Os04g0353200

From RiceWiki
Revision as of 11:05, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os04g0353200| Description = Conserved hypothetical protein| Version = NM_001186960.1 GI:297723050 GeneID:9267440| Length = 8736 bp| Definition ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os04g0353200

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001186960.1 GI:297723050 GeneID:9267440

Length

8736 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os04g0353200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:16884735..16893470

Sequence Coding Region

16888099..16889010

Expression

GEO Profiles:Os04g0353200

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008397:16884735..16893470 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008397:16884735..16893470 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>aaacgtggtcttccacatgtccatattattttatggctaaaaaaaactggtgcattgactgctgatgaggttgataagttcatatcagcacaattacctgatccttctgtcgatccaattggttttgatgctgtatctgcatttatgattcatggtccttgtggtgagggacatccatcatgtgcttgcatggttaacggcgaatgctctaagaactatccaaaagaatattgtgagaagacaacaatcttacaaaatggacatgttagatatgctcgaccaaagaatagaatatctaccaaaaagaatggtgttgctgttgataatgcatttgttctcctgcataatgtggatttatgtgtgaagtaccaagcacacataaatgtagagagagttagccgtgatgggatggaaaaatatttattcaagtattttaccaaaggttttgattgttcaaaggttggtctccaacgtaaaagagcatccggtgaatcatctacctgtaccaaaggtgttaatgagatccaagattacctagagtgcagatgtatagctcccaatgatgcagcttggcgcttgctccagtttgaaattcaccacactaacccttctgttgagcgtcttcctgtccatctaccactcggaaacagtgtagtatacaatgaggatgacagcctagaacaagtattgcagaacccatggaatcaaattacaaagctcactgcctggtttgaagctaacaagacctatcctgaggctgtgtgctacacatatgcagagttcccagagcacttcacttggcatgctgatggaaagtattgggattatcgacgtggtactggtaacgtcggaagactagccaatgtaggccctaaccagggggattcctactatcttcgtatgttgctatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>KRGLPHVHIILWLKKTGALTADEVDKFISAQLPDPSVDPIGFDA VSAFMIHGPCGEGHPSCACMVNGECSKNYPKEYCEKTTILQNGHVRYARPKNRISTKK NGVAVDNAFVLLHNVDLCVKYQAHINVERVSRDGMEKYLFKYFTKGFDCSKVGLQRKR ASGESSTCTKGVNEIQDYLECRCIAPNDAAWRLLQFEIHHTNPSVERLPVHLPLGNSV VYNEDDSLEQVLQNPWNQITKLTAWFEANKTYPEAVCYTYAEFPEHFTWHADGKYWDY RRGTGNVGRLANVGPNQGDSYYLRMLL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>4461..5372#gattccccattctctccaccgcgtcgtcgcctccgacggcgccgccgttcccctttcatctcgacctcgggcaagtagctggcatcgctcgccgtcgtcgcttccaggcgaggccatcggcggccgccgtcgcttcttcctagagaccgccgccgtctccccacacccgcgcggcaccccgtcttgccctctccctctagggttttcttgggcgtcgaatcgctgtaagcccctcgataacttctctggttgttttgcttggagctccagctcagggagcacggctttgatttggggatcgtgcctctcctgcctctctggtgtggagctatcggtgtcgcgttgttttctcttaagctagggttagtgcttggtactgtaggtgggaaagcaatttcttttttggagggatgaactcctggcttcttctctagatggtagctttgattggctgtgccatggaattgcctgcaatgcttgatagttttggtatcccctgtgtacaaaaattatgcgtaataaaatagtttggaaatttattcactgaaccgttcgctgagttatttttggcctgctgccgtatttgataggtagatgcaatatttagcatgatctactggctttgtcctggttgtaatcactcacttaattgctttgcaagttctgttataggatggaatctgttgctttttgtgctttagttgattggtcttagtaaagcttatttccattcttaatagttgaagctatatattccattgtatgcatgggatggtgcagcttgcagttaataatgcccgatgcggtgttgtgtgattccagaaataccaaatgtctaagctttatctacacatgtagtgatattttttgtgttttatatacagaaaagcttcaattaaagatggcttatatgtaacaacatgagcagtttgccagcatcagatcggctttgcatcctttcttcttgagttccggcgtcacatcgtgtttgcattcttaaacatttcatctcgattatttgtttttcttcacccattatatttgctcatagtttatcgctttcctttcatttctttttcaccgaccagaacagatcgggcctcttttcactaaattggggaaaaatcaacagagtgttgttcttggcttcttgaaaatgctatcggctccacctagagtgcacacccgcttcttgaaaaatcaacagagtgttgcttacttactccatatatatagaccattgcgcatatttgcctttcctggcaatcttttcctgctctttctctctctctctactttggtcacggcaagctattgttaagaatgccttcagatactattaggttcaaccaggggagatactattgtctaatttatatataggccagtcatggtctataatttttatgtcaacctcctgtgttgttttgtatcaaatttgcttatcgatgatttatcgttaccatatatcattgcctattgttgcgttgattaatatgtacctcttgatggtagatcgtgcttgctcctattattaccatgggtgattcttttctcagcttatatgtatatgtttttgtattctcgtgtaatattctagctcttaaagtagctttgtatagagggttacatatgttgagttatcttctcattatttatatttccttttatcagttcgttggttctcattactacccagtttgttaccttacacagtgttataccccatgccaacatgcaatagattctttgttagttcccacttaatttcagctctaaaactttcagattatgtctatgcctgatggaaaatctctggtttgtgcacgccttaagcgtaagcgaccaatattagagattaatgatggtgagctacatgaatcgctatcaaacgatgccgatgacttccccacagccttcaatttcagatctaaccggcctgttcgacgccgtttgtgtactcaacttgctggtatatatggccaccatggtgcttaatcttttaaaacacctctgtgtgcttgctgctcattcttatatcttaataaaaatattacattcacaaataatgttctccatctgccttcacagtgcacccatgcaatgtagctaatgctattctcttacttatagagactaatgatggtgagttacatggatcaccatcaagccacgcgaatgacttccccacagccttcaatttcagatctaaccggcctgttcgacgccgttcgtatactcaacttacaggcatggccaccattgtgctcaatttttttttaaaaaattcttatattacattcacaaataatgtgctccatttgcctccacaatgcgtccatgcaatgtgcctaatgctattctcttacttattcctcagattttcctcgcccagattccgccatggctgctcaatcacgtaaaaaacgtaaagcatatatgtcagagcgttctagggtattgcgacaacggttggcacattcatcatcttccatatatgataaaggtgtctgtactgtgtctcaaatttacagttccttttcttttgcatattatgtgcctaatatcctaatattgccttccgcagatgcatcgtcttctcataccactatccctacaaatggtcattcccgtaagtccatcgctaacatatattttccctgtttgttctaagccatatgtattcgaacacattttgtttcttgcaattgagaaggcatacacgatacatactaatttgtgttgattctcgcagacgattcgtatgtgatgctcaatcatgatgttatctcgactgttcgatcatgactgctcatcaaactgctcgattgtaaatgttcaatctcgatgctggtctcgatgtatacactcttgcctcaatagatttgtacattttacactagaatgagaactcgagctcacatttccccctttttattgtcaggctctgttttctcaccattaaaccttggtccaccaagtcacacatgttgttattgtggcgcattattttggtatgaggagcgcatcgaccgacggcgtcacacaacaagaccgttatacaacaagtgctgcaaaggaggaagtgttatcttgccttcctacaagccacctccagagcctttgcatagtctgctaactgcggtggatagagctaaatcagctcatttctgtgagaatataaggtactacaactctatgtttgcttttacatcaatgggggtgaatgtgattgattctatcaatgatggtcgtggtccatatacattcaagagaagtggccagctctgccatcgtattgggtcgctcctaccaaaaagggataaacgaccagaatatgctcagctgtacatatttgacactcaaaatgagcttatgaatagattgcgtgttggcacctataaaaatagagccttccaacctaacgaagaaattgtagctgctctcatgcaaatgtttgatgcccataacccaattgtcaagttatttagggttgcccgtgataggctttctagggcaggtgcacccgatgaccactattttataagattgtttggatctcctgacaagcatggcgatatatttaatgctccagtagcatcagaggttgttggattagttgttggtgacttaggtacaagtgatattggacgtgacctgatggtagaagacaaggctggcaatctaaggaaagttaaagaagatcactgtaaatttatggcgatgcagtacccaattttatttccttatggagaagatgggtatcatcaaaacattgcatatagacagtgtcgaagatcagcagggattaaacggaagcgtgtcacagaggtagaatattatgcctataggcttcatgatagaggtgatgatttcaacaccctaacgcgttgcaaaagaggtacacaagcctatgttattgacgcatattgttgcatggaagaatctcagttgagtcactttaggactaaatcatttcaacagaaatatagaactgctcctctcaaagaaattcatgatacaatacatagaggcattatagaagggtctgaagcaggccaaagaattataaaaccttcttcctatgttggagggccacgctatctataccaaaactaccttgattgtgttgctctttgtcgaaagtatggttgtcctgatttatttatcactttcacatcgaaccctttatagacaaaaattacttaggctttggctctaattcctgggcaacattcatcgaacagcctgatattgttgatcgtgtgtttcatatgaagctgcatctcttcatcgatgatatcacaaagaatgaattttttggtccaattactgcaggtttgatacattactttaattctagacatactccttttatttacctttccatttattttaaatatgtttttcactttatttatttatgatgtttcgcagttgtatacattatcgaattttagaaacgtggtcttccacatgtccatattattttatggctaaaaaaaactggtgcattgactgctgatgaggttgataagttcatatcagcacaattacctgatccttctgtcgatccaattggttttgatgctgtatctgcatttatgattcatggtccttgtggtgagggacatccatcatgtgcttgcatggttaacggcgaatgctctaagaactatccaaaagaatattgtgagaagacaacaatcttacaaaatggacatgttagatatgctcgaccaaagaatagaatatctaccaaaaagaatggtgttgctgttgataatgcatttgttctcctgcataatgtggatttatgtgtgaagtaccaagcacacataaatgtagagagagttagccgtgatgggatggaaaaatatttattcaagtattttaccaaaggttttgattgttcaaaggttggtctccaacgtaaaagagcatccggtgaatcatctacctgtaccaaaggtgttaatgagatccaagattacctagagtgcagatgtatagctcccaatgatgcagcttggcgcttgctccagtttgaaattcaccacactaacccttctgttgagcgtcttcctgtccatctaccactcggaaacagtgtagtatacaatgaggatgacagcctagaacaagtattgcagaacccatggaatcaaattacaaagctcactgcctggtttgaagctaacaagacctatcctgaggctgtgtgctacacatatgcagagttcccagagcacttcacttggcatgctgatggaaagtattgggattatcgacgtggtactggtaacgtcggaagactagccaatgtaggccctaaccagggggattcctactatcttcgtatgttgctatagtgaaggtggcaaggtcgtactcagagatcagaacaattgaaggccaacagtatccaacattccaggctgcttgccaggctcctggtctcctaggtgatgatcgtgagtggttgtccgctatagttgatgcagcgcattgggctcttccataccagctccgtgagttgtttgtcacacttctcctcttttgcaatgttacagatccattggctttatttgaagaacatttttctagaatgggtgaggactacatgcatcgcattgggcatagtatgacataccattctacaccttttacacaacatgttagatcatttgttcttgctgaaattgacaagttgcttagaaattctggatatagcttaccacactttaacttgcctgagcccattcttaccagtgcatgtgcagttggcaatagacttttaacagatgaacaagcttatgatattgataggatatcagtagaagcagctgaacaactcaatcaattgaatctgaatcaaaaacatgtttatgatgttgtccttcaatcagtcaacaattgcattggtcacacattctttgtgcatggctatggtggtaccgggaagacatttctttggaatgctttgcttaatgctgttagagctcaaggaaaaattgctttggctgttgcatcatctagcattgctgcacttcttctgccaggtggtcgcacaccgcattcccgcttcaaaataccattagatatacaagaacattcactctatgctatcaaaaaaaaaaaactcatctagcccaattgatacaacaaacatctttagttatatgggatgaggcacctgtcaatcatagacattgttttgaagctctggatagaacactaagggatatcctatcctcaaatgatccatccctagctaagaagcaatttggaggcctcacagttgttttcggaggggattttaggcaaacacttccagtactgcctcatgcatagaaatatgagatcttaagtgcatctattacccgctcttatttgtggtcccactgcattattctgcatctaactgagaatatgaggcttcaatcaccgttgttgtctgatactcagcgagatcaccttaaagaattctcaaaatggcttcttcatattggagaaggaacattgcctgataactctcctactgatagacatgatacatgttacatcaaaattccaggatacttgcttttgccacctgaatcaagaaatatttcatcactggtatcttttgtgtacaatgaatcaagcatttcagatatggttgcttatttctgtgagcgagcaatccttgccccaactaatgacatagctgcagaaatcaactcccacatgatatctcagttgccaacagaacaaatgtcatattatagctcagacatcatagatgatagcacagctaatcgtgctacacttgaggccttttatccagtggagttcctcaacacaatataaatgagcggcttgccagatcattgcttgcaattaaaagtagggttcctataatgttgctccgcaatttgaacccatcaaagggcctttgcaatggaacaagactcatagtaactcagctaactcactgtataatagaaggagaaataatcataggaaaagctaaaggatgtaaggcatatataccaaggatagtaactacatctaccgacaaaaggtggccctttaagattaagcgtcgccaatttccagttcgagtttcatatgcaatgactataaataagagacaagggcagacacttagtagggttggagtttatctacctagcccggttttttcacacggtcagctctatgttgctttctcacgagtgacatccccagatggtttgcgtgttctgatagataacaaccctcctgaacatgcagaaagcactcaaaatgttgtctacaaagaaattttcgatggttttacatgtaagctgagctcataagtactatgtttatgtagtctaatattttttccccttatcaaaattgaataaacatattgttttctattttttgcaggcttctactaactgcaagcatttcccttttggtttcatgtacaactactgcccactgtttactgaatgactttcttcctcagttaatgatgcttttattggtgggccaatcttttcatgtttgagatgtctttccatcatcctgcatattatttttattcgttccctttgttgtactatagttacataatcatgtgaaagttaatattgtcatattttgcagattcactgcttattcagactccatgcagtccaacctatgaaatgtgcctgattttcctgttttgtgtacaacaatagaagtacacccttctttcctcttgacgttgggaaacaacagcgttttggctcaatcattcactttccttctctctaggtgagtattaggggtgcacatgaactaggtatataattattggtctttcttcaactgccatccatagaaaagttctattagttctctgttattttttatccagatatacctaaaatttgtatttatctctatggtgctgagaattgatatgtatgattttgcattcttagagaactaatcaattaacaacgtccgttcttttcaatgtccataaccacagttacaaaaaaaaacccgtctattttcactatatgtgatcgcactgtacaaggcctacatttgcctatatgttttcttctttcctgatcatccatggtattttttttcatgcaacattcattattatacatcaatttgtagatctccattctatctaattacccttcttcaatgttacttacaaatgtgctttccagtcggaataccttttccttccaatgtatatcatcgtagcaatgtatcagtatattccagtttagtcatataattaaacattactgctaatccatatgagtggttacccttgcccttatgtctatatccaacttaccttcatatcagacccagctaaattatttcttttctcttcacagggtgcatcttgaactactagaatatttaccgtgtgatgtgcctcattttgtgcgcgcacgtgtggatcataacatgatattgctatatatatgcatgactgatacgtctatgtgctttgcccgtgtatacttggcttcgatagtttctcagacctatgaatatgttctttaaatattgttataccattctacagtcaatctgttaatcagttcttatatgttattcgaaccccacctctacaatcgtatattagtaaatgtttgtcctcaattgttttaatgaaatatgtatatccatcttatatgacagtatggaataactgcaaaattatggaatagcctgagttcc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os04g0353200, RefSeq:Os04g0353200