Os05g0582100
| Gene Name |
Os05g0582100 |
|---|---|
| Description |
Cas1p-like family protein |
| Version |
NM_001062971.2 GI:297604973 GeneID:4339732 |
| Length |
4657 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0582100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:29041810..29046466 |
| Sequence Coding Region |
29042320..29042478,29042559..29042655,29043122..29043178,29043259..29043321,29043439..29043527 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>VSFLLGLFPVLIGWIYAEILEYRKSLLYGKVHSDANLENETMKE DDKAVLLEGGQSKSPSTKLRNMSTKANLIRFITMDESFLLENRAVLRAMAEVGIILVY FYICDRTNIFPETKKSYNRDLFLFLYILLIIASALTSLKKHNEKSAFTGKSILYLNRH QTEEWKGWMQVLFLMYHYFAATEIYNAIRVFIAAYVWMTGFGNFSYYYIKKDFSIARF AQMMWRLNFFVAFCCIVLDNDYMLYYICPMHTLFTLMVYGSLGLFNKYNEKPSVMAIK IACCFLTVILIWEIPGVFEFLWAPFTFLLGYKDPEPSKANLPLLHEWHFRSGLDRYIW IIGMIYAYFHPNVERWMEKLEESETKVRLFIKGAIVTLSLTAGYLWYEYIYRLDKITY NKYHPYTSWIPITVYICLRNCTQQLRSASLALFAWLGKITLETYISQIHIWLRSSTPN GQPKWLLSFVPDYPLLNFMLTTAIYLLLSYRVFEITGVLKGAFIPSRDNNRLYQNFIA GIAISACLYFCSLILVKITIV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3989..4147#3812..3908#3289..3345#3146..3208#2940..3028#2696..2782#2399..2520#2061..2316#1817..1966#1283..1441#669..741#537..593#318..446#1..92#gtttcgtttttgctgggtcttttccctgtcctcattggatggatctacgccgaaatcttagaatacaggaaatctttgttgtatgggaaagtgtaagatttctttctgaatactataattttatttagctttaggaacttagagttggttgttgatatgcatatattcgaagtcaactgcccaccattgctcctaataattgaatcatgtaaccagagttttcgtgatgaaactggcatgacatatcttacttcatgcaaatgttgaaaaatccatggtctaatctcctcctatccgggcattcttttcatctgcagtcactcggatgctaatttggagaatgagactatgaaggaagatgataaggctgtattacttgaaggagggcagtcaaaatcgccatctacaaagctccgaaacatgtctacaaaagcaaatttaatacggtactgtttgaatgcataatgcacagtttttaggattttagcaaattctattgcagttaagtgatgtctcgatgtggctgtgagttgcaggtttataacaatggacgagtcttttctgcttgaaaaccgtgctgtgctaagagcaatgtaagactattcagagctaattttttccactctagaatttcgtgctaagacgcacaccctttaactttcttgcagggccgaagtgggcattattctggtctacttttacatttgtgaccggacaaatatatttccagaaactaagaaggtaaccatattgctccttttcttactcttgacactctcaatgatgtactatatggagtagatgtaaactgcaacatgtagcttttggctaaattgtaactgtagcttgttccacatccctggggatagttcttactgttttttataatctaccatatcttgtttcttaattgttcttcctgcaattaattcttgcaagttatagggacttttctgccttagtttcagtgtaggcttatctctaaaacaagatagagaccgtgagttagggctaagtaggtgacatatctgttccttatctagttatctgactggcttaagctttctgccatctcatacagacagaactcatagccaatggatgtgagcatgtggcttgtagaaaggggataggttataagtcggggatcggggtcttgttggccaacttttctcgttgatctaataagctagaatttagggatttacctcaattaggccaaaaaagcattatatgatgttcatttctgcagtatatagtaatctttgtgttgttttgacagagctacaaccgcgacctgtttctgtttctgtacattcttcttatcatagcatcggcacttacttcacttaagaagcacaatgaaaaatcagctttcactggaaagtcaatactctatcttaatcgtcaccaaactgaggaatggaaagggtggatgcaggttagtgactttacttcactgcttctgttcttttagtaaatgtgatttcagttatttctgtactgagtttttatagcgcatggttatcatccttcctgttttgtacacgcaagcaatgtactttgatgtttgttcaccaggcattgagttagaaaaaaaaactctgggtattcttatccaaatcgtgctctcagttttatgtcatgcactgtttttatttggacaagccctatgttacagccatttcatgcctcagaaatttccaactactgtcgtagcacttttatattctttctcgctgttgtattatgcaatccttttagtacttgtatgttggctttaagtgtgctataattattttatctgcctttccaggtcttgtttctgatgtaccactatttcgctgccacagaaatatacaatgcaattcgggtgttcattgctgcctatgtctggatgactggattcgggaatttctcatattattatatcaagaaagattttagcattgcaagatttgcacaggtttccatcctagcccaattatccaatgttgtttcttaccccttgatttgttgtaaccatcttagaaatactaaagaccatcttttaaatgcagatgatgtggaggctaaatttctttgtggccttctgttgcattgtccttgacaatgattacatgctgtattatatatgtccaatgcacacactttttactctgatggtatacggatcacttggtctgttcaacaagtacaatgagaaaccatctgtcatggctattaagattgcttgctgcttcttgactgtcattttgatatgggaaattcctggggtatttgaatttttatgggccccctttacatttcttctaggtgagttatgcatgttttctgtcttagcattattctcattaaccatggataggattttacaccattttcctttcatgtacaggatataaggatccagagccttccaaggcaaacttacccctgctacatgagtggcatttccgatctggccttgatcgatacatatggattattggaatgatctatgcttacttccaccctaatgtaagtaattcggttatggatccacatttcctccctttggaactgcatgagtgagcagtacatataccgtgttcctttcatacatttcttcctagggagttctctcttattttaagaatatgttccttgtttatactatatattaatgtagcatggaatccgctatctgaaataggttgaacgttggatggagaagttggaggaatctgagactaaggttagactgtttatcaagggagccattgtcactctttctttgacggtaagttgcatccatcttttaccaatgcacagactttctatattgtcaagatgacatacttgtttgctttaccaactagatttgcttttgttttaaaccatgatgctgtattgatttcaaatgctgtactaactaggacttctgttcctcattttaggctggttacctatggtatgaatatatctacaggctagacaaaattacatacaacaagtaccatccctacacgtcatggattcctatcacgtacgtataaaaaacactaccatgattatatggcatgtggtaaattgtttctttaattgaatagacactttcagcaaaaagaaaacattgaattgacacaacaccgttgttttacagtgtttatatctgcctacgcaactgcacccagcagttgaggagtgcctccttggctcttttcgcgtaagcacctaatataatgatgtttctttttctttattggctttattttttactaagattttaacctgttttttcaatagctggcttggcaagatcacactagagacatacatttcccagattcacatttggctcaggtatggtatcaatttttttcagcatgtgttactgttgttttaattacttaatgcatgaccgttcaaaaaaaaaatttacgcatgaccagtccagtaatcagctctgcatctgatgtcaaatgtatgaacagaactacgaatgaaaataaacaagcaatttgacgggttgtgtattcagctgcgttgacttaacctacttggtgtaacacctacagctatcataagaactatgatagatttagatttattgatgctaacattgaaaatatattttctactttcaaagagaattcggaattcaaattcaagaaaaacacaagaaatgaagatttctggattagaatacatgtcaaaatttctttctaatatgaaatacgtctaggatttgttggcattgtccactctattgtgtccagtgtttttaattttaagaactggaaccacggtgctgattcttattttacaggtctagcacgccaaatgggcagccaaaatggctcctatcttttgtaccagattatccattgcttaacttcatgcttactacagcaatctatcttcttgtaagtgaacctgcccagggtgcattttcattcaaaaattataatcatcgaagttattaattccatgatgtatactgcagctatcataccgggtgtttgagatcacaggtgtactgaagggagcttttattcccagtagagacaacaatcggctatatcaaaattttattgcagggattgccatatctgcatgcctgtatttctgctcacttattcttgtgaaaattactattgtataggtaaacagctggaacctactatagatacttacggctttcacatagtctgtctctatatatcccagtttcctcagtattggttccacgtgattacaggtagaattgccaagtaaatgaccttgatagaaggtcgttcctgaaaattgtgtgcttggtatctggtggtaagatattcagctcaggcctcaattccattttgcatttggaggtaaagatacagttcccatgaaggacctgccgatcttctagttgggaattgaattgccagaggatgtaggtatagaagtcaaattttgatttatcatttcccccatttaaaacactgtacacagttagcgaagttgtgcattctttgggagttgtagatgctttcctaagttgatacaacagtgtaagaatttcctcccctcaaagcactgtaacatgtggtgtactatacagaatgatactacaaggaagggtttcccttttgtaaaacgaaatataaagggcaagccccaatctttcttt</dnaseqindica> |
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