Os10g0112600
| Gene Name |
Os10g0112600 |
|---|---|
| Description |
Nonaspanin (TM9SF) family protein |
| Version |
NM_001070575.1 GI:115480893 GeneID:4347974 |
| Length |
3721 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0112600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:819138..822858 |
| Sequence Coding Region |
819474..819693,819936..820420,820540..820696,820787..820924,821127..821703 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:819138..822858 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:819138..822858 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcagcaatggcggcgccgaagctcctcctcggcctggtgatgttggtcgggtgcgccgcggcggacagccaccgctacaggccgggcgacgccgtgccgctctacgccaacaaggtcggccctttccacaaccccagtgagacgtaccggtactttgacttgcccttttgtgccccagagaaagtaaaggacaagattgaagcccttggtgaagtccttaatggggatcgtctggttgatgcgccctacaagcttgatttccgtgtagattttgatgccaagtctgtttgcagtagacggctctccaaggatgatgtggtcaagttccgacacgctgtttccaaggactactacttccagatgtactatgatgaccttcccttttggggatttattgggactaagccagaaaaggcagatgcaggggataagtattatctttacaggcacatcatctttgacatcctctacaataaggaccgtgtaattgagatcaatgtgcacactgaccagaacgcggtagtggacttgacagaagacaaggaacttgatgtcgaattcctttatacagccaagtggaaggagacacagataccgtttgagaagaggatggagaagtactcgagctcatctgtcatgccacatcacttggaagttcactggttctcaattgtaaactcttgtgtcacagttctcctcttgacaggattcctggcaacgatcctcatgcgtgtactgaagaatgattttgtcaagtattcacatgatgaggaggaacctgatgaccaggaagaaacaggatggaaatatatccatggggatgtctttcggttccccactaacaaatcgttattttctgctgctcttggtacaggcactcagctatttgctctcacaacatttatattcctacttgcactggtcggagtattctatccttacaaccggggtgcgctttttactgcactcgttgtcatttatgcactcacttcaggaattgctgggtacagtgcaacctctttctactgtcagttcgaaggaaaaaactgggtgaggaacttgctattgactggatgcctgttttgtggacctctctttctgacattctgtttcttgaacactgttgctattgcttacaattcaacggcagcattgccctttggtactatctgtgtcattgtgctcatatggacgctggtcacatttcctttgcttgttttgggaggcattgctgggaaaaacagcaaaaatgagttccaggctccttgccgcaccaccaaattcctgagagaggttccaccacttgcctggtaccggagaaccattccgcagatggcgatggccggttttcttcctttcagtgccatttacattgagctgtactacatctttgcaagcatctggggacacaggatctacacaatttacagcattctgtttatagtctttatcatcctccttattgtcacagccttcattactgttgctctgacctactttcagcttactgctgaagaccacgagtggtggtggaggtcattcctttgtggtggatcaactggatttttcgtcttcgcttactgcttatactactaccgtgaacggtctgacatgtctgggttcatgcagacatcattcttctttggttacatggcctgcatctgctacgccttcttcctcatgctgggcatggttggtttccgtgccgccttgctgttcgttcgccatatatacaaatccatcaaatgtgagtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAMAAPKLLLGLVMLVGCAAADSHRYRPGDAVPLYANKVGPFH NPSETYRYFDLPFCAPEKVKDKIEALGEVLNGDRLVDAPYKLDFRVDFDAKSVCSRRL SKDDVVKFRHAVSKDYYFQMYYDDLPFWGFIGTKPEKADAGDKYYLYRHIIFDILYNK DRVIEINVHTDQNAVVDLTEDKELDVEFLYTAKWKETQIPFEKRMEKYSSSSVMPHHL EVHWFSIVNSCVTVLLLTGFLATILMRVLKNDFVKYSHDEEEPDDQEETGWKYIHGDV FRFPTNKSLFSAALGTGTQLFALTTFIFLLALVGVFYPYNRGALFTALVVIYALTSGI AGYSATSFYCQFEGKNWVRNLLLTGCLFCGPLFLTFCFLNTVAIAYNSTAALPFGTIC VIVLIWTLVTFPLLVLGGIAGKNSKNEFQAPCRTTKFLREVPPLAWYRRTIPQMAMAG FLPFSAIYIELYYIFASIWGHRIYTIYSILFIVFIILLIVTAFITVALTYFQLTAEDH EWWWRSFLCGGSTGFFVFAYCLYYYRERSDMSGFMQTSFFFGYMACICYAFFLMLGMV