Os10g0105400
| Gene Name |
Os10g0105400 |
|---|---|
| Description |
Conserved hypothetical protein |
| Version |
NM_001070559.1 GI:115480861 GeneID:4347955 |
| Length |
9282 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0105400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:385775..395056 |
| Sequence Coding Region |
386008..388056,388166..388294,388931..389062,389167..389538,389753..389894 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:385775..395056 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:385775..395056 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgccgccgcccatgctcgcggatgcggcggcggcggcgccctgctcctcctcatcatgctcatccaactccagctcttcctcctcctcctccgcgatctggtcgcgccgccgcgacgagatcaccttcgaccgcctcgacaagttctggagtgccttgtcgcctcaagcacggcatgagctcctcaggatcgataagcagactctcattgagcatgcacgcaggaatttgtactgttcaaggtgcaatgggctgcttttagaaagtttcacacaaatggtcatgcatgggaagttactgcaacaaaaaggtccaggtgttgtacaagatgattcttggggaggcctttcgacaacaaaggatggcctcctgactcttcttgactgcttcataaatacaaattcccttcatgtactccagaatatatttgacaatgcacgggcgagggagcgtgaacgggaaatgctttatcctgatgcatgtggtggaggagaaagagggtggattagcccagtaatagctaattatggcagggggcatggaacacgagacacatgtgctttgcacactgcacgcctttcttgtgatgctctggtgggttactggtttgacctgtgtgaagaaactagatcatctcttctgcggatgagggaagaagatttcattgaaagacttatgcataggttcgacagcaaaagattttgcagagattgccgaaggaatgtcattcgtgaatttaaggaactgaaagaattaaagcgtctgcgacgggaacatcactgcactagctggttctgcattactgatacagctttccggtgtgaggtgtttgaggatgctgtcttagttgattgccgccaatctttcttggatcaagataagtcctataatcgttttgagtttgctgttggaacagaaaaagggaaatctgatatactaggatttgaagctgtggggatgaatgggcaagtgcacaggaagggccttgatcttgaccagtttgaagattattttgttactctgagagcgcattatgcggataacaagaacacagatttctatgtgaaggcccatgccttgaagggccaatcatgtgttcaccgcaggctgatcgtgggggatgggtttgtgacaattactaagggagaaagcattcaaagtttctttgagcatgctgaagaagctgaggaagaggatgaagatgatgctatggacagggatggaaatgatactgatgtcgatggtgttcatccacagaagcatgctaagagtcctgaacttgccagagagtttcttttggatgctgctgcagtgatattcaaagaacaggttgaaaaatctttgagggaagccacggcacaacaaaatgcacatagcgtatttgtgtcccttgcattaaaattgttggaagagcgggttcatgttgcctgcaaagaaataattacattggaaaaacagaccaagcttcttgaggaagaagagaaagaaaagcgtgaagaagaagagcgcagggagaggaggagaacaaaggagagagaaaagaagcttagaagaaaagaacgtttgaaagaaaaggaaaaggagaaagaaaagataccagttcaattgaaaccttacattggtacctcgtcatcacccctgagcaactcagcaacaccaattaatgatcagtcaccagatattgcccactccaaatactcagctagcgatgatgaagataaagatagtattgtggtcacggaatcgttctctcctgatacctgtgttgatcaatctctaacaagggaaagtgatggacaaagcaatgagtttcattgcagtacaacactggaatttattccatcagattgcaatggttctttcatgtgtgaacaatctacatcctcaaggaggaaactcagatttagaagggattcccttcaagaacagaccactggtttttggtatgaagattgccaagatgacactgggggtgttggaaatattcactggcaatctagggagagggcaaggaatgcaggtagaggctgcaactctttgttcagtgcgaataaccggacaagagaaaggtatgagtacaatgcctgcagttgtggccagcaggaagattatgggtatttttctccaacagctagatcaagtagagagatgaagatgtccaggaaaacaatggttgagaagccctggttacagtaccgcaggtgctatccattggatagcttcatagtgtcaaaaggaagccgagttggtagtacgccaaacaagaatgcagctccaaaacaagtatgggagccaatggatgctagaaagaaagctagcttagggagttcgaatggttcttctgaaacagttagcggtgttgatcgatccaatcaagtggggtgttcaaaggatattgtcaattgtagccaaatacttggctcggagcatgaagaactagctgaagcttgcaaatcgataacagatcagccatgtgaaagcagtgaaaataatcaagctgcttgcaatagtgaacctcctgtggtgaacaagccagacagctgctttaccaaagatggtggtcagacagcaaacatgaccagttcagatagctcttcatgtctaagcgagggagacagagatagtagcatgagcagcatgacctcattgagtgctcagaatccggaatcctcgtctacttctgattcagaaggatcttcagaaaggaacaatagcaacccaggcaatccaccaaccaagaacggttcgcgttcattacttgaaatgtgcgcaggaaatggtttcagagaataccagccacagaatattcacccttctgatggcaatcaatttgggtttggtgtgacccctttccaggagcagctgttacatcagcaaaagattcatgcagctccatacccgtcaaccttgatgggtttccataatcatcacatgtcagttccaacaaatggatacctagcataccctcaacctggtcatttctacccaaatgctgttggatatggtgtggctggaaaccaatgtgttgacttcccaatgcagtacagtaatgtgcatccttatgcaggtcctgaatttggttatgtgcctgcacagccagtccataagactccggtgaactttaatgccatggtgccaactgctgcgctctttagaaatggagcgccagaagtcataaaccctgtcattgtaaaaccagacaggcagcatcgccatacccttcctcctgagccgaagcgggtggatcctgatcctcagaacggctgttcagaagataacaagaagccgcaagatggctctgtgcctttctcgttgttccatttcaaccttcccatatcctcgcctgcccaggcatcatctgaagacgaggtgagtggaggatgtttggcgtcgagatcgccaactccaagtgctcaaaaagctcagccttgctcaagggaggagaccaacataaaggagtacaacctgttctctgcaaggactggagtggaatttcccttcttctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPPPMLADAAAAAPCSSSSCSSNSSSSSSSSAIWSRRRDEITFD RLDKFWSALSPQARHELLRIDKQTLIEHARRNLYCSRCNGLLLESFTQMVMHGKLLQQ KGPGVVQDDSWGGLSTTKDGLLTLLDCFINTNSLHVLQNIFDNARAREREREMLYPDA CGGGERGWISPVIANYGRGHGTRDTCALHTARLSCDALVGYWFDLCEETRSSLLRMRE EDFIERLMHRFDSKRFCRDCRRNVIREFKELKELKRLRREHHCTSWFCITDTAFRCEV FEDAVLVDCRQSFLDQDKSYNRFEFAVGTEKGKSDILGFEAVGMNGQVHRKGLDLDQF EDYFVTLRAHYADNKNTDFYVKAHALKGQSCVHRRLIVGDGFVTITKGESIQSFFEHA EEAEEEDEDDAMDRDGNDTDVDGVHPQKHAKSPELAREFLLDAAAVIFKEQVEKSLRE ATAQQNAHSVFVSLALKLLEERVHVACKEIITLEKQTKLLEEEEKEKREEEERRERRR TKEREKKLRRKERLKEKEKEKEKIPVQLKPYIGTSSSPLSNSATPINDQSPDIAHSKY SASDDEDKDSIVVTESFSPDTCVDQSLTRESDGQSNEFHCSTTLEFIPSDCNGSFMCE QSTSSRRKLRFRRDSLQEQTTGFWYEDCQDDTGGVGNIHWQSRERARNAGRGCNSLFS ANNRTRERYEYNACSCGQQEDYGYFSPTARSSREMKMSRKTMVEKPWLQYRRCYPLDS FIVSKGSRVGSTPNKNAAPKQVWEPMDARKKASLGSSNGSSETVSGVDRSNQVGCSKD