Os04g0635900
| Gene Name |
Os04g0635900 |
|---|---|
| Description |
DNA repair exonuclease family protein |
| Version |
NM_001060547.1 GI:115460823 GeneID:4337137 |
| Length |
5815 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0635900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:32741115..32746929 |
| Sequence Coding Region |
32741563..32741564,32741795..32741930,32742068..32742225,32742420..32742510,32742604..32742723 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:32741115..32746929 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008397:32741115..32746929 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggagacgaaagcaacacactccgtgtacttgtggcaaccgattgccatctcggctacatggaaaaggacgagattcgtaggtttgattcatttgaggcgtttgaagagatatgctcattagcagagcagaataaggttgattttgtgctacttggtggtgaccttttccatgagaacaaaccttcacgttcaaccttagttaagaccattgagattctacggcgttactgcttgaatgaccagccagtgaagttccaggttgtcagtgatcagacaatcaactttccaaacagattcggccaagtaaattatgaagatccaaacttcaatgttggattgcctgtgttcactatccatggaaaccatgatgatccagctggtgtggataatctctctgcaattgatattctctcagcctgcaatcttgtaaattattttgggaagatggaccttggtggctctggtgttggtgaaatagcagtctatcctgtactcgtaaaaaagggtacaacttttgttgcgctctatggccttggaaacattagagatgaacgattaaacaggatgtttcagacacctcatgctgtacaatggatgcgacctgaaactcaagatggaatgtcagtatctgactggttcaatattcttgttcttcatcagaataggataaaaacaaaccctaaaagcgcaatcaatgagcatttcttaccacgttttctggactttatagtatggggccatgagcatgaatgccttattgatccccaggaggtacctgggatgggttttcacatcactcaaccaggctcatcagttgcaacctccctgattgatggtgaagcaaaaccaaagcatgttctcttgttagaaatcaagggaaaccagtataggccaaccaaaatacctttgagatccgttaggccctttcactatgctgaggttgtgttaaaagatgaagtggatgttgatcccaatgatcaggcctctgttcttgaacatttggataaaattgtaagaaatcttattaagaagagtagtcagccaacagccagtagaccagagaccaaacttccactaattagaatcaaggtagattactctgggttttcaacaattaatccacaacgatttggtcagaagtatgtcgggaaggttgcaaacccccaggatattcttatcttctcaaaatcagcaaaaaagcgtcagactactggagtaggcaatattgatgactctgagaaacttcgtcccgaggaactaaaccaacaaactattgaagctttggttgccgaaaataacttgaaaatggagattcttccagttgatgacttggacattgcattgcatgattttgtgagcaaggatgacaagatggcgttttatgcctgtttgcagcggaatcttgaagaaaccagaactaaattgaattcagaggcagataaatttaaaatagaggaagaagatataatagtcaaagttggcgagtgcatgcaggaacgtgtgaaggaaaggtccctccgctccaaggaagattcacggttcacgtcaagctctcaaaacttggatactggaggtagatctgttacagctcaaagtaacctgaactctttcagtgatgatgaagacaccagggagatgcttctcggtgcaagaacaactaatgctggaaggaaagcatctggatttacaagaccctctaaagatgctaccgatgttgccaaaactggaacttccagaaggggcaggggaagagggacggcctcaatgaagcagaccactctgaatttcagccaatcaaggtcaagtgctgctatccgcagtgaggaagtgcaatcttcttcagatgaggaaaatgagactaatgaagcaaacgaagttgttgaatcttcagaaccggaggagagtccccaacaaactggacggaaaagggcagctcctagaggtggtagaggtaggggtagaggcgctactgcaaaaaggggtagaaaagcagatatttcatccatccagagcatgctgatgagcaaagatgatgatgacgatgatgaagatgacaggccgaagaaacctccacctcgggtcactaggaactacggagctgttaggaggagatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGDESNTLRVLVATDCHLGYMEKDEIRRFDSFEAFEEICSLAEQ NKVDFVLLGGDLFHENKPSRSTLVKTIEILRRYCLNDQPVKFQVVSDQTINFPNRFGQ VNYEDPNFNVGLPVFTIHGNHDDPAGVDNLSAIDILSACNLVNYFGKMDLGGSGVGEI AVYPVLVKKGTTFVALYGLGNIRDERLNRMFQTPHAVQWMRPETQDGMSVSDWFNILV LHQNRIKTNPKSAINEHFLPRFLDFIVWGHEHECLIDPQEVPGMGFHITQPGSSVATS LIDGEAKPKHVLLLEIKGNQYRPTKIPLRSVRPFHYAEVVLKDEVDVDPNDQASVLEH LDKIVRNLIKKSSQPTASRPETKLPLIRIKVDYSGFSTINPQRFGQKYVGKVANPQDI LIFSKSAKKRQTTGVGNIDDSEKLRPEELNQQTIEALVAENNLKMEILPVDDLDIALH DFVSKDDKMAFYACLQRNLEETRTKLNSEADKFKIEEEDIIVKVGECMQERVKERSLR SKEDSRFTSSSQNLDTGGRSVTAQSNLNSFSDDEDTREMLLGARTTNAGRKASGFTRP SKDATDVAKTGTSRRGRGRGTASMKQTTLNFSQSRSSAAIRSEEVQSSSDEENETNEA NEVVESSEPEESPQQTGRKRAAPRGGRGRGRGATAKRGRKADISSIQSMLMSKDDDDD DEDDRPKKPPPRVTRNYGAVRRR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>449..450#681..816#954..1111#1306..1396#1490..1609#1681..1749#1869..1960#2093..2195#2276..2383#2464..2526#2588..2659#2837..2914#2993..3055#3132..3195#3332..3417#3971..4084#4275..4352#4427..4495#4583..4818#5001..5091#5221..5409#5597..5632#actccgccgccgccgctcgtccacagctcgccgccgcggcgcccctcccggcgacgactgatgctccgccccctagccgcctccaccccgccgtccccgagcagctcgccgacgctgaccagagcagaggcccgtacgacggtctccgaactgctcgcgaagtaggggaagccgccaccgcgttgtcgtcgcctaagcttcgccggtgctcgcagggttttggtttggtttggtttggtccggtgagttcctttgctttggtcagatatttcattagtggattagtatgaaattagaggatgctattcggctaatagaatatggacgtatggaaccaatcgtggtgttttgatatcacattttgctgcttgtttactgttatcgatgcagtgagggtttgatcaggaaagