Os04g0503500
| Gene Name |
Os04g0503500 |
|---|---|
| Description |
Leucine-rich repeat, cysteine-containing subtype containing protein |
| Version |
NM_001059775.1 GI:115459279 GeneID:4336323 |
| Length |
7597 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0503500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:25525296..25532892 |
| Sequence Coding Region |
25525614..25525798,25525880..25526026,25526388..25526459,25526817..25526960,25527101..25527172 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:25525296..25532892 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008397:25525296..25532892 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggaagtgcttgctctaggaagagaggccagctgcttgttgatgaggaagatctctacagtgcaaggttctccaagagcagcagcttcaagtggctactgcacaccttgccccgcagcggctctgatgtacacaggaaggtgcagggaccagtgcctgtgcggtgcccatcgctaatggagctctgtgtggccaaagtccgcgaggatattgggaagtattctgatttctcgctgctgcctagagatcttagtcagcaggtatttaatgaactggtggagtggaacattctcactgaagagttgcttggagcttttcgtgattgtgcattgcaggacatctgtttggcagactaccctggggtgagggatgcttggatggaagtagcggcttctcaagggcaatcattgttatctgttgatatctcttgctctgatgtgactgatggtggactgaatcaactcaaggattgcatcaacttgcaaagtttgtcatgcaattactgtgatcagatatcggagcatggacttaaaacattgtcaggcctctcaaatgtgacatccctgagctttaaaaaatgttctgctgttactgctgaaggagctaaagcctttgcaaacatggttaatttgggtagcttggaccttgagcgatgtccgaagattcatggtggacttgttcatttaaaaggcttgagaaaactggaaaagctaaatttgaggtattgtaatggcatcacagattctgatatgaaacatttatcagatcttacaaatttgagagagcttcaactttcttgctgcaaaataagtgatcttggtgtttcttatctaagaggtctatcgaagctagctcacctaaacctggagggctgtgcagtaactgctgcttgtttggaggttatttcaggattggcttcattggtattgttgaatcttagtagatgtggagtatatgacgaaggctgtgagcatttggaaggtcttgtcaagttgaaggttctcaatttagggttcaactatattacagatgcctgcttggttcatctaaaagaactgatcaatttggagtgtttgaacttggactcatgcaagattggtgacgaggggctagcacatttgaaaggacttctgaaactaagaagcttggaactttcagacacagaagttgggagcaatggacttcgtcatctctctggcctacggaatttgcagagcatcaatctctcttttacattggttacggacattggcttgaagaaaatttctggcctgaattcactcagatcccttaatcttgataatcgccaaatcacagataatggtttggcagctcttacatgtctcactgggttgacacaccttgatctatttggagctcgtataactgatgctgggacaaactgcttgaaatatttcaagaatctacagtcccttgaggtctgcggtgggttaattacagatgctggagtgaagaatatcaaagacctcaaagctctgacgctgcttaacctatctcaaaatggcaacctcactgacaaatccttagagctgatttcccgcctcactgccttggtctccctgaacgtgtcgaactctcgggtgtcgaattctgggctccaccatctgaagccactccagaacctgaggtccttgtctctggagtcctgcaaggtgaccgcgattgagatcaagaagctccagttggctgccctgcccaatctcgtcagtgtgcggcccgagtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGSACSRKRGQLLVDEEDLYSARFSKSSSFKWLLHTLPRSGSDV HRKVQGPVPVRCPSLMELCVAKVREDIGKYSDFSLLPRDLSQQVFNELVEWNILTEEL LGAFRDCALQDICLADYPGVRDAWMEVAASQGQSLLSVDISCSDVTDGGLNQLKDCIN LQSLSCNYCDQISEHGLKTLSGLSNVTSLSFKKCSAVTAEGAKAFANMVNLGSLDLER CPKIHGGLVHLKGLRKLEKLNLRYCNGITDSDMKHLSDLTNLRELQLSCCKISDLGVS YLRGLSKLAHLNLEGCAVTAACLEVISGLASLVLLNLSRCGVYDEGCEHLEGLVKLKV LNLGFNYITDACLVHLKELINLECLNLDSCKIGDEGLAHLKGLLKLRSLELSDTEVGS NGLRHLSGLRNLQSINLSFTLVTDIGLKKISGLNSLRSLNLDNRQITDNGLAALTCLT GLTHLDLFGARITDAGTNCLKYFKNLQSLEVCGGLITDAGVKNIKDLKALTLLNLSQN GNLTDKSLELISRLTALVSLNVSNSRVSNSGLHHLKPLQNLRSLSLESCKVTAIEIKK LQLAALPNLVSVRPE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7095..7279#6867..7013#6434..6505#5933..6076#5721..5792#5169..5240#4633..4704#4232..4303#2944..3015#2703..2774#2536..2610#2114..2260#1779..1986#1095..1223#815..1021#gagtccctctcctcccccctctctctttctcggcgaggattggctgtgtgattagaggtaatttaatcgcgatagattggtttaactctaatccgggagtttgcttggcctagggtttggtggatttgcgtccctgtgagaatttccatatccaatcgggtaattctccaccaccgtattctgtgtaattctgttgcgattttattgggtgggtgggttggttggttgtcgtgttgatctgcccaactcgtactctctcgatgcttatgtgttattctgggttggaattttgggcattttttttaattttacggtttcttctcccttgatggagtgatttgcagaacagggtgtggaacaatcgaaagtagggtacagtgactgaactattaggggtttgggggatttgataatacgtagatagggttgatgctttgattcgtaagacatggttcatttttcttgagctagtgtcatctgttagttttcctggattgcacttaggattggcagcaatccgtaattattgtaagagcctaggttgcgtgaaagatgaacacacccaccaaaaactgaggactcgtggggtttagtattgtttggcagtatctgtatataatctgataattttaagtcaatttacacgattgtttgatgtgcagaatggggccaaagagagcgaagtctatgccaagtcgtaatcgtgctgggaatggatgacaaagaatcacacagtcacgagctagaatgatatgcgctttttagtccatcaagaagaagtgattggtttgtgatcggtgctcgcatcgtcgccatgggaagtgcttgctctaggaagagaggccagctgcttgttgatgaggaagatctctacagtgcaaggttctccaagagcagcagcttcaagtggctactgcacaccttgccccgcagcggctctgatgtacacaggaaggtgcagggaccagtgcctgtgcggtgcccatcgctaatggagctctgtgtggccaaagtccgcgaggtagtgcttgtggccttggatgattgagttttctgtgtgtattgttgcctgacttgatgaggggtgatttcaggatattgggaagtattctgatttctcgctgctgcctagagatcttagtcagcaggtatttaatgaactggtggagtggaacattctcactgaagagttgcttggagcttttcgtgattgtgcattgcaggtgaagtgcttgatcttgtttggcacgtaattatgactgagctctaaacacgttcgcgaaaaaaatgactcaattctaaacaaggaaaatcaatatggaattattgcaaactctatggaatgcaatcctgacattcccttgtagcagtttctaactttcaatgtagtatcagggaacgaataaaggcatcttgttggaacaattcttactatgttgtaaacgattttatagcttatttttataagctaactcaggaaagtaaactaaaatgtgttggtaaaatttatcctgtaagcaattgaggaaaatccactcaaggaagcctccactgggtactgatactaatagaccagttgagctcacgtgcacagctgctatcttattctgtgtaactcagatgatgcttctatcttcctgctacaagcaagccaagcaatcgctttacttgtgtgccacataaagaaaggaccaaatttggagtatttcttgtttctgggataagttactctgagactagatattgacctcctatgctattcttctacttggtctcaggacatctgtttggcagactaccctggggtgagggatgcttggatggaagtagcggcttctcaagggcaatcattgttatctgttgatatctcttgctctgatgtgactgatggtggactgaatcaactcaaggattgcatcaacttgcaaagtttgtcatgcaattactgtgatcagatatcggagcatggacttaaaacattgtcaggttagtgattttctgatagcctgagagttgagttttcttccatctctatgataagagtggtgtcaatgttcctgatcactagatattctgttcctgtcatttatggtattgctttttaattctgcaggcctctcaaatgtgacatccctgagctttaaaaaatgttctgctgttactgctgaaggagctaaagcctttgcaaacatggttaatttgggtagcttggaccttgagcgatgtccgaagattcatggtggacttgttcatttaaaaggtttcctgctatttcattaatatatcatcacaatgtaaccacagccaacttatttattataaatgcatgatctaattttatcatttaccatgtgttccccgcaccctacaccccaatgaaacagagatatatttatcatccagagcttttatatatctttctttgtaataaatacagggaagactggcatgctacctatttgttcaaacgctactcaatcgtgaatacattttaattatacttctgtcagatccaataataactttctttttcaggcttgagaaaactggaaaagctaaatttgaggtattgtaatggcatcacagattctgatatgaaacatttatcaggtaacacctttatgttgaccatctagtgtcaagcagtgtatgttatcacacatactgatctgcacgtctaataaatacccttttccttgtagatcttacaaatttgagagagcttcaactttcttgctgcaaaataagtgatcttggtgtttcttatctaagaggtatcccagaaataaatttcttccttttccagtggaaccttatctacctaaagctacatccatttgtatctgtaatattctgattaattcgttgtttctattaatataatgacatgaagtttcatctaaagttagcctctgtttcatattttgtatttgttctttacaggtctatcgaagctagctcacctaaacctggagggctgtgcagtaactgctgcttgtttggaggttatttcaggttttgcatcttttccatacgagtgctatgttatcagttcacgcttccatgaaaatgtcttacatttattctagggaagtccttggggtaatttaatttgactgttgaaagggtgccacatctgccagaactcatgtagaataatccattaaattcattaccaaaaatggatatttagggacctgaagaagtgcatgtcatgaaatttcacacatttcttttggttctcattctatatatagtcaactacctcatggatttatccccagagaaatctcttctggtggatttgacatgaaagttttagaaattccctttgcaagttgaatgagaatgacaaagtggctaggtaacttgagagtgtcttgcttctactccctccgtttcacaatgtaagtcattttagcatttcccatattcatattaatgttaatgaatctagacatatatatttatctagattcattaacatcaacatgaatgtgggaaatgctagaatgacttacattgtgaaacggaggaagtactataggactattatgctgcttcttgtaaatgagagatttttttattacttttggtgcttatagatggtaatggaatttcattttattattttcaaaggaaattcattgttgacttgaggcacattttcttcttcttttttcagtcctatatttctctgtgaagcgtaagcttaccatattactgttgcgcagctagcgattagaatgctggtttatagaactctttagttgcctaagatatttctctgtactcagcgtacagtatgtttgacaactctggtgtactgctctttgatgtaatctatttcatgattacatgaacacttaacaagctccctgtttggtgagatcatattttcattaatagaaacaataaggtgttcaacaacgagaggaaatcgggcgggggggggggggggggggtaataagcgcggccatggaggaagaagcagcggtctggcgtgtggctggcctgcccatctgagccaccgctcactaaacggttgccaaacttgttgcgagatatagccccacgccttttgtgttttctttctttctcatttgcttgttttcctttcagcggaagattgtaaagttttaaaaactccctttctcttaatacaaaagatgcacaaggcttttgtgcgtattctcaaaaaagttttcattaatagtgatgttattacaggattggcttcattggtattgttgaatcttagtagatgtggagtatatgacgaaggctgtgagcatttggaaggtaatattataacctctggtcgttgactttttggcgaacacaattctctattatttgcagagcgcattgttttttgtctacaaataggaaattatgccctttgtatgcagatgacaaactaagtagttataaattggttaattctcagtgtacgtctagtcagttcacctaccattttttttcaacaatagttaagatgttttgtgatctacaaataggaacatatgccactttatgtctcgttgtgtaagctgtccatattaagttctgtttcttcatcatacatggttgcacttcttcttagcgttgtcggtggtcttgccttgcaggtcttgtcaagttgaaggttctcaatttagggttcaactatattacagatgcctgcttggttcatctaaaaggtaaatagactcttcattatttatcttcatatgatatttgacatcaatgtagaataatgtttaaaaattagcattctagcatccaaatttgaagcgctgtgatctaagtgacaagtgagtcctgaaatttggtaaagcactgctgtgaaaatccatagaatttgatcactattactcaagaaataacacttatattttcttaatataccagtattctcttgtttctgtcattaaaattgccgatgatatgagactagatgcataccagaatacgcttttgtttcacttttgccatgttgtttttgttcaatatatatgtttacgccgcaccaagtggaaggtgtacccacttgattgtattgatttttctggaaacatgtcagaagtctgacatcattatatactatatatgctaattaacacatgaagtggggagctttcctgatgttcttctgttcttgtagaactgatcaatttggagtgtttgaacttggactcatgcaagattggtgacgaggggctagcacatttgaaaggtgagtttcttagttgtcatgtcttttctttgtttttcctgttatcttgtctatacttatacgaaagatggtagtgtgggacccaccaacagtgaaataagactttgcctatttctacagctagcttatcaggcacaaagctagaaagtgacaacataagttgcatgatgacaatatattagacaataggaataactttttatgggctttaaaatactggcattttgctagtatttcataaaacactgaaggcggagaatcacacaataagcctcatgcagtaagtcgtagtttacttttgtttaatggcatatagtattagtgctttgtaccagactagtccgcaattgtcagtttagcattgactaagtatactttgttccttatggaattcttaattggtttaattgtttgtattactggttacattctttttttttggggtctcaaatcattggtgtacatctctctgtgctgtaggacttctgaaactaagaagcttggaactttcagacacagaagttgggagcaatggacttcgtcatctctctggtttgtttaatcttctgcacaaatgctagtgccattgactttattttttttaaaaaaaatatatgatgtttgaatagttcaagcggtttcagtttttagttattactcacaacagttcttcaactaatatatctcctcaggcctacggaatttgcagagcatcaatctctcttttacattggttacggacattggcttgaagaaaatttctggcctgaattcactcagatcccttaatcttgataatcgccaaatcacagataatggtttggcagctcttacatgtatgtcctcatttttggtaaaattacattgtttaatactggcgtgcatgattgggtttcctgttatgcattagacatggtatcttacccattttagcaatttaattggatatggcatgattgggtgctacgttattttttggggcatgtagagtgttggtcttttttatgtctgtttaggatggtgttcctttcctctcaaggtttgatgtttcgctttaatcaaatggtgattgttgtgcattgtagtaggagtaagaatttggctacaaggttatcgtctgaattctccagttctgtatcgttgtgtagtcctttggttgtattttgccttgaagtgacatttgtttaatgcaggtctcactgggttgacacaccttgatctatttggagctcgtataactgatgctgggacaaactgcttgaaatgtaagtgtgcacataaaaagttggtccatgctaaggttctgtttactagtctggtgattttggattatcggaacaagctagtttactataagagttaagataatggcacgttgggcctttttgcacttgtgtagcaccgagcttatcattgtgcacacataaagcaaatcctattaacctagcattctgtggaactttttttttctcaacccctgctattattagcattgaatatgacagcatcttggtgcatattttactgggaaattattattcccttggaaatttgggggattctcgttatttttatgcatcaaaatatcacgtagcacttaaatctgtttgctaatgcattcttcagatttcaagaatctacagtcccttgaggtctgcggtgggttaattacagatgctggagtgaagaatatcaaagacctcaaagctctgacgctgcttaacctatctcaaaatggcaacctcactgacaaatccttagagctgatttcccgtatgtcttttgcgctcgtcaggaatgaaagcattcaacacacaatttatctatttatttgcatatcttccatgtgtacaggcctcactgccttggtctccctgaacgtgtcgaactctcgggtgtcgaattctgggctccaccatctgaagccactccagaacctgaggtccttgtctctggagtcctgcaaggtgaccgcgattgagatcaagaagctccagttggctgccctgcccaatctcgtcagtgtgcggcccgagtaatctggtagctgcacatgtgtccacatgtaaatatccacctgcttagagcaggacaaatgtacatattcccacaagaacaagctcgagtgatctgtacgtcagtcctgcttgtatcggtgtgtctggtcgccctggtgctgaagggtctgatggatggcctagtggtgaagggctggcacgtatttaggccgtgtaaatatgtagcggtgctgatgggaaggaacaactgtaaatatggcgtgcttcctctgcattttcgatgttatgtaatgtttcgtgttatcgtgttaatgaactggtattgttgcttgacctttt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |