Os04g0286000
| Gene Name |
Os04g0286000 |
|---|---|
| Description |
EGF domain containing protein |
| Version |
NM_001186908.1 GI:297722946 GeneID:9268253 |
| Length |
4682 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0286000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:12391575..12396256 |
| Sequence Coding Region |
12391575..12391768,12393047..12393693,12394345..12394881,12395313..12395465,12395541..12396256 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcaacgctcgcgagctgccccaagagttgtgggcagatgagcatccactaccccttcggaatcggagcaggctgcttccggcagcctgacttcaacctcatctgcgacaactccactcagcccccaaagctcctcttgcatgatggcaccaccgaagtcgtcggagatgaagattcactacgccggaccaggtatcccgtcagaggtgtgaggatctggcgtagtgattccagtattggcatggacgtaggattatcggagtggatcgatatcaacatttctgccactatccctatggtacctggcgttgctgagtacaattattcatggaaccttagttctttcagtatctttgatgcttctctgaatattactggttgcgagttcgacacatatataatcaacaacaagagctatagtcccactacagcaatctgcaaaagtagctgccccaacaaagagatcactgaaacggtagctcgacaaagctgtaatggtactggatgctgcacaatttatgttggaatagatgttgctaacttgcatctccgtttcgtccgccatggcagagaaggttttcttggagtgaactctagtcgaagctccttatggaatagaattaacatagttagcagttatgccagcgttatgtgggggataaacaatcgaccgacgtgcgctagcgtaaaggatcagaaccaaacggattatgcatgtgcgagcgccaacagtcaatgcgtggacagcatctcatctaccgatcttggctaccgctgtgaatgcaacagtggttatatcggcaatccttatgtacttgatggctgcacacgtgacgaagtactaaatgtgtcaagcgctagtggtgaggtttatgaactttgttcgctgaaagcaggctatcacccagttcaacaaaaggcaaactgctcccgatggtgtgggaatatcagtgttccatttccttttggtctagaggaaggctgcactgcaagaaaattatttgaactcaattgcacaaatgtgacatcttctacgctccaatttaaccgcggtcatgttgtgacagacatagatctcgcagaaggggttgttggcatcaaacttattacctcatattacgtagagcaggtgtttaggatgtacatatcaggagaaccttacctatatgcaagtttcggagaagcagtgatctctgtgcattgggctgctgccaatctgacatgtcaagaggcccagaagaaccactctcgatatgcatgtgttagtgcaaacagcacatgtttaggtgtcaactctactgatggttatgttggatatcggtgcaaatgcatggatggttttcatggaaatccttatgatgctaatggttgtgaagatgttgacgagtgcaagaaaacaccaggcatcttcaaaggcatatgccacaataacattgggagttaccaatgcatggagtgcctagacaaaacagagtatgatgtgacagctatgcagtgtgtttcaagaaaaaaacaaaatcttctgataggtattgtaattggacttagtgttggattcaccattctactctttgtaatgagtgggatgcttcttcttcggagatggaaaagggacattcaaagacaattacgaagaaattactttcgaaaaaatcaaggtcttctattagaacaactaatatcatccgatgaaaatgcgagcgataagacaaaaattttctccttagaagagcttgaaaaggcgacaaataatttcgaccccacacgtatcctcggacgtggagggcatggcatggtatacaaaggaatcttatctgatcaacgtgtggttgccattaaaaagtcaaagataattaagcaagatgaaattgataattttatcaacgaggttgccatcctctctcaaataaatcatcgtaatatcgtaaggctctttggatgttgtcttgaaactgaggtcccactacttgtctatgacttcattccaaatggatcattatttggaactctccatgctgatgcaagtagtagttttcaattatcttgggatgactgcttaagaattgccactgaggcagcaggagcactctgttatcttcattcagcagcttcagtatcagtctttcatcgtgatgtgaagtcagctaacatacttttagatgcaaactgcatagccaaagtttcagattttggtgcttcgagattggttcccattaatgaaacccatgttgttacaaatgtataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATLASCPKSCGQMSIHYPFGIGAGCFRQPDFNLICDNSTQPPK