Os07g0108900

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os07g0108900

Description

MADS15 protein

Version

NM_001065255.1 GI:115470242 GeneID:4342214

Length

6425 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os07g0108900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:470174..476598

Sequence Coding Region

470595..470721,470877..471040,471552..471593,471730..471771,472147..472246
,472396..472460,473795..473873,476290..476474

Expression

GEO Profiles:Os07g0108900

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggggcgggggaaggtgcagctgaagcggatagagaacaagatcaacaggcaggtgacgttctccaagaggaggaatggattgctgaagaaggcgcacgagatctccgtcctctgcgacgccgaggtcgccgccatcgtcttctcccccaagggcaagctctacgagtacgccactgactccaggatggacaaaatccttgaacgttatgagcgctattcatatgctgaaaaggctcttatttcagctgaatccgagagtgagggaaattggtgccatgaatacaggaaacttaaggcaaagattgagaccatacaaaaatgtcacaaacacctcatgggagaggatctagaatccctgaatctcaaagaactccaacagctagagcagcagctggagagttcattgaagcacataatatcaagaaagagccaccttatgcttgagtccatttccgagctgcagaaaaaggagaggtcactgcaggaggagaacaaggctctgcagaaggaactggtggagaggcagaagaatgtgaggggccagcagcaagtagggcagtgggaccaaacccaggtccaggcccaggcccaagcccaaccccaagcccagacaagctcctcctcctcctccatgctgagggatcagcaggcacttcttccaccacaaaatatctgctacccgccggtgatgatgggcgagagaaatgatgcggcggcggcggcggcggtggcggcgcagggccaggtgcaactccgcatcggaggtcttccgccatggatgctgagccacctcaatgcttaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGRGKVQLKRIENKINRQVTFSKRRNGLLKKAHEISVLCDAEVA AIVFSPKGKLYEYATDSRMDKILERYERYSYAEKALISAESESEGNWCHEYRKLKAKI ETIQKCHKHLMGEDLESLNLKELQQLEQQLESSLKHIISRKSHLMLESISELQKKERS LQEENKALQKELVERQKNVRGQQQVGQWDQTQVQAQAQAQPQAQTSSSSSSMLRDQQA LLPPQNICYPPVMMGERNDAAAAAAVAAQGQVQLRIGGLPPWMLSHLNA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5878..6004#5559..5722#5006..5047#4828..4869#4353..4452#4139..4203#2726..2804#125..309#ctcctcctcctcttcttcttcttccactagctagttcgtcttcctccttcagctagcttgtagcagctaaggttaggtcggatcgagatcgggatcggccgccggcgagcggcgagcggcgaggatggggcgggggaaggtgcagctgaagcggatagagaacaagatcaacaggcaggtgacgttctccaagaggaggaatggattgctgaagaaggcgcacgagatctccgtcctctgcgacgccgaggtcgccgccatcgtcttctcccccaagggcaagctctacgagtacgccactgactccaggtacacctatagcctgatcgattccttgccatttctggagcacctgagcccgcctgagatggatgaactcaataattctcctagctttttgccgtttctggccggccgcttccatggatttcagctgctgctctctgaatttgccatgtttggtttgtgcatctggttgcatgtgtgctacagctgatgattttatgcttcactagtgctgcaacacatgcaacacagtccaatccaagctagctcagctactccaggaggaggagtcagctgcatgcctcctcatttcgggaaatcatctctctctctttctattttttccctttcctttcttgtttcccctttttctttcctgctagcttgcttctctctctacaccctgcataccctttttgggattgatggccggttttaattaatttcccctcctttctttagttaattactaccctactactaattcatctcctcccgatcctctcaatttctcatcatatggagtactactaaaatatatatatgtagtacgcacttggtgtggccggtctttgttaacatcatgtgcttgcttagattcaaggggattatatatataagaggatctactactaagtgtactttgtgattacatcagctatctatgtagctgatgatcttgctttggtcttttgctgatccattgagctagtgctaattctcatcacccttccatttgatgtactgcaaatagttttttattcattcgcttcttctccctcttccccatgtgatttgattgctagctccttcctgacttttatttgggttgatttcgtcacatcttcctctcaaattaatctcatgcgcgtgcctttgttctccacctgtcaagaaattaattaaagaatatatcacacgaattacgaggagtccaccaccagtgtcatgcactcctccctattgttcacagtcacagctgatgcatgcaaaacatcttctgtttctcaagtaattaattcccctcttcttgtgaggcttggcttaaaattactcaaacagctgtttttcttgcttatgcatcatcttcctcagataccaaaacgttggagatggacagatctggcctttcctcttcccttctctctcatcctcttctatgtttctgcctcttcttatgatgaatctttatttggtattattcacgttaagcatctctttaaagagccctagatcaaatttgatctatctcttttggtttaacttcatggccagttgcttgtgtgttttggtctagaacgaccacgtacgcgagatatttccttttctgctcagctgattaattaataatgatgggataattcactaattattctggagttagatcaagagatgtacttaaacatcctgtgacacgatgacttcaaaaaataatcttgctctctgtaaaatcacataatagctagccatcgcgcgtgtttcagaaaaataatttatcttgcttgctagcttttgctcaaaatgcgtttctgacgtctaggtaaagaggacttttacggtcgtctgtgttgtactggaacagtgccctgcacactccccagcgtcaagatcagtctaaggcgcttcatttctagctcagaaatcttcacttatttgatcttaattatagatcttcctgagatagatctaagggtgttccagtaaaacagaagaagtcaagttcttcaggatcctcgtgatataattaaactgtagtctcacaatcttactgatcatcaaggagtctgtaaacacctatacgtacggctataggattatggggaggttggtctaaaataaaggtgttaaattacttgcaattatcaagatgtgcaaatcatcacccagtaattcaatggtgctattatatatagtctgttttgaacagttccactggttttgttagggtccttgctgatggctgtttaacggtgctgttatatataatcttgattattttttttgctaaattttcctaagcaacccacttcaaattttggaatgggtgaattcttatgttcacaccctcatatcacatgtgtcatgaggagcttttttttcgtcacacagtcccatacaacgtccctgttttcttgaagataagataattcatgcatgcacttgaatataaccgagtgttttcatgtgcatgctttttatttggctgtgtcgagtgtttagacagcaaaagagctcttgtgcatacaaatgccgatatctatatattagtagtcttaatccacatttcagctttaattgcttggaatagtttggtaggcattcctagcttcagaccatttaaatatacttcctaaacgttgtcatgagaatgctgaatgcaaagtatttacatatatagtggactaatttcagattctgctcatgatggttttccctgcaggatggacaaaatccttgaacgttatgagcgctattcatatgctgaaaaggctcttatttcagctgaatccgagagtgaggtaaaacacagtaggttgtatgatatataacttttacatgaagggaatattattgttccttttctattgcattagcatttcaatcatatcatttccttgtggccttttaaatcacatgttaacaaagcagtttttctgaattctatcgttctacttgccaaaactagatgttggtaaccttctgttttatactttttaacttcaaacctcgtgtcttttgcactctggcatatttcttaaaatttctacttattgggatatcatgcaggagagtcctcattcccttcatttaatcccctcaaattttatttattatggtcatacaattaatgggccacatgcatggaagtcgatcgccagcttgcgatcagcatcctatcattaatgttatgatctatactaattcttctgtaaataaattaaaattgcactagtttttaactaaatgctactattctatttttttatccatactccgtttgagtggtttcttttgtgtttcatgaagcaatataatatgcttaagaaaacatagaaacatgcacaatacaataatagcgctggtagaatccggttggagaccaaatgtttcgatattctaagtgcatatttatatatactaagtaaaactgtaatcataaacatgcatatggactgtgatcgatgaaatgtttcttcattttttttttcaagataactcttccccagttgacaacatgcactgcatccagaagtactcatggtatttgttttcagtactgtttgatgagtaaaactttggtaagtgttaaaaaatgatgataagtgcaaatatttgttcctttaccacttccaccttcttggagtaaagaaaaaaatgtgtgtggtttggcaaagttgttgcatatatcacggcattagtgtgcggataatgcgaataaatgcatcaataagcactaggagtaagttaattagttctctaccttaattgaaaagttcatgtacatttaaaaaaattaaacatgcctctttttatcatttgttgaatttctacatttatcaagacagcaaaggagttctcatctactaataaattaatttaaggagctataactcccttaattttatcaaatattcacatacacggttgcatttgaggattttctatatactccactaaatgaggatgcatttaggttctttataatattttatttccatcgtttcatcatctgtttatgtttacagtaatttagtaatagttctctaattttgacagtaatggttggctcacagaaaacatcaaccaaccatatatattggtttatactgacaaagagtttttttttgtacagggaaattggtgccatgaatacaggaaacttaaggcaaagattgagaccatacaaaaatgtcacaagtaatcgatatatatatccaatttctataataatgttaaataaatttcgaactaattgcactaattattatttttaaaccaatttaaaagagaacttccggtattgactgctgaagatgacgtgaaactaacttatgtatcttgtgtagacacctcatgggagaggatctagaatccctgaatctcaaagaactccaacagctagagcagcagctggagagttcattgaagcacataatatcaagaaaggtagtatttttttggatagtggaatctttttatttgaactcccgacctctacacaccaaatgtacagaaaaaaaggagcaaattattaaaagaaacgtagtaatatatttagcatgttctgtttcaaactggactgaattgaaataattcatgcatgcgcatgcctgagttacataaatatatatccaaatgtcttgttgtcactgctactttgaaacaaatgttcttttttttttcctttttgagaaaatatatgagtaaatattttcagcacattctggaggaacaattaccaaatataaactttttagcacattctggagtacaattaccaaatatgacggactaactagaacaatatgtttgtgtttgcagagccaccttatgcttgagtccatttccgagctgcagaaaaaggtgaccaattgaactgcactactgtgtatgcatgtatatatgaatcgtgcatgcaaaccgttgttagctagtagttagttatagtttactcttggttagtctcaactgatagtgcagttttcttgcatgagtgcaggagaggtcactgcaggaggagaacaaggctctgcagaaggaagtaagttgtcgaaaatatagtatttactgctgcttatattaattaattcattctgcttgactagccaatggaggcactaaacataattaattcatgcgcattggttttgatcaattgatttatcttgttgacaattttccaatctatccatgggtttaattactagttttgtcaatggaggcattagagataattaattcatatgcgcactcgaaagtttgaaattgctgtagtttacttgttgggtggatcatatcgccaataattttttcccccacagttgaccgcaaatgagaagtaattttctttgccttctagacttgacggctatttttttagcgtgttggcaattgaacatatgaccttgggttaaaaccacacatcttttatcattgcgctatcaaatacatctcgataaatttgtcccttactagcggtttatgtggtttccttggtggtcggtttgtgcctcttagaaaaaaatcgtgatgtttgtagtgtgcgcatgcagctggtggagaggcagaagaatgtgaggggccagcagcaagtagggcagtgggaccaaacccaggtccaggcccaggcccaagcccaaccccaagcccagacaagctcctcctcctcctccatgctgagggatcagcaggcacttcttccaccacaaaatatctggtacgtatatgtctgcattcatgtctcatcagttgctattcagttataaattaatctgttactgcactaattaagatcgatcacacccttgttaagttctaagtctctaattaattaactgcatgtatataattatgcacatctgtgcatagtagctacccgccggtgatgatgggcgagagaaatgatgcggcggcggcggcggcggtggcggcgcagggccaggtgcaactccgcatcggaggtcttccgccatggatgctgagccacctcaatgcttaagatgatcatcgtcgtcgtcgtcggccaaacagctgccgtatgcaccgtgaatcatgggagcaaccttgaatgaattgaagtcattggtatcgatcctagcgataatatatatgattctcctaaaatgaaattgatctcaaaaaaacaaacctagcgattaagctattcttatatatgtgtttgcctgctgccccctaccctacaggctacatatgatttgcaagaaattaattatgagcaaggatcaggatgtgtctttgtgtaatcatcagcacgtacctagtgcttcctactgatatatatgcatgcaattgtgtgcatataaatatatttgcatgccatgctcccgtgatggttaattaatttatgattgtgtttatacgctaattaactgcagatgcaaactaatcaatcgaattat</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os07g0108900, RefSeq:Os07g0108900