggttttgtatgcagatgataagggggcagtatcaataaaagcctaattttgacacattttggttactagcaataagcgcccatggaacttatggatgtcttttttgtttaaaccaaaaaattgtgtttgatcaaatttattccattgcgtgaatatttgtattatgtcacattatggcgaagttccacaagtgaagcataagctccactggcaatccccatgagtgcctcgtgcctccccttctcaacaattgcaccgtccttcaggactgcaataatatcagcgccttggattgttgagaggcggtgtgcaacaacaacggttgtccttccaaccatcacatggtccagtgcatcttgaacgatgcgctctgactcagcatctaatgcgctcgtcgcctcatctaggagtagtatcctgggatccttgacgatggcccttgcaatggctattcgttgtttttgcccacctgataattgggttcccctctctccgacactggtgctgtacccctctggcatacttgatatgaactcgtgggcatttgctgccttagcagctgccacaatctcttcctcagttacttcttcattctttccataagctatgttggcacggatcgtatcattgaaaagcactggttcttggctaactaatcccatctggtccctcaaccaactgatctctagtttcttgatttctacaccatctaataagattacaccagaatcaggatcataaaaccgttctagtaacgcaattgctgtagacttgccgctgccactctgaccaacaagtgccacagtctgcaataagcaggttttgagttagtccctggacaataaactaaatcttcaaaaaaaaaaattgagagaacattgacaaaattaggcttctgttaaattaagaccttcccagaggggatgctcaaggtaaagtcactgaagatttgaacatctggacgggatgggtatctgaaactgatatgcgtaaattcaatgtcacccttgacaagctccaaggttaaaccttcgttgctgctggaatcaatttgagattttctatctaagattgcaaatatggaagaagcagaatccttagccttgctcgagtcagaagccatggcagcagttgatgatactcccagcatggccacaactaaagaaaagaaagcctgcactataataatttgaagtaaatatcaaagtaaaacattcataaataaatttgaaaatgatttctagatgtgaccttgaagacatcgccaaaagtagagttgccttgactaacaaactttgcaccaacatagtagcaaagagcagaggtcataaacaacatcatgtttgagaaaccaaaaccaaggcctccaactatccccgttcttattccctggtatctagaagcttgacatttctgattgtattttgtcatcactttcttctcagcacaataagatgctactgttctgatgctaccaactgcatcagttgcaacttggcttgcttcttcatacatgatctacagtcacatatcaaacataaatggaaaacaaacaactttaaaaatgactgtcacatccataaggatgaaaggaaagagaatgcacaaatatatcgtgtcatatagtctaccatcaacgaaatgtgtaacttgtcaattttttcagtgtgaagcatgtatggagtaaaacttataagatcacacacttcaggaaaaaacatgcggaaatgtccataaaactaattatttgctcaccttagcatcttgactgaacccctgtaggaacctcacttgagcatagccctgtagaccgattaaaggaattacaaataagattatcaatgaaagtttccagtccgcgatcattgcaattaatattccacaaactagggttgcagtgcattggacaagcaaggccaaattatcgcctacaaggcgtctcacattaagggcatcgacacatagctttccaccaagagctccactataacaaatgacacaattagtatcttgaatattcgattccaatgatataatgaacatatgattaactcacctagaatttgctggatgatcaaaccaagaaacttcttggtgtactatgcttcgaaatgtcaaagcacggatgcgctttataagtttcccaccagcgattgcaaatagaaggatatttgctagctttgatatcatagcaattgcacccatgccaacacagagcaatccccaaaaggttgcatctttctctcgcttgtctggtgattcataaaaaactttaacagcactggccaatactaaaccaatcattgggaagacagctccatcaattgctgctgcaagagaaccaaacagaagaattgcgatttctggtttgtttaggctaattaggcgacccatggatccttttttgggtaactttccatcatttttcaaattgcgattctcaccgtctgcaccatcatactctagtaattcagtggccccacgcaagctgaaggggaggtttaaagaatgggagctgctcccagctgaatttctacttaatgagcgtttgagtgactggctccttttatttaatggaccatctaagtgggggtcgattgcctgttgcgcctcttgtagccgaataagttgagagtatgccccgttaggatccttaaccaattcatcatgatgtcctgcatatgcagtttattgttgttaatctgcttcgggaaaaaataagataaagaatgcacagaaaagacatcaaccttgttctgcgatttttcctttatgtacaactgagatgcagtgggcatttctcacagtgctcaaacggtgtgccacaacaagggtggtccttccaaccatgatctgattcagtgcgtcttggactatcctctcagactccaaatccaatgcactagtggcttcatcaagcaaaaggattttggggtttttaagtatggctctggcaattgctatcctttgcttctgcccccctgaaagctgagcgccacgctgtccaactaatgtatcgtaaccctgaaatcatgtgaatacaagattagttcttcatacatgaggtgtgtgttggtatgaacagatagtgttatgtgtgtacattaggcatgctctcaatgaatcttgctgcattggcaagctcagctgctctcttaatttcttcaagtgttgcattctctttgccataaagtatattgtccttgatagatgtcatgaagagtattggttcctggttaacaaggccaatcttccctcgtatccactccagcctcaagctcttgatgttcattccatcaatcaaaacctcaccagcctgtggatcgtaaaatctctcaactagatttatcacagttgatttgccgctaccactctcccctactatggccattgttgttccatttgatacacacatcgaaaatccatcaaatatcaattgctccgacctgctcgggtaactgaagaatacatcctttagctctatgtcacccttgatatcttctaacacaatcccgctagtatcatcatagtcaatctctggtttcctcttgattactttaaacaatctgtaagcagcaattcttccttcttcaaaggcagcagtacagggggtcgcatcacctaaagctctattccaaacatttgaaaatgtgcatgttaggaaatatagtccatgatgcgttgaaaattaagcttgagtttgtgaaattccatacaggcaccaatattagctagtgctattaatttgttgtagagtaatataatgtaggcccattggttgaatttagctgctgatttcgaatggattcttagcatcaatacctaccttgcacctatcatgataccaaacaagatgttcatgatatccgccccactatatcctctactgaggcttagcttactgccataccatacaattaatccaaagctggaaaaatagattaagttgaggaaacccatgccaaagccttggataaacccttccttgaccgcacccttgtatgctttctttatcagatcgttgtagaggccaatggctttcttttcaccattgaaggataccacctgttattgagtacacacatgtgcacaaattaatttactatttgtcatctacattgcaccattaagaaaatgcctaccgttcttatagatccaactgtttgttcaacaatgtcccctgccttgctgtatgatgctaggccctcgttagatattttggctaacatctttgagacaattccggcagcaaagataaaaggtggtatggtagaaagcatgacgagagtgagaagccagcctttgaggaacgcaagcacaaaaccaccagggaaagtggtaacaagctgtagaaacttcccaacctaaaagcaagaatatttcttttaggcaaaaaaggagtgctaaagcctaaataagattacagcgaattgaaatggtcaatctaaaaataataaagagggtagatcaataagagccatgttctgttggtagtcgcagcatgtatagtagccaagagcatcactgaaatagtagctaactttattttatattgtagaaggtcaaaagcaatgaacaagaaacaacttggtttgtgcagttaccttctcaccagtagcaccttgaattagtgtagtgtcagtagagatactggagataacttgtccagttgtcatttccttgtcaaagaatgccatatcttgtcgcagaattgtcttgagatacaaggatcgaatgcgagtggcctgcctttccccagtcacagaccagcatgacacctctgtcaagcgtagctattatggtcatctatttatatctgatgtaagagttattttgttgccctcctattattaactgtgccacagaattatcatggcctcactggatgttttttttttttttggccgggtcagtcaaaggttggctgaccaatttcattaagattgggaagaaaggcctcactggatgttcagatactagaatgtggctattgggtgttcaggtatttgtagattatgatcatatgatatgtgtagcttctcttttctaataattaggatgcttagtcatgctatcatcaatatgtattccatacaaaaatatccgtaaagataattgtatcaatcatacttacggagaaaacaaacaatccctgatccaatgcccaagtagacaaagtatagtaccgcctgaaagaaaaataagatataataacaaacatattagatcagtatatagctatgaagtaatattttatatttttaaactcccttttactcctctttaacacgatagggagctcttgacattttcctcaaaataactctcaagttgtgtattaatattttacttataaagctaaatcagcaaaattaggacgaatgctgctcatgtatttaagttgaggccatgacagtgttaatatcaattttcgttcatatttgtcctgtaagctgttagcatagaccaataactattaacatggtccagtcaacatttgcaggcctgccttcatgcagaaacaaaagggggatcatcagtatctgtaccttgttgacttgatgaaggatgttgcccggggatgatttcccaaaggcgtcgaccatctgcccgaagatgatggtcatgattacttgtgacatgccgcttgcaagtgatgctatggtgccaaccagcatcaacgccacatctgtgctgtccgcatacttgaacaggtgatggaatgccaccttgccatccttggccatcctcctgtcattctcttcctttccacgcttatctccatcagcagctcttgctgtggatgcttcttccatgttctgcctacttagtaccagagcaacatgtgctttacttgttatgtattgctttggctgatatgggttgtctagcttttatagtgtccttgtcatgttagattccacgtaactgttttctcaagaaaagataccagttaactgcattcacaagagttaacagaaaagatagtgaggttttattttttctttctttttgcaaaaatatagtgaggttataattgtggtaacaaaggataatgacatgaacatataaagagtggcaagacggccatgaagcgagtaaaatggggaaatgattagccagacaacaccttcttcatgtctcatctttgtccaggatgtcaactctatgttgtttagttgtgaatgtcggacttattgcaaactcttgtgctttttttacacagataacttgaacagcccatggcagaaatcatggcgatatcgacaggaatctgaggatccatgtgtctttaaagtcgtatcctctgcttccatcaggtaactaggacattttggcagagcctgcttaaacctacatgtaagtttgtttatctgctgcacaagctgacctggtcgtgtagtttgcagtctgatggttactctatttcgtgtctgaatctgcagatagctttcacttgatctgggcaggtagtctcttatctaaatgaaaaataaactgcaagcagatgcagccagggtgaccgcccaatttttaaatgagacaatgcagtctgattgaaggatctatgttcggttccgttaagcatctcatctattgtgtcttcttccttttgtttcacgtgtgaaggtgatgttttatcgggagtctgtgtaggaatgttttttaatctgttgctttcatgggaaaatccatgatcagctgcccaaattcgttttgttttacaacattactcacaaacgattggaagctactattgcagattgtcacatcaggtgtgttgtgccggcgtcaagatgttcctcctcttgggcttttgtcagaagcaagggccaaggggtcactctggattctgctgcatgatgcagcagctgttcatggagttccagccttccaggagatggtgatggtcctcgcgtttagatttcttgcacccatttccatctctagttggagagaggatgaggaaggcggcggcgatgcagggattatgctgctgatcagtggaccttcaatcgtagattcaccacctcagaacaatttggatggaagagtttcaaattttgtgcagcattacgaactgcaaagttgttgcgtgacttgattttgttgccctatagtctgatgatgtacttgccatttgaaacggccagattctcgct</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0548400, RefSeq:Os05g0548400