Os04g0440100
| Gene Name |
Os04g0440100 |
|---|---|
| Description |
Nonsense-mediated decay UPF3 domain containing protein |
| Version |
NM_001059408.1 GI:115458545 GeneID:4335928 |
| Length |
7675 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0440100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:21919307..21926981 |
| Sequence Coding Region |
21920236..21920274,21920388..21920506,21920610..21920675,21921287..21921755,21921835..21921932 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
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| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6708..6746#6476..6594#6307..6372#5227..5695#5050..5147#4174..4258#3256..3360#3088..3167#2894..2992#2691..2786#1434..1540#313..473#acctcgctctctcctctcttcctcttcccccaatctccgacagttgccaaatttcccttcccacccccaaacccaaaccccagcgacgacggcgacgacgcgcagcagacgaaagcgagcgagaggcgagagaaatcccatcgtttcccaaaccctaaccccctcctcctcctcctccagatctcggcggccgcgcggctgatgcgaggtgagccccgtccgccctagggtttgcggcggggtgcgtggtggtggtggttgggccgggggggacggggccctcctgctcgcgggggtgggggttgggtggggatggcggcggcgcgcgcgcacgtgaaggacccggcgcaccggaccaaggtggtgctccggaggctgccgccggcgatcgcgcagcaggccgtcgtggaacaggtcgacgcgcgcttcggcggccggtacgactggtcgtgcttccgccccggcaatgccaggtaacgcgcgattcctctcgccttgctccctccgtgtgcgtcgtgcgggtgcgtgcgtgcgtgcgtgcgtgtggttggggggcgtcgggggcacgtttggtctgtagctagggattgggttcgaagctgtttattagcctgcgaattgtgtacggggaggtaccaccccatgaaatttcgttagtagatttcattggctggttttgattgagtagctgtggccagcaattagcattctataatcgtgcaatttacagatacaagtttggactgtttgcctctatctagtgcatttggttatgtctagcaacaaataggttgctgtgatcaagtagttactgagttttaagtttgcaatcctaactgattgtgggccatttacagttctttcgcgttgttgtgatctcgaagcatagtggattgtgtacttcaaattgtagctaggatattttggaggtgtattttagtttattcttattagatttaatattagctgtgaccaaattattgcttggagatagtgcccaccttcttagttttgttgcataattttagctgtaagtgaactaaatgtgcttttgattgcagctagtataagtgaggtcaatatgttttttttttataaaaaaaattaccttaccttgccattttggctgctggagtaagaggttttgttctgtttgttcatttttatgcttctgtaggattgccttaagacatgctagttatagagaaaatttcctataagaaaacatgcacactgcaaaactacttggcagcattgagccttttttagtttgtgctgagtgatgtgcaacgtactgtggccattcgtatgtagctagtgattcaattgttatgtctgcaattcttaactcattgccgtggaagctaaatgatagtggcattctccacttcatttttattctcatttttctgacaatgttattgcttgtccagccaaaagaatcacagatattctcgactctaccttaacttcaagggcccagaagatgtcgttgaatttgctgaggtcttcaatggtcatgtgtttgtgaatgaaaagggtaactttcacatttatgtaccaacgtttctttttgccatgcaaatttatattcaggattcagaacttatattctgattatgtcaatgttgtcactatcaaaactagatacacatgtagcaatataagcagtgtggatctttgtacaaactaatagtgcaacatagagaatcagaatgaaattgcaattattgagcatttacatagtctttgaattggagattgatcttgtcgaataggattttgggactaaacagtaggttttgcatatttttccctattcaacttattgatgtctagtattatttttccctttttgattagtgcgcagcaaagaaaatattcaactgtaactatataaattccaatattatggaaatagtttaaattgagaaggcccaacattgttgttaccatttttggtgttattagagatatagaggtctcactgtggctgttatagcgtcaattttctaggtacttgattttgctataagtttccttttatatgttgtccaattattccattcctaagcacagagtttcctttatatctaagcttgggggcaactgtggtgtattctggtcttttctcctttactagtacagttgaatatgcattcaagctacctaagtatttgccaacatacttgtctaatgttgtgtaatgctgtgacaataaagtactatgataatactatacttctgttaggttctccaaatatatcacagtagaaattgataacctaacttgcattttggaggctggagaccatcctacaaacaccaccttttgttactatttattggttactgatgtatgttattgctattctttcttatacacttcatagcattttaacattttcagatgcctattttcagcatgctggtataattgacattcatgttaagttattttcttatttttggtattcaagttaaaaaagaggttgacttttgatggttgcaagcaagcactgcttataatgtgatatattttaggtcggaacataagttaatacttttaatgtaatcaaggtgttgagttttccttcaacagtcgagcacatgcttgtaaatttaattttggactatgcttttttgttttaaattttattgtcatgcatgcggcctatggttcctgtcaggtgctcaatttaaagctcttgtggaatatgcaccatcgcaacaggtccncaagtcaaacacgaagaaagatgctcgtcaaggaactataatgaaaggtcctagacaatcatttaatctcattctccatcctgtaggtgacacaatttcatatttatcattacttcaaacttagctggcatcttttttgggatttaatatccagatccggaatacttggagtttcttgaatcgatttcaaagcctgctgagcatctgccaagtgctgaaattcagctcgaaaggaaagaagctgaaagggcaggtaaagtattgtttgtaatatcagattataattatgcctttcaaagatgccaagcataaaagaagggtctattatcaacttgatcactattgcagctgctggaaaggaaccacctgttgtgacgcctcttatggtctatgttcgccagcaaagggcagctaagagtatggctcaggtatacgtgttcattaaactgtagtattggtttatattatattttatcaacttgagggtcggctaactagtacttccacatgttacagagatctggaagtagtagactcagtagaaaagttgcgggtgttgttactagcagtcctagtccttctaaaaggggttctgagaagcgcaggacctctgcttcgacggtaaatttcttgcttgaaaaaaatagtacaattttaaatggccacaagaggtggggcttcattttttcatgcatatattttcatagtctggtcttggatttcatgaaatgaacatatcctatgtcatgttttcttcacgaaatactactattttaaatggtcacaagaggcgggacccatctattttatttcccgataggttctttttatttcttttaatatttattgccctttctcgccatggtgttcgccctaatttcagtttgtttgtactatcgacctatgtcatgttttctttgttcaaaacaaaatcctgtccccagtgtgcatttctgtttgtgctactgtttgtgtattgtatgctcttatatgttttatactccctctgtttcatcttataagtcgttttgacttttttcctagtcaaactttgttaagtttgaccaagtttatagaaaaatttaacatctaaaatatcaaattagattcattaaatctagcattgaatatattttgataatatgtttgttttgtgttaaaaatatcattatatttttctaaagaagtttgactaaggaaaaagttaaacaacttataatatgaaatgcagggagtatattttatttctgggctattgttgtgagttttcatctattctttttcaacctttgaacagtgcactgtgtctcagtttggttattttgggtttcatgctgcattgttataaaaagtacccagttcattccgcacaaaaactatgccatgaggttatgacaagctactgtttttgtctttttttcatgtgatcttcagcaatatgttctacgagagaatgctaaggagaagccaacttatatcttagtgccaaagagagacgagcatgcgcagagggaaaaaggtactgctggaacttcaggtggtactgattcaagaaatagataatcactataactttgttgtaaccattcatatcaacatgtccttttattttattgattattactaagtatctgttctctgctataacatatccatgcctatatatgctgataaaaggttgtatcaactaatgtatagtttgagctgagttaggtaatagggtgatgacactgattgattcaattctgtgagaactgaggcaagatcaagttgatcttattatgctgtgttgcatggtgaaatctagctatatgaaacctgtacaatttaagtaaataggttaaatcttagttgtttttatgactattccaaaacaaaaactaaaaccactgcaatgctaaaagcaccatcaacatagacaagtttagtttgggcttgtttacttatttggcataatagctattgtgttgagataggcctgtggacatttgtatggctacctgccatccaattatggcaatggcgtaccttgttgggtgacatctacttttgctacactacgtcaatgtcctatcctatagaaaatggatttcattttgaacttccatcattttgtc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