Os04g0625900
| Gene Name |
Os04g0625900 |
|---|---|
| Description |
Like-Sm ribonucleoprotein-related, core domain containing protein |
| Version |
NM_001060477.1 GI:115460683 GeneID:4337065 |
| Length |
4749 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0625900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:32222641..32227389 |
| Sequence Coding Region |
32222729..32222957,32223799..32223920,32224017..32224126,32224280..32224344,32224436..32224623 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcccgccccaagaggacgaagccgccgccgccgtcgcgcaaggcggagacggcggcggcggcggcgcagcggccgtcgtcttcgtcgtcgtcgccgtcgccgtccctccccgaggcgctgctgctcgcgacggtgtgcatggtcggcctccccgtggaggtgcaggtccgcgacggatccgcgtacgcgggcgtcctccacaccgcctccgtcgaaggcgcatacggtgttgtgctaaagaaagcgcgaaagatcgctaacgggaatgataatgccaatattcctctgggagcttttgtagatagtcttgttattcacccagatgatctcgttcaagtcattgcaaaggatttttcactccatacaaaagatgtgtgcagaactcctgtttgtgataccgtcgcagccagtgcatatgtgaagcctcaaacttcacatgtgaatgtgtttccactaaaagaggttaagaagtgcagcacgccaggtgaggagactaacatctccattgggagaagttctcctgcctctccaactggatatgtagggccacgcctctcctgtaacgagataatgagttctgcggttgttggatcaaaagatggaaatactaagagtgcagttttgactacacccacaatgtcttcagatgtgaaaatctctcctccagccacagttgctaaaactgccacgccgagcaaaaccattgctaaggaatccaaactcaacccttgtgctagggtcttctctccttcgtttgcaagttccagaccagtacttgcagctgcaccctctgttaacccaatctacatctcaaactctgtagctggagttccaaccgggttacctgtatttgaaactaactcagtgccaggcggttcatccctgtccagcaaggctgttcattataataacctggctgctgcaaactatgctatttcacctcaatatactcagtcaaccatggggcataatgtgagcaggctggatcctgctagaattggcacaccttatcatcccatgcaagttggacctgcttacattagccctagtcctcagcctgttactggtgggaaatttaatcatgttgtttatgtacacccattttctcaggatgtaatgcatggagcacctgttatgccccaaggatggtctcttcctgcaccattgaaatcacatcaagctagcctccagaagttccaaggcacagcccctgtatatgtagccccacctatcatggcaactgggaacctgccattggtggtaccaagccctgcaccgcttgtgcagccattccaggccgttcgtcccatcatggtacctgctgcaagcagcatggttccaggcaaatacatgtaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MARPKRTKPPPPSRKAETAAAAAQRPSSSSSSPSPSLPEALLLA TVCMVGLPVEVQVRDGSAYAGVLHTASVEGAYGVVLKKARKIANGNDNANIPLGAFVD SLVIHPDDLVQVIAKDFSLHTKDVCRTPVCDTVAASAYVKPQTSHVNVFPLKEVKKCS TPGEETNISIGRSSPASPTGYVGPRLSCNEIMSSAVVGSKDGNTKSAVLTTPTMSSDV KISPPATVAKTATPSKTIAKESKLNPCARVFSPSFASSRPVLAAAPSVNPIYISNSVA GVPTGLPVFETNSVPGGSSLSSKAVHYNNLAAANYAISPQYTQSTMGHNVSRLDPARI GTPYHPMQVGPAYISPSPQPVTGGKFNHVVYVHPFSQDVMHGAPVMPQGWSLPAPLKS HQASLQKFQGTAPVYVAPPIMATGNLPLVVPSPAPLVQPFQAVRPIMVPAASSMVPGK YM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>89..317#1159..1280#1377..1486#1640..1704#1796..1983#2366..2611#3191..3292#3463..3513#3994..4084#4198..4352#ttccgctttcgtctcgtctcgcctcgtcgcatcgcatcgcctcaactcccaccaccctctctctcttttccctcccttcctccctcccatggcccgccccaagaggacgaagccgccgccgccgtcgcgcaaggcggagacggcggcggcggcggcgcagcggccgtcgtcttcgtcgtcgtcgccgtcgccgtccctccccgaggcgctgctgctcgcgacggtgtgcatggtcggcctccccgtggaggtgcaggtccgcgacggatccgcgtacgcgggcgtcctccacaccgcctccgtcgaaggcgcatacggtgggtgctcctccctctatcctcctcctcatcctcctccccgtcgttgtttctgtggttgggtggctcgcttagggttcggagatcgcggggatgtggttgtgagcgtgatccagctgtgtgcgcgtgtgtgcgtagtgggtggcgatttttaatagggttggtgctccggctttttttttttttcgtttcgaagttaactggttcgtgatccgcttgttggttgggttgggtggcggtggacgctggacgcttgcgttgtttgttttttggatagtgccatggtgggatggatttgggggtggttgctggttagagatcgctggatgagtttcccccatttgtggcgtggctgtagatgtacttttgtgtttgcggttaagatcttggctgtttggtctttgatcgtcgtgattgcggtggggatttggatgagagtcccgtaaatcgttcctgggttcgtggtctagagaggatctcgcactgggttccaggatcataggcaatgatcctggtctctataatgtaatcgggtatcatggttatgctataaaccaactgcctggttgattgcaaatatatgttgtttttcttctctagaattgagatgccaatttgccatgaagaaatttatgattcatttagtgcattctagcattctggcagcagtcacatttttgggtttgattcgtactccttttggatttgtaatatcctagggatgcattttttttcttgccagatcatgtttataatgttgttctttctggtttcaacaatcaatttagttttctttttctgtgtggagaaaaaatgatactgatgtatttatgttgaacaggtgttgtgctaaagaaagcgcgaaagatcgctaacgggaatgataatgccaatattcctctgggagcttttgtagatagtcttgttattcacccagatgatctcgttcaagtcattgcaaaggtagctttgatgtgcttaaacatgctaacaaattttcccgccaaaagaaaaggtatactaacagattgccttctcgtggacgcttctacttttcaggatttttcactccatacaaaagatgtgtgcagaactcctgtttgtgataccgtcgcagccagtgcatatgtgaagcctcaaacttcacatgtgaatgtgtttccactaaagtatattcttgattcaccaataataggataaaactctttcaattgtttctttaatgatgctggttaataatgtagatttctagcaatctattctgtatatatatttcaatgtctattcattcttgaggttaattcatgctatttctttaacagagaggttaagaagtgcagcacgccaggtgaggagactaacatctccattgggagaagttctcctggtattatgtctaacctctttactattttactccgataattctttttccacttttcttccttgtacttaaacccgtccaactgttatgctagcctctccaactggatatgtagggccacgcctctcctgtaacgagataatgagttctgcggttgttggatcaaaagatggaaatactaagagtgcagttttgactacacccacaatgtcttcagatgtgaaaatctctcctccagccacagttgctaaaactgccacgccgagcaaaaccattgctaaggtgagctctctcggacccttgatacgtaagcatagggaaaactgtgtctagagaattagagatctagaaaaatgttttgctaatatattttaccttttaaggagcccagtactatttggaaagcattatcagttatttcgtccatgtacataacaatctgtgcaaggcttgccaactatgttatcaatgttatcagtgtgttattttcttattttgtattatcaagcacagttctctttccttcctatgtcatggatttctatgcatcctgagggaatgaagccgtgccaattctgtttttatgtttactgctgtcctagatgttctacctttgtaaccttcctgtgcttcatcattgtcatcagtccattcactattgcaggaatccaaactcaacccttgtgctagggtcttctctccttcgtttgcaagttccagaccagtacttgcagctgcaccctctgttaacccaatctacatctcaaactctgtagctggagttccaaccgggttacctgtatttgaaactaactcagtgccaggcggttcatccctgtccagcaaggctgttcattataataacctggctgctgcaaactatgctatttcacctcaatatactcagtcagtaagttctttgattaattcttttataatatcattgttgcttcaatagttcatcactttcttcagattgctgtcatatagtcatgaagtgataaacaaggaaaatattgcaatatggtgccaactcctattcagcaccgacattcctttaagctgataatttgctttatgtgaccactactactatctctacatattttaactattatctttactctggtgtaattttccatttatcttgagattaactattgaactactaatagctatcgtcaggggcggaatcaggcatggggcagctagggcttgagccccatgcctagctccataatccccattataatcttgaaaaatgctatgtaatttatgaaaatatttgagatcccattagctcagccttaggcgtggaaattttctggctccgccactggctatcgtttatcgttatgttatattctgtgcattgaattttcagattctacttcactttgatcttattgctgcataactctggcatgtacgttttgttcggatatgatcctgcctcctgaatccttatacatggttttttgaatgacagaccatggggcataatgtgagcaggctggatcctgctagaattggcacaccttatcatcccatgcaagttggacctgcttacattagccctagtcctcagcctgtaagttctaatcagttgtatatatataaatatatatatatatatatatatatatatatatatactgatattaatttcaaaatgctgttcatttgtacctattggttacatgatatactatcatttgctcctgtactgatctaatttatttttatgttatgacatcataggttactggtgggaaatttaatcatgttgtttatgtacacccattttctcaggtgagtaatgcaacagtgttatttctattaatagctcaagtggaactctgcgagagtaagatgatgaattaatgatgcaagtacaatttgtgttgtttcatacaatacttttaactgattaaatagtgctgattcattggagatatcatgggtgtcttttgtatcgctcaaccagtagatagtgcaagtgaggcactgttatccaaattgaacttggatattcgtctgttttaaaaaataaaaactactcagctacatttcacacattagataatgtgaagcttcatttcgtggcatgcatctttgttggcaaccctatacattgcgtagtcatttaggcatatgaagctctcctgttaaccgtaatgattaatatttgacattatcatccctctaaaaaactcatcctagttatatttactgcaaatacaaattgccctaactgactttagctgatctactatatgctttccgctgaaggatgtaatgcatggagcacctgttatgccccaaggatggtctcttcctgcaccattgaaatcacatcaagctagcctccagaagttccaaggtaaaaatcgtactcattgtcgaatggttcctttattttaatggaaggtattaaaatgtttattttatttattcattacactaatcaaaacatttaacgtagaaactctccaggcacagcccctgtatatgtagccccacctatcatggcaactgggaacctgccattggtggtaccaagccctgcaccgcttgtgcagccattccaggccgttcgtcccatcatggtacctgctgcaagcagcatggttccaggcaaatacatgtaaacttgtcatagcagtgtgatatcagtttttgttggaagaatcttggttttacccctttggccgttggggtttacatctaagaggactcgcagttttgcctaatctgttaattctcttgctagttgctggtctgtgtccgtctttttgttggaaggacttgcaacttttaccattcttaatgctttggcatcatcacgattttccttttttcttttttttttctttttggatcattggggtgggggtggtgggggtgttccatgagagcagttaaatgaaatagagaatattgaagcattttttttgtcatgtcaaataccttttccctttttgaagagtagcatgtactatgtacaatgagacactgtaaaagagttagatagtaaattgattgttt</dnaseqindica> |
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