Os05g0498300
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Contents
Annotated Information
Function
1.MSH5, a meiosis-specific member of the MutS-homolog family, is required for normal level of recombination in budding yeast, mice, Caenorhabditis elegans, and Arabidopsis. OsMSH5, is its rice homolog. 2.OsMSH5 functions upstream of OsZIP4, OsMER3, and HEI10 in class I crossover formation. 3.We investigated OsMSH5’s roles during CO formation and synapsis and find that loss of OsMSH5 function resulted in a severe reduction in CO formation, which means OsMSH5, similar to its homolog MSH5, plays a vital role in Meiosis. 4.In addition to ZEP1, three other ZMM proteins including OsZIP4, OsMER3, and HEI10, their loading depends on OsMSH5.
Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0498300 |
|---|---|
| Description |
MutS III domain containing protein |
| Version |
NM_001062483.1 GI:115464696 GeneID:4339215 |
| Length |
11441 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0498300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:24570055..24581495 |
| Sequence Coding Region |
24570338..24570388,24570950..24570981,24571073..24571167,24571361..24571441,24571514..24571586 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:24570055..24581495 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:24570055..24581495 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacgaggaagaggaggaggagatgtccgagagggaggtcgactcccaggttcatatggcttgtgtaatgcaaggacgcagagttggaatagcatactatgattcaagtatgcaccagctttttgtattggaaatctgggaagacataactgaagattttcctttgattgatcttgtgaaatatcaatccaaaccgagcacaatatacacaagtactaaaacagatgaggcacttttgttggcgttacaacgaaatgattgtaatgatgaggcccctgctgtgaagctcatgaaaagctcaaccttcagctatgagcaagcctggcacagattaatgtacttgaaagtcgcagctatggacgaagggttaagtgtaaaagaaaggatctgttttcttaattccatgatggatcttggaagtgacgttcaagttcgtgctgctggaggtcttcttgctatattagacaacgagaggcttcttgatacccttgatcagatggaaggtggagcatccattgctattgattctgtggcacagatatcattggacaagttcctgaaacttgatgcaacagctcacgaggcgctacagatttttcaagtagataaacaccccagttacatgggaattggaagggctaaagaagggttctcagtttttggtatgctcaataagtgcgtcactcctatgggaaaacatctcttgaggacatggtttttacgtcctataatcgatattgatgtcataaataatcgcctcaatacaatatcattctttctttgctgtgaagatgtaatgtctgcactgcgtgggactttgaagtctgtcagagatattccccacatgctcaagaaattcaactctccaagttcattctgtacaagcagtgactggcatgcatttctgaagtgcatttgctctcttctgcatataaacaagatttttgaagtaggaatatcagagcatttggcaatcaaattacaacatatgaacattgacttggttggaaaggccaattcttccattacagaagagctggattatgtatcagatctggtagttggtgtgattgatgtgcaacggggtaaagaaaaaggctacgacacactggtgaaagacggattatgtgaggagttagacgaactgaggatggtctatgaagaattgcctgattttttggagcaggtgtcagccaatgaaattgcctccttccctttctcatttgaatgcagaaaagctcctctaatcgtctatgtacaccaaataggatatttaatgtgttttttcgatgagaagataagtgatgccttgttgataggacttccagattttgaatttgcgttttctgaggaaggagaggagagaaggttctactatcatactcaaaagacgagagaacttgacaatcttctgggcgatatttaccataaaattcttgacatggagagagcaattataagggatttagtgtgtcgtgtttgccagtttatacctcaactgacgaaagcagtaaactttgcagcagaacttgattgcatattatcgttggcaattgttgctcgccaaaacaattatgtgaggcccatcttaactgaggattccatacttgagatacagaatggcagacatgctttgcaggaaatgactgttgataccttcgttccaaatgacactaaaatccgcagttcaggacgaatcaacataataactggacctaactactcagggaaaagcatttacatcaagcaggtggctttggtggtttttcttgctcatattggaagctttgttcctgctgattctgccattgttggattgacagataggattttctgtgcaatgggcagcaaatccatgacaagtgaacagtcaacttttatgattgatttacatcaagttggaacaatgctcaggcacgcaacatcgagatccctatgcttattggatgaattcggaaaaggcactctaacagaagatggtattggtctgcttggaggaactatcagccattttacagactacgattgtcctccaaaggtccttttgtcaacacatctgacacagattttcacagaaagctacctgccgcagtctgaacatatcaaatgttataccatgagtgttctgaatcctgatgaacaaacagacaacgaagatgtcatattcctttatcgacttgtacctgggcaagcgctcttgagctttggactacactgtgcacagcttgctggtgttccgagtgaagttgttcagagagctgttactgttttgggggacatccactcaaagagacctataaggcgcatggtctgggagaagttagcagcaaaggaccaacaataccaggatgcagtgactaaactgttggccttcgacccacacaaaggtgatctggtcaacttcttccaggaagtttttccgtcctag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDEEEEEEMSEREVDSQVHMACVMQGRRVGIAYYDSSMHQLFVL EIWEDITEDFPLIDLVKYQSKPSTIYTSTKTDEALLLALQRNDCNDEAPAVKLMKSST FSYEQAWHRLMYLKVAAMDEGLSVKERICFLNSMMDLGSDVQVRAAGGLLAILDNERL LDTLDQMEGGASIAIDSVAQISLDKFLKLDATAHEALQIFQVDKHPSYMGIGRAKEGF SVFGMLNKCVTPMGKHLLRTWFLRPIIDIDVINNRLNTISFFLCCEDVMSALRGTLKS VRDIPHMLKKFNSPSSFCTSSDWHAFLKCICSLLHINKIFEVGISEHLAIKLQHMNID LVGKANSSITEELDYVSDLVVGVIDVQRGKEKGYDTLVKDGLCEELDELRMVYEELPD FLEQVSANEIASFPFSFECRKAPLIVYVHQIGYLMCFFDEKISDALLIGLPDFEFAFS EEGEERRFYYHTQKTRELDNLLGDIYHKILDMERAIIRDLVCRVCQFIPQLTKAVNFA AELDCILSLAIVARQNNYVRPILTEDSILEIQNGRHALQEMTVDTFVPNDTKIRSSGR INIITGPNYSGKSIYIKQVALVVFLAHIGSFVPADSAIVGLTDRIFCAMGSKSMTSEQ STFMIDLHQVGTMLRHATSRSLCLLDEFGKGTLTEDGIGLLGGTISHFTDYDCPPKVL LSTHLTQIFTESYLPQSEHIKCYTMSVLNPDEQTDNEDVIFLYRLVPGQALLSFGLHC AQLAGVPSEVVQRAVTVLGDIHSKRPIRRMVWEKLAAKDQQYQDAVTKLLAFDPHKGD LVNFFQEVFPS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>284..334#896..927#1019..1113#1307..1387#1460..1532#2099..2162#2760..2911#3149..3250#3325..3352#3427..3458#3542..3599#3700..3786#4323..4379#4597..4698#4839..4883#5911..5988#6645..6695#6770..6851#7178..7251#7319..7415#7979..8075#8168..8257#8375..8439#8525..8583#8675..8751#8987..9073#9149..9208#9304..9367#10164..10217#10322..10404#10499..10530#10609..10632#10924..11039#11118..11198#aacaacttccttcccgtacaagccagtgcccgagccacgctcccgccgcacttcgcccctcgccgcctagcttgctccatcctccgcgcccgcgcagctgcgctcgccgtcgccgtcgctgcctagcttcctccagcctccgcatctgcgctctatttgtaccgcattctcggaggaggagcaggaggcgaggagccgccgagtagaggagagggggaggcgaagtcggtgctctcgccgggggttgacggtggaactccgggcgagcgatcgagccggcgaaatggacgaggaagaggaggaggagatgtccgagagggaggtcgactcccaggtgcgtattggcccgatccttccgagttcctcgcctcttattgcgccacacggagtagatttctctgcccccccctcccccaccccgctgcaatccgatcgaatcgtgttgccgaaaccccagttccgcgcgatgccgggttctattttattttaaacgaaaatgtcgtgttctagtctggaatgtagcttagtagttgtagacatcagctgtactgcttttacggcaccttcccgagcgtcacacattttccttttatctgatgcggatgcggcgccatgctcagatttggttcaggtgatgcttaggaaaggcgaatcaaacattgctagtttagttgatgatttctgtaatgttgttcattgtacaagcctcaaaccaccttccgaccagatgcacattttgatatgcaaatgcattcctctgtatttctcatgatgagacgaatcgatgtattgagtttaagaggaacagccgaacaggtcctatagctgtagaaaattttgcacgtctttgttctaatgcactgtacgtactgagtgtcaaaggattacatttcaggttcatatggcttgtgtaatgcaaggacgcaggtaaaattttgatgcatacttgatttgttgagtctgagataccactgtttctctatctaacattaatccatgctactttaatgattctcagagttggaatagcatactatgattcaagtatgcaccagctttttgtattggaaatctgggaagacataactgaagattttcctttgattgatcttggtatggtgctcatatgaccacacttataccaactaatttctctatctatatgaaacggaaatttacttgtaatataatgcatttttggtaacaaacaatttacatcatgtccactgtcaactattttgaacacttcgaatagaggaaacatggttatatagctgacaatctgtggtgttttttgctgtcacagtgaaatatcaatccaaaccgagcacaatatacacaagtactaaaacagatgaggcacttttgttggcgttacaacgaaatggtttgaactgcaacaatttctttaaccaatatcttcagttctcctttaatgattttggttaaaatcattcagattgtaatgatgaggcccctgctgtgaagctcatgaaaagctcaaccttcagctatgagcaagcctggcacaggttagcagctctgttaaagtgatacatgcgatttccacaccacataatatgctttacctgattcgcaagaattgataggacttaatacacaaatgctaaattgtgtcgcatgttgcatctgcatatgaaatcaaccacattgatcaagtgagcaatcaaagctaaatgtgcatggtttggaaacttctaaagtactacttcctccgttccacaatgtaaaactttctagcattgcctagattcatatatatgttaatgaatctagatatatatagaaaacatatacattgatcaatggataaatctaggtaaggccaaaaagtcttacaatatgaaacagagggagtattcattaacagaggtgtttggtaacttatgttacataccgcgatcttgtgatgcatagatgttggccgatcccttttcaatgaggaaaccaagaattatcaattccgggaaaaattcattacaagcaacaaccttgtaggctaatagtaccttcacctgtcaatcattatatttctgatgatgtgatgatgaaatatcattgtgtttgtaaatttcagattaatgtacttgaaagtcgcagctatggacgaagggttaagtgtaaaagaaaggatctgttttgtaagtgatttaagtgagattgcctctactcgtttgtacttatatgttttagatcatctacattggcacgagcttaagcatttatgaattattgttcaaactactgctaaagccatatattccttttctgacatttcttcattgtcacatatagcatgcacaatttatgaatattagcatattgcccatgcgttgcaacagaattaaaaaaaataacgtcatcaacccgtttttctatcacttacatatctcatctcttaatttctgatacacctttgagctgataggtggaaccttcggacccacactctcatttacggtgaagaaagtacatgtccattatgctcaattgcatagttagaaacagatcttttatcttcattgtaatgagctgttgagtagcattttctgtgtgaagatctgtttgcatcttccactggacatcctttatttgtctcacacaagttgctgttacactctttctatttccttttctatcactcgcccttctggctcaattttttgtttctgtcactcagatttgtctttcaagttttgttattatgcagtggtaataattttaggatttgtttacagcttaattccatgatggatcttggaagtgacgttcaagttcgtgctgctggaggtcttcttgctatattagacaacgagaggcttcttgatacccttgatcagatggaaggtggagcatccattgctattgattctgtggcacagatatcattttatccttttatccgtaatgatattatacggactaaatgtgctaatgtactgatcagcatgtttttgtggttttactttggaaacaagttagaaagctatttatgtaggattgtaggtactcttcagggtaaagttatatcttgacaatttgttgcatagtgttcgatgcattcttaacaggctggtattctcatgtttttgtgtatttagtattatattccttgacacgctctcagggacaagttcctgaaacttgatgcaacagctcacgaggcgctacagatttttcaagtagataaacaccccagttacatgggaattggaagggctaaagaagggtaaggattttgtctaaaccttgtactttctcatagccatggttctgatttgtaatagtaacaaaaaattacaggttctcagtttttggtatgctcaataaggtaaatgagatatttctcttctattcttcgtttctaccagtttactgattatgttgtggtcttgtggattgtagtgcgtcactcctatgggaaaacatctcttgaggtcactgttactttctataatcatgattgcagatttgcagtaagaatggcattcgtcttaactaattttatgcttcattccaggacatggtttttacgtcctataatcgatattgatgtcataaataatcgcctcaatacagtatccttaatttgttgaatacacatttctcaatttccccaatgctcaataccaaaaaggtaccagtagatttctgaactgtttctcctagacatgctagatatcattctttctttgctgtgaagatgtaatgtctgcactgcgtgggactttgaagtctgtcagagatattccccacatgctcaaggtgctattatctttactctgtatgttacttgtacctccttttcttatcattccccatgttataaaaagagaggtgtgctgaaataaagtaaacaaatgatagtatctcacagtcctctgttgaaaaacagaggttaaacctgccttttgtgttgagtatgttggtgttgcttgtgttttacccttcacataaatgtataaattctgtagttctcttttagtatttggtcattgctcatggctttgttttcttggactcgcacacattgtgagttttgttctcaatgatatatatgttgtcgttgttgtacatataagaaggaacaaagccttgctttttttaagttagcaattattctatttgaagtagaagagactcaagagtaatgttaactgtgaaataattgaatcaacggatcatgataattatatgcttatcataacatgtcgtggttattcttattctctttgagcacacattattcttcttcacagtttttctaatgtgcataactgacattttatatttttctgaagaaattcaactctccaagttcattctgtacaagcagtgactggcatgcatttctgaaggtacctacctgtaatgatgcatatggatctggctattactttataaatgcacaatcactttgaatatgctcctgcgttttccttctcccacttagctattccatatttgaagctctgccctaagtgcaagatacgaagcacccatacgtgcatgattttcttttctttcatttctcttgctgataatatcccttttctttcacttctcttatttcagtgcatttg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