IVNCSQILGSEHEELAEACKSITDQPCESSENNQAACNSEPPVVNKPDSCFTKDGGQT ANMTSSDSSSCLSEGDRDSSMSSMTSLSAQNPESSSTSDSEGSSERNNSNPGNPPTKN GSRSLLEMCAGNGFREYQPQNIHPSDGNQFGFGVTPFQEQLLHQQKIHAAPYPSTLMG FHNHHMSVPTNGYLAYPQPGHFYPNAVGYGVAGNQCVDFPMQYSNVHPYAGPEFGYVP AQPVHKTPVNFNAMVPTAALFRNGAPEVINPVIVKPDRQHRHTLPPEPKRVDPDPQNG CSEDNKKPQDGSVPFSLFHFNLPISSPAQASSEDEVSGGCLASRSPTPSAQKAQPCSR EETNIKEYNLFSARTGVEFPFF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7001..9049#6763..6891#5995..6126#5519..5890#5163..5304#2524..2783#2042..2320#118..261#acccttgttcattcctcctcgcctcgcctcgcatctcggctcgccgcgccgtcagatccctcgcctccgatggcgcaccgccgcctctgaccaaccaccgcccccaccgccgcccacatgccgccgcccatgctcgcggatgcggcggcggcggcgccctgctcctcctcatcatgctcatccaactccagctcttcctcctcctcctccgcgatctggtcgcgccgccgcgacgagatcaccttcgaccgcctcgacaaggtatctccccacgccccacgcccccaaggactcagctcgcctcgatcggatctgggggcttcgccgtctagctcacgcggatctgtctgactttttcactgtgcctctcgcgttgcctagctccacgcccgcatgtccgtaccaagcttggggtattggatttgattggtcgtcgatatgggatgatgcttacacggccacgcttcccggttgctgtatatcattcattagattgtggacttgctcgcagtcggcgtgagctccccatgggggctattaagtgcattcgccaggcgaaacggctgtatttcactgcctgccttaacgcggatatgcgaattatccgattgctttgtcctctttcaacgattggccgcacttactgccggtgcttctcagctagctgactgggccagttagagcaacctgaaactgtgatagggtaattattggccctttactaagggccagtcatggactgttaccagtggtggcctagccgttacgcttctcttccgtccatctcaccatcgactgtaccttactactgaaacctttgatttggggtttgggttacgatcgtaggtatgtgctccggatttccattttccttggttactctctgcactgctgaggcgccactgaaatgattcgattataacctactatgacttgaccttagtattttactaaccaaaagtcatgtagtgattcatgctatgtgctattctcttatatggagttctacccatacggcttgattcttatagtctgcatttggcaattcataatttattgcctagacctttaaatgtgatgcttatttttcctagaattatgagttacctattcaagagaaaatcattacttcgtataccttacaaagcggtcctccctgatatctcagtacatgcttatacttggtaatgtaaggagtaggtgctgtttagtccctttcacctcaaattagtatctgtgcttcttgctcttcgctcaaatattctctacccaggaatccaaaacatttgggtatcaacatatactccaatacatttttctttgttgcgtgaaaaatactaagtctctaactgctttggttggatctgatgaattagatcatttcaatcttttattggagtaacagttgctgtattgtgctatacaatgatagaccttggttctctctgtttagaatgatcatttttttttcctatcattctttcgaattggccttgttgtagattgagttgctataatgttaatggcaccaagagtagagaatgcatagcaccttctttgtttgtaatatattatcatctttatatttgtttattttggtttgggaacttaaggccatcatgactcctgacttaaatggcgtaaatgaacttgccttacacctcacattctatcattctatggaagaatgaggagtctctacccacaattccgaacttgtttctttatgctatagatgctgaacaatatgtaatttgcagacccaccaaacagtttgtcttttttgtagaaatgtcacactttgatggtctatgctggataatgttatacatgtattaagctgatagttgatgtttatattattcattgcactatatttttcctagtttatttgaaaatgtttactatcatctctcctgcaagaacaggttacttgtttaagctttcttgatttgttattggagtaatggaagatctaaaaaatcatattttactaacagaaccgatcatttttattgatgtgagttccattttttcccagttctggagtgccttgtcgcctcaagcacggcatgagctcctcaggatcgataagcagactctcattgagcatgcacgcaggaatttgtactgttcaaggtgcaatgggctgcttttagaaagtttcacacaaatggtcatgcatgggaagttactgcaacaaaaaggtccaggtgttgtacaagatgattcttggggaggcctttcgacaacaaaggatggcctcctgactcttcttgactgcttcataaatacaaattcccttcatgtactccagaatgtaagcctgaataacaccttatggttttatacttttctatttttctacttgttcttgttgggttagcaatttattgagaacactactgaagttttctctagaccatgcctgttcatttaaaagaatatttgcatgatgctgggttagggtgcactaatttaaccattctaattttctccgaattaatttgactcttttaatagatatttgacaatgcacgggcgagggagcgtgaacgggaaatgctttatcctgatgcatgtggtggaggagaaagagggtggattagcccagtaatagctaattatggcagggggcatggaacacgagacacatgtgctttgcacactgcacgcctttcttgtgatgctctggtgggttactggtttgacctgtgtgaagaaactagatcatctcttctgcggatgagggaagaagatttcattgaaagacttatgcataggtgagtgcaaccaagtacagtttgtttgatacaagattaaagatcatgaaattgatgcacagttaagcatgtgaacaaatctatctagctggagtaagagtataatagcccaaaaactttatttgctttccccagtaaggaatcaactactgtcaacacaagtatgctatcatcaattgggatgattttgtgtactaatgcctccatccataattgtgtgggtgcatggcgcatttttccaatggcgttgttcacaaatgcaggccatatctaacattccagcctccttgcatgcttccattgaatgttgtgcttagagctaatatattatggtaatttagtcctatccaaaacctcctttgtacatgtccaagacaaaatttccccctacatttgtgattgaagggaggttttttgttacatcgctttatctatttgctccttgatctgatgagggcgtcttttgagtttttaatgtttgggggagtactattagtcgtttttttattagttctcgttacttataaagcaataatgcatcattgcactaggaaaacgaaagctttatttacaaatggttagatttgtatggttcatgtaagtgctatggtaccttggtgtgcaattttgtgtactttggtagaagtcgatgtttctctgtgattcaaaaaggatatttgttttttttcctattcaaatagttactgcttaccagcagtttctaaatcggattatgaggataactacatactcgctccgttttttaatagatgacgccgttgactttttctcacatgtttgaccattcgtcttattcaaaaaatttacgtaattataatttattttgttatgagttgttatatcactcataatactttaagtgtgatttatatcttatacatttgcataaaatttttgaataagacgaatggtcaaacatgtgagaaaaagttaacggcgtcatctattaaaaaacggaggtagtagtatagttgcaataatatgttttttatatccggactttgtgggaaacttttggtctgctatgttccgagtgactgcatttcacttagggtatgcttggttcatggccaaggttggataggatatggccatccatattttcagggatatggtgatccaactttttgttttgttgcgtggatatggccatccagtttcttgtatgattagatggatgaggatggatggattgataacaataaactattaattaataagaaagtatattaattatcattaatcttagcatattctatactaattaacaacaaaatagattaattgtatatactctctcccttccaaaatataaggcacaaccatccttaacccaaagatcaagaaacaattattatcacctcctagtttggatcaccctaataaatataatacacccaatagaattagagatctcgaaggtggaggatttaaaaaataataatttagtggagaggagttactaattgcatgcatgcatgcatgcacgccttatattatgaaacatctaaaaaagtagttgtgtcttatattatggaatggagggagtaaagcactaaacctcaagaccaagaataatttaaatcgcatcaatcaagataccatgcacacattctcccacaatgcatgcatcgattaaaacaccatgccaattacaccctagcattcacacattctcccatgctgcattaattctatttcgatgaaatccatgtccatgcagttatatgatgatcaatttgagagattttgaatttcattatatgatgatcaatgtgggaatgagggagtaattaacaacaaaagttattaattattgctaataaattactactacctccgtcccagaaagactgcagttttgcattgtttatgtccaacgtttaaccgtccgtcttatttgaaaaacttttacgattactatttttattgttattagatgataaaacatgaataatactttatgtgtgactatttttttttattttttcataaacttatcaaataagacggacagtcaaacgttggacacagaaacccacaactgcacttaaaatgggacggaggtagtaatgaattgagattagcaaaggtgggccaaatgagctcatccagcatcttcgtggaatattccctctcctgaccaccccatccacccttgcccaccaaggcaccaaccaaacacactcaaaagttggatcgccaactcctatctaaggatatccctccaaccacccttagtatatgtgggatagttacgacttgtgattggaagaatgcttaatagacttttatgctcttcacaggctggtttggtgtgtaatatttagctaattctgtggatgaatatctggacaggttcgacagcaaaagattttgcagagattgccgaaggaatgtcattcgtgaatttaaggaactgaaagaattaaagcgtctgcgacgggaacatcactgcactagctggttctgcattactgatacagctttccggtgtgaggtaaggatggtgctcctttctatatgcactctcacaattgttctttctttgtttctgctttctcttcttcgaatacactcagctagcaaaaccttataagggtaaaactatggaaaataagactaaaaggagttgcattcccatttttaattgcacagtagatgacatggagtttgcctgtaggtggttaacatctggcattttatattttcaggtgtttgaggatgctgtcttagttgattgccgccaatctttcttggatcaagataagtcctataatcgttttgagtttgctgttggaacagaaaaagggaaatctgatatactaggatttgaagctgtggggatgaatgggcaagtgcacaggaagggccttgatcttgaccagtttgaagattattttgttactctgagagcgcattatgcggataacaagaacacagatttctatgtgaaggcccatgccttgaagggccaatcatgtgttcaccgcaggctgatcgtgggggatgggtttgtgacaattactaagggagaaagcattcaaagtttctttgagcatgctgaagaagctgaggaagaggatgtaagctcatttcttaagtaataagattaggatgatcagaacatttgttagtccatgttgatggtctgccaattcatatagtctaatttgttatacatgagcaggaagatgatgctatggacagggatggaaatgatactgatgtcgatggtgttcatccacagaagcatgctaagagtcctgaacttgccagagagtttcttttggatgctgctgcagtgatattcaaagaacaggtagtgtatatcatgcaatttctaagtcctaatcactaaaagatacatgttttttttgtgatattagctgtatatatagcaaacacttttctaaatttatgatctgcgtctgaagtatcattgttgttgtatacaatatcgatgtcttctgtgtaatatatatactaggatctttagcatatgactatcgcttcagtgtcattaagatgtttagcatttactgctaagttatgaaaatatgacatggtattctaaaagaactttttttaatataaaactacccttttcaaaggatgattttctttgtggtctagatgaactaatctttattcatactcatcacaatatatgtaatatatgtattgtattagaatagccaacatagttgattaaatcatgcgacatagtatgttcttaactagttcattgaactgtttatgacattagatgattgtactcactctccagtgtatagatagattgtactcgctcttcaatgtaccaaacattcatggtcaatgtaatcagcacacgtgtcaagctattgttgtttcctcttttctttttaagatagtcgtacttaagcctgcagcatcatctcgtgttgacataggaaacattgtttttcctgtgaaggttgaaaaatctttgagggaagccacggcacaacaaaatgcacatagcgtatttgtgtcccttgcattaaaattgttggaagagcgggttcatgttgcctgcaaagaaataattacattggaaaaacaggtgagctacacatactttgttgtgtagaagaagagagagggagcaacttttgttaggatttgttgtgccttagttgacatgtagtaaattcgattaacttgccttgtagaccaagcttcttgaggaagaagagaaagaaaagcgtgaagaagaagagcgcagggagaggaggagaacaaaggagagagaaaagaagcttagaagaaaagaacgtttgaaagaaaaggaaaaggagaaagaaaagataccagttcaattgaaaccttacattggtacctcgtcatcacccctgagcaactcagcaacaccaattaatgatcagtcaccagatattgcccactccaaatactcagctagcgatgatgaagataaagatagtattgtggtcacggaatcgttctctcctgatacctgtgttgatcaatctctaacaagggaaagtgatggacaaagcaatgagtttcattgcagtacaacactggaatttattccatcagattgcaatggttctttcatgtgtgaacaatctacatcctcaaggaggaaactcagatttagaagggattcccttcaagaacagaccactggtttttggtatgaagattgccaagatgacactgggggtgttggaaatattcactggcaatctagggagagggcaaggaatgcaggtagaggctgcaactctttgttcagtgcgaataaccggacaagagaaaggtatgagtacaatgcctgcagttgtggccagcaggaagattatgggtatttttctccaacagctagatcaagtagagagatgaagatgtccaggaaaacaatggttgagaagccctggttacagtaccgcaggtgctatccattggatagcttcatagtgtcaaaaggaagccgagttggtagtacgccaaacaagaatgcagctccaaaacaagtatgggagccaatggatgctagaaagaaagctagcttagggagttcgaatggttcttctgaaacagttagcggtgttgatcgatccaatcaagtggggtgttcaaaggatattgtcaattgtagccaaatacttggctcggagcatgaagaactagctgaagcttgcaaatcgataacagatcagccatgtgaaagcagtgaaaataatcaagctgcttgcaatagtgaacctcctgtggtgaacaagccagacagctgctttaccaaagatggtggtcagacagcaaacatgaccagttcagatagctcttcatgtctaagcgagggagacagagatagtagcatgagcagcatgacctcattgagtgctcagaatccggaatcctcgtctacttctgattcagaaggatcttcagaaaggaacaatagcaacccaggcaatccaccaaccaagaacggttcgcgttcattacttgaaatgtgcgcaggaaatggtttcagagaataccagccacagaatattcacccttctgatggcaatcaatttgggtttggtgtgacccctttccaggagcagctgttacatcagcaaaagattcatgcagctccatacccgtcaaccttgatgggtttccataatcatcacatgtcagttccaacaaatggatacctagcataccctcaacctggtcatttctacccaaatgctgttggatatggtgtggctggaaaccaatgtgttgacttcccaatgcagtacagtaatgtgcatccttatgcaggtcctgaatttggttatgtgcctgcacagccagtccataagactccggtgaactttaatgccatggtgccaactgctgcgctctttagaaatggagcgccagaagtcataaaccctgtcattgtaaaaccagacaggcagcatcgccatacccttcctcctgagccgaagcgggtggatcctgatcctcagaacggctgttcagaagataacaagaagccgcaagatggctctgtgcctttctcgttgttccatttcaaccttcccatatcctcgcctgcccaggcatcatctgaagacgaggtgagtggaggatgtttggcgtcgagatcgccaactccaagtgctcaaaaagctcagccttgctcaagggaggagaccaacataaaggagtacaacctgttctctgcaaggactggagtggaatttcccttcttctagacaacagacgcgcctattatttggcacagaacaatacatagcgagtgatttgtattctccaaaaaaacaaaaacaaaataagttacctcgaggtttttaccgtgttccctcgaatatttatttatttcttcttccatttgttttggttgcccttgtgtgtaaggaaattgcaaagatagtgagtggtatagtttctaaattttgagatatgttaaatgtttgttgtcccgttt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |