Os05g0588700
| Gene Name |
Os05g0588700 |
|---|---|
| Description |
Histone deacetylase interacting domain containing protein |
| Version |
NM_001063011.1 GI:115465752 GeneID:4339773 |
| Length |
7225 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0588700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:29399229..29406453 |
| Sequence Coding Region |
29399522..29399594,29399671..29399771,29400041..29400193,29400309..29400447,29400554..29400624 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MDSSAGDPGDGVPSKRARTERDPYRVETMEFLVLVKSELPDDVY SHFVRSMIKIRRQRNMSIEKCKEIILEILDGQPEAIQVFEHFIQGYSPCRAKMRSKAH NFVERVKACPDISREDFHALLNVLAKYYKNEIKTSEEVLEKVERIIGNYPEFLEEFKI FVPHHLRAHLPNEKSCTSPKSSRVSETFVSFTLDAMNKLDGLRVKATNGRNQATPLKY TQDQNQNHEGRGYSLRHKQTKRTTGLIENPRKQGDDKSPHAEDDEEHKAEPLLQWSTS RENELPLKVDPSNCKHCTPSYCLLPKNCVTLQSSYQTELGRSILNDSLVSVTSGREDC YKFRTKNQYEENMFKCEDDLFESDMLLQRFRATADFIEDLQYRFGSNVKIQEHLTPLH KRCIEQLYDDSGIDMLDALSESENTSSALAVILSRLNQKIGDFSEARLSLNKMCPDTV ANNYYRSLDHCSPSFKQLDMERMSPKALLAEDKQISRIKSHTDIHIHEDVGVIINYAY SRSCSTEDKPMMNWTKLVKAFVSVKFQWPDLKDTVSRRNVCEHCGMSRDFLNNIPVAV LTNEFVFSSKEVESLRAKSNESTSSLDHFDAEVEEGEFIPDVENIQLRVRCLPTNNSM HSTYGHWSGSEEHKSSRDDSNNEVGSSEYFGRTSKECDANRGISCCTLAVLCRLLQVM YERLLVAKNLSEGASTHDSYAHFKEKLCSLIDGSTDNWNFEQHCLKFLGPNSYVLFTL DKLIDRVIKQICKIYPSREDSSVLQRQERSRRTFNILKDPALPARRTNSSKELLHHQN ARGTSIELPKQGREEAKGGCESHGDTGKMKQNHFQRRKKRALENGPPSFSQPGSGNQA HN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6860..6932#6683..6783#6261..6413#6007..6145#5830..5900#5216..5527#4646..4944#4278..4538#4078..4184#3810..3961#3579..3733#1408..1603#1081..1209#908..1009#660..813#407..579#tctttccctcggccgcgcggccgcgccgcgggggttctagaaggttccggaaggtgtggagtctcggtgccctcgtcgctcgcctccttcctccaggcgtccgccgccgccggcatacttgaggtcagtccctccactcgcgtgcgcgaatcaaggcgccgagatcacgagagtactcctcctaatcgcctcggtttcgtcagcccttacggcggattgatgacttggttgaatcgaattcctttttcggtttttttgcgaggggataaccggagcggcggtagattttggttgcctagacgaggccgtcactgtagattcgtctgttctcgtgcaggtctttgctgatttgttgcatctgtctgctcttgtgcaggtgttcgcctaaataattaggagaaatagaatggattcttccgccggtgatcctggcgatggcgttccgtccaaaagggcgaggacggagagggatccctacagagtcgagacgatggaatttttggtacttgtcaagtcagagcttcctgacgacgtatacagccatttcgtccgatctatgatcaagataaggaggcagaggtatcaatcactatatcctctcatctactcggctgtgagttttgatgactgatgataaagaatcctgatcctgaattcaggaacatgtcgattgaaaaatgcaaagaaattattctcgagatattggacggccaacctgaagccatacaggtcttcgagcacttcatccaaggatatagcccttgcagagcaaagatgcgtagcaaggcacacaatttcgttgagagagtgaaggtgcccaaagaaacccgctttgcttgctccctccttgtgtggtgtgggtgctcgtttggtaccaattgttgttaacttgaccttatacctgcaggcatgtcctgatatcagccgcgaagatttccatgctttgctgaacgttcttgctaaatattataagaacgaaatcaagaccagcgaagaagttctcgaaaaggtgttcattcttcaataatggcttgacaaaataattgcaaaggccctgatttcacaatgatttacttgcaggttgagagaatcataggtaactatcccgagttcctagaagagttcaaaatttttgtgcctcaccacctaagggctcatctgccaaatgagaaatcttgcacaagtccaaagagtagtcgagtcagcgaggtatacattacatgcttcgcataacatatgctaaggcctaactgctaatgatcattcctcgtatatcttataacatgttggtgaacaattattttataaataatttattgaactcagtatcactagctcactgctttcagtaaaattttctattctgagcgcatgtgccatcatcagtttatcaaatttcctttgcagacgtttgtgagttttactctagatgctatgaataaattggatggtctccgagtaaaagcaaccaatggaagaaaccaagcgactccattgaagtatactcaggaccaaaaccaaaaccatgaaggcagaggttatagtttgaggcataaacaaactaagagaaccactggcctgattgaaaatcctagaaagcaaggtgtgtgaaagttttctcttaatttgtttattctccaaatacaggcgagccctaggtgctttgctttaacatccttctcaggaaataatgaagttagacacaaataatgaaccctttcttaataacagtcatacatgcccaactgttttcctttttgctagagaatgcacaaatgatttgcgtatctttgcattcacctatttcatggtatcagatgttatttcgaagtatgccctagcaattgagagaaatttgataatttgacactttcttcgtcgccaatttgctttaattgactcttgtgagatgacatgtgtgaccatttgagggaatagaagtgtgccagggtgtcaaataatcgaagcccacatcgtggagtgtcactatcaaatttctcagcaattgagtgctacatttgctagagcttattttcatatatgaaaccagcatggtggcccgcgcagattacgcggctagcatcattgtattttctctcatataatagtataaatatattctcaatttattattaaaatgacaacataaatttaaattttgtactaaccaaactaccaatgtgtaacagtacattcatattgtattgtatatacgtgatagttattaattatttttaatatcaaattttagttatttctaaattgtattcccatatagactctagattcgtcttccaatattattccttattttttaattccgaattttcattatttgtaaattgtacttcctccatttcacaatgtaagtcattctagcatttccctcattcatattgatgttaatgaatctagacatatatatctatctagattcgttaatatcaatatgaatgtgggaaatgctagaatgacttacattgtgaaacggaaggagtatatatatagactctaggctcttcttccaatattatttatttttaattctgaattttattatttctaattgtatttctatgtggactctagactcatcttttaatattctttattttttaattttgaatttcagttgcttctaaattgtattcctatatggactctagactcttcttcccatattttttaattatgaattttagttttttgtaaattgtatttctatatggactttaaactctacttttaattttattattattattattccgaattttagttaattataaattcctatatggactctataatcttattctaatattctttattttttaattcttcatttcagttatttctaaattgtatttatttctaaattatatttctatatggactatatactcttctttcaatattcttttttaattccgacttttagttatttctaaattgtatatctatatggactctaacctaattttaatttacttttttttaattccgaatttttattagttctaaattgtataccggcatggactgtagtcttctcttccaatattctttattttttaattccgaatttcagctatctctaaattgtatttctatatggactttgtttttctttttctccgattaatatgataatttctaggccgtgagagcgaacgtggaggcaagttactagataataaattacaatttacagtctctaggaggaatgcaccttagaattttttaaatgaaaaggttaaaagttgaatatattggttcttaaaccctttcgtgcttcctaaattatcctaaaaagaaactatgaggaccgctattgtgaaccattcaattcaaatgttgtacagcatgatgttccgacttctgagtacaactgttttccaacagttaggtgtgttggtttttatattatctagtttctttctattgatgtgcacatgatacaatgtaacaacagacaaatgcagtatcattttgtgtggctagccacttgtttttgtattttgtatatatttaattgaaccccttgtgttgaagttatgtttaatcatttatgataggtgatgacaaatcacctcatgcagaagatgatgaggaacacaaggctgaacctttgcttcagtggagtacctcacgagaaaacgaattacccctaaaagtggatcctagtaattgcaagcattgcactcctagctattgcctgctaccaaagaatgtaaattcctacaaacgcacaagttttccatgtaaatcattggcatctgttctaacattctctttcttgatctcagtgtgtgactctccagtcaagctaccaaactgaacttggaaggtctattttaaatgattctttggtttctgttacatctggacgtgaggattgctacaagttcagaactaaaaatcaatatgaagaaaacatgtttaagtgtgaagatgacttgtaagtacacagatgttagtttttcagatgcttcagcactgttttcattctttcagctatcagcaaaaatttgcctggtcactgataatcaatgaatgttgtgtactactttttaggtttgagagtgacatgctattgcagaggtttagagcaactgctgactttattgaggatcttcaatatcggtttggcagcaatgtgaaaattcaagaacacctaactcgtaagtatactgtactatgtaaatttttcggagccaaaacttttcgagtggttagctgagtgttacattttttccttgtttttacatgtgcagctctacataagaggtgcattgaacagctatatgatgattctggcattgacatgcttgatgctttgtcagaatctgagaacaccagttctgctcttgctgttatactttctcgtctaaatcagaagataggagatttctccgaggcacgattatccttgaataaaatgtgcccagatactgttgccaataattactacagatcacttgatcattgtagtccctccttcaaacaactagacatggaaaggatgagcccaaaaggtacttttactattatgtactgctgaagctaggttctgcgttataattcatggaaattttaccattttattagttcgttcttactcatttcagtatctctcttgcagctttgctggcagaagacaaacaaatcagtcggatcaaatctcatactgatattcacattcatgaggacgtaggcgttatcattaactatgcatatagtagaagttgttctactgaagataagccaatgatgaattggacaaagttagtaaaggcatttgtttctgtgaag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