Os09g0248300
| Gene Name |
Os09g0248300 |
|---|---|
| Description |
Frigida-like family protein |
| Version |
NM_001069203.1 GI:115478145 GeneID:4346501 |
| Length |
5440 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0248300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:4235759..4241198 |
| Sequence Coding Region |
4235998..4236414,4237825..4237994,4239591..4240632 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:4235759..4241198 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008402:4235759..4241198 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtccgacatggagtccatgacagcccttatggagtctacaggctccaagctgcagctgcttcagcgtgcatttgccgagcttgagagccagagtgctgtttcattgaacttaaagtggaagcaacttgaggaccatttccatggccttgagcagtcgcttaagaaaaagtttgatgagctgaaagagcaggaaaaggagttcaaggagacagtcacgaaatcggagcagatgcttgagcaacaagaggctgctgtcgtggcaaaggaactgacttctcttgaaagactgcagcagaaaagggatgctgcgttggctatgatcttcggcaagtcaaagctgaacttgtctatgcctgtaatcaacccaatcagcaaatctgtgagtaacaatgctgtgttaaatggcaacatcgctagcctgtggcccaaacctgcaactgcgcatggtgcatacctgcaagatggaaacactgctgtgaagcctcgttctcaacttgttatcctctgtgaagaaatgaatgttaacgggcttcataagttcatatcagacaatcgcaaagacttaacatccatccgtgaggaaattcccgttgcacttaggggagcaactgatccatatggcttggtgttagcttctctagaagacttctattttggagacaatcttatattggatggtaaaaaggatggaaaccttctgggtgtacggaggacgtgcctcatgttgatggaatcacttgctcagctgcaaactgatgctactactggtttcatatcaaaaggccaaatgcttactgctagtattaaggagagagcgaaaaagatagcgcttgagtggaaatccaagttggatagccttgactttgatgctagcaatgggaactgcctggaagcacatgcgtttcttcaactcctggctacctttgctatattttctgaatttgcggaagacgagctgtgtaagcttctcccatcagtcagtcgtcgtcgccagacacctgagctttgtagaatacttgggttgtcacagaacatgccaggtgtcattggagttttgattgaaaatgggagaactattgatgcaattaatttggcttatgcatttgagctgactgatcagtttgaaccagtcgaattactgaaagcttatctgaaggaggtcaagagtatgtcacatgtcaagaccggaaagatgtctccgggagtacagaatgaaattaatgaacgcgagttgtctgccttgaaagctgttatcaaatgtattgaggagcacaaacttgatgagaaatatcctatcgacccacttcagagaagagtcatccagctagagaaagccaaggcagacaagaggagggctgttgaagctggaaagccacagtctaagaggcctcgtgccaacggatcagtatatgcgccacatattactagcttttctgacaaaagcttctaccaggccgctgcgccacagaggcattcctacccttacgagaggcagtatgtatatggtgctgaggcccatcatcacccaacaatgataagctcagctccctatggcatgtcacctgcccacacaacatactatggtaatggctatcaggttcagtaccaggtaccatatatccactga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSDMESMTALMESTGSKLQLLQRAFAELESQSAVSLNLKWKQLE DHFHGLEQSLKKKFDELKEQEKEFKETVTKSEQMLEQQEAAVVAKELTSLERLQQKRD AALAMIFGKSKLNLSMPVINPISKSVSNNAVLNGNIASLWPKPATAHGAYLQDGNTAV KPRSQLVILCEEMNVNGLHKFISDNRKDLTSIREEIPVALRGATDPYGLVLASLEDFY FGDNLILDGKKDGNLLGVRRTCLMLMESLAQLQTDATTGFISKGQMLTASIKERAKKI ALEWKSKLDSLDFDASNGNCLEAHAFLQLLATFAIFSEFAEDELCKLLPSVSRRRQTP ELCRILGLSQNMPGVIGVLIENGRTIDAINLAYAFELTDQFEPVELLKAYLKEVKSMS HVKTGKMSPGVQNEINERELSALKAVIKCIEEHKLDEKYPIDPLQRRVIQLEKAKADK RRAVEAGKPQSKRPRANGSVYAPHITSFSDKSFYQAAAPQRHSYPYERQYVYGAEAHH HPTMISSAPYGMSPAHTTYYGNGYQVQYQVPYIH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4785..5201#3205..3374#567..1608#gtgtcctcgcctgagggtgtccccatcccatcccgtcggctgggcgtggaggtggagtcccgtgtcgcgagttcggccgccgctgccctgcgccgatctccatccccgtcggttgtcctgctgcttccgccgcatcctggtgagtatccatcctctttctcgttcatctctacccacccacttttttccttgaatttccctgcgttaattctagcttctcttccagatctggaagcttcttttctctcaattttgatcaccttacaaataacagtttgtttgttcccccaaaaaaatttacatcacagtataccatgtcccacgttagatccgtccatgggtagatgatgttgctatgttctccgatttgtgtgcaatagcgtataaaattcccttcaatgttccttcatccatgcgcaggaagaaattaaccgaaccattttagtgagatattgcgtagtttcgatgaagtttttgctgtactgtgcggggatttgtttgcagtgctatttgggttgcgcgaaccaacagcttccgttgtttactcatttgcaggagctgccgccatgtccgacatggagtccatgacagcccttatggagtctacaggctccaagctgcagctgcttcagcgtgcatttgccgagcttgagagccagagtgctgtttcattgaacttaaagtggaagcaacttgaggaccatttccatggccttgagcagtcgcttaagaaaaagtttgatgagctgaaagagcaggaaaaggagttcaaggagacagtcacgaaatcggagcagatgcttgagcaacaagaggctgctgtcgtggcaaaggaactgacttctcttgaaagactgcagcagaaaagggatgctgcgttggctatgatcttcggcaagtcaaagctgaacttgtctatgcctgtaatcaacccaatcagcaaatctgtgagtaacaatgctgtgttaaatggcaacatcgctagcctgtggcccaaacctgcaactgcgcatggtgcatacctgcaagatggaaacactgctgtgaagcctcgttctcaacttgttatcctctgtgaagaaatgaatgttaacgggcttcataagttcatatcagacaatcgcaaagacttaacatccatccgtgaggaaattcccgttgcacttaggggagcaactgatccatatggcttggtgttagcttctctagaagacttctattttggagacaatcttatattggatggtaaaaaggatggaaaccttctgggtgtacggaggacgtgcctcatgttgatggaatcacttgctcagctgcaaactgatgctactactggtttcatatcaaaaggccaaatgcttactgctagtattaaggagagagcgaaaaagatagcgcttgagtggaaatccaagttggatagccttgactttgatgctagcaatgggaactgcctggaagcacatgcgtttcttcaactcctggctacctttgctatattttctgaatttgcggaagacgagctgtgtaagcttctcccatcagtcagtcgtcgtcgccagacacctgagctttgtagaatacttgggttgtcacagaacatgccaggtcagtgctatcatggattaatcatgcacctagttccgttatgtattgaccataggggttttctatttgtcattgtcactcagattgctagagagcttattcttaccacttcaacatttgttcatatatgaatagactatatcattggatttattttctagttagtggctgcagcgagaatatacctagaagtaatcaatattgcgacattgctgtttagatgatttatatggaaaatctgaaggctgctacttatgttttagtggctgcacatcttaaacccactatctagtatctgtattgttcttactggcaacaaaattcgagcagcttctaacgctgcgttcgaattatggactttcctctcacgcacgaaaaacgagggtggtttattagcgcataattaattaagtattagctaaaaatgaaaattagattaatatgatttttaaagcaatcttcctatatattttttttgaaaaaaaaaacataaagtttagcagtttgaaaagcatgcgtgcggaaacgaggtagtataagttgggaagggggaagaaagaacaccctaaggctgtgtttgatacttggggttgggaacccaactccaccgcacggaaaacggagcggtccattagcgtgtgattaattaagtattagttaatttttttttcaaaaatggattaatttgtttttttaaagcaactttcgtatagaaactttttgcaaaaaaacacaccatttagcagtttgaaaagcgtgcacgcggaaaacgagggaaaggggttgggaaacttgtggaaagaacgcagcctaagcatgctagtgcatggtctaaccagctcaattcaggactcaggagatcttaatgtcacaggatgttagttactaacttccgaataatatatgtaattgcatatagtatatattggattatagcaagctaatacgactttattcaatccctttttggttgaatttgtcctcccgtttgattatttactgggatgtgctgttgtgcatctcttttagaaaaaaaaatacacatatatgagtattatggttaatgttatgtagtggcaaaatgcattagaccttaaaagatgaatcaatcaagagttggcaccgacatggttttgaaatatataaccgtggaattgaacgattcaacttttatgctggcgctgatttacacatctatcaatttgcctaagattttaaactttctcaaagagttgtacagaagcaaggccctagttcgtgatatgttgttacagcttgtatagctccagcaattaagcaatctaaaattattataatcacatacatgaatgatgatttttgtatggtttgaacaagcatattgcttattgtttagctgctgctgtatctgcttttgttttgacagtttcaacagtcattgcaactgaacattattttttgtgcaatatttgtttgcctcaccctttgctccattcttttaattttgtctttcgtcttttgtgccttttcccctcttgcatgctcttttcgtttttacaagtcagcaacatttgttcatgacaattaagtcctcatgttcatgtttctggacatcaggtgtcattggagttttgattgaaaatgggagaactattgatgcaattaatttggcttatgcatttgagctgactgatcagtttgaaccagtcgaattactgaaagcttatctgaaggaggtcaagagtatgtcacatgtcaagaccggaaagatgtctccgggagtacaggtacacttttttcatttcaattttcagagttcaagatccaagtcgggagctgagtaaccctggtctactttggtttaacaaaaagtgcattatttaatttggatccaaaaattatcattcagaatttcgaaacttgaaattctgtaaaaacttagtattaaatcattgtaagtctctccttgaaaattgaagttgaagcgtcttaaagacaagattacttgtagcttgtagcaattctgttcgatagatcagttggcatgccacttatttagtattcgttgccaagcatataatatccattaatacaataaaagaagatttttgtgcaaatcattataatattgcactggagcaataaattcgttcactatattctagtgttttcatgctcatttttcctgtagcaccatgacatcctgccatgatgatccatgaaatgctccttatgctgcatacctcaaaatggcagccaaaattaggataaggagattgtgccataacttcctgttcctgggattgactagtttggatgggattttgcctagatccagggaaaggaatcttgcgtattactaattaaatttgtaccaattctcttaaggagatctgaactacatgaaagttcattttcttcagctctgcattcctttcccaccataaccaaggtttatccagattttttttaacagggaagctaatcgttagattatgttttaatagtttgctcagtgtacttcttaatttccttattctggaatactacctccgtcccagaatataagaatttttagggttgaacacggttattaagaaagtaggtagaattaaatgggagaaagttgtgattggatgagaagtggaggttggtgaggaagttgaatggtggatggttgtgatttgttgggaaaaaaatattggtagataagttgttattttttgggacggagggagtaaagttagcaaattatttagacgccaatcagcttcagtatagaagcttgaatgtcattctgaagaacttgaataataataatatctcgacccttaggggagagacatcctgaaggcatctcatttgaggtcgagaaaaggccctgaaagctggctaacccatatggggactttttgttgtcttgacccgtgctttaggggaacatgcagagggcctttttttggagccctggttggtagcctcacaactggaggacttaccatgttttcaagaacttgaacaataaagagctatcttatcttgcaagatattaagctagttgcctgctaattttactttctcgagtggcgtaattaatattctctcttcttgctggtatgtgcattcttgagcatatctgcatgcattcctaattgttatgttttgtattacatctgatgaattatcatataatgcagaatgaaattaatgaacgcgagttgtctgccttgaaagctgttatcaaatgtattgaggagcacaaacttgatgagaaatatcctatcgacccacttcagagaagagtcatccagctagagaaagccaaggcagacaagaggagggctgttgaagctggaaagccacagtctaagaggcctcgtgccaacggatcagtatatgcgccacatattactagcttttctgacaaaagcttctaccaggccgctgcgccacagaggcattcctacccttacgagaggcagtatgtatatggtgctgaggcccatcatcacccaacaatgataagctcagctccctatggcatgtcacctgcccacacaacatactatggtaatggctatcaggttcagtaccaggtaccatatatccactgatggagagagcgccgtgtcctctttcttaactatgtagcttttaacctgctactatgtgttgtagttgtatcaatccactagctagactgcctagctgaaattagttcgaccactcctgtgtgtgctgagtggccagtgtgaaaatctgttaatttccctgacgacttatgacataatttactcctaatgtttagttaaataatttgcttttgtttaatataaggagttgagatagtccc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |