Os04g0183100
| Gene Name |
Os04g0183100 |
|---|---|
| Description |
Conserved hypothetical protein |
| Version |
NM_001058720.1 GI:115457169 GeneID:4335104 |
| Length |
10652 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0183100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:5648225..5658876 |
| Sequence Coding Region |
5648612..5648635,5650213..5650424,5650828..5650950,5651243..5651297,5652068..5652217 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:5648225..5658876 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008397:5648225..5658876 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggctggtcctcctccgcaccagccgtcctcctccggagatgtcgaggtcgccgtagagagcggctccggggcctcgtcctcaaggaacaaactgctgagtatggtgaaaaaacattcagatttgatcggctggacagttattgatgctgaagctgatgcatcagacgtggaaatggatgataaattctggcatgaaatacttgatcttttcttcgtgcatggtagggtttcaaaggggagggaagaggatgaccttgtcttctttgttaataatatgaaattgaacgggtacaggtccagtgataacatggaaaatccacctcccttttttgtgcgaagatgggctcctaagcttgaaaagatcaccaatataaatttagctgatgtcaattgggaacgttcattctatttgaatttaattgctcacacgtcatactctgttacagttgcaatatgcagtatcatggatctttgcaaccgtgcagagaaaagcaaaccattatcaccagtttataaggtcacaaaaactgtgtatgcatccccgagccgcgtaaattttcatcttgatcgaaggaaggcagtagaaacggtacctgcataccccaatatttgtttctcaattgatgacttcgatgatacctttgatgcagttcaggttttatcagaccctgaacattgctactgtgttattctcaatgcacatgatggggcagcatttcctgaaaacactgaatcgaaaaatcctagctcaaatgtgctatctggggtaaacactgggagcaaacaagaaaaaccaccaaagagaactctcttttcaggctacgtcagctaccaaaacgttcgagaagcttatgatgctggcagatcaaaatttgagagcttattctcactcgggcatgaccgcactaaacttgataaactttatatgaggggccctgaaggacgtggagaagttgaagtagctgtttctggaatagcagatcagagccatgagagatcaaagaaagatccaggaaatagctttcgggcccttgtccatagtgcagcatctactgcatcaaaactagcaaagcatgcctacgaggctgcatctaccaacaaacgctttgatgatgagcttctgcctctaaaatgttgcttgatgtcagtatctcttccttgggactacattgcacatgacctgctgcacaaggaaacacctccgttggacctatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGPPPHQPSSSGDVEVAVESGSGASSSRNKLLSMVKKHSDLIG WTVIDAEADASDVEMDDKFWHEILDLFFVHGRVSKGREEDDLVFFVNNMKLNGYRSSD NMENPPPFFVRRWAPKLEKITNINLADVNWERSFYLNLIAHTSYSVTVAICSIMDLCN RAEKSKPLSPVYKVTKTVYASPSRVNFHLDRRKAVETVPAYPNICFSIDDFDDTFDAV QVLSDPEHCYCVILNAHDGAAFPENTESKNPSSNVLSGVNTGSKQEKPPKRTLFSGYV SYQNVREAYDAGRSKFESLFSLGHDRTKLDKLYMRGPEGRGEVEVAVSGIADQSHERS KKDPGNSFRALVHSAASTASKLAKHAYEAASTNKRFDDELLPLKCCLMSVSLPWDYIA HDLLHKETPPLDL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>10242..10265#8453..8664#7927..8049#7580..7634#6660..6809#6424..6498#6293..6352#4566..4623#2583..2689#2063..2137#1782..1974#132..217#ggctttgcccgtaataaacccattcaacacccaaacgccaccgagagtcgccggcggcggccgcatccggccatccaccgccgatcgccgccgcccttctctcccgttccttcttcctctccgctctctcgatggctggtcctcctccgcaccagccgtcctcctccggagatgtcgaggtcgccgtagagagcggctccggggcctcgtcctcaaggtacggcacgcacctatatccccttcctccaatccctaaattgggaaccacaactgatcctcccgaggagtggaggacccgccatggctcatacctcgcatccacgccgcgggaggtgccctggacgcccacccctcggctgcccggccgccgccgaggatgatttttctcctcttttttttttaattatttttcacttctgtgagctttgggcagcccttccatgttgcaaaagttgtgaaattcctagcttggcagttgcacatatcgatttcaatcgaggctgcctatacatcatgtgacatattttttggcctcctatcatacagatttcttacccttcagatcaacatctaatggatgacattaatatacacaaacaaaatacaaaaaacaaacaaacgggtcacgtggacaaatctaaagctcacgtgggctcaaatgggctcaagtagatttcaaacttacatcgtaaatacactaaaattacatatgtaattttcagacttacatcgtaaatacactaaaattacctatgtaattaatatgtaattatagtgtaagtacgatgtaattagtacgtgtggggatcataaacaaattaactttggaaaacacgtacggctagtttaacaccagggaacagtaacgtggacctagttaattagcagctagatgcaagcacggatctcacaaaccatcctacggctaaaaaaccgaatgattgaaggctcataaatctgtcaaacgatggttagcgattccgatttcaattacctaaagtaatgttttgaaatctagcacaagttattgctcattgatgctcaatgcattcgagtgaaattacatttactgagaccttagagctatctatgataccattttatatcgtaacaccgctctttagtctttacgatggaaccaagattgccattcaaccttgttaacctgtgttcatattgggagtttttcttttctttgagcagtggtcctcttgttgctattttaagatgatctcatgtaaagattgaatttctttgttgaatggcttcttttcagcctctccttattttctaggtttagcagtgatgtgattagatcatgggggacccaggacaaaataaacaatagtttcagcttcggaagtcttgtctctgctgactatcgatcattcatctcacttcagttgtcattttcactagaactaaagctatctcaacaagcaaagcaccctcctttgatttgcagctccgtctgcatgcttaaccttaacccttgctgatgtcctctatgcttgaagagcgctcttgatcccattgctaaggaaaacatgaccaaaatgatcattcttgtgacttccgctgaaaaaaaaaggacaacatcataccccactgtaacacataccacccaatgatgctggtcagagctaagttatctccctagtggtaatgcattggaaataggaagagatttgattttgttctatttaagcatatcttcatcttctgcgaaaacttatatcctttaaccagtgctcaactttctgtcctgtacttttttttaggaacaaactgctgagtatggtgaaaaaacattcagatttgatcggctggacagttattgatgctgaagctgatgcatcagacgtggaaatggatgataaattctggcatgaaatacttgatcttttcttcgtgcatggtagggtttcaaaggggagggaagaggatgaccttgtcttctttgttaataatatggtacatttcaatctattgattccccttatttagcttgacggtgtggtcttgtatgctaactgaagctcaatattctatgttggtgcagaaattgaacgggtacaggtccagtgataacatggaaaatccacctcccttttttgtgcgaagatgggctcctaaggtaattaagctagactatttgtttaacttgatcaataaatgcatgtgtcccttttggtagaaggaaaatttcaagacttctttctattttggaatttctctgtaatttactgttgagttattctgtttgaaactgtatcaagatgaactacatcatcatgtattgtcaaccataacatattttttcattcatgtttctttccaataatatttatcattcattgcacatttacacttgcaccagcaagtcttatactgcatttctttagcatgtacttgattgtctgccacaatttgacagacttaaatttggtaaatttactttcataagctagtgtttggttcataacatactttctagagcatgagctcaacaatttcttatactacatttatacatactgtcttgattttctatttggcctcttttgttttatgtggagcagcttgaaaagatcaccaatataaatttagctgatgtcaattgggaacgttcattctatttgaatttaattgctcacacgtcatactctgttacagttgcaatatgcaggtaatgtttctgcaacaaatctctcaagatatcctgcatgttttgtatttagtatttaggcaaattttgctacaggacatcgtgacttcgcggttttagccataggacactgcacgaaatggcttttgggggaatacactctataaacgtggtaatttgccagcagacaccgtacccattaaaataatagttttcgtttgaaggagagaaaaaccgcatgagatgtcagaaatacccctggacccacatgtcagctctcccatctctcttgtctctctgtctcctccatcgatgtctcctccatcgatgccacagatgggtttgccggcgatgcggacaaggtggcgccacgggacggctcaccggtggtagctggcgacgcgcttcgccgacctgaccaacaacgtgttccgtgcgcctacctcggcaccacgcccgccggcaggggacgccacgtcggggaggcgtactgccacgactgtgtccagtgtccgcgcatgccgcggcccaagatcctaaacgcgttcgacatcattgcatcgtcgccgagcttcgacctgtccgggctgttccaggagcgcggcgagaggatgcgcttcgtgtccggcgcgtcggtggccgacatcatcgccaagctagaggagatcgccggcatggtgagcttcatggcgcggaccaaggactgccaggtgagcatcgaggcgacgcagaacgggcagaagggcgcgctcgccatctccgccaaggtgttcgagctcacgtgggagctcgtcatggtccaggtgtccatggtccgcctatgagctgttaattttggaggtctgtttgattatccatcttcttgccacgagagaaaaacatctatagcgaatctcgattaatttgccagcatcgaggaggcggcggtgctcggatgtccggcagtcgcgcgcgccctgaaccagtggcggcgctagctgtccggcggtcggaggcggcggggtagggcgcgcatccggagccacctgcggcgctcggatgtccggcgggcgcacgtgaggaggcggcaagcagctttggcgggaggtggtggcggcgggctagagcgcgaggaatcgatgagtggtggcggactggcgcagggaagcgtgggaaggaagggggggatagagagaagagagatgggagagctgacatgtgggtccaagggtattcttgacatttcgcgctatttttctctctccttccagcgaaagttattattttaatgggtgcagtgtcccttggcaaattaccacatttatagagtgtattaccccaaaagtcattccgtgcggtgtcctagagctaaaatcgtgaagtcacgatgtcttgtagcaaaatttacctagtatttatcttgaatgattggcattcagttatttatgttaacaaggaaaagtttatttggtgatctagtgatgcacatcctttctaatgtgcaacttaatggttctaaacttctaatctgtcagtaaaaaagttgcctgtatattctcttaaattcttatccttcctttgctcaaatgtgacactgttgccacatgttgtctgtactagttttatgcttctattttctgtttcttccccgctctagcagttgtgaactggatctaggttaccttctaacttacagaactagtcagatatctttcgttattaatttatactggcatcattgtgtgtgtgggtgtttggggcggggggggggggggggggtactcacaaatatttggagtgcaacaatatccattgtcacacaaactgagacctctgattgtgtcatatgttcctccttagttgatatatatagcaaattattattcaacaattgtgtttcttatgatctactgtacagtatcatggatctttgcaaccgtgcagagaaaagcaaaccattatcaccagtttataaggtaatgtacaagtaagcattctgtgccacttactcgtgatgtttaatgttgagctttgtttcatgactacttatatattcattgtttcagaacattccataattttatccacagttttaaaccaggccagtgagtgaactggctatttcttggttcactagtcaggtttttctgtaggaacacagtctgatgaaggtaacattaaattgtcttgagaaaatcctttaaaagattaacagctattcgagttgtttgccaactaatacctagtattgtttcttacgaacaatggtcctatccacttgattccttcctacattgaaagacaaagatgctggttcaaatctgcatattgcaactcctttaaattttgtttcacctgttttggagctaaacagtccagaacacagacaatactggatcaggcttctgtgtgtttagaggattttaccatccttaagaggtgccaccaggtacaaggtaatgacgggtaccattcaaatctaaccattgatttgctgggaggatgatggccaaaagttaaaaatagcaatgctaggtatctatatccgtttctcacgacagacatgggaatgggatcagaggatcagggaggatgccttgcaaggggaatgcacatgatggcacccaatttgagtctgctgctttgatctgaacagagggaggaatctggatgaggaaaaataatgcgtaactcaaagaacaagactttctcatgaatcgatatcctattatttacagcagatccaagctctggatcttgtttttatagttcatcaatataaaactgccaattccactgtaatctggtattccagcatatagctatttacgtttggttcagcaaacccaacaacaaaattcatagcaacaaacaaaaaataaagaggaagagaggtcagtggggtctcagctcagtactgaaccagcggcgatgggagtggaccagggtggagggaggtccctgccgtcacctgcccccacgttccctgctctctcctcctagcgcatcagaaggtcgtcgagccggtccactgccacatctgccacgcaaaggtcatcgctgtcactgtctgctcatcgttctcgttgttaggccgcccatgaaatcgaggaagcctcccagctaccgccgccctcggccatatctggcacccctgacatcggcggcggccatgtctgtcccaaaggtgggcgatggtcggcaggagagggaagacggggagacagcgcatgagctgcagagccaaggaggtaatgtcgttggatggggagaaatagttgatgcgaaattaccatgttaccctcccaccattagaaatagattggtacctgctctcaataggccgtcgtggcgggcggtacaaaacctttccagccattagatggtgtgtatttgactgctaggattatggtacctcctgccctcaaggactgcagaaagcctcgtgtgtgatcatttggctgggttttctttattcttccaagccttgggttgaaatgaacctgactctgaaagagttgttccattttatttaactcttaacttctgtatttcattgttgcaatgctatctaccctagctaaagtttaacatgttctcagtgttaagtaattccatctcaaactcattgtcttatcaaaacaggtcacaaaaactgtgtatgcatccccgagccgcgtaaattttcatcttgatcgaaggaaggtgattttttttctggccttttctgttaaaagagatggtttttctatatacattcttgtttctttgaacaggcagtagaaacggtacctgcataccccaatatttgtttctcaattgatgacttcgatgatacctttgatgcagttgtaagttcccatttaattccccctagtagaagagatagtgttcagcgttctaacaagtgttgtcatatggatgtatctttaatattgcattgttttcattgttttcatatatatactctataggaaaaccctaatgattaacgtggtcattcaaattttagcaggttttatcagaccctgaacattgctactgtgttattctcaatgcacatgatggggcagcatttcctgaaaacactgaatcgaaaaatcctagctcaaatgtgctatctggggtaaacactgggagcaaacaagaaaaaccaccaaaggttctctctctctctctctctctctctctctctctctctcacacacacacacacacacacacatacgatgcaggtttctttgtagtaccattttcagatggaaagaacttcaaatcactttttttgttgtgagtagttctgcagttagaaatatatgttatcacatcttgcatttttttagataatgtcacataagatcagaagttttaatcagtttttaaaagagttatgcattgttaaacattaccgatctgcagtactttcttgtttccggtagtaattgagtgccaaatccatcatatctttaagactgtgatcattcatttaaaaccgatctactttaaaactgtgagcatttgttcaaacccataagagtcttgttaaacttcggttgttggcaactggtaatttattgtggtcacaaggacaacagtttcaggccccatattatcagtgccatagtaaagtagtattttcttggcacctcaaccttttctagttttatagatataataatattttatatgctttggagggcttgctcagtcgtgccttctcagttgtgcacatctttcactatgctcctaattattttaatataaatttagaactattgacaggttctctctgcctactggcatcactcttgttcaaagcatagttacgctttagaagatatctgcttctgcaacacaactttatgatgtataatgtcatacaatattaatgagtttctcacctacatagggcttctgtgattattattgcagagaactctcttttcaggctacgtcagctaccaaaacgttcgagaagcttatgatggttagtctttcgtccatctaagtatttccaaggaaactattgttcagttggtcttctgaagtatttgcttcctttcaactttatctgcacagaaactattgtcacatgattaatattcctgtcaacatatttcttcctccatagctaaatctaatagaatcatatgtttgatagtactggttttaactgcatcaaccctttgctcaactagtggatttcctgtttaaaaaaattgtaggtacctaacatttcattccttgtaggtttcacattttctgatatcctgttatagctggcagatcaaaatttgagagcttattctcactcgggcatgaccgcactaaacttgataaactttatatgaggggccctgaaggacgtggagaagttgaagtagctgtttctggaatagcaggtcagttatggttagtctgagagtcccaaatcatcagtgccataattatcatgctgtgacatgcaatcatgcattatctgtaatgagtagttctaatagaatggatttgggactcagttaaaataatgacacacatatattgctatggtaattggtaaactactgtcgtatctttatactgttgttgaaatgtttgtttctctacaagttatcactttttggtgcaatgctaggttatagtttgcattttgcattctataacaaatgtacaacattagaactacttccaaatatccttactgccccaccccagacatgcacattcactttttgggttactgtagctctagtgcaagttgttgatccatcaaactctcacacgggaatgattgtcttctaccagatcagagccatgagagatcaaagaaagatccaggaaatagctttcgggcccttgtccatagtgcagcatctactgcatcaaaactagcaaagcatgcctacgaggctgcatctaccaacaaacgctttgatgatgagcttctgcctctaaaatgttgcttgatgtcagtatctcttccttgggactacattgcacatgacctgctgcacaaggtaaaatccgtcactacttgtgaataataattattttgatgactaaaattgttaataactagttttcttttcctgcttttgttttcacaattatcaactattcgctgttgtcaaacaatatctttattctgtgtgagattgttgataactatttttgctttcttgcttttttttgtcacaattatcaagtattggctatcactactggagaactaatcttttgtcgtggtaccaaaaaacacaaatttctcagatctattaccaaccatactaaatatgttatttagtaccggttggtaacaccactagtactgtacaatcactaaacattgtttttagtcccggttcaacattgtcagaccgagtcagatccttagggattaaagatcaaccggtactaaggatcaacactttagtactgattgatgtcaccaaccgatactaaagattattttcaccttcctcgacttcctttacatttatttatttcatgtagatgcatcggccatgtaaacgaagtcgacgaaggtgaaaatggttaaataagcatttaataatttaaaacatcataattgtaaatatacattttcatgtattatcttttttaaaattctaaaaacattttcaatgaattcttcttatttctagtgattttaatgagttttaaatggacttaatcagagctatggttaattatatataaattctagaagttttataaaattgtaagtattttttttcatgtattatacttattttaactatttttagaagttttttaaaattctgagcatattttcaatatattcttatttctaactattttttaaaaaaaaatggacttagttttctgttcttattccttcattttctataattttcctttgttgtctttttttttaacattttcatccaatgtctctaaaattctaaagtactcttattttctctaaaagtttattctctcctctttttccacaactttttgtgagagaaatgtgtagaaacatagctagaaatgtaatatgttaaccatacatcaatagaggatgaaattgctaaccttttagatcctttcgattcgtgtaatatcaccaaatactttccaaaaaaatttggcagcacttctcttcctcctcttggcaacaatggttcgagctagaggaggaagaaggcatataaaagggaaatgagctttggtactggttggtaacaccaatcggtactacagatcaacataatctttagtagcagttggtaacatcaactggaacaagtattagtcacaccaatcgatactaaagatcctgaggggcggcttgacacggtttgacaatgttgaaccgggacttaaaaactatcttttattaccaaccggtactaaagattgtatagtaccgttggtgttaccaaccggtattaaaaaacatctttagtagtgatataactaaaatcactaaagattatagatccgagaaatttgtgtttttttaccacgaaagagatctgttctctagtggtgatatgtaacttatgatatgaaaaagttgaggttgacaggccatgccatgtaacaggaaacacctccgttggacctatgatccgcaacagtttcaaaccaatacgaattttgggaagaacagcatggttgagaagtggtactcatctactgggacatctcatggtcaacaatgagaatttgtttcaggatccttactgggctagccattggggcgagttgaaaggaagaggattgcttgtgttatgaatgttgagactgcgattccagttatgcaacacaaggaatgatcttacgtacatgattttggaaaagtttgtggttagcaagtcttgtgtgctcgatattgtgtaagatatgtgatgtacatgtgtactttaaatagactttgtatagtttttatgcgccgttgtacaatgttgaaagaagacgtgcaaagaaagcatattttaacttttttatcacgagg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
