Os10g0127900

From RiceWiki
Revision as of 08:30, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os10g0127900| Description = Conserved hypothetical protein| Version = NM_001070622.1 GI:115480987 GeneID:4348024| Length = 8580 bp| Definition ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os10g0127900

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001070622.1 GI:115480987 GeneID:4348024

Length

8580 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os10g0127900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:1722588..1731167

Sequence Coding Region

1722947..1723168,1723268..1723423,1724688..1725077,1730916..1731026

Expression

GEO Profiles:Os10g0127900

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008403:1722588..1731167 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008403:1722588..1731167 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ccgctggacatccagaaacgccgtcgagcaccttacgtcgccgccgtctgcccctgtcctgcaccgcgtcgagctccacttcgccgcgtttcgccatctcgccgtctcgcgggtttcttcgcacaacttgaagctggctgtccagcattggaagatctcttcttacatcaatgcggcgttcacgatgacgaaatctcctcccatacactgaaggttttgaccttcgatagtgtttttttctacatgccgatggacactgttgaattcaccttgctgaacaagacatctatttctcttccaagtgttacttctctgaccatatctactcccgagggtttcacacctatactaaaggacacggcatcagtagtgactgcatcagtatcagtatcagttacaatgtctagttttagatttcgttttgatgctaatgatctcggccagtatctccagagcctttccggtattacaaatttagagttcaactatcagggttcaaagttgacaatcgaaaaccatttgcaatggtgcccggaattcctcaatgttgtcaacctgactcttggtcaatggtgcctggattcaaacttctatgccctaattgtcttccttcagaactcacctagactacagaagctaactctgaaactcgaaaagagtaatatgagaataagtcgaagaatcattggcgagcttacggaaatatcgtttacatgcgagcaccttaatactgttgaagtgatatgctcggagaatgatccccaggtcatcactgtgcaagatttctttgttagcagtggcatgacctctgttcagtttcatatcaaacactggagcccgtacgcgaatgacctaccggcatttattcggtcgatatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>PLDIQKRRRAPYVAAVCPCPAPRRAPLRRVSPSRRLAGFFAQLE AGCPALEDLFLHQCGVHDDEISSHTLKVLTFDSVFFYMPMDTVEFTLLNKTSISLPSV TSLTISTPEGFTPILKDTASVVTASVSVSVTMSSFRFRFDANDLGQYLQSLSGITNLE FNYQGSKLTIENHLQWCPEFLNVVNLTLGQWCLDSNFYALIVFLQNSPRLQKLTLKLE KSNMRISRRIIGELTEISFTCEHLNTVEVICSENDPQVITVQDFFVSSGMTSVQFHIK HWSPYANDLPAFIRSI</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>8000..8221#7745..7900#6091..6480#142..252#tgcatttcatcgaacaccttgcgatcaccctctcaccaccgctagagatcaccattgtgaggctccccggccggagctggaggttggacggagtggaggaagagccgtgctgccgccgtcgccatgggggaagccgggtagccgctggacatccagaaacgccgtcgagcaccttacgtcgccgccgtctgcccctgtcctgcaccgcgtcgagctccacttcgccgcgtttcgccatctcgccgtctcgcggtacaccctcgcgcctgtagcgtcctccatacatctaattgctagcgccggctccaaaatcggcgattagcgcccatggccgtgccgccccggccgccgtttcgtcgccggcgagctctccgtgggtaggctatcccgggagctcccctctccatatagttcgtgaaatcgaatccccataccccgtagatgctcccgcacccttcaattcggccggaggatgtccctagcaccgaagccccttgtagccgagctcgggcatggcgtcgcctgatggcgccgcgcgcccccgtctcctcgcgcgccggctgccattggcgggagattgccggagctcctccgcgcctcaccccggccgtcgccgagccgcccgccgccgtcccggctcgggccggccacgccgactgcgccgagccgcgcctctgcatcgctcggtaacgggcgagaggaagaagaagatgaggagagagagaaaccgtgtgggacccacatgtgattagcgcacagtaatcctatccctaacggtgattatcccactcaatggcaggtggggtccctatagttaaaatctaagaaaacacaattatatattttgttcctatgacaggcgggacccaatggtaattaaacaagcaagtttgaccctaagtcaaccatgccggtcccacatgtcaaccacactgggttttggataatgtttccgattaaaaataaatcatttatgaacagtgcatttttacaatttctcggattaactcaaatttgaatctttaaattagtataacttattcattttagctccgattcgagtgaaacttgaacctaaattcatctaaattcataagctttccaatggtatataactcattatttaataaaatatattaatatcaaatgattagattatggtcaacttaaaaatgtgctaataaataaaattgatattgtacagtagagtagatgtcaaataaatatatttaacatgttttgtcactgtagcaaccacataatctaagtataagtgatgtctcaaatgaatggatgtataggaaaatactagtgcttatttaatattcgatggccatataattaaattcatgacttaaaaattagttacataaagtttagcttcatattttgtaactaaaatattaatactcatagataaatctttaacttgtttatgagaaataataacagagctgggtgtgatgaaatcaatcgaatgatagatttaaccagtgcaatatcctatatagtagtatatttataatttggttgacacctattatttaacatattatttaacagaacaataaataactcatgttcggtaaataatccaattaacatattattggacttgcatgtacagtacatccatttaacacatacacagtaagtcaatcacctactgttgcacctattaaactatgaattgtttgataaacatcaaagttagataaaaacactaattataaatctagacctcgttacgaggccacgtagacaaataatctgtacctataacctcacagatctatatagagcatggatgattattaacccttttataatttataatgacaagtaaaatatgatcgtgattaaaataatgccccattggtaaaataataatataaatgattcactgtaattatttgattgatcctaaatctatccaacaacggaacctctagtatatgaccattttatttagatagatgcatgtgtagacataatccttccatagccattagctagactaaaccaccatgacatcagaaagactaagaaaccttagctcttagcttgattagaatccattagcaaacgcaagtagtatgagcaaccctaggttcgacctcaacaattatattttgtttgcgcacattggattgttgtttgaacattgatttttctcgcgtattatagtattggtgtatcgattagtcgtgaggcaacgtatgcagcttccaggaggtgaacgttgatcaatattatatcaagaataagaactatcctaagcaggcaagtcatcaccccattccctgagcatgttgatcccaattgtgaaattgttttgtttacaaataaaattgcatgcagtgatgaatatcctacttgttgttatgccatgcctttgattattgcttatctcattattcccctgtacccataattatgtatgagtccctagtcacttatgacaaatgcttagtaatgctaatttagattcatgcattctcatatttatcaaatgctttatgcttgggaaactaccttggggaggtagttgagatacggcatgtggagacatgagtgccacattgccatgacattgatgagatgatttgtgaaagaaaatgaaaactgaacaaatgttttcgactagggcggctggaggacttgggtggtgtccggaaaaggctagtgccgtccctggttagttaaggaccgagccatgaagctaagcatgaaacgacccccgtacaaccgtacttctcgtatgggtatagacctagcagagtaaatagccgagcggaggtagtatccctgcatagtggttttcttgatgtgtgtgaggcagggcgtacggtggggcagccattggtaggaccacgaggggcaggtgcctacagtggtgtcgccatcggtaggactgccatatgtaaacctaaacttaactataacttaatgcatgtgtgagtcttcccttcccgggagagccagaactcctctcactgctagaaaccttggacgcctagagtgcatgaggactaaagttcatggagcgggtactgccaaagtgaggttattgaaaggctttgccatgacgcgtctcatgtgttgggatgaggctcatgtgttgggcagtcacggagtatgggtaaagtgtacttccactgcagtgtgagtaaaccaatctattcgaatagccgtgctcacggttattgagcaccgggacatgtattacacttggctagactctaaattcttaaaatgatgggtgggatgttgcatgatgattttgtactggtggaacaacttctcgagaggcgagaagaggtagaccccagaaaaccatgacgactagtggcgggaagctatccttgggaacacaatggatggtggacagaaccgtcgctgtttaatgaacaatggaattaaaacttgaccagtttatgctaggtcttaggtttgtgaaatgatatttgaaaactcagctttacgcaaagtaaccataaccactccttgtattatcctgtacattactgcatttttttgtggtggcttgctgagtacttttgtactcattgttgctctatatatatcttttagcagagtgttgaagagaagcccttgttagtacgcttgcgtacctaacaagatgatcggagtgtggttccattctaggtctcgttcccagtcgactgcttgtggcatgttaaccgggcccttgtattattttgtctttcgctgttgttctctgatagttatcggcctgcctggccctaatgtaagcatataactcttttagcctgaattcattcgtgatatgttgtgattcggctgtgtgtaccaactactgatccagggattggtactgataaacacagaagatttccgatttccaaaatcggggatcgacaattactaaatctaaatctatagttatgtaatacttcactttaaattagtagtcacgtgataaatttaatattaaacatgtagttttattatatatcatcttgaataaatatatagtcttgtaatagtttgatcataggtttattattttactcaaattttcaaaatgttaaaaaataagttccaacctaattgcataacttcatatcaaatcgctaaaagcaaaaaggaacacatggtatttgagcaagtactataaaatttctaaatactagtcataagataccaatcaagcttaaatggtaatatggaggagaggagagaagaaagaaatgagagtgaaatagagaagttaattggtgacaaatgcgttgaggttagtgtaatagaggtaatatattgtataggttatttttaaatttatgagaagatgacgtggataaaacttgcttgaaccaacttggggatggtgttttcaagcaggaatcctatctcgcgcagatgcgcgagcaaactaactcggatctactaggctcaccctaccctacactgcagttgttagcattttttttctctttttcgagtgatttcctctccttccgtcgttttcccgtgcaactttttgtctctcgtgattttttttctttttctcgcgcaattttttccttttttttttgcaagattattttttcccgtgtgctatcaggctaagtttcaacttcattttattttgaaaatttttgactcaaaatttaaaaacttctaacataaaattgaaaagttctaactcaaatttagaaattttcaactgaaaatttgaaaatttcgattaagatttgaaaactttcaactaagatttgaaactttcaatttaagatttgaaaaaattcaactcaaaattgaaaacttgcaaatcaaaatttgaaaactttcaaatctaatttgaaaactttaaagttaaaaattcaaaactttcaaatcaaatttgaaaactttcaactcaaaattttaaaaaaccatatccatttttttaaactttcaagtccaaatttaaaactctcagttcatcttttaaaattttaattcaaccagtctgttcgttattttgctataaataatcacgcttatgctaatctaatcgcgtttagcgctaagcgaggggaggggcgcgtctgcgtgtggcatggcgccgtgcgcgcgagttactgtagcagcgcggatgcgcgagttacgagagaagcggaaaactgaaaacgcgcgagatctcgcgtattactccttgtcacggacagtttgagagcgggaggcctcctcccaatctccccccttccccttccatagttccatggtggcgctcttcagacgcgagcgcgaggagcaccgggtccgcttgccggtggccggcctgactcgttagccgccgtcccgtccggggcgaaaggaagcatacctcgctcactccatttggaggtaatggcttcacccaatctttcttgaatcaccattcctctctggatggatgttcttcaccaaacaatgctgtattgccgctcaatgtagcatcgtttcttgcgctaagatcttgaatcttgcttggagttgagagctggggattcatggtttattgttccgttactgtgcagcttcccccatccgcacgcgcaccagctgttcgacgaaatgccaccgcgcgctctgcccccagtggaggacgacgccggcagggactggctcggtgacctccccgaggaggtcctccaccacatcatgtccttcctagacgcgcgccaggccgtgcgaacctgtgtgctgtcgcggcggtggcgcaacctctggcgtaccgtgccttgcatcaacgctgacttcgatgagtttgatctcgtcttttaccaaggggacgacgaggactatgatgacgtgctggcgttcaaaaggtttgttaaccgtctgctggagctccgcgatcccaccgccatgatagacaccttctggcttaggtacaccaccagaccagaaggaaacacgaattccaatgaagatgcctacgggtggattagccacgctttgcagaagcaggcccgggttttagaggttgtcgtgttctgctgcttatttgagctggaccactcggtgtttacttcctgctacctgagaagaattgcgttctccggtattgttttatgcaagggtttcttcgcacaacttgaagctggctgtccagcattggaagatctcttcttacatcaatgcggcgttcacgatgacgaaatctcctcccatacactgaaggttttgaccttcgatagtgtttttttctacatgccgatggacactgttgaattcaccttgctgaacaagacatctatttctcttccaagtgttacttctctgaccatatctactcccgagggtttcacacctatactaaaggacacggcatcagtagtgactgcatcagtatcagtatcagttacaatgtctagttttagatttcgttttgatgctaatgatctcggccagtatctccagagcctttccggtattacaaatttagagttcaactatcagggttcaaaggtatgcatatttctattacatagtatgcatctttatttaggtgtcaatttgaaaaacttaaagttaagcatggtgttgtttcttcttgctacttcataattgcaattgtttaattacctgtacctgcaaaacttatgggcattgtttggataatgggatagggaaatgatttcccaactatcaaaaggtatctttaaatcctaaccatttattctccctcttccatttaatcctaacccttcattcatttcctaatcccaatcccacccttcatttcccattatccaaacacacccatgattcaagtgatcattttgtcgtgaaatcatgatgtgttgatacgatgaccactgatgttatcaaccactcaatgcaatatagttcatccactccagccattttttgtacacaaatcaatccgttgaacacttgtcctgctgtttctttgttggtagttttatctcaaaatgaaactggatcatttctcatgtgaggactagaatgttctagtctggatgcaatatcagggctgccaaccaaatgtgcatcttgtttgacatctgactgattattttagttgacatcagttcacatcttaccttactttttgaaagagggggttagcggtgagctggtgattgtaggttctagacccaaccctagtccagatttttcttggctgcagacatgtatgcattttatttctaagatatttatagaaaacaatattgcaattgcatatgcggccatttggtattgtgtaatcatgcatgaaatcgttggtttccggattaattatttattgcattttatattttagacagtatgttgaattgggatatgatgcaacgcacagacattatgcatttatgctacataaatttgaaaattaagagacattcgaaggcaatatgcaaacagaaagtgcttcaggattagttgaaaatctcacttctagtgcttcatcatgaaatatttgtactgttctttttactagtttttgttacatgacttgcatggaaagtatcctagcagtaagttaacatgcctgagactcgcattgaaaatatgaacatgtataatattgtttagtctggtcttttgttgacataatttcagtttctcctgtggtcttttaccatccgttatcctaaagttgaagctattatacatgcactccaaatagaattctttatcacatattgttaatgctctcaatttagttgccatattttctgattatattcatttgaatctttcgaagttgacaatcgaaaaccatttgcaatggtgcccggaattcctcaatgttgtcaacctgactcttggtcaatggtgcctggattcaaacttctatgccctaattgtcttccttcagaactcacctagactacagaagctaactctgaaactcgaaaaggtaaatgctttcgtccaaatgtgcactgatcctacttgattgctttttacacaagagttttcacatcgggatatagatcacctgtttttgttgctgtagagtaatatgagaataagtcgaagaatcattggcgagcttacggaaatatcgtttacatgcgagcaccttaatactgttgaagtgatatgctcggagaatgatccccaggtcatcactgtgcaagatttctttgttagcagtggcatgacctctgttcagtttcatatcaaacactggagcccgtacgcgaatgacctaccggcatttattcggtcgatatgaaatggcaaaggatcacgaattagtttgccatcccattgaagaaaatcactctctttcgcctgtcggctacatctgctggttacagtagagtgttcagtgatcttgtttggtgctttctgctatgacgtgaaggtgagtagaaacaattgcatcttgccttgcatgtaaggtcagtggtattgtacttgtttgctgcgatcacatgatgatttgtagcaataatgatgctccaagaaaaatactgtatggctatggcgtctcctgatacagcctgccactgctttctcaacttggctggtctccggtgaaacgtattgtatttgtctctctcctaatataatcccatgttatagtgttgt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os10g0127900, RefSeq:Os10g0127900