Os04g0459900
| Gene Name |
Os04g0459900 |
|---|---|
| Description |
Peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S family protein |
| Version |
NM_001187040.1 GI:297723210 GeneID:9268615 |
| Length |
5616 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0459900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:23353384..23358999 |
| Sequence Coding Region |
23353504..23353640,23354071..23354189,23354338..23354420,23354519..23354617,23354923..23354989 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcactgcctcgcctgcgccgctccggccgcgcgcgccccgggcagtcgcgtcggcggcggcggccgccggaggatggctatcgagtgcgccgcctcctcccccttcacccgcgacggcgaggaaacggccccgaggtcaatgatggaaacatatggtgaaatgtcaagtaaacctgtattgcttgcgtcaaggaggaagcttgttgcattatcatcgttttgcttttgcttacattcttcaaggtacttctcagcacttgctttgggtgatccatctgttaaaattgatgatgtcactccaaagatttttccatctggtccactgtttccaactgagaaacggatcgcagagctttttgaaacaaatacttactctgttgtcaacatttttgatgcaactctgcgccctcagctcaatgtaactggtgttgttgagattcccgaaggaaatggttctggcgtagtttgggatgattccggccatattgttacaaactaccatgtggttggcaatgccctttcaaaaaaaccaaagcctggcgaagttgttgcgcgtgtcaacattcttgctgctgatgggatacagaaaaattttgaaggcaaattggttggtgctgaccgttctaaagatcttgctgttctcaaggtggatgctcctacagatctgttgaagccaattaacgtgggacaatcttcagctctaagagttggtcaacagtgtttagcaattggaaatccatttggctttgaccatgctctaactgttggtgtcatcagtggtttaaatcgagacattttcagtcaagctggagtaacaattggaggtggaattcaaacagatgcagctattaaccctgggaacagtggtggtccattgctggattcgaaggggcatatgattggtattaatacagcaattttcacacagacaggaacatctgctggtgttggttttgccatcccgtcatcaactgttctgaaaatagctcctcagttaattcagtttggaaaagttcgccgtgctggcttgaatgtggagtttgctccagatccaatcgcatatcagcttaatgttcgcactggatctctaatattgcaggttcctgggggcagtgctgcagccaaagctggtcttgttcctaccagtaggggttttgctggtaacattgttcttggtgatgtcattgttgccgtggacggtaaacctatcaaaggcaaatctgatctatcgagggttctggatgattatggcgttggagacaaggtgagcttgacaatccaaagaggcgctgaaactctggaggtaaccttgcctttagaagaggcaagtatctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MHCLACAAPAARAPGSRVGGGGRRRMAIECAASSPFTRDGEETA PRSMMETYGEMSSKPVLLASRRKLVALSSFCFCLHSSRYFSALALGDPSVKIDDVTPK IFPSGPLFPTEKRIAELFETNTYSVVNIFDATLRPQLNVTGVVEIPEGNGSGVVWDDS GHIVTNYHVVGNALSKKPKPGEVVARVNILAADGIQKNFEGKLVGADRSKDLAVLKVD APTDLLKPINVGQSSALRVGQQCLAIGNPFGFDHALTVGVISGLNRDIFSQAGVTIGG GIQTDAAINPGNSGGPLLDSKGHMIGINTAIFTQTGTSAGVGFAIPSSTVLKIAPQLI QFGKVRRAGLNVEFAPDPIAYQLNVRTGSLILQVPGGSAAAKAGLVPTSRGFAGNIVL GDVIVAVDGKPIKGKSDLSRVLDDYGVGDKVSLTIQRGAETLEVTLPLEEASI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>121..257#688..806#955..1037#1136..1234#1540..1606#1740..1815#1946..2012#2799..3016#3620..3687#4239..4318#4858..4944#5020..5127#5249..5377#gtgaggtttcaaatcatctcgcttcacggtggtcgctcgcaagccacacacgcacgcacccccaccactcctcccattcgagaccccgcggggctctggattgcttgctcggaacctgggatgcactgcctcgcctgcgccgctccggccgcgcgcgccccgggcagtcgcgtcggcggcggcggccgccggaggatggctatcgagtgcgccgcctcctcccccttcacccgcgacggcgaggaaacggccccgaggtatgcccgccccttgcccctgcgccagaaattttgttctaaccgggtggttttcatcggtacaatctggtggttctggataactgtattgcgtagttagtgtaggatggcccaatttgggtacctttcgcttgctgaatctcggttgcttctagcgggagattattgattattccagttgtgttccgtttgatatctagtagagtagtagttgatgaatttttaggggaaaattcgatgtgcgagaacattcgtgttagttaactcaccatcaagcagcgtccacattttctcatgttctgttagtagtatttgtcttttgcacggcgctcactctgtgactatgtgcacctgcattaggtattcatagttggttgaccgttttcctattcactctatctgtttatgtttatctgaaattatattccaggtcaatgatggaaacatatggtgaaatgtcaagtaaacctgtattgcttgcgtcaaggaggaagcttgttgcattatcatcgttttgcttttgcttacattcttcaaggtacttctcaggttcggactaagtggcatgataatttaggtgttaatagaaattaactcgatccttgtcagttgtcacctacccaaatgattgcttttgtagtatttaatttactctataagtgttcatgctttgtaacttacaactccttaaatacagcacttgctttgggtgatccatctgttaaaattgatgatgtcactccaaagatttttccatctggtccactgtttccaactgaggtcagtacttagttgaacccactttatcctattttacttcttccaaaaatatatttacatttctttggatatttcttcttttatggcttgcatggcagaaacggatcgcagagctttttgaaacaaatacttactctgttgtcaacatttttgatgcaactctgcgccctcagctcaatgtaactggtgttgttgaggtaaaactaaaatgtgctttcgtgttataggttagagtagagtcaagagtatgtgttagttgttgctcaaattgacaaatgcatcactagtattctccatagaagcactaggataggacaagtctggcattctttctttctgaactggtgattcgatcaagctaaagttagacaaggaattgctgatttattgtcttgatgtcctgtatatctttcgcagatatcatgtgtagagtcttattgttacttttaatagaaattttagaagcccttgtttgaaagaaacttcttaatattcattatagattcccgaaggaaatggttctggcgtagtttgggatgattccggccatattgttacaaactaccatggtatggcagtcagtaaattaaaaacccatcatatgtgagagatctaaattccttcatacataattatggtgcttgaccctttcaccctgttgcacactcatcttattcattttaattgttggtgcaatgacagtggttggcaatgccctttcaaaaaaaccaaagcctggcgaagttgttgcgcgtgtcaacattcttgctgctgatgggtaaattctaataaaactgcattttacaggatagtttcatgatttaatgtatatacaattgcaatgttccttgtatatgcaagccaactaatcgttaatgctctggtgctctcctatatctacctgaaaggatacagaaaaattttgaaggcaaattggttggtgctgaccgttctaaagatcttgctgttctcaaggtgagaagtcttttgattagctatagagaattgtcatctatcatcactatgtttaccataggtttctctcatctcatttcggtgtgcaacattttatattagtcattcaattcatttcatctccctggtggcctggcatgtacatgcctcaaactctcattaatatccttctgtcgttagccaaggatttaactatctgctcatttttatctcacatggcatatgtcatggactaagaaaataaaaagggagtagaaagtggaagtaacagaaaaagaaaaaaatgatacttttggagttttagtttcataagtaaaaattcatctctttagccaactgcttcagtttttccctttttgttgttttgttttgttatggtataatagtttatttgtgacagtaacacaacattttcttctgttgagttaggggtcccatgctatttgattgaaatgttttttgaagagttaagttacgaaactgagggggggggggagggggggaggttcctttcagaggtcaagaatacatacttttgtttgccccgtcctttcttcttttacggaaatagtatatgtatgtttttagataccaagatgtttttatttacctactcatcttatgcctgccttgtcccaatggaatctagttcaaggacaaccaatggaagggctgtattagataattttacggtttgttagtgcgtaaagtcctgttgtgattttcacctgagctcaaatgttgtcagacatagtacctcatatatggattatggacatgcaataggtggatgctcctacagatctgttgaagccaattaacgtgggacaatcttcagctctaagagttggtcaacagtgtttagcaattggaaatccatttggctttgaccatgctctaactgttggtgtcatcagtggtttaaatcgagacattttcagtcaagctggagtaacaattggaggtggaattcaaacagatgcagctattaaccctgggaacaggtttgtagatatgtttctttaatgatttatcaactgattacccttttctggtctcagaacccaacctggaaactaccattagttgtactggtttacatctgtatattacttactgacaagcataaacacttttgtcactagttacttgatggctatactgtattactgtttatggtttctactatgcacaaaatgatagtacttgcctataacagtgcaaaacagttgactcaggacacagaagaggaagtattttacttcttactttcttgagtttctagcatcgcatctaaagtcaggacacatagattggggctaaattgcagctctggcagttggcatagtggtaatatttgttgctaccagtttactatattagggtagaatttgatcatatttgtggtcaaaatcagcttgaccatgtatgccctcgtccttgaagtgatttagtatgcattacctgtactctggggcaatgaacatctagggttaaggatcatgttgtaagtagtggtttatacaatatgtgttggatatttatgtttctgaaaatgtattatagagggttttactaagcatgtatactgatgtatgtccatgcagtggtggtccattgctggattcgaaggggcatatgattggtattaatacagcaattttcacacagacaggttagattatctcaacatgaaatgtattaatcaaatagcactgaattgtttcatgctgatttgcggaggtaacattagtagatgttcatgctttctctacagatgtcaagcactgcacttagcattcaaaagagaatatgtccaattagtaaaagttcatcctcaataaactaaaatgatcataacacattgcaaagcttgcctcgatccctgtacatcagttcatttcccagagtactctggttgatggcacactttgagtgactttctattttgatggcatgattagtgagtggtatcatctatcatgtttatattcggattcacagcattctttgaaattgttatttgcttgcatcctaatgggctgtaagaattgacataattgattatagttgactcaaaatcacctccttgaagctgtgcattagaccatttgtttttgttgttgatttggtagagcataaatcagatattcagatccaactatgtccaatgtaacttaaattcctatgttagtctgagattccattatttcttcaatgtcgcaggaacatctgctggtgttggttttgccatcccgtcatcaactgttctgaaaatagctcctcagttaattcagtttggaaaagtatgttgcatggatatctttcaataacatcatcatcaacctaataacatacgtattttctaatcatccccttagaataatgtgttatgtttatggagatgccatatgtaggtatatgtttcatgcattagatggcatcttatggattgtgattctttatcaataatcaataactgtggttgtcatgattttagaccaacatgctgtgaaacatgctcagagtcaactttaggtgttagcagtaggaggaaactttcggttgataagtttttgtaaatactatagggaccttttccaaagatagttaaattaattttggtctgagtttggcccaaaactttgccctcccctcctgaaaactctcttgaaactttgtgaacactattgcttgaatgtttttgttgcaaaaattttgagcacagataaattttagattgctattaagaaccttctttcttttccattgccgacacatgtgcttagcagttagcttctgtattctattttattttaaattatgcttacactcc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| External Link(s) |
