Os09g0565900

From RiceWiki
Revision as of 07:35, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os09g0565900| Description = Hypothetical protein| Version = NM_001070486.1 GI:115480714 GeneID:4347876| Length = 4687 bp| Definition = Oryza sa...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os09g0565900

Description

Hypothetical protein

Version

NM_001070486.1 GI:115480714 GeneID:4347876

Length

4687 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0565900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:23379679..23384365

Sequence Coding Region

23379914..23380678,23380757..23380897,23381414..23381596,23381686..23381814

Expression

GEO Profiles:Os09g0565900

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008402:23379679..23384365 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008402:23379679..23384365 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgatggttcaaatgtatgccggcggtaattacgctggagacgacgttttactgatcaattcagtaagcagcacgagtagtatgtttattttgctggtgtatttcttgcatgggagagaggatattaagtactggatcctcatgatcctctttgctttggtggtatgctgcggaatgggatggttagtttggcaccctaacataatcatgtccgagagaacacaagacattttaaagaagtccaccaaatcagctgggattactggaatagtactattcggattggtgaattttctcccattttttgatctgtggaccataaccaagagcaacagtacagacttcagtttaacaacgccaattgttataaatacgatgttggcaggtgtattgagtgcattctgggctttgtatgcctggatatttgacccaaaatcacccaattactttatgatagcaaattcattggcggctggcatgagctcaatacaatttgtatggctgttggttctgcgcaattctcacagagaagtaaacggacagattgtagaagttgagagtctgcggtgtgtgttacttagtgtcgcaaagtcgttggagaggttgggagcagcagctcctaccgaggagttcttgcaacaaaccaagtatctgctgaggttacaagaaggtctgtccattgggctgcagtcgttggatttgatggagagtgcattccttcggctggaacaggagctagtgaagaacgttgctcgcactgctaatcatgttttagaaatgcaggataaacaagatgcagcggctaatttcgtggcaaggtctgatgacaacaatgcaaatgatgtgctaagagcctgtagaattttacgtgaaggatgcacaacgaacaagaatgcttttgatagcatgcaagaggctatacaacacaagattgcaaatgccgaaggaggagaaaacaacttgaaagacagaatcaatgccgcagcagcagccataagaggcttggccatttccatgggatacaatatgcaaaccatcaacggtcgagggattccacccacggtgaagatcgccttcaatttttgctgtgagcagattttgtcagttaaaacttgcgccgacgccccgtttgtgtggttggggtttggtggattttctctacgaaggcgtctgaacttacggtttgataacgtgaactggcctgatgtacccttgtag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MMVQMYAGGNYAGDDVLLINSVSSTSSMFILLVYFLHGREDIKY WILMILFALVVCCGMGWLVWHPNIIMSERTQDILKKSTKSAGITGIVLFGLVNFLPFF DLWTITKSNSTDFSLTTPIVINTMLAGVLSAFWALYAWIFDPKSPNYFMIANSLAAGM SSIQFVWLLVLRNSHREVNGQIVEVESLRCVLLSVAKSLERLGAAAPTEEFLQQTKYL LRLQEGLSIGLQSLDLMESAFLRLEQELVKNVARTANHVLEMQDKQDAAANFVARSDD NNANDVLRACRILREGCTTNKNAFDSMQEAIQHKIANAEGGENNLKDRINAAAAAIRG LAISMGYNMQTINGRGIPPTVKIAFNFCCEQILSVKTCADAPFVWLGFGGFSLRRRLN LRFDNVNWPDVPL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>3688..4452#3469..3609#2770..2952#2552..2680#agagcaaaaaagaaaaagctagcacagagctgctcacttctcagtatagaggcagaggcagagacgacagaggcagcgcgattctttctttttggcctcctctcctcttgtctcgctcttcttcttctccctcttcttcttctatgagacctcgctctactctctctggcggcgcggccacactgctcttcttcctctgatcgagacctctctcggcggcgcgcacactggtagcgtggtgagcggagcggtacactccctactccccagtgcttcttgttctgtatacgcatcatgttcttgcatctcacatcttgcaatgtttttcatgttctatccgcctccctcttctttacaatctgtttctcgatctattgtgtgctagcttcttttcttaaagaaaataatttggataaagagatgtcgctttttctacatctcgctcatgctgcatgcttatatatgtttttccattgagatcgattggacagccatggttccaaaataactagtttttaaaatgtttcaataaaaagagcatcttttttcttgtcttgtgggcttgtggttagtacaaattttcggtccgatgccaaccggggttttggtgcacatacgaatgccagctcctctatatagtttttggatggtgtgagaggccaccatattcatcatcaaaaggagctgatagatcgatgttgcctgtgtccatggctagggaaatggcgcgcgcggcgagattccatcggctaggtagctgcatctcatcgatccagaccaacagtatgcgagccagcgagttggctttgacgtgtgcatgcgttggggttcattgggccttcaatatatttctcttgtgaaaaaaaaggtgtcttttaattaatttaatttcgtcgtcgaccctgtcgaatgggacagtatattgggagagcaatgcaaacgatctggagtatctatcactcgatctgagcgcatatttttatctcacattctcactcctaggcgccctagctaggatctcgatcggtaattaattagtgtatcatcctaagatgaacatatactgtataaactaatcggccggtcctcctttccttgcaaatatgcaaattttgattctttatatatacgtccttataaatactggtcctcatcatttcaatcttagtatagattcggaaagagctagctagatacagcaatcaagaaatttgcgcatttatttaaatatataatgtgtgtttttctcttgaaattatcgtaccgtatttgattgtttctttgcttgccgtttcgtttgcacaggtatgggtccaaggagcacaagaggccgtgttctcatgttccttttgctggtcctgatgatggccgtcggagccaatcgcgattcaacagtacgtcttctcattcccttccctatcaatcggagagatctagctagtccttaattataaattgttcgtcccacgcttgctaattaactcacacattgctaattaattaactcgtagtgttgtgtatatatattcaggcggctggatttgcaaggacggtgtccaaggctgaagtgttggcatcacctcctccaatttcaccagctgtcaatgctgtcatcattataagaaatcgggtggttctgtcaattggtaaaatcaatgttttgaatgattagatgcacttttttatataaaaaatagatgataatgtggctttatatataatttctattattacaatacaattcatgtttttttatacgtcgttgtgtattgttatgatatatgaaagttttttcatgtacaatctagatattgtcacaattagatagtgtagcatttctctgcttcatctcaagcatgtttcaaaaataagtttgaattaatgacacctaattattatacgttatctaattgtttataacaaaacaaaactcacatcttatgtaataattggagttgtatttagaaaaataaagattagtattatctttgaggatttagatgtgtagaatggataacaatatcacacgtgattatgaactaaagggaggtgaatggatgagcaatgattaaattagatagatgaatagctagcttcttgatccaacggctgataactctatacaaatgcgatccaatggcttaaaattgttgataatgtggctttttgcatatcttgatttttatgagtaaatgcttcttagtgggtatcaactatataggaagatatgatatgcattcatttctcttctgctctatttgattgttttcaaattaagtcatgtctagtctcgtgtactagttattgcttttatggcgattaatatgcatgcttacaatattattaaccggtctcccttttattttttttctctgcatctatttaatttattttattttatcttattgtagctaatatttttagcgtagcagtctcattatggccgttttttgttcgatggagatacggttcttggtttattacacgccagattttttcagcaaaagtcgtggcgtgtaatcttgtggcatctgtcacttggactatctatatgatggttcaaatgtatgccggcggtaattacgctggagacgacgttttactgatcaattcagtaagcagcacgagtagtatgtttattttgctggtgtatttcttgcatgggagagaggatattaaggtaaatggaacaaagtcgatatgtttttaattagttgttttcttttaagttgatctaatagtaattttatttattttacatttatatagtactggatcctcatgatcctctttgctttggtggtatgctgcggaatgggatggttagtttggcaccctaacataatcatgtccgagagaacacaagacattttaaagaagtccaccaaatcagctgggattactggaatagtactattcggattggtgaattttctcccattttttgatctggtatggttgcttgtctgaaacacatacgcattctactgttgtgtccattaattgttagtttagtctaaaaccttttggttagttagagaacaaatcatgttcagtatcagtttcacactgaaattaactttggaaatgtatcattgcttaataagaggaacatgtatttattttggtaacatagtttttttcagtagtaaatagtaggtatatacctatgcaggcacaaaataagttcaggacaaccaagctaggtttcataggatatttgtgtccttgaggctaagtagcgatccaattttgaattgctgcacccaccccttgtagtatcatatttcatcatgtgcatcattatccacttcactgttcgttcctaccaagggaaatcactcagtaatgtaattagtgtggctactgtagtgatttttttttgtgtccattgtacataaaaaatgatttaagtatatgcaattttttttttactttactaacgccccatttgttttttaatttcagtggaccataaccaagagcaacagtacagacttcagtttaacaacgccaattgttataaatacgatgttggcaggtgtattgagtgcattctgggctttgtatgcctggatatttgacccaaaatcacccaattactttatggtaagtaatacattgcttgtttttgtttttactaattattaatagtttatattttctttttaatgtacgtcattacagatagcaaattcattggcggctggcatgagctcaatacaatttgtatggctgttggttctgcgcaattctcacagagaagtaaacggacagattgtagaagttgagagtctgcggtgtgtgttacttagtgtcgcaaagtcgttggagaggttgggagcagcagctcctaccgaggagttcttgcaacaaaccaagtatctgctgaggttacaagaaggtctgtccattgggctgcagtcgttggatttgatggagagtgcattccttcggctggaacaggagctagtgaagaacgttgctcgcactgctaatcatgttttagaaatgcaggataaacaagatgcagcggctaatttcgtggcaaggtctgatgacaacaatgcaaatgatgtgctaagagcctgtagaattttacgtgaaggatgcacaacgaacaagaatgcttttgatagcatgcaagaggctatacaacacaagattgcaaatgccgaaggaggagaaaacaacttgaaagacagaatcaatgccgcagcagcagccataagaggcttggccatttccatgggatacaatatgcaaaccatcaacggtcgagggattccacccacggtgaagatcgccttcaatttttgctgtgagcagattttgtcagttaaaacttgcgccgacgccccgtttgtgtggttggggtttggtggattttctctacgaaggcgtctgaacttacggtttgataacgtgaactggcctgatgtacccttgtagtacgaattgggctacgtactgtacgtgaaacttgctctaatagcttcagcgagcaagcactgtgcaacttctggattgctagctaggatacttcgtgtccctaagtagtcatatgcttgttagctctgttagtttcttctgctgcttttgtgcccgattgttgtggagtgtgatgcttctactggtgccagacagctctatatatctttccagcaaattaatttctaaaactagc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0565900, RefSeq:Os09g0565900