Os04g0489100
| Gene Name |
Os04g0489100 |
|---|---|
| Description |
Lipase, class 3 family protein |
| Version |
NM_001059690.1 GI:115459109 GeneID:4336232 |
| Length |
8991 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0489100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:24830035..24839025 |
| Sequence Coding Region |
24830688..24830769,24831575..24831997,24832148..24832366,24832487..24832584,24833032..24833162 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgggcgccggcgaccccgtggccgctgctgcggtggcggcggcgtcgtcgtcggctggcgcggccgccgcctccttccggctcgggatggtgcgggtggtctcgttcctcgtcgggggcctcaacgtggccgtgctgctgctcgggctctacctcatcgacggcgtgctcccaccggggtgcggcggggggctcgcgctcgccgcggcgcccgcgctggcggggatccgcgtgctcgccatgatcggcaccgcgcgcgcgcagcacgccacggcggatgccatcgcgaggcgccacctcgacgaggccgcagcgtcggtcgccgctgacgccgttgcgcgccacgagatcagggtgaggtataaacgctggttgtggtggactagattcggcatggcagtgggtgcaatgcaattggttggggcaatttatctcatgcttgtcattgtcagagatatttcaaatgaaagaagagccacttcctgtttctttggacaggatgaagctgatcatgtctcgaaacgagcattaattgctttgtttcttattctttcctgggttgtggtcgttgtccaatgcttcacgggttctgatatattaaggtggaggtcgttctatgcaacacatgacatggcatggaaagctcattacagggaagtgttcgatcatggaattcgagaagctttatgctgcctagggcgtgcaaagtatctaaccgtattggaagaggatgaggtttactctgtggcaagacttctgggtgatttggttgcatatcgtgcttctgggacaggacatttggaacttttagcagggcttgcactattacagaaaaatgaaaatttgcctcatttgcaaactgaccttacggaagcgccactgaaccttatgcaagaagctgctatccttcatccctttgctgaagcatgttacacgggacctctccttgatgttgggagaaaccctattttgtttccatgtgcatgggtttacagacaaggtgttttaactccatggtcgcgcagaaggcgccctgcacttgatggtgacaactggtggcgagggcatgctgccgctttccttcgatttgttcacataccagctgcagcacttctacggggccgtgtttgccagagcaagagggaagctgcttactttgtcgtggtcctccatgacaaaaagacagttgttattggagttcgtggaactgaaacaccagaagatctcataaccgatggattatgcagagaatgtgcatttactatggaggatttggatggactagtaaaatgtgaacagttacctgcaactacaagggagagagttatttctacctttccgcattatggacatggtggaattctagagtccgccagggagcttttcatgcaactcaacgactgcacaggagataattcgtcatccctaacagttggatttcttcctgcactggtgggggaaggcagtgaatgccatggatataaaattcgagttgttgggcattctttagggggttctgttgctacagttcttggaatgatgctttttggcaggtatccaaacgtgcatgtatatgcatacggaccactaccttgtgtggactttgtaatagctgaagcctgttcgcaatttgttacaaccattgtgtgcaatgatgagttttcttctcgcctttcaatcaactcaattctgaggctgcggtctgctgcaataagggctctttcagataactctccagctgatacagcaatgatacagaaacttgctcgcagaattttgaatgttaacaagtatcatgataatggtcctgatggtggcataatggaggactatagtgctaggcaccacacatttgaagggagggcagtatctactgaacgacggtttcctcaccaggatgcaccttgtacttctgagccagacctcccaattttgcaaaatggcatcaatgggtataatgggtctaattcatccatagatgttatgagctctcagggtctacatactgattgtgatgcccagacaatttcccttcatgggctcgattctggttcagaacagcgtcacacatcttatagggatataccagttgagcctcctgaaatgtttcttccaggcctagttgttcatatagagcggcaaagaagaagcctcttccctctttggaaatgctggagcttgcagggaagtgaaccaccatataaagctttttttgcaaaaagggagaacttcactgatcttgccgttactccttcgatgtttacggatcacctaccatggaggtgtcactatgcaatgcagagagttctggaagcgcaaacggcagcaagttgtcctgattcaccggtagaacgtttggtctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGAGDPVAAAAVAAASSSAGAAAASFRLGMVRVVSFLVGGLNV