Os05g0593100
| Gene Name |
Os05g0593100 |
|---|---|
| Description |
Similar to Vacuolar ATP synthase subunit C (EC 3.6.3.14) (V-ATPase C subunit) (Vacuolar proton pump C subunit) |
| Version |
NM_001063035.1 GI:115465800 GeneID:4339800 |
| Length |
4174 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0593100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:29629031..29633204 |
| Sequence Coding Region |
29629483..29629579,29629667..29629746,29629838..29629921,29630830..29630955,29631136..29631252 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccacacgttattggatcgtgtctcttcccgtgcagactcctggctccaccgccaattctctctgggcgcgcctccaggactccatctcgcgccactccttcgacacgccgctctaccggttcaacgtccccgatctccgcgtcggcacgctcgactccctcctcgccctcagcgacgatctcgtcaagtccaacgtcttcatcgagggggtctcgcacaagatccggaggcagatcgaggagctagagcgcgccgggggtgtcgagagtggggctctcaccgttgacggcgtccccgtcgacacctacctcaccaggtttgtgtgggatgagggcaaatacccaacgatgtcaccgctcaaggagattgtcggcagcatccaatcacaggtctccaagattgaagatgacatgaaggttcgaggagcggaatacaataatgtaaggagccagcttagtgcgatcaacagaaagcaaactggaagcttagcagttcgtgatctttccaatctggtaaaaccagaggatatggtcacatcagaacatctagtgacactccttgcagttgttcctaagtactctcaaaaggattggttgtcaagctatgagtcccttgacacatttgtggtaccgagatcgtctaaaaaactttatgaggacaatgagtatgctctctacacggtaacattgtttgctaaggttgttgacaactttaaggtccgtgcacgtgaaaaaggtttccaggttcgcgattttgagtatagttctgaagcacaggaaagtaggaaggaagagctggaaaagctaatgcaagaccaggaagcaatgagggcatcacttctgcaatggtgctatgccagctacagtgaggtattcagttcctggatgcacttctgtgctgtgcgtgtctttgtagagagcattcttagatatggtcttcccccatcattcctgtctgctgttctagcaccttctcaaaagggtgaaaagaaagtaaggagcatcctggaggaactctgtggcaatgtccatagtatttactggaaatctgaagacgatgttggtgtagctggtctgggaggtgaaaccgaggctcacccctatgtttccttcacaataaattttatctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATRYWIVSLPVQTPGSTANSLWARLQDSISRHSFDTPLYRFNV PDLRVGTLDSLLALSDDLVKSNVFIEGVSHKIRRQIEELERAGGVESGALTVDGVPVD TYLTRFVWDEGKYPTMSPLKEIVGSIQSQVSKIEDDMKVRGAEYNNVRSQLSAINRKQ TGSLAVRDLSNLVKPEDMVTSEHLVTLLAVVPKYSQKDWLSSYESLDTFVVPRSSKKL YEDNEYALYTVTLFAKVVDNFKVRAREKGFQVRDFEYSSEAQESRKEELEKLMQDQEA MRASLLQWCYASYSEVFSSWMHFCAVRVFVESILRYGLPPSFLSAVLAPSQKGEKKVR SILEELCGNVHSIYWKSEDDVGVAGLGGETEAHPYVSFTINFI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3626..3722#3459..3538#3284..3367#2250..2375#1953..2069#1449..1590#1247..1314#692..791#460..587#303..371#95..217#gtctgttttgttttcccctccgactccgactccgatcgatctccaccccgaatccctcctcctcaccgccggcgagcttccggctgcggcggagatggccacacgttattggatcgtgtctcttcccgtgcagactcctggctccaccgccaattctctctgggcgcgcctccaggactccatctcgcgccactccttcgacacgccgctctaccgggtaagcatcctccccgccttccttccttccttccttccttccgccaccaccatcctcaccctcctcctccgcctcccgcccgcagttcaacgtccccgatctccgcgtcggcacgctcgactccctcctcgccctcagcgacgatctcgtcaaggtaacccatctcttctcttctccccgatctcgatctcccttgccccccagctctcacgcgattcctattattcctgccgctgctgcagtccaacgtcttcatcgagggggtctcgcacaagatccggaggcagatcgaggagctagagcgcgccgggggtgtcgagagtggggctctcaccgttgacggcgtccccgtcgacacctacctcaccaggtcgctcgctcgctcctgcccctgctgcctctcagcttagcgattccaactcttttgctaaagctctctacctcttccttcctttgcttcttcttcttttctaggtttgtgtgggatgagggcaaatacccaacgatgtcaccgctcaaggagattgtcggcagcatccaatcacaggtctccaagattgaagatgacatgaaggtgatgacctttttcccttgcgaccacataatcactagtcaagacccaacctacatatagtgctgttaatatgtttcgaccctaatgctgtctctagtcattaattaacgacacttggtgtattcttattcttcttgtacataagacataaagttttgccgttcagcgggaattgtttgcttgctttgcaacaagtaggcaagttttgacattatctccataacgtgcaaagttcaagctagtgagctttgttctcctgccaagtgtgtttttacagggtctagcttggtttctgttttggtatgttctgttgttctagccagctatcaacacaaccatattcttgtgattaggcatccacgtctccttttttagcattgagttatcacgcacaacactacagcgtgacctgttgaatttacaacagctgagctgaatgtgttttttaccttcaggttcgaggagcggaatacaataatgtaaggagccagcttagtgcgatcaacagaaagcaaactggaaggtagattgcatgccactgagtttttggctttaagccaattctttcttgttttatttcaaaggactcagaaatgcgagggtatggtttcatcttttgttagtcaactctaattagtttgttttccttctgtatagcttagcagttcgtgatctttccaatctggtaaaaccagaggatatggtcacatcagaacatctagtgacactccttgcagttgttcctaagtactctcaaaaggattggttgtcaagctatgagtcccttgacacatttgtggtaagtatatgctcttttatagtgacatggttagtaatagactgtcatttcaactatttatatgattttcgtcctttcagcaagttgcttattttacttttgtagtttttgttcaatccaacaatgtttagtttgttaccacttgtggcgttaatagttctactagcaggagatgttacccctgtagaaaccacttaaagtaaagatctgtttgacctgtaaattctttactcagattgttttatttagcccttataaggaccttgtttttttttccagcactacatgttgatgtgattagtattcgtaattggttgttatatttgagtgcttttttccttgaactaattattgatttataggtaccgagatcgtctaaaaaactttatgaggacaatgagtatgctctctacacggtaacattgtttgctaaggttgttgacaactttaaggtccgtgcacgtgaaaaaggtttccaggtaaatttgccgtcctaactttttcatcaaaaacctttgtttacacttcacatttagcttttatccctagagccttaggagttccaaataacttgggacagaaattcagtcttgtttttctgtccccatcaatctggcaattctctgtcacccattaacttgtattacgttgaaatacaggttcgcgattttgagtatagttctgaagcacaggaaagtaggaaggaagagctggaaaagctaatgcaagaccaggaagcaatgagggcatcacttctgcaatggtgctatgccagctacagtgaggtgcatgtctttttaggcttatttaataatcctgtcaacaatgacatttctttagagaagaacttttttattcttatgaatgtcatttttgtttcatgtaagttctattaaaattactaccaattaatgtttgatgttcatttcatcattttgcaccagaatagagataaatatgttttcatctcctttagtagcctgacggtcttaattgtccttaaaagcatccaattatgcggaatctgaaccagtaagaagatattgtctggtctcagttgccacttgccagcaatagatagatgccacgctgtgttttatgtttaaattttacataaggattttagtaagttataacttcatggcatactgcaagttcttcctactgctgttattatctcactagaaccttattattcagggataaatccttgtttctgggatgtattaataagcttgtgtttattatccataattgtctattttaatttgtgcagaataccatttatgtacgtcatgctaaagtgcaaaactttgtgcttctctatgtgcgtaaaagaaaataattctgctgttgtttatctctgcttatgcagtgaattgccgtcatgaaggatttgtttactgaactgagttagttagagcctagctctataggctatagacatacttattacatattcactatgtcccaaaaaaaaaaaccaacctagtcaaggatgggatacaacctagtcatgtccagattcgttgtactaggttgtctcatcatgtcctagtcattgacggagggagtagcacatatgtttcttgattgttgggttttgtggtttgctttttctttgattcattcctcgtgaacttgtgttttcatggtgctcagttgtaattgcttacataaaactattctgcaggtattcagttcctggatgcacttctgtgctgtgcgtgtctttgtagagagcattcttagatatggtcttcccccatcattcctggtaatctattctactgttacgtagtatatgatagtcaaatttgtactttgatgcctgatctaatatcatatgctgtttatgttttcatcagtctgctgttctagcaccttctcaaaagggtgaaaagaaagtaaggagcatcctggaggaactctgtggcaatgtccataggtaattcagcgtttgagtttgtgttcattgcattgttagtcacaacatgcacctgcttttgtcattaattgagcctctgaattgcagtatttactggaaatctgaagacgatgttggtgtagctggtctgggaggtgaaaccgaggctcacccctatgtttccttcacaataaattttatctgagcacagtatgttccttgctacctgtggccaggcaaggcagtgttttggagtaattactactttggcaaacaaaaaaccagcgaatggttcggtgtatattataattgtgatacgtcaattctttcttgatttatttacccagcttatatgatcctgtagtttgaaccgatcaataatgtagctttttgggggaacctggactattttcctggcacaatagggtatctgtttggactattttatccccggcaactacaatattccaactgtttcctttagtatatctattgtgctttgagagcaccgtgtaagatgttgtggatattatgtttttgtaactttgagcagccaggttcgtaataaaagatcaatataaataattcaggtcgccgagcctgattgtaaacagtttgttgttgaattcgagctgtctccttttttctttgacgatt</dnaseqindica> |
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