Os04g0529600

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Gene Name

Os04g0529600

Description

Lanthionine synthetase C-like family protein

Version

NM_001187095.1 GI:297723320 GeneID:9267565

Length

4121 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os04g0529600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:26897506..26901626

Sequence Coding Region

26897506..26897694,26897782..26897981,26898085..26898196,26900633..26900749,26900868..26901179
,26901288..26901626

Expression

GEO Profiles:Os04g0529600

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggctgatcgcttcttccccaacaatatgccgggctatgccgacgaaggcgcgccgccgccaccggcggcagcggcggcggcggcgatcccctccacctactcctcctctctccaccacctcctctccctcccctaccccgacctcgccgatcgcttcctccacgcggcgcttcacctgaagcagaaggtggtgcacgagacgtgggataagaggcggcgcgccgccgcggcagcgggggaggcagtgggcgacttcaccctctacaccggcgcgctcggcacggcgctcctgctcttcagggcctacctggtcaccggcgaccgcgcggacctcgccacgtgcgcggagatcgtggccgcctgcgacgccgcatccatgggggccgagatcgccacgttcatctgtgggcgagctggagtctgcgccctcggtgcggtggtggccaaacacgccggagatgaagctggcgttgctcattacctgagcgcgtttaaggagatcaaaattcatagtaaatcacctgatgagcttctatatggaagagctggatacctatgggcatgcaccttcctaaacaagcaccttggagataatactataccgccaaccactacagacactgtcatgagagatattatcagagatggtagaacactgtccacgataggctgcccattgatgtatgaatggtatggtgagaagtattggggtgctgctcatggactttctgggatcatgcatgttttgctggacatggacttgactaaagatgacacggaatgcgtaaagggaaccttgcgctacatgattcagaaccggttccctagtggtaattaccctgttactgaggaggataagcatgatcgatttgtgcactggtgccatggggctcctggcatttccctcaccttagcaaaggcttcacaggtgttcccagaagaacgattccttgaggcaattgcagaggcggcagaggttgtttggaatagagggctgctcaaaagagttggaatatgccatggagtaagtgggaacgcctatacatttctagcacttttccgcctaacgaaaaagaaggaacacctctaccgtgctaaagctttcgcttgctttctccttgaccgagctaaacaactgattgcggatggcatcatgcacagtggtgatgagccgtattccttgtttgaaggacaagttggaatggcttacctgtttctggacatgattaacccccttgattctaggtttccaggttatgaactttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MADRFFPNNMPGYADEGAPPPPAAAAAAAIPSTYSSSLHHLLSL PYPDLADRFLHAALHLKQKVVHETWDKRRRAAAAAGEAVGDFTLYTGALGTALLLFRA YLVTGDRADLATCAEIVAACDAASMGAEIATFICGRAGVCALGAVVAKHAGDEAGVAH YLSAFKEIKIHSKSPDELLYGRAGYLWACTFLNKHLGDNTIPPTTTDTVMRDIIRDGR TLSTIGCPLMYEWYGEKYWGAAHGLSGIMHVLLDMDLTKDDTECVKGTLRYMIQNRFP SGNYPVTEEDKHDRFVHWCHGAPGISLTLAKASQVFPEERFLEAIAEAAEVVWNRGLL KRVGICHGVSGNAYTFLALFRLTKKKEHLYRAKAFACFLLDRAKQLIADGIMHSGDEP YSLFEGQVGMAYLFLDMINPLDSRFPGYEL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..189#277..476#580..691#3128..3244#3363..3674#3783..4121#atggctgatcgcttcttccccaacaatatgccgggctatgccgacgaaggcgcgccgccgccaccggcggcagcggcggcggcggcgatcccctccacctactcctcctctctccaccacctcctctccctcccctaccccgacctcgccgatcgcttcctccacgcggcgcttcacctgaagcagaaggttaactcgtccaccaccgtatcgctagttcgtcacctcatgcgctgattgagtgattgatattctggtgtgctcctcgtcgatcaggtggtgcacgagacgtgggataagaggcggcgcgccgccgcggcagcgggggaggcagtgggcgacttcaccctctacaccggcgcgctcggcacggcgctcctgctcttcagggcctacctggtcaccggcgaccgcgcggacctcgccacgtgcgcggagatcgtggccgcctgcgacgccgcatccatgggggccgagtaatctgcgcgttcctcagccgcttcgtcgggcgcagcagcgttttgatttggtttggtttggtaaggtggtgactcggtggggtttgggggatttgtgcaggatcgccacgttcatctgtgggcgagctggagtctgcgccctcggtgcggtggtggccaaacacgccggagatgaagctggcgttgctcattacctgagcgcgtttaaggaggtgattaagcgtaaaatgctgctgctgatgatgcctataacgtgattgtgatgattagccttctgaactcgataaatttgtagtttgacttggatgatgctataggtgcaggttcatctcagttaaaactggaatggcaatagaaatgagcattggctattttggcttattataaactagctgggtagcccgcgcaattacgcggctagcagaaaaaaataatatttttttaagtataatcttacttaaaatttattaaagagctatctcaatgttaagactttaaaagaccaaaccttatcatcctcgtgtttctaattacatagtttttaaaatcacaccagttgctacctcttatgtcatctccttctttatttgcttgctcaatctatcactatttctatttattattcttggagcctttaaaaattggattttatagtttttagagtttattgtcacgttgggtttcgtttttataatttctagatgtcccatcaaacgttgccattatactcccgtccactatctcttctctttattgtcattgagattttaaaaatcgaacataattatagtttgggttcatttttactttctagaagtcccgccaaaccgtcagcggttttgccattatgctcctctacggctcgcccgctgcctcccttctttattgtcattaagattttaaaatcgaacatgattatcattgttttttttttactttttagaagttccgaacctttaaaaattggacttgtagttttattttttataatttttagaagtcccatcaaacgatgccactatgcccctctgcagctctcgtccgccgcctactctttattttcattgtgattctaaaaatcgaacataactattattgcaatttattttttattttctagaagttccgtcaaccgtcggaggctctgcaactatactcttatacaccccgcccactgcttctcctttttattgtcattaagattttaaaaatcgaaaataattatcaatgtggtttttttttctttttactttctagaagtctaggcaaccgctttacttgtttgcttcacatcctacctgacatccctccttttaatcgtcattaggattctatttggtgtttcattaacaatttttatataccatatcaaccaccaccaactctacttatttataggcctgttacttaatttatctcgttgtgtgttttagatggtcttttctttcaatagtctttatttttatcacaaattttagttatttataaattttattcctaattgaaatcttttttttctaatttcagaatttattttttctaaaaaaattagttaataccatattgtgttcttttaatgtttttatttcttattttcaactttagttgtttcaaaattgtatttctaattgaactctcttttaatttttctaattttggatattattatatttttattcgaaattttaattaatctcgtattgggtccttatatggattcttctttcaatattgcttatttttaattccgaatttcagctaattttaaattgtattcctacttgaactcttctttattttctttttccttaatttcggatttatttttctttttattctgaattttaattaatctcatattgggttcttatatggactgtttttttaatattccttatttttaattccgaatttcagctatttttaaattgtattcctacttggactcatgtttccttttctaattttggcttttaatttatttttatttcgaattttgattaatctcgtattgggttcttatatggaaacttctttcaatattgctaatttttaattccgaatttcagctatttttaaattgtatttctacttggactcttctttcctttttctaattttggatttgattttatttttattttgaattttgataaatctcgtattgggttcttatatgaaaacttctttcaatattgcttatttttaattccgaatttcagctatttttagattgtatttctacttggactctccttttcttttttttttctttttctccgattaatgtgagaatttctagccctcacagcgaacgtggtgcctcctttcaaagcttttttaataatataatagatagattaattatcaggacttggcttgagctcctaagaaatgaaattgctgtttctaaataagaagccacatatcaaacaacactgaaccatagaaattttactgctgttttattacagtatgcaataacaattttacgtttgatcggttgcactgttttatagaaaaaaaatgttagtcccaagtatgtctctttactcacttgaaagttcatccatctaaacaaagcaatatgttatctatggtagtatggcccatgttcatgtgacataacatgtattatcctggtatagatcaaaattcatagtaaatcacctgatgagcttctatatggaagagctggatacctatgggcatgcaccttcctaaacaagcaccttggagataatactataccgccaaccactacagtaagtacacagttcaatctttagtgccttcatttgtcattcttccattcatacttgttggatgatcgctgggcacatgcgatggatgatcatcatcattctattgaactatttgtaggacactgtcatgagagatattatcagagatggtagaacactgtccacgataggctgcccattgatgtatgaatggtatggtgagaagtattggggtgctgctcatggactttctgggatcatgcatgttttgctggacatggacttgactaaagatgacacggaatgcgtaaagggaaccttgcgctacatgattcagaaccggttccctagtggtaattaccctgttactgaggaggataagcatgatcgatttgtgcactggtgccatggggctcctggcatttccctcaccttagcaaaggcttcacaggtttgttttctattctcagatcatctcatctcaaccacctgctttggctgcatgtttcgttctggcaatctgttacattctgcatatactatgtcatatccttaccaggtgttcccagaagaacgattccttgaggcaattgcagaggcggcagaggttgtttggaatagagggctgctcaaaagagttggaatatgccatggagtaagtgggaacgcctatacatttctagcacttttccgcctaacgaaaaagaaggaacacctctaccgtgctaaagctttcgcttgctttctccttgaccgagctaaacaactgattgcggatggcatcatgcacagtggtgatgagccgtattccttgtttgaaggacaagttggaatggcttacctgtttctggacatgattaacccccttgattctaggtttccaggttatgaactttga</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os04g0529600, RefSeq:Os04g0529600