AVLLLGLYLIDGVLPPGCGGGLALAAAPALAGIRVLAMIGTARAQHATADAIARRHLD EAAASVAADAVARHEIRVRYKRWLWWTRFGMAVGAMQLVGAIYLMLVIVRDISNERRA TSCFFGQDEADHVSKRALIALFLILSWVVVVVQCFTGSDILRWRSFYATHDMAWKAHY REVFDHGIREALCCLGRAKYLTVLEEDEVYSVARLLGDLVAYRASGTGHLELLAGLAL LQKNENLPHLQTDLTEAPLNLMQEAAILHPFAEACYTGPLLDVGRNPILFPCAWVYRQ GVLTPWSRRRRPALDGDNWWRGHAAAFLRFVHIPAAALLRGRVCQSKREAAYFVVVLH DKKTVVIGVRGTETPEDLITDGLCRECAFTMEDLDGLVKCEQLPATTRERVISTFPHY GHGGILESARELFMQLNDCTGDNSSSLTVGFLPALVGEGSECHGYKIRVVGHSLGGSV ATVLGMMLFGRYPNVHVYAYGPLPCVDFVIAEACSQFVTTIVCNDEFSSRLSINSILR LRSAAIRALSDNSPADTAMIQKLARRILNVNKYHDNGPDGGIMEDYSARHHTFEGRAV STERRFPHQDAPCTSEPDLPILQNGINGYNGSNSSIDVMSSQGLHTDCDAQTISLHGL DSGSEQRHTSYRDIPVEPPEMFLPGLVVHIERQRRSLFPLWKCWSLQGSEPPYKAFFA KRENFTDLAVTPSMFTDHLPWRCHYAMQRVLEAQTAASCPDSPVERLV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8257..8338#7029..7451#6660..6878#6442..6539#5864..5994#5543..5664#4472..4626#3636..3741#3298..3389#3097..3218#2173..2273#1868..2087#1406..1544#133..489#gggcctcgtcccccgctcctcctcccccaccttcgtcgcctcctcttccccctcctcccccgccgccgccgcgccccctcctcgccgccgccgccgcctgcatcccgacggagggccgccgcggccgccgccatggcgggcgccggcgaccccgtggccgctgctgcggtggcggcggcgtcgtcgtcggctggcgcggccgccgcctccttccggctcgggatggtgcgggtggtctcgttcctcgtcgggggcctcaacgtggccgtgctgctgctcgggctctacctcatcgacggcgtgctcccaccggggtgcggcggggggctcgcgctcgccgcggcgcccgcgctggcggggatccgcgtgctcgccatgatcggcaccgcgcgcgcgcagcacgccacggcggatgccatcgcgaggcgccacctcgacgaggccgcagcgtcggtcgccgctgacgccgttgcgcgccacgagatcagggtgagaactcgagctccttgccggctagcttaggccactttagttgggtgatttgctcggcttaactctgacgtatcgtaaagtcgtgataaattgtgctttgatttcagttggttcaaccgttcaaggataaaccaacgcatttttttgtttgtttgtctaggtatggttacaatacgggattatttgagacacgatcaatctgaacaagtggacttgatttcaccatttatcagaattttgaggcgagttaatgcaaatgcgtgtaactgacgggagttgtcaatggtgctaagatacagcgtattaagcttagatgaactgcgaatacatcttattaagagcttttatctgatgcatatggctggaggacaatgtgcttatagccaaacactatgaagcgactcagtgttacactgtgaccgtgagcttgagcacctttttattagatcacagagacctgacatgagggtttagggttaagatttcgaattggaatctaatatcatatttgtggatttgaattgttttcctgccacttgttggcattctgcattgttcaaattgagttcattaactttgtaatcatatttaatctattgatataggtaatcataaactttttacaataaacaacacgcattaatatcattataaatctggagaatattgttgacgatatatcagtgaggatcatggattcatagttcttaactctctagcatagcattataaatctgtaatctggataccatcctttaagatgtatcagtgaggagggctcagaatattctttatgggtactgatgggatatttgaattctgccatagaagctagagtaggtgtaagaagagtagaatttctactgagcacttatttatcatactgctatttctgttttgttttgctcaacaggtgaggtataaacgctggttgtggtggactagattcggcatggcagtgggtgcaatgcaattggttggggcaatttatctcatgcttgtcattgtcagagatatttcaaatgaaagaagagccacttcctgtttctttggtatgtttgagtcagatgatcagatcctgtcatatatctgtagtgcatttcagctgtgaatggtgaacctttgttagatgaaatctttctgccaagtaaactttatacataaacattactggagccttctccccttagagtttccaaatgaaaaaaaaatatgggtaaaaagtgtcaataacttttgcctttacttaatatagtactaaattatgataggttttgatggcactagtattttatccactgcctacttgcttatgattttttgtcctgctccatcaattctgttcaataattggcctgccttgctcgcaatctaggacaggatgaagctgatcatgtctcgaaacgagcattaattgctttgtttcttattctttcctgggttgtggtcgttgtccaatgcttcacgggttctgatatattaaggtggaggtcgttctatgcaacacatgacatggcatggaaagctcattacagggaagtgttcgatcatggaattcgagaagctttatgctgcctagggcgtgcaaagtatctgtaggtcactacctattctttttatgctgagaaatatcactatttatttacctatatgagctagttgtcttacatactgatgcagaaccgtattggaagaggatgaggtttactctgtggcaagacttctgggtgatttggttgcatatcgtgcttctgggacaggacatttggaacttttagcaggtcagttttctgtttcattgctttcacattgaatatgttctgtgtcctatttggactttcaaaattaaatttgatgccaacacacatgatgacatgaatattctaaattttgtcacttaccttctaaagacgtgcacagctatgtaggtgtttaggttttcaataagcagtgagtaaattctactaggctcaattgtaccattcagaactccaacataaacttccgtttttgttaccacctacttgtagtcatatgtgtgcaatctgtccacctcctaaaaacatgacttatgtacaaaatctagagaggaatctatttagcacagaaaattggaggtgagtaaattgtaagacagtaatacagtgttcccgatgaaacccctctcattgcaaaaatctataatacatatattgtgaattcagatgtttaaatgaatatgtataagttacattcttcataggatatagatgggtttggtgcaatttacttgatagaccacggaaatttcaatattgcaaaaagagtacagagcttaaagtgctgctctgtttggagttaaattacatagcaccatgctttcatcttttctactttgagtagttgcctgctagcggttaggttaccatggatagttgactaaacaggaccagattctccgcatgggttgtattgccgtgtcactttatgacaaactattttatcagtataatgtagactgttatgagtgtacaagcatcacatatgatttttttatggaattccttgttattgtcactatattgagagcatactaaggatccatttttacggtgcatgttttagggcttgcactattacagaaaaatgaaaatttgcctcatttgcaaactgaccttacggaagcgccactgaaccttatgcaagaagctgctatccttcatccctttgctgaagcatgttacacggttggaaacactatctaactggaacaagtttaatacctcccttccttgtataattgcatttgacgtggtattatttcagggacctctccttgatgttgggagaaaccctattttgtttccatgtgcatgggtttacagacaaggtgttttaactccatggtcgcgcagaaggtatatctcctgaactctcttatacttctcagttgtgtgtttattgccaaatacccctatggttgatgatcctctttttggccagttcagctggagattttgttcggtaaaatgtgaagcaagctaaatttgatttttattttgcttaatcctccttgaactggaccaactgttacattgagataagtttgaacatcttatgctgttcttgccttatatgacatccacatattggtcttcatgcaggcgccctgcacttgatggtgacaactggtggcgagggcatgctgccgctttccttcgatttgttcacataccagctgcagcacttctacggggccgtgtttgccaggtaacacgagtttggataaaattggaatttataaactaaaattgcaatgatgaaaaatatatttcagccaattatgcaatcgttccaagtgacatttgtaacctgccacatgttaatgttactttagctcatagttgatatctactttatggatcccgcctgtacctaattatgtacatttcgacgttatttggtgaattggttaaagtaagccatcctttaggttgcagtaatgtacttcacataccttaagtagctgtgtcatgtgcggcacatgtatacatgccatgcttggtgacccaggcaaatgggcctgcataaatagaggttaagagataagcatccctatgttttagtcaatagaggcaaatcatgtattgaaggctctatcatgctttaccacctttgcagccctcctgctcattctcctccctagccatgttattaccagttcactatctatggctcctggctggtgaggcctttgcccaacgcacacattgccacatttacctcatacatgccctctgggaatgcaacgaactgagagcctgagagtaatgtggatgaccaaatatgtttgccgtactgtgctgattttgttgttacattagacatgcttacagttgaagggaggcattgaaacccagccatacttgataaagagcatagcacggttggtttttcagtaaaatcattgaacttgatttgattctttttatgtatgcagagcaagagggaagctgcttactttgtcgtggtcctccatgacaaaaagacagttgttattggagttcgtggaactgaaacaccagaagatctcataaccgatggattatgcagagaatgtgcatttactatggaggatttggatggactagtaaagtaattccctcttgatagccatctcgtctattcttatctaatctttctactcttgtggtcaaaattagtctttttttttcctcacggactacttgctgcaagccatttgctgatagttaaataccaatggtcaaccctgtggtgctctgattagcattcacatgattagaagaacatgaacaatcacaaaatgatttaacctgaaatt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| External Link(s) |
