Os04g0118400
| Gene Name |
Os04g0118400 |
|---|---|
| Description |
Similar to Elongation factor EF-2 (Fragment) |
| Version |
NM_001058592.1 GI:115456913 GeneID:4334959 |
| Length |
5203 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0118400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:1080566..1085768 |
| Sequence Coding Region |
1082111..1082201,1083071..1085511 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:1080566..1085768 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008397:1080566..1085768 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggtgaagttcacggttgaagagctgcgcaggattatggacaagaagaataacattcgtaacatgtctgtcattgctcatgtcgaccatggcaagtccacgcttacagattcccttgtggcagctgctgggattattgcccaggaagttgctggtgatgttcgcatgactgatacccgtgcagatgaagctgagcgtggtattacaatcaagtccactggcatctctcttttctacgagatgagtgatgaatcactcaagttatacaagggcgagagagacggaaatgagtacctgatcaaccttattgattcacctgggcacgttgatttttcttcggaggtcactgctgctcttcgtattactgatggtgctttggtggttgttgactgtattgagggtgtctgtgtgcaaactgaaactgtgctccgccaagctcttggtgagaggattaggcctgtccttactgtgaacaagatggacaggtgcttccttgagcttcaagtcgaaggtgaggaggcgtatcagaccttttcccgtgtcattgagaatgccaatgtcattatggcaacatatgaagacacgctccttggtgatgtccaagtttaccctgagaagggaactgttgctttctctgctggtttgcatggctgggctttcacactctcaagctttgctaagatgtatgcttccaagtttggagttgatgaatctaagatgatggagaggctttggggtgagaacttctttgacccggccacaaagaagtggaccaacaagagcactggctcagctacctgcaaaagaggtttcgttcagttctgttatgagccaatcaagcaaatcatcaacacttgcatgaatgaccagaaggacaagttgtggcctatgctgcagaagcttggtgtggtcatgaaggctgatgagaaggatcttatgggcaaggctctcatgaagcgtgttatgcaaacttggctgccagccagtaatgcacttcttgagatgatgatataccaccttccatctccttcgaaggcccagaagtaccgtgtggagaatctgtacgagggtcctcttgatgatgtctatgcaactgctatcaggaactgtgatccggaaggtcctctcatgctgtatgtttccaagatgattccagcatcagacaaaggtagattctttgcctttggccgtgtcttctctgggagggttgcaactggcatgaaggtgcgtattatgggtcccaactatgtccctggccagaagaaggatctgtatgtgaagagtgtccagcgtactgttatctggatgggaaagaaacaagagtctgttgaggatgttccttgtggtaacactgtcgctatggtcggtctggatcagttcatcacaaagaatgccaccctaacaaatgagaaggaagctgatgcctgcccaatcagagcaatgaagttctcagtgtccccagttgtgcgtgttgctgttcagtgcaaggttgcatctgatcttcccaagcttgttgaaggtttaaagcgtctggcaaagtctgatcctatggtcctctgtaccattgaggagtccggtgagcatatcattgctggagctggagagcttcaccttgaaatctgcttgaaggatctacaggaagacttcatgggtggtgctgagattattgtttcccctcctgttgtctccttccgtgagactgttcttgagaagtcctgccgtacagttatgagcaaatccccaaacaagcacaaccgtctttacatggaagctcgccccttggaggagggactggccgaggccatcgacgatggacgtattggcccacgtgacgatcccaaggtgcggtccaagatcctgtctgaggagtttgggtgggacaaggacctcgccaagaagatttggtgctttggacctgagaccactggccccaacatggtggtcgacatgtgtaagggagttcagtatcttaatgaaatcaaggactctgttgtggctgggttccagtgggcatcaaaagaaggtgcattggctgaggagaacatgcgcggcatctgcttcgaggtatgtgatgtggttctccacgctgatgctattcacaggggcggtggccaggtcattccgacagcgaggagggtcatctatgcttctcagctcaccgcgaagccaaggctgctggagccagtctacctggtggagatccaggcccctgagaatgcccttggcggtatctatggcgttctgaaccagaagagaggccatgtgttcgaggagatgcagaggcccggtaccccgctgtacaacatcaaggcttacctccccgtcatcgagtcgtttgggttctcgagccagctccgtgccgcaacatcgggccaggccttccctcagtgtgtctttgatcactgggacatgatgacttctgatcctctggaggtgagctcgcaggcgaaccagctggtgctggacatccgcaagaggaagggtctcaaggagcagatgacccctctctcggatttcgaggacaagctctaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVKFTVEELRRIMDKKNNIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVAAAG IIAQEVAGDVRMTDTRADEAERGITIKSTGISLFYEMSDESLKLYKGERDGNEYLINL IDSPGHVDFSSEVTAALRITDGALVVVDCIEGVCVQTETVLRQALGERIRPVLTVNKM DRCFLELQVEGEEAYQTFSRVIENANVIMATYEDTLLGDVQVYPEKGTVAFSAGLHGW AFTLSSFAKMYASKFGVDESKMMERLWGENFFDPATKKWTNKSTGSATCKRGFVQFCY EPIKQIINTCMNDQKDKLWPMLQKLGVVMKADEKDLMGKALMKRVMQTWLPASNALLE MMIYHLPSPSKAQKYRVENLYEGPLDDVYATAIRNCDPEGPLMLYVSKMIPASDKGRF FAFGRVFSGRVATGMKVRIMGPNYVPGQKKDLYVKSVQRTVIWMGKKQESVEDVPCGN TVAMVGLDQFITKNATLTNEKEADACPIRAMKFSVSPVVRVAVQCKVASDLPKLVEGL KRLAKSDPMVLCTIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLQEDFMGGAEIIVSPPVVSFRE TVLEKSCRTVMSKSPNKHNRLYMEARPLEEGLAEAIDDGRIGPRDDPKVRSKILSEEF GWDKDLAKKIWCFGPETTGPNMVVDMCKGVQYLNEIKDSVVAGFQWASKEGALAEENM RGICFEVCDVVLHADAIHRGGGQVIPTARRVIYASQLTAKPRLLEPVYLVEIQAPENA LGGIYGVLNQKRGHVFEEMQRPGTPLYNIKAYLPVIESFGFSSQLRAATSGQAFPQCV FDHWDMMTSDPLEVSSQANQLVLDIRKRKGLKEQMTPLSDFEDKL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1546..1636#2506..4946#gtggatcttgtcgaccatcgttatccaccaccaccaccaccacgccgctcgctgccttcgtccccagccaccgccgctgcctccctctatccccacccgaactgctcactgcttccatccacgccccatagctccggaagggcgcaaggaagacagtgaggtagatgaggtcggcgacgctgctgtccgattcctcctgctttctcagatctagcggcgccgagctcggggacgcctgatccggcagcccgcccgctgtagccgctaaagaagaggtagaccaaatattgtttttcttttttcttttttttttgggaatttttggattggatttgtttccgtaagcttcggttcttgttgttcgtttggttggatttttttttatgttttgaattttttttcctttctccgattatgaggatgcaaagaacgcgatcggatttagggacgacgggtgcgatgggcgcaacggacgaaaacacggaacgaacgtgtactgactacggatggatgaagtaaaacgaactcttcaactacgcacgggacgcggacgaacgagaagttattaattttttaattagttgttattattattaagttattattataagatttagcatagcagcaacaacatcataaatcagttatacccgtaaagctacgatttttctcttttttttgaatttttttcggctcctcggagaggtttacacgtggttggtaactttgcaaaaatttatattactccggttgagttgttgtgtacctaacactgtgagtgagttggaagaaatttgcaatttaatttgggccgtaacgggatttgagatgaggaaagcccattagacccaaagtaccagcaccataaaaaccctagccgccctcctccccttcctcacagccgcctccactcctctcctcttctctcctagccctagccctagccctagggcgcgcgttcgctcaccgccgctgccgcctcggcaggtaagcattgatcgatcccctcgccgaccgtctctcttttcctctcttcttcttgaggcaggtttgccttgtatgttcatcgcgatcagtcatccacatgcaaagaacacctctctttttttcttttttgttaatttatcatccgatctagcaggatggaaatggttttcttcaaatcttttcagtactgagtgctctagttttgttgcgtctagcttcttgatttgccttctcatagatcggatgttccttttcagtattttgactgcacatgatttggttgtgaggatagcagtaaaaatgaattgatgtgttcttgataatagccataagtaatcatctttggtatcatcctaaactcgatttggttggtttggtatctgggttctgtgaattttccttgggcttattaacttctcctgacatagttgctggaagatttttggctaagattgcatgcgcttcagttttttttttgttggcttctaacgaggaggctcctttgctttttgtaaacaggaatttgcatccgtagcgtgatcttcaaaggctgccaagatggtgaagttcacggttgaagagctgcgcaggattatggacaagaagaataacattcgtaacatgtctgtcattgctcatgtcgaccatggtatgtgctacaagatttgatctattaagactaacgatgttttacagtagtacttcttagttctagcagttagtgttgtatttcgcttttcctattgtatcttgtttgcatttgtcctctaatgatgtatattttcatccgtgcatccataattccacctgttaccttctatatgtattgatttctgttaccttctatatgtatgactgatgcttacttttatatagtaccaattgtttacttgttcattttaacatgcctataattgtattagtcaattatttacttgttcatttgaacatgtgtaattgtattagatttgacatgaaatctcaaaatttacactgctttacttgtgtgcttgacatcgatgcctccatgcatgtcctattaatacaaatttgtttgaggttatctatgcttactaagccttaggattttttttggccaaatctctagtttctgtttttgtattgcaaatagtcaattatctttcaagttgtgatgctatttgtgtttttgttgtatataggctaatatgttcaatgctcatgctctaagcgtcattcatttcttatgctgagtatttgtttaattctaatgttttttgctttaatggcatgcctaatatgtgaaattttgttgattctaacaaggttttactgcttggtctgattcataattgtaacatgactatctttggactatttctaaatttctaaatattatgctgctgaagtgtgaattcatatgctatatactcctttaattggctatgcaagcatttcaactcttctgtaaatttgctgctgaccattccattttctgttagaaatacactatgctaatatgttatgtgttccttgcaggcaagtccacgcttacagattcccttgtggcagctgctgggattattgcccaggaagttgctggtgatgttcgcatgactgatacccgtgcagatgaagctgagcgtggtattacaatcaagtccactggcatctctcttttctacgagatgagtgatgaatcactcaagttatacaagggcgagagagacggaaatgagtacctgatcaaccttattgattcacctgggcacgttgatttttcttcggaggtcactgctgctcttcgtattactgatggtgctttggtggttgttgactgtattgagggtgtctgtgtgcaaactgaaactgtgctccgccaagctcttggtgagaggattaggcctgtccttactgtgaacaagatggacaggtgcttccttgagcttcaagtcgaaggtgaggaggcgtatcagaccttttcccgtgtcattgagaatgccaatgtcattatggcaacatatgaagacacgctccttggtgatgtccaagtttaccctgagaagggaactgttgctttctctgctggtttgcatggctgggctttcacactctcaagctttgctaagatgtatgcttccaagtttggagttgatgaatctaagatgatggagaggctttggggtgagaacttctttgacccggccacaaagaagtggaccaacaagagcactggctcagctacctgcaaaagaggtttcgttcagttctgttatgagccaatcaagcaaatcatcaacacttgcatgaatgaccagaaggacaagttgtggcctatgctgcagaagcttggtgtggtcatgaaggctgatgagaaggatcttatgggcaaggctctcatgaagcgtgttatgcaaacttggctgccagccagtaatgcacttcttgagatgatgatataccaccttccatctccttcgaaggcccagaagtaccgtgtggagaatctgtacgagggtcctcttgatgatgtctatgcaactgctatcaggaactgtgatccggaaggtcctctcatgctgtatgtttccaagatgattccagcatcagacaaaggtagattctttgcctttggccgtgtcttctctgggagggttgcaactggcatgaaggtgcgtattatgggtcccaactatgtccctggccagaagaaggatctgtatgtgaagagtgtccagcgtactgttatctggatgggaaagaaacaagagtctgttgaggatgttccttgtggtaacactgtcgctatggtcggtctggatcagttcatcacaaagaatgccaccctaacaaatgagaaggaagctgatgcctgcccaatcagagcaatgaagttctcagtgtccccagttgtgcgtgttgctgttcagtgcaaggttgcatctgatcttcccaagcttgttgaaggtttaaagcgtctggcaaagtctgatcctatggtcctctgtaccattgaggagtccggtgagcatatcattgctggagctggagagcttcaccttgaaatctgcttgaaggatctacaggaagacttcatgggtggtgctgagattattgtttcccctcctgttgtctccttccgtgagactgttcttgagaagtcctgccgtacagttatgagcaaatccccaaacaagcacaaccgtctttacatggaagctcgccccttggaggagggactggccgaggccatcgacgatggacgtattggcccacgtgacgatcccaaggtgcggtccaagatcctgtctgaggagtttgggtgggacaaggacctcgccaagaagatttggtgctttggacctgagaccactggccccaacatggtggtcgacatgtgtaagggagttcagtatcttaatgaaatcaaggactctgttgtggctgggttccagtgggcatcaaaagaaggtgcattggctgaggagaacatgcgcggcatctgcttcgaggtatgtgatgtggttctccacgctgatgctattcacaggggcggtggccaggtcattccgacagcgaggagggtcatctatgcttctcagctcaccgcgaagccaaggctgctggagccagtctacctggtggagatccaggcccctgagaatgcccttggcggtatctatggcgttctgaaccagaagagaggccatgtgttcgaggagatgcagaggcccggtaccccgctgtacaacatcaaggcttacctccccgtcatcgagtcgtttgggttctcgagccagctccgtgccgcaacatcgggccaggccttccctcagtgtgtctttgatcactgggacatgatgacttctgatcctctggaggtgagctcgcaggcgaaccagctggtgctggacatccgcaagaggaagggtctcaaggagcagatgacccctctctcggatttcgaggacaagctctaagaaaaaacccttttggtctcgcatatgtttttgccattaatttacctgttctaatagctgttctactattgttaaagagttataagacaagtcagaaatatgatgtgtttgttacacatcaagtatcggtgttggtagtgttgtgctgtggaactatatattttgctgtctggtgatatgcaacagatatggaactttgataatgtatctgttgatagtttttacggttttctgaatcagtttcagtttgatatatc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