LLLHDGTTEVVGDEDSLRRTRYPVRGVRIWRSDSSIGMDVGLSEWIDINISATIPMVP GVAEYNYSWNLSSFSIFDASLNITGCEFDTYIINNKSYSPTTAICKSSCPNKEITETV ARQSCNGTGCCTIYVGIDVANLHLRFVRHGREGFLGVNSSRSSLWNRINIVSSYASVM WGINNRPTCASVKDQNQTDYACASANSQCVDSISSTDLGYRCECNSGYIGNPYVLDGC TRDEVLNVSSASGEVYELCSLKAGYHPVQQKANCSRWCGNISVPFPFGLEEGCTARKL FELNCTNVTSSTLQFNRGHVVTDIDLAEGVVGIKLITSYYVEQVFRMYISGEPYLYAS FGEAVISVHWAAANLTCQEAQKNHSRYACVSANSTCLGVNSTDGYVGYRCKCMDGFHG NPYDANGCEDVDECKKTPGIFKGICHNNIGSYQCMECLDKTEYDVTAMQCVSRKKQNL LIGIVIGLSVGFTILLFVMSGMLLLRRWKRDIQRQLRRNYFRKNQGLLLEQLISSDEN ASDKTKIFSLEELEKATNNFDPTRILGRGGHGMVYKGILSDQRVVAIKKSKIIKQDEI DNFINEVAILSQINHRNIVRLFGCCLETEVPLLVYDFIPNGSLFGTLHADASSSFQLS WDDCLRIATEAAGALCYLHSAASVSVFHRDVKSANILLDANCIAKVSDFGASRLVPIN ETHVVTNV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..194#1473..2119#2771..3307#3739..3891#3967..4682#atggcaacgctcgcgagctgccccaagagttgtgggcagatgagcatccactaccccttcggaatcggagcaggctgcttccggcagcctgacttcaacctcatctgcgacaactccactcagcccccaaagctcctcttgcatgatggcaccaccgaagtcgtcggagatgaagattcactacgccggaccaggtcatctctgacgggcccaaaccctcacctttgacgggtttggtcttggtcagtgattagtggtcactgatgacaaaatcacctgtgacggatgaaacacccgtcacagataacccatctctgaccggtatataagtcatctctgatgggttaaaacttgtcacccgtcacagatgagtcatcagtgacgtgtcgtaactacctgaccgtcactgatgactcatctctgacgggttgtaacttacgacccgtcactgatgacaaagtaagaaatacaatttttgaattttaaacgcaacaaaaaaacctcaaaaaaatattttgaattttactagccatcctatacatggttacatatcactacctacaaattcacaatttttcacgcaatataacttgtagcgattcgaactcaagacctcaacctccatatagagctcccttaccaactcacctactcaacacatattgactactaacccaatgttattattttgtctatgcttatctgaatcatttaacatatatttaacaccctaaatgacttcaaatgaaaatattatcaactaaatagttatagatctcatcgtgttttataacttttacatagaaaatatcttcatccgatgttgtttgaagaattcaaaatttcatttttcaaaatatatctcactttataacatgtaaattttgtgaaatgaaaatattttcaattataatgttgtagatctgattgagttctatgactttgatacggggcatgtatccatccatgtcatttgaaaaaaaactcaaaattttgtttttaaaagtagatctgatcacttgtaatgcatgttcggggatgtaaacgatctctaatagaaatgttgttagttataaagttgtggatatcattgagagctacaacttttatataggacatgtttcaatccgaggttttttgcaaaatttaaaaatttgaatccgagttttgcttccaacccgtcactggtatccgctcacctgtgacgggccagaaatgaaagccgtcacaggtgcggcccatcacctctgacggcttctaatgtatcggcccatcacaggtgaggggataccagtgacgggttggaagcaaaactcgtcgctggtatacctctgacgggttttcctttcggcccgtcacaggtgaggggatacctgtgacggtccgcggccggatggctcaccggtgacgttatcccgtctgacccgtcagaggtaatggtcactagtgaccaaatcgtttgcccgtcacaggtatcccgtcagaggtgtgaggatctggcgtagtgattccagtattggcatggacgtaggattatcggagtggatcgatatcaacatttctgccactatccctatggtacctggcgttgctgagtacaattattcatggaaccttagttctttcagtatctttgatgcttctctgaatattactggttgcgagttcgacacatatataatcaacaacaagagctatagtcccactacagcaatctgcaaaagtagctgccccaacaaagagatcactgaaacggtagctcgacaaagctgtaatggtactggatgctgcacaatttatgttggaatagatgttgctaacttgcatctccgtttcgtccgccatggcagagaaggttttcttggagtgaactctagtcgaagctccttatggaatagaattaacatagttagcagttatgccagcgttatgtgggggataaacaatcgaccgacgtgcgctagcgtaaaggatcagaaccaaacggattatgcatgtgcgagcgccaacagtcaatgcgtggacagcatctcatctaccgatcttggctaccgctgtgaatgcaacagtggttatatcggcaatccttatgtacttgatggctgcacacgtgacgaaggtgatttatatatatatactccaccagtacgtctgcaataagtctgttttgccttccgatgattgttgcaaatttgatgctgatctattttctacgtacctctcctatttactctttatgtatttcaattgggaaagtgaattcatccctcgaggggatatccctcgttttgtgcatgtcacctaaatagttataaaaaaatatgaaaaaaattgacaacatagattaatatgaaatatatcactcgacaaacatgcaagtttaatttcaacttctacaagttgtaacaaaaataacaaatatagttgcgaatgtgcgataactattttcagtttaatttgttatttttgttgcaacttatagaagttgaatttggtcttgcatgtttgtggagtgatatattttatattaatctatgttgtcaatttttttcaaattttttgataactatttagatgacatgcaaataacgagggggtgtcccctcgagggatgaaaatccacatccatttcaattccaaagcattagtattgtatgataatttatctgaacgaacaaaactttgtgaggcttggcatttcattcaagtccactagctttctgttttacttgagtagttgcatcatattgtttatgctaactattaaaagtactaaatgtgtcaagcgctagtggtgaggtttatgaactttgttcgctgaaagcaggctatcacccagttcaacaaaaggcaaactgctcccgatggtgtgggaatatcagtgttccatttccttttggtctagaggaaggctgcactgcaagaaaattatttgaactcaattgcacaaatgtgacatcttctacgctccaatttaaccgcggtcatgttgtgacagacatagatctcgcagaaggggttgttggcatcaaacttattacctcatattacgtagagcaggtgtttaggatgtacatatcaggagaaccttacctatatgcaagtttcggagaagcagtgatctctgtgcattgggctgctgccaatctgacatgtcaagaggcccagaagaaccactctcgatatgcatgtgttagtgcaaacagcacatgtttaggtgtcaactctactgatggttatgttggatatcggtgcaaatgcatggatggttttcatggaaatccttatgatgctaatggttgtgaaggtatgctactctgctttgccatgttttttgtcatccccaagtgtttttcaaccactccctagagtatttggtctaaggtttctttacatattctagtagtgcattttttattaatggattgagttgcacaatgcggagtgagatgcataatcctagaaaatagtgaggctcctcaaacctcgcttgaatttatgttgtggtgggcaaaggttacccttttttttttgcaacaagcaacaaacttttttttctctaaaatttgcaatgtagacaatctaatgggtgcaaagtttctcataattgttattgggagcaagactaccaatgataataccgtttgaattttactattatgaccatcacctctatgtttgtaattttattcacgtttcaaacattgcatttcaatttgatgaagttccttattccagatgttgacgagtgcaagaaaacaccaggcatcttcaaaggcatatgccacaataacattgggagttaccaatgcatggagtgcctagacaaaacagagtatgatgtgacagctatgcagtgtgtttcaagaaaaaaacaaaatcttctgataggtatgttctcaattgttttccacttctcaaactacgtgaaaacaaaacactaattcggcgataaaatccctttaggtattgtaattggacttagtgttggattcaccattctactctttgtaatgagtgggatgcttcttcttcggagatggaaaagggacattcaaagacaattacgaagaaattactttcgaaaaaatcaaggtcttctattagaacaactaatatcatccgatgaaaatgcgagcgataagacaaaaattttctccttagaagagcttgaaaaggcgacaaataatttcgaccccacacgtatcctcggacgtggagggcatggcatggtatacaaaggaatcttatctgatcaacgtgtggttgccattaaaaagtcaaagataattaagcaagatgaaattgataattttatcaacgaggttgccatcctctctcaaataaatcatcgtaatatcgtaaggctctttggatgttgtcttgaaactgaggtcccactacttgtctatgacttcattccaaatggatcattatttggaactctccatgctgatgcaagtagtagttttcaattatcttgggatgactgcttaagaattgccactgaggcagcaggagcactctgttatcttcattcagcagcttcagtatcagtctttcatcgtgatgtgaagtcagctaacatacttttagatgcaaactgcatagccaaagtttcagattttggtgcttcgagattggttcccattaatgaaacccatgttgttacaaatgtataa</dnaseqindica> |
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