Os04g0291000

From RiceWiki
Revision as of 11:02, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os04g0291000| Description = Glucose/ribitol dehydrogenase family protein| Version = NM_001186917.1 GI:297722964 GeneID:9269666| Length = 6417 bp...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os04g0291000

Description

Glucose/ribitol dehydrogenase family protein

Version

NM_001186917.1 GI:297722964 GeneID:9269666

Length

6417 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os04g0291000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:12710092..12716508

Sequence Coding Region

12710092..12710200,12712007..12712182,12712794..12712862,12713192..12713310,12713440..12713518
,12713881..12713965,12714647..12714693,12716350..12716508

Expression

GEO Profiles:Os04g0291000

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008397:12710092..12716508 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008397:12710092..12716508 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgtggggcctgctgaggcggagcagctcctccgggttctcgtcgtcgtccaccgccgaggaggtcaccgccggcatcgacggctcgggcctcgtcgccctcatcaccggtgcctccagtgggattggggctgaaacatgccgagtcctggtgatgcggggtgtgtatgttgttatgggggttaggaatttatctgccggtgcacgcgtgagggatgagatattgaaacaagttccgtctgcaaagatggagattcttaatcttgaccttagctcgatgtcatccgggtttgttttgtgcccttcaagctttcagaggatgacattgagctgcattttgcaacgaatcacatcgatgaaagttacagctatagaaagtggcaaagaaggaagggttgtgatagttgcttctgtcagctacagtctctcttatccaggggggatttgttttgataagatcaatgatgaatctgggtataacagattccttgcttacggccagtccaagcttgccaacatattgcattctaatttattatctagccacttgaaggaacaagatgcaaaagtaatagtgaactctcttcatcctggagctgtcgccaccaacattttgcaccactggtgtcccctatatggtgctatccgtgctattggtaaatattttgttaaaggtgttgaacaaggtgcagccacagtgtgctatgtggcattgcatcctcaggttgctggagtcactggcaaatacttttctgactgcaatatcactgaactgaaatctcatgcgctcgacatggacctcgccaaaagattgtgggatttcagtctcagccaaatccgttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MWGLLRRSSSSGFSSSSTAEEVTAGIDGSGLVALITGASSGIGA ETCRVLVMRGVYVVMGVRNLSAGARVRDEILKQVPSAKMEILNLDLSSMSSGFVLCPS SFQRMTLSCILQRITSMKVTAIESGKEGRVVIVASVSYSLSYPGGICFDKINDESGYN RFLAYGQSKLANILHSNLLSSHLKEQDAKVIVNSLHPGAVATNILHHWCPLYGAIRAI GKYFVKGVEQGAATVCYVALHPQVAGVTGKYFSDCNITELKSHALDMDLAKRLWDFSL SQIR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..109#1916..2091#2703..2771#3101..3219#3349..3427#3790..3874#4556..4602#6259..6417#atgtggggcctgctgaggcggagcagctcctccgggttctcgtcgtcgtccaccgccgaggaggtcaccgccggcatcgacggctcgggcctcgtcgccctcatcaccggtaagcctcaactgtactctcatcccctgattcttggttgattgactcctctgaaacatggctttgctcgtagaatttctgtttttttggtttggtagctaagtaattcatcagcttgcaaagtggtccttaactaatcaatctattagtgtatttctccaagtgattcatctattagagcatgcaaagtggtccttaactaatcaatctattggagcatgctaactaattcatctattagtgaatatattgtgtattgctccaggtcgtccttaactaatcaatcgagccacttcctccgttccaaaataaatttatttctagcttgtgataattgctacttctattatcttacctgctcttgctctataaattaaagaaattccattcattcgatatttgttacctattgcgaggtgatcgtaccttaattaggttacttgtggtggaactagcccactcgggttcatgtcctaaacttgatatgcatgctcagatttacggctatctgttcttcagtggtaagcgacgtatccatcgataacgggattcccgtggtgacttcgtcaatctcaagatatgatgaccaagtctcccagagatgctcataaagatagtgtgtgagttttcaagggtaaatgtatgtgttgtaagcgccttcgtttataccgtgtttttttagaaaatatattatcttctgtttcaccaatatttattttctattaatcagagacacttggttttatttgctcttcatgcatgctgattttgggactgatacagtataaagaaatcttagccgttactttttatttcctttatctattaacaaatatattttcacatcctaatttaataaaatacataacaaaaggaaaacgttagtacccatagaatattttccaaaatttaaccatcagagaattttaatagtggttgcaaggaattctaatgcacagaatgaatgtgcaaaacaaatattatactttacaaaagagataaatgaatgacttaaaaatcgttgattccaaataggagacataaaattaaaatatgattcagattataaatactagaattttgatatccattcaaatggattttttttctagtcaatcttagcattaatattctagtgtcgaatttgaattatgcggatttgaaaattctcattcaagattttcacaattcgttttgaacttctaaaagtatctattttgaagatttaaagctatatatgtctttacataatcatcctaatttgaaaaaaaagcaaaaaaaatatttaaatcaaagtttcgttataaaccaaagctttgttgttcaaaatataatttgggcactgaaatttttctagagattgattatgaagatttaagagtatcgctttgcataatcatctgaattttgataaaaatcaaacaactattccggaactatatacaattaaaagtaatttattttaacttttgttataaaccgaaccttccatgttcaatttttccgctatggaaatttttattcaatttggaacatgatttttgtatttttatagtattagaaacctgaatgtcaaattagttaaggaaaatttggactacaataattgcctttggtagaatttaaatagtaaaaaaatatatgatattttaccatccatgatgtaaatgcaacattaatccctttggtcaatgggtgatggatgatgcacagtaatttaatgcgccataaaaaaaatcctaatcaaattgtattgcagacctgaattactgttggcatcattgctgatggatatgtttcttgcaggtgcctccagtgggattggggctgaaacatgccgagtcctggtgatgcggggtgtgtatgttgttatgggggttaggaatttatctgccggtgcacgcgtgagggatgagatattgaaacaagttccgtctgcaaagatggagattcttaatcttgaccttagctcgatgtcatccgtgaggagatttgcagagattttcaaagctttgaaccttcctttgaacattttgatgtaagcaaatctatgtttggatgtacttcctccgtttcataatataagtcattctaccattgcccacattcatatagatgttaatgaatctaaacatatatatgtgcctaaattcattaacaactatatgaatgtggataatgctagaaagttttatattatgaaacggagggaatagtactaaattggctacattggcatgttttggtagaaagaaacattgcgcattttacagaactataattgcaacaacataatctgcaatgtagggattttggtgccgaacaaactggattgagcaatcgatctggctattgagagtttgagatattgaataatattaaaatactctgtaagcaagattaattgtcaatattgatgtttagctaggttgagcattaggacagtataactggaaggtaaaagtgactttgaaacctccactaaaaaactctattccatctctactgaatatgttttatctttatctttttacatattgccctatctttgactaaacaattttattctgctctgtttaaagaaataatgcaggggtttgttttgtgcccttcaagctttcagaggatgacattgagctgcattttgcaacgaatcacatcggtatgatccacttttacagtccttaaactccaaactgaaacttttgatcgcaagaaggttttgctaaaacatgaaactaaatttatactgtagaatattagagtttcagtttatttcaatccatggacttgcatgtttaccaaaacagtacatactttacataatttcacttgtacctcatcatatttgcctatttggctggactactcatcttacacccatttttggttacttatgtggaaaacatctgcttttgttgtatgattgcattcttgagttaataatgccatgcagggcattttctactgactgatcttttaatcgagaagatgaaagttacagctatagaaagtggcaaagaaggaagggttgtgatagttgcttctgtcagctacagtctctcttatccaggggggatttgttttgataagatcaatgatgaatctgggtattactttgcgacacaacacattttgcctcttttttacatgttatttaccttctagataaaacatgagaaaacaaatttgtacaagaacatcacattcaactatatatttttattctctcttgctaggtataacagattccttgcttacggccagtccaagcttgccaacatattgcattctaatttattatctagccacttgaaggttctcacttttctctttattttcctttactttgggaacacctgttgattcacactaactctagttaatttttttttgttccacacatcgtttgcctgttctgtaatcttataaaaaaatggtagtactatgttaaactattctgttgttaacaaaatcatgcggctctttagctgaattaataatacgaagttatcataaaaataaacctcctagtggtaaaacaccaacagaggatggaagtcaattgccctgttatttgtgtttatggagctgttctaagtacatgatatcagtgatcgcattactatttctaaaagcttcacagatttccttgatgataaatatttctctgctgaaaggaacaagatgcaaaagtaatagtgaactctcttcatcctggagctgtcgccaccaacattttgcaccactggtgtcccctatatggtaagaatatatctcacgagtgcaagttattactggaaaaataaagcaagttcaatactcatgaatgattggtcgaatctcacctcgtagaatgtttagtttgatgtatcgtgcctaactagcaactaatctaggtcttatagcttcatgacattttccttctacatattggtttcaagggctggaattttactactcccaaactcttccattagattgctaacccctgaactattttttggctaatttggttcactttaatcctcaatagcatctcccttatttgtttttctttacgcaagtcttattgtaagttaaaattttttaagccatacatgacaccattaacaaagtttttaaaaaatatgacaatttgcttaaaatttaagacttcgatgtttaagtcaacttactgcttccaatctctgtaaacagcagtgattaaaaatttcagaaaaaaatggagaggtaggttatacttcatctatcaacactaccatttttttggcgcaaaatacgatttacatagagagaaaaaagagaaataccgtatggtgcactgtttctactagttcagggttaactgctccaatgaaatagtttgagagaatgaaatgcattttttttctactgcagatagaaagttatattcttcctcttccttcttttttattatttcaggtgctatccgtgctattggtaaatattttgttaaaggtgttgaacaagtaagttttagaacattctttgttcctttcacaagataaaagtaacagagttctgttttatgttatatgcattatatgtattttatatgcaatctaagtccatgtgtttacttgataggtaacacatatttttttgccaacatttttattgcactacataaatgattttacaaacgacaaaccaattaacatgatccgaaccctgcaatcgcagcaccacacttcctcttgttatcaatcctgtcgaaaacccgattgacctcgccgagaaggctaatccctgcatacgaatcgaagaacataagcaagaacaaggtagattgcaacttaatatgtagatgaatgattaagattttaaagttggggtttcacaaaccaaactagcggcgaaacttcaatggcagaaataatttaagcaaaatccaactctaaactatgacaactattgaacaaatatgactgaagatgtcctagggttagtcttagggcacacacccccttgggcttagcccacaacttatagaaggaatctctgtaaatatgattagagacgtcataaggggtgtgcgccctaggactatccctaggacgtctctaacctaagtcgggcctcttgacagcatcaacttcaaacggaatctctagggcgcatacccccttggcttggatccgtttgaagttgatgctgtcaggaggcccgaatctgaatctaaaacatgtagaatttcatctattcccttctatgaactaaaagtgacgtggtaacatggggataaactttgggaaggatattggttagtccccaattaacttcatagatcattcaatcactccgtatgtccgctcccctttccttcacccaagcaagttcctctacaaacgagcacatgcaagactcatagtataatagtgtttgttcaaatatatgacatgtaaatcttacatagaaagcatgtacctttgcttgataaatatttaaggtagccatgaccatatctaagctagtgatgtcctcatcacctaccaccacacccaccatcgccgagctcgctagcgcctgatccgccgtagccaagatccttgatgccggatccgccgctcctgtacgcggccaccgccattgattccgtcgtcacgatcacttgaagcttgacacacctccaccacccgaagcaaccattgtcatcatcgatccgcagcccgaagcaaccatcgccgctgctagaaaccagctgtgccttcgcccagtggtggatccatagtgtaagcattggtgtcagcggacaccaatgacttcttactaatctctttgctaatgcactctagaaacaagaattactctcttatatatatatattgacaccaccatatttcagtaatgatcccaatgactctattttctggatccgcccctgccttcgcctctcgtcgctgccactcggaggataggagtgggatgagggagaagggagagtagacaggacttagagaattgaggagactcagacaccactttttgtagagttggtgttatattaaacttatgaagtggcaaaatctccttgaaaaatttactaattcataacctttttctgttaattgctcaaaaccactcatactcatacattcaatgcttatccttgtttgtttttgcagggtgcagccacagtgtgctatgtggcattgcatcctcaggttgctggagtcactggcaaatacttttctgactgcaatatcactgaactgaaatctcatgcgctcgacatggacctcgccaaaagattgtgggatttcagtctcagccaaatccgttga</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os04g0291000, RefSeq:Os04g0291000