Os05g0592400

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Gene Name

Os05g0592400

Description

UV-damaged DNA binding protein

Version

NM_001063030.1 GI:115465790 GeneID:4339794

Length

8159 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0592400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:29593472..29601630

Sequence Coding Region

29593587..29593690,29594021..29594069,29594168..29594227,29594318..29594409,29594922..29594973
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,29600276..29600560,29600647..29601228

Expression

GEO Profiles:Os05g0592400

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgagcgtgtggaactacgtcgtgacggcgcacaagcccaccagcgtcacccactcctgcgtcggcaacttcaccggccccaaccagctcaacctcatcgtcgcgaaatgcacccgtatcgagatccacttgcttactcctcaaggcctccagcctatgattgatgtacctatctatggaagaatcgccacactagagctcttccgccctcataatgagactcaggacttccttttcattgcgactgaaagatacaaattctgtgttctgcagtgggatggagaaaaatcggagcttctcactagagcgatgggagatgtttctgatcgcattggtcgccctacggacaatggacagattgggatcatcgaccctgactgtagacttattggtcttcacctctacgatggattatttaaggttataccgtttgataacaaagggcagctgaaggaagctttcaatatcaggcttgaagaacttcaagtattggacatcaagttcctgtatggctgtgttaaacctactatagttgtcctctaccaggataacaaagatgcaagacatgttaagacatatgaagttgcattgaaggacaaagactttgttgagggtccttggtcgcagaacaatttagacaatggtgctggtctgttaatacctgtaccagctcctcttggtggtgtcataattattggtgaggagacaatagtttactgcaatgccaactctacatttagagctataccaatcaaacagtcaatcataagagcttacggacgggttgacccagacggttcgcgctatttacttggtgataatgcaggcatattgcatttacttgtccttacccatgaacgagagagggtaaccggtctgaaaatcgagtacttgggagagacttcaattgcatcatcaatatcatatctcgataatggtgttgtctacgttggttctcgatttggtgattcacagcttgtaaaactaaatctccaagctgacccaaatggttcatatgttgaagttcttgagcgatatgtgaaccttggacccatcgtggacttctgtgtggttgaccttgacaggcagggtcagggtcaggttgtcacttgttcaggagcatttaaagatggttcccttcgggtggttcggaatgggataggtatcaatgagcaggcttcagtagaactacaagggatcaagggtttatggtcgttgaaatcttccttcaatgatccgtatgacatgtacctagttgtgagctttataagcgagacaagattcttggctatgaacatggaagatgagttagaagaaactgagatagaaggctttgatgcgcagactcagactttgttttgtcaaaatgccatcaatgatctgcttatacaggttactgctaattctgttcgtctggttagttgtacctctcgggagctagtggatcaatggaatgcaccagaaggattttcagtcaatgttgcatcagctaatgccagtcaggttctgctggcaacaggtggtggccatcttgtttacctcgaaattaaggattctaagctggttgaagtgaaacatatacagttagaacatgagatctcctgtgttgatttgaatccaattggggagaatccacagtatagctctctggctgctgttgggatgtggactgatataagtgttagaatactttcacttccagaccttgaattaatcaggaaggagaacttaggtggagaaattgttcctcggtctgttctgctttgtaccttggaaggggtttcatatttgctctgtgctcttggagatggtcatctgttcagttttctgttgaatgcaagtacgggtgaattaactgatagaaagaaggtttctcttggtacccaaccgataagccttcgtacattctcatcaaagggtacaacccacgtgtttgcttcatcggatagaccgactgttatttatagcagcaacaagaagttgctgtatagcaatgtcaatttgaaggaagtcaaccatatgtgtccttttaatacagctgctattcctgacagccttgcaattgctaaagaaggtgaactctcaattggaaccatcgatgacatccagaagcttcatatccgtacaatccccttgaatgaacaagcacgtcgcatttgccatcaggaacagtccaggacactagcgttctgcagcttcaagcacaaccagactagtatagaggaaagcgagacacattttgttcgtcttttggatcatcaaacttttgagttcctgtcaatttatcagcttgatcaatatgagcatggctgctccatcattagctgctcattctcagatgataataatgtttattattgtgtgggaacagcatatgttttaccagaggaaaatgaaccatcaaagggccggatccttgtatttgcagttgaagatggcagactgcaattaattgtagagaaagaaactaaaggagctgtctattcgctgaatgcattcaacggaaaattgttggcagctatcaaccagaagattcaactatataagtggatgctacgggaggacggttcacatgagctgcagtctgagtgtgggcatcatgggcacatattggctttgtacactcagactcgtggcgatttcattgtagttggagacttgatgaaatcaatatccttgctcgtgtacaagcacgaggaaagtgcgattgaagagcttgctagggattacaatgcaaactggatgagtgcagttgagatgcttgatgacgagatctatattggagcagagaataactacaacattttcactgtgcggaagaacagtgatgcagcgacagatgaagagaggggcaggctggaggttgttggagagtaccatcttggagagtttgtgaatagactccggcatggttcgctggtaatgcggcttccggactcagagatgggccagatcccgacggttatctttggcaccatcaacggggttattgggattattgcttcgcttccacatgagcagtatgtatttcttgagaagctccagtcgactctggtgaagttcataaagggcgtggggaacctgagccatgagcaatggcggtcgttccacaacgacaagaagacgtcggaggcccgcaatttcctggatggtgacctgatcgagtcattccttgatctaagcagaaacaagatggaggaggtggccaagggtatgggggtccccgttgaggagctatccaagagggtggaggagctgactagattgcactag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSVWNYVVTAHKPTSVTHSCVGNFTGPNQLNLIVAKCTRIEIHL LTPQGLQPMIDVPIYGRIATLELFRPHNETQDFLFIATERYKFCVLQWDGEKSELLTR AMGDVSDRIGRPTDNGQIGIIDPDCRLIGLHLYDGLFKVIPFDNKGQLKEAFNIRLEE LQVLDIKFLYGCVKPTIVVLYQDNKDARHVKTYEVALKDKDFVEGPWSQNNLDNGAGL LIPVPAPLGGVIIIGEETIVYCNANSTFRAIPIKQSIIRAYGRVDPDGSRYLLGDNAG ILHLLVLTHERERVTGLKIEYLGETSIASSISYLDNGVVYVGSRFGDSQLVKLNLQAD PNGSYVEVLERYVNLGPIVDFCVVDLDRQGQGQVVTCSGAFKDGSLRVVRNGIGINEQ ASVELQGIKGLWSLKSSFNDPYDMYLVVSFISETRFLAMNMEDELEETEIEGFDAQTQ TLFCQNAINDLLIQVTANSVRLVSCTSRELVDQWNAPEGFSVNVASANASQVLLATGG GHLVYLEIKDSKLVEVKHIQLEHEISCVDLNPIGENPQYSSLAAVGMWTDISVRILSL PDLELIRKENLGGEIVPRSVLLCTLEGVSYLLCALGDGHLFSFLLNASTGELTDRKKV SLGTQPISLRTFSSKGTTHVFASSDRPTVIYSSNKKLLYSNVNLKEVNHMCPFNTAAI PDSLAIAKEGELSIGTIDDIQKLHIRTIPLNEQARRICHQEQSRTLAFCSFKHNQTSI EESETHFVRLLDHQTFEFLSIYQLDQYEHGCSIISCSFSDDNNVYYCVGTAYVLPEEN EPSKGRILVFAVEDGRLQLIVEKETKGAVYSLNAFNGKLLAAINQKIQLYKWMLREDG SHELQSECGHHGHILALYTQTRGDFIVVGDLMKSISLLVYKHEESAIEELARDYNANW MSAVEMLDDEIYIGAENNYNIFTVRKNSDAATDEERGRLEVVGEYHLGEFVNRLRHGS LVMRLPDSEMGQIPTVIFGTINGVIGIIASLPHEQYVFLEKLQSTLVKFIKGVGNLSH EQWRSFHNDKKTSEARNFLDGDLIESFLDLSRNKMEEVAKGMGVPVEELSKRVEELTR LH</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>116..219#550..598#697..756#847..938#1451..1502#1643..1705#1816..1865#2375..2450#2878..3090#3197..3303#3400..3508#3923..4123#4207..4422#4721..4831#5189..5464#5542..5816#6248..6599#6805..7089#7176..7757#gcgctctagactgtgcaggagagaccaccccctccctccttctagaagactagaaccctcgccatcctccccttcccccaccctagcgtcggcggcggcggcggtggcggcggagatgagcgtgtggaactacgtcgtgacggcgcacaagcccaccagcgtcacccactcctgcgtcggcaacttcaccggccccaaccagctcaacctcatcgtcgcgtccgtaatctattccccccttcctcccccctctcgccctccaaatctagggttttgctgcgtcactcccactcccgcctccccctcggggtcgggatcgttctagggttacaacgctgctcgctcttttttcctctgccacctccacgcccttcgtttaaatcactgtgggatgacacattatttgacgggcccttgttttctttcttttgttaaaactcactgtctttcatctctttctatatgttcttcaacttagattccctgcttgttggctctctgcatattcattcctttactaactctgcgcatgtgctgcaaatcttccaggaaatgcacccgtatcgagatccacttgcttactcctcaaggcctccaggtctgtggttcatgatatttattattatctactacttgcaaatgattatgtcatgtgctgctctaataacatcataacctcttcccttttgtaagcagcctatgattgatgtacctatctatggaagaatcgccacactagagctcttccgccctcatgtcagccaatttactgttcctcgacttgccattctgttgttgccgtgcactggatggtaaaactaacactatttatcttacgcctttcagaatgagactcaggacttccttttcattgcgactgaaagatacaaattctgtgttctgcagtgggatggagaaaaatcggagcttctcactaggtttggtcacttgcactattctctttagcttacaaagcaatgagactgcttttataaccttttatagacataacattggcttgtcaaatggttcaaattgaatgtactgtaaaattatggatcactagtcccacacaatgctatccagtcgttgtctagctgattccgtgtagcatggaaggtcctcatggccaccagctgctccttgataaaggaagattgagacttcaagagttaatccttgccaagccaatgttatgtctacggagtcactgctctctgtgtctattgagcctctacgctgatgagagggtcaacagagtgcagatgggggagggagatgcaatgacagctaattttgagagtgcgaaagatatccagagtaaaacgcctcaataaccatggtctcacagtctgtttatagaagaaaataatattgctactctctgataaatttcaataactattagtcttttaactgataaatgataagtactatttgcaatatgtagagcgatgggagatgtttctgatcgcattggtcgccctacggacaatggacaggtgtgtggtatttccgaattgaaactccaatgttggcttgtaaaaattgtgaaactaccccttctatgtagatctatatgcaatatatataggaatgcattcttttgccctcttatatttggccaattactataatgtagattgggatcatcgaccctgactgtagacttattggtcttcacctctacgatggattatttaaggtaagtgtgcaccttcttttttaaaaaataaaataaaatgggatttgtccttgatagcatgctttttttacatctccactgagagaagcttttacacccttgccatccaggttataccgtttgataacaaagggcagctgaaggaagctttcaatatcaggtatcaggatggcaaaacgtataatcgaacatattggttgatggaaacatctgtgtagtgacttagtcaggaaaaacatgtgccactagtaatcggcaactaaattgttggagcattttgtgcgcttaatgtgggagggtctttcctatcgtttctctagtttgcttttgttggtgacattcagacaaccaaaatgtacataaagtgaagcaagctctttttttgctttctttgtttttgtatctgtgttgcctgatctgcttagaaaaaggaaaaccaaatgattggtgaaaatttattactatagtttacatctttgctggctaacacaaaacctaacatttctcctggtagactgaaagctgtgttgtggttggaatgtatttttatgctttacatcttctgttaaatataacattaccattcgggggttaatatttcattaaggatgatgcatattcgtacatttgaccttaccagagagtaacacttgcattttctttcttcaggcttgaagaacttcaagtattggacatcaagttcctgtatggctgtgttaaacctactatagttgtcctctaccaggtttgctcaaacttcactatattttttgtaccctgcaattgaagtctgaatccaatgggatagttttgaactacaacaattgccatggtgccttttctttgtatgtattgttatactattatttttttagtgtacagttgtattaatcaatctacatttcactggactttggatttgctattgtgctcaagtggtgcaaagattacttgctgttacacacctataatccactgtgtttattttgacttaagtgtaggcattttacataataggttactgttggttttcacaggattgagaattgagattggtagaatgctgttctttatttacttttgatttattcaaaatatctgctggttctcagatctttatttgaccattgtgagatagtaaaagatctgatttaatttgcatgctttaccaggataacaaagatgcaagacatgttaagacatatgaagttgcattgaaggacaaagactttgttgagggtccttggtcgcagaacaatttagacaatggtgctggtctgttaatacctgtaccagctcctcttggtggtgtcataattattggtgaggagacaatagtttactgcaatgccaactctacatttagagctataccaatcaaacaggtaatatattgttctctttatggttcttagatttgtggtgcctactgtgtgtgcaggtatgttggcactccataactaattgtttttgtcttccattcttgtacagtcaatcataagagcttacggacgggttgacccagacggttcgcgctatttacttggtgataatgcaggcatattgcatttacttgtccttacccatgaacgagagaggtaccagctatgcactgttttgaaactaaaagactcttgatccatttctcagtactcacaaatattcccttttgatgtactggttacttttttaagggtaaccggtctgaaaatcgagtacttgggagagacttcaattgcatcatcaatatcatatctcgataatggtgttgtctacgttggttctcgatttggtgattcacaggtgagttaatagcagtttgaatttgaactacaatgtactccctccatccacaaatgttacacatattacttttgacaccaagaccaaggagaaattaaatcatcttggatgttacaaaatcaaggagtgaatgcaagcatgcaaccaatggctatttagatgactccttgggttctaataaaacatttaatttatctcttcatttaagtcttgaatacataaagactacaaataggaataacttatttggaaaaattcaaatgtgaaataggtgtaacttttgtggatggagggagtaatgtccctttttgggggtggtggtcatgccctaatttcaatgcatgcgtgtgctttatgcagaaaaagtaaatttcaattcgttctgtatgttgacacaaatattgttgttgacagcttgtaaaactaaatctccaagctgacccaaatggttcatatgttgaagttcttgagcgatatgtgaaccttggacccatcgtggacttctgtgtggttgaccttgacaggcagggtcagggtcaggttgtcacttgttcaggagcatttaaagatggttcccttcgggtggttcggaatgggataggtatcaatgagcaggtattgaattaagatctatccaatattgtccaattttagttctgcataaagttgagctatattatctcttatcatgtaattaggcttcagtagaactacaagggatcaagggtttatggtcgttgaaatcttccttcaatgatccgtatgacatgtacctagttgtgagctttataagcgagacaagattcttggctatgaacatggaagatgagttagaagaaactgagatagaaggctttgatgcgcagactcagactttgttttgtcaaaatgccatcaatgatctgcttatacaggtgccttttttaatcactgcttcgttcatttttgttgcatttcttgtaagtaatacatccatgaatttgtggggtatggaatttgaaggaaccctatttgaaatgcctgaatgaatcctaattaactaaaataattattttgaaatgattttgttgatatttgagaggcaaaaagttgtctcggtaagttgtatgttctgtgtttttatacattcactgatttaggtggtttcaccactgttgtgaactgttttaataaatacttaaaaagggtgtgattttttactttcaatgacaggttactgctaattctgttcgtctggttagttgtacctctcgggagctagtggatcaatggaatgc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External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0592400, RefSeq:Os05g0592400