Os04g0117600
| Gene Name |
Os04g0117600 |
|---|---|
| Description |
Dihydrouridine synthase, DuS family protein |
| Version |
NM_001058588.1 GI:115456905 GeneID:4334955 |
| Length |
6968 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0117600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:1034034..1041001 |
| Sequence Coding Region |
1034091..1034342,1034996..1035112,1035186..1035416,1038234..1038489,1038585..1038841 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:1034034..1041001 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008397:1034034..1041001 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccgccaccgccgccgccgccgccgcggcgcctcccgccgacccgccggactcctccccggccgcttcctcccctccgaggcccagcccggaggagctggtcgcccgtgcagtggcccccgtcaagcccgccttcctccgcccgcccctgtccgcgacgccccccaaggatgagggcaaggccaacggcggcggcgcggtggtcgcggagaagaagtccaagcgccagctcaagcgcgagcgcaagcaggaacagaaatcttcatcacatctttgtatcgaagtagggaaaagtggaaatgtgagctcttgcaaatatggtgattcttgccgtttcagccatgacatagatgcctatttggctcagaaaccagctgaccttgagggcacgtgcccatttaccaatctggaccagttgtgtccatatggactaacttgtcgatttttgggtacacataaggacatccatgcagcttctggaaatctttcagagaaacatgagataaatgctttaaacaaagacattcaaaagctcttatggaagaacaaatataagttccccaaggccagtgcacagatcaagcttcttggtcttaaggaagtcattaagagcaaaccggatgctgcaaatgatgataagaaggttaatcatgataatctagacgggaatgatgatgaaaataaagaacctctttgcaatcctcctgtaaatgcggaatgtgattctactttgtgtgaagaattggatagatcagagggagaacctttgattgataactcaattccatgtgttgaaccaaggccaacaaagaagtcaaaggttgaaagtgatgaaattgacaaacatggagcgggtactctcaacactaacacagaatctgaagatcctaatttgagtaatggattggaaccctcaaataactcaagttcttgtagaactgacctaatcacaacacctcatttacgtgaaaagaagataatagattttcgggagaagttgtaccttgctcccttgactactgtcgggaatctgccttttcggagactctgcaaaaccttgggagctgatattacttgtggagaaatggccatgtgcacaaatcttttacagggacaagcttcagagtgggctttgctgcgacggcattcatcagaggatttgtttggggtgcaaatttgtggagcctatccagatacagtagcacgaaccgttgaacttgtggataacgaatgttcagttgatttcatagacataaatatggggtgcccaattgatattgttgtcaacaaaggtgctggatcatcattgctaacaaaacctatgaggatcaaaagtattgtacaagcagcatccactgttactgaaaaacctttaactgttaaggtaagaactgctttctttgagggaaggaaccgtgctgattctatagtttccgacatctatgactggggtgcgtcagccataacagtacatggtcgatcccggcaacagcgctacagcaaacttgctgattgggattatatttaccagtgtgcccagaaagcccctgaccagttgcatgtcgttggaaatggtgatgtattctcttttactgactggaacaaacatgtttcaggctgctctaaaatatcgacaagcatgattgctcgaggtgcactcataaagccttggatatttactgaggttaaagaacaaaggcactgggatattacatctggcgagagattcaatattcttaaagattttgtgagttttggtctggaacactggggttccgattccaaaggtgttgaaacaacacgctattttttactagaatggctaagctacacctgccgctacataccggttggcctgttggatgtgatcccgcaacgtttgaactggaggcccccaagctactgtggccgtgatgatcttgaaaccctaatgatctctgattcagcagctgactggatcaggatctcagagatgttgcttggcaaagttccagaagggtttacgtttacacccaagcacaaatccaatgcttatgatcgagctgaaaacggctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAATAAAAAAAPPADPPDSSPAASSPPRPSPEELVARAVAPVKP AFLRPPLSATPPKDEGKANGGGAVVAEKKSKRQLKRERKQEQKSSSHLCIEVGKSGNV SSCKYGDSCRFSHDIDAYLAQKPADLEGTCPFTNLDQLCPYGLTCRFLGTHKDIHAAS GNLSEKHEINALNKDIQKLLWKNKYKFPKASAQIKLLGLKEVIKSKPDAANDDKKVNH DNLDGNDDENKEPLCNPPVNAECDSTLCEELDRSEGEPLIDNSIPCVEPRPTKKSKVE SDEIDKHGAGTLNTNTESEDPNLSNGLEPSNNSSSCRTDLITTPHLREKKIIDFREKL YLAPLTTVGNLPFRRLCKTLGADITCGEMAMCTNLLQGQASEWALLRRHSSEDLFGVQ ICGAYPDTVARTVELVDNECSVDFIDINMGCPIDIVVNKGAGSSLLTKPMRIKSIVQA ASTVTEKPLTVKVRTAFFEGRNRADSIVSDIYDWGASAITVHGRSRQQRYSKLADWDY IYQCAQKAPDQLHVVGNGDVFSFTDWNKHVSGCSKISTSMIARGALIKPWIFTEVKEQ RHWDITSGERFNILKDFVSFGLEHWGSDSKGVETTRYFLLEWLSYTCRYIPVGLLDVI PQRLNWRPPSYCGRDDLETLMISDSAADWIRISEMLLGKVPEGFTFTPKHKSNAYDRA ENG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>58..309#963..1079#1153..1383#4201..4456#4552..4808#4979..5251#5618..5899#6046..6166#6352..6521#6614..6712#ccccttaaaaccctcccttgctgctatgcctcattgcctcctcaccgcgccgcaaccatggccgccaccgccgccgccgccgccgcggcgcctcccgccgacccgccggactcctccccggccgcttcctcccctccgaggcccagcccggaggagctggtcgcccgtgcagtggcccccgtcaagcccgccttcctccgcccgcccctgtccgcgacgccccccaaggatgagggcaaggccaacggcggcggcgcggtggtcgcggagaagaagtccaagcgccagctcaagcgcgagcgcaagcaggtatagccgtcgttcgcggtggacgcgaaggtggtttttgcttttaatgctccgggagtgcttgttggaatgctcatgtgcattttttcccctgcatttggatgtcatttctgctgtgtgctgtatctgttccatacaatcttactaagcgaatttgagacatgcatattttgagatcttatagtttgtagtagctatgggaaatgactgttgattcagaatcaagaactacatactgaagatacatgtaatacttaaaaaatccagaagccccataaggaatcagggatttatgttctatttaatttgccatttatgttctatttagggctttgtgctcaccatgcctcttctcatgcttgatcatagtgtaaattagtgctgtttgatattccaatggttttttctggtatctgtgttactccagtactagtaaagactacatgttgagttttgcatcatctttctttcacgaaattgtccagagctgtccctgtttcatacttccagttccatgcaatttgctcgaactttggttataaatgtatgaaattgcaatttgcttgaactttggttgtaaatgtacatgtgcatgatgctttgtaatccactcaatgtgccgatgctcaacaaaattttgttatactgtgcaggaacagaaatcttcatcacatctttgtatcgaagtagggaaaagtggaaatgtgagctcttgcaaatatggtgattcttgccgtttcagccatgacatagatgcctatttggctcaggtactgttttattgtgttgttttccctgaactttcttaggcatgcttatatctttgttattttctgtgcacagaaaccagctgaccttgagggcacgtgcccatttaccaatctggaccagttgtgtccatatggactaacttgtcgatttttgggtacacataaggacatccatgcagcttctggaaatctttcagagaaacatgagataaatgctttaaacaaagacattcaaaagctcttatggaagaacaaatataagttccccaaggccagtgcacagatcaagcttcttggtcttaaggtatataactcccaaattctggttgcgtatctatctgatataccattttctcgtttctgttaatttgctccaatattcgatctgtcgtgcataactcaattttgttggattatggatttactttcatggagttaaatttgaaggttaattggatccatgtcactgcaattttgacaaattaaaaaaatgccactactattcatcatatcggctccatgccactgaaaaattctaaaattggaaccatgccactcccgtcgcttttcccgtcctcctccctcatgccgtcctcatcccgtcgtcgccaccacaccacgtcggcctcgccttctccctgccggcgagggccgccgccgccgctgctcctccccatcctctccccgcacggaccgtgctgccgctgctactcccgctccggagagcaaccagccggaggagagctccagatctggtgccgccggcaccgccgacgaggtccgccgcggctgctcctccccgtcctcgtcgcgcgcaccgtgccgccgctgctactcccgctctggagagcaaccagccagcgagcagcgtcgcggggatccccatctcctcctctagatccgacgccgcgggcaccaccgacgagggccgccgtcgccgccgccgctcttccccatgctcttgtcatcgtcgccgccgcggccatctctggtgagcacctcgggatccccgtctcctccagatacggcgccgccggcatcgccgacgagggccgctgccgctgctcctcccccatgctcttcttgttgtcgcccgcggctcctcggcctcgccaccaagctcaccaacgattcctcctgctccgatctcctccgctgttccccgtcctcgggaacggcagcgctgcgtacctcctccgcggcacgccgccgccgccgccgacgatgacgccccggtgccccgtccacatcaagagctgttcgtcaccggcgcagcgtgttcagggagttccgtgacgcggcaccatctcccgaaacgcccgatgccgacgccaccgacgacgactacctcggggagcttgacttcgaagacgaggatggattcgacgccgactctttccttgccgcagacgtcctgtccagcgccaccatacatccatacataagaagcctcatggtgctcgagtttcgtgttccggcaaggccggctcaacaccggccaagcaatgaagcggcatggcgatgagagtgattggtggatgtgccctgctcaattgccgtgagagaggatgaggaggggaagggaaacgccgtgagagaggagacggaaaaagggacgggagtggcatggtttcaattttagaaatttccagtggcatgtagccaatatgatgaatagtagtggcatttttttaatttatcaaagttgcagtggcatggatccaattaaccctttaaagaaacacggttaccaaatacatatggtagcccttagttctatagccgtgaagaaattatggttgtagataattgtgatgcatctccaatcacaatgtatctctaactagggaaacttgatgcttgaactggcatgggtgctcctttgcagcaaattagtgcattgcacacttgcactgcaaacattctgatgcatcaatgcttgaaatttattctttccacatacaattattgctgaaatttgtaaaactgagttactatgttatttttcagaacaaattatatggtagcaaataataacaattactatcatgtccaacgaatggtgtggaaaaatggaacaccttaagtattatgctttgcatttctaaacttgctctttgtaattgttgatttgtcatggatgaaatatattgtggttgcttcttgtttgaactggtgccaactgcaattcagcgaggactctgagttgtttgtatgctactcctgagtactgttttatgtatctgccaaaaaacattttcgctagtgtcttaataagtgtatatttggtggtggcaaaaacggtagaagatgtgttgtgttgggaagccaatggagcctgtttaatagttaatgaaaagcctggtcgtacttataaatgcatataacagaattgatcatgtactacccctatctatgttttccaggcagatttttgaataatcatgtccatcaatagggcttattttgtatcccaatgcaaaagtgtgttgtttcctctgtatccctaataaatatttatctttaccttgtattctataattcatttgatgtagcacttggatagtgatagaataattagggggcaacctagtcattgtaatgccttcttggtttgtgttcaacatgaaaatattccatgctaagttgtatggatggagtatgctacagctgtttgttaggttattgtgttgcagtatgtgccctctgagcttcagttggctgatttcttgacaaatgagcagagcagagctctgcacaatttcttccttccaccattctgttcctttttatgctccttctgtgttttctatatttggcctggagccctcatgttgaatacaagtgctattcatagcccttttcaatagttagtatttagtattcagcaaatacggataagatcctggaaataattgatttcgtgtgatggcaactgctcacttggtaggtcatagctctcttggtttagatatttcatatcatacaagggcagttcatattgcacttgaattattaggatgtatgtcgatgtatctgctgagacacgaggtgcagtttagaatgttccatttgctaatattgaatttttggggtctatttgatatactttgtaatacaggaagtcattaagagcaaaccggatgctgcaaatgatgataagaaggttaatcatgataatctagacgggaatgatgatgaaaataaagaacctctttgcaatcctcctgtaaatgcggaatgtgattctactttgtgtgaagaattggatagatcagagggagaacctttgattgataactcaattccatgtgttgaaccaaggccaacaaagaagtcaaaggttgaaagtgatgaaattgacaaacatggagcgggtttgttcttgaactttaagattgccattttcaatgcatctattactcttattttgaattgttgtgttgaccttttttggaacattatggtttaggtactctcaacactaacacagaatctgaagatcctaatttgagtaatggattggaaccctcaaataactcaagttcttgtagaactgacctaatcacaacacctcatttacgtgaaaagaagataatagattttcgggagaagttgtaccttgctcccttgactactgtcgggaatctgccttttcggagactctgcaaaaccttgggagctgatattacttgtggagaaatggccatgtgcacaaatcttttacaggttaaaaaactaaataaattacctctgccctgtttcattgcatgcttttcctgtttctgattgcatgtttcttactcctattgcaaaaagttgaaccaaagcaaagttaagttaatatatctgtttgacattcttcatgagacactttattattgatatatttcatgtagggacaagcttcagagtgggctttgctgcgacggcattcatcagaggatttgtttggggtgcaaatttgtggagcctatccagatacagtagcacgaaccgttgaacttgtggataacgaatgttcagttgatttcatagacataaatatggggtgcccaattgatattgttgtcaacaaaggtgctggatcatcattgctaacaaaacctatgaggatcaaaagtattgtacaagcagcatccactgttactgaaaaacctttaactgttaaggtaatggtgcagtagctcagttatactctgttaggagctaattagcacttgaggacaaaagttctggtgatttcatccagatgtcgatctgccaatgcattgtcacatttatggtcaacagggttgaactagaatcagagctttgaaaaaccaaatattttacatgtttagcgtactttttggaaggaaaactatctatgggtggacttagcctgcttgaacattttatgtctcatgatcggtaatcaatgcaaagtttaattagagataaggtacatggggagggggctgctaagacatgtatgacatattaaaatggaaataaacactgctttgctcatattgatctctgttgcttgattccaggtaagaactgctttctttgagggaaggaaccgtgctgattctatagtttccgacatctatgactggggtgcgtcagccataacagtacatggtcgatcccggcaacagcgctacagcaaacttgctgattgggattatatttaccagtgtgcccagaaagcccctgaccagttgcatgtcgttggaaatggtgatgtattctcttttactgactggaacaaacatgtttcaggctgctctaaaatatcgacaagcatgattgctcgaggtgcactcataaaggttagtttggtgctgcagtatatgtactttaacatctatcatgagaaaaatgctataattgctagctgtaatgtcaggcttttgttccctcaagttcatgtctgctaattttgtgctaatgcatggttttttttttcacctgacagccttggatatttactgaggttaaagaacaaaggcactgggatattacatctggcgagagattcaatattcttaaagattttgtgagttttggtctggaacactggggttccgattccaaaggtaggttctctctattgccagatattggctcagattatgagttttgtgaggcctggaatgcgataatatctgctcatcatcgagttacagttttttttttcttgctgcactgaaatgctcggcatgaaatcaaattgattttgaaagggttgtcttgatcatcaaattatcatgtgtattttcaggtgttgaaacaacacgctattttttactagaatggctaagctacacctgccgctacataccggttggcctgttggatgtgatcccgcaacgtttgaactggaggcccccaagctactgtggccgtgatgatcttgaaaccctaatgatctctgattcagcagctgactgggtaagctgtcctcgttctgagtgttggatggtttctatcttttactagctatcacaagctgataatatatatcttgtctaatgtacgtacagatcaggatctcagagatgttgcttggcaaagttccagaagggtttacgtttacacccaagcacaaatccaatgcttatgatcgagctgaaaacggctaacaccattcatctctcttcaaagcttgtgcccagccttggagctccatgctgcctgataatgtttacttgaaccggcggtgtaggggagcagcatgattttgcttcacccaaacgacacaattcatgtttatttaaacatagagagctgctactagtaatatgtgatgagggaattaccgtgacaagggattatgactcccttggaccgccaaaagaaaaaatccgcttcatttctgaaggaatttttatttcggtg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