GFRAALLFVRHIYKSIKCE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3166..3385#2439..2923#2163..2319#1935..2072#1156..1732#841..881#41..180#ctgctctgcctgactgcctccatcccccaccgcgattgagatggcagcaatggcggcgccgaagctcctcctcggcctggtgatgttggtcgggtgcgccgcggcggacagccaccgctacaggccgggcgacgccgtgccgctctacgccaacaaggtcggccctttccacaaccccaggtccgtccgtccctccgcctctcaatcttccttaattcggagtttctcaatctttcctgttccaatccccacaacgaatctatacgagtaccaatttaatttgtaggagcaagattagattccttctgaaatagtactgtacaagcgatattctgaaatactgcatcctattaacaaacctgcagaattgttgaaaacaagaaataatttggaataattcaggataaaagaatttaattatgcaagggatcatttgctttctttcagtagggtaataaactatgatatccattgctcccaggacagatactaccgaaatttaagacgcccacaatggctccctattttgtcttcttttttctttcctggatataataagtaatacctttaagtgcataccttgctgaataaccaaaaaattctcaacactgttcatgtgcagatgatataatggatctcattatctgacagctgctactagagactgcaaatatttctctagtagcgatgccgtcagttgcgctagatttgtcaaatgcttcaagtggatttatacataatttcttttctactagttgttgatgtatattgtagagtgaatcacagatgtacaaggttcagctttattttattctcacacattgattttgccccttgcagtgagacgtaccggtactttgacttgcccttttgtgccccaggttagattctccctaattaattaaggtgttgctagctgtaatctgccttatgtttacttagtgaactgtgtcatctcccaagtggaggccattgacttctttactataaacaagaaagattctttgcaattaagctgaattttgattcctaacaccttctagtacagaactagacttgtttttctgatgcttattcaattttacagaaagatgaagttctgacttaacctccattctcttttaatcaagttatctgtgttgtcatcaactacagagaaagtaaaggacaagattgaagcccttggtgaagtccttaatggggatcgtctggttgatgcgccctacaagcttgatttccgtgtagattttgatgccaagtctgtttgcagtagacggctctccaaggatgatgtggtcaagttccgacacgctgtttccaaggactactacttccagatgtactatgatgaccttcccttttggggatttattgggactaagccagaaaaggcagatgcaggggataagtattatctttacaggcacatcatctttgacatcctctacaataaggaccgtgtaattgagatcaatgtgcacactgaccagaacgcggtagtggacttgacagaagacaaggaacttgatgtcgaattcctttatacagccaagtggaaggagacacagataccgtttgagaagaggatggagaagtactcgagctcatctgtcatgccacatcacttggaagttcactggttctcaattgtaaactcttgtgtcacagttctcctcttgacaggattcctggcaacgatcctcatgcgtgtactgaagaatgattttgtcaagtaagttatcatttcctatcctttgtggtgattgattcgaagattgaaattttttctagtgacaatatagataggtttttatatattgggattctctagcttcattcataactaagaacaaaatatcctggacacttgtttatatagcttcattcgtagctttgatttctcaaggtttctattaatattattccctttgaaggtattcacatgatgaggaggaacctgatgaccaggaagaaacaggatggaaatatatccatggggatgtctttcggttccccactaacaaatcgttattttctgctgctcttggtacaggcactcagctatttgctctgtaagtccctattagttttacacactgaatttcctatagtgttagttttttaacggacttatctaacaattcatatgctggcctatgcagcacaacatttatattcctacttgcactggtcggagtattctatccttacaaccggggtgcgctttttactgcactcgttgtcatttatgcactcacttcaggaattgctgggtacagtgcaacctctttctactgtcagttcgaaggaaaaaactgggtatgttctattatctatattacagattagcattgcataaatgccttggaatcaggggtcgtattatcttgttattcctattttctgccaattaacatcttagtttcttctgtttgtaggtgaggaacttgctattgactggatgcctgttttgtggacctctctttctgacattctgtttcttgaacactgttgctattgcttacaattcaacggcagcattgccctttggtactatctgtgtcattgtgctcatatggacgctggtcacatttcctttgcttgttttgggaggcattgctgggaaaaacagcaaaaatgagttccaggctccttgccgcaccaccaaattcctgagagaggttccaccacttgcctggtaccggagaaccattccgcagatggcgatggccggttttcttcctttcagtgccatttacattgagctgtactacatctttgcaagcatctggggacacaggatctacacaatttacagcattctgtttatagtctttatcatcctccttattgtcacagccttcattactgttgctctgacctactttcagcttactgctgaagaccacgagtggtggtggaggtatgcattctttcaccttctactgttgtacttgctggattgcatatgatttccattctagcatcaaaacagagttgtcttcatttaaaaaaaaaacagagttgtcttcctcattagatatcacagtaattgtgtgttttctgccaattggttgtctctcaggagttcaagaagccattccctgctatgccttgcaagttctaatgcatcttatcctttcttttttttttcctctgatgcaggtcattcctttgtggtggatcaactggatttttcgtcttcgcttactgcttatactactaccgtgaacggtctgacatgtctgggttcatgcagacatcattcttctttggttacatggcctgcatctgctacgccttcttcctcatgctgggcatggttggtttccgtgccgccttgctgttcgttcgccatatatacaaatccatcaaatgtgagtagactatgcatagttggtgaaggccagagatgaaagaaaccagaggtagctgatgcaattgattagccattattcatagcaaaaggtagtgagcagtaaatctgttccattttgtacgactgatgtggtgaattttgcggctctttttttatgtgttatgtccttgtaatttgcatcattgttgaaggaatcgtgcttagcaattttacaccattccattcccttgatgttgagagacagtgctgatgaattttgtaagaattcagaggagcaacctcttgaatattatagcctgaaagcttgatccgaaacaaaccaatagaaactatgacatctgt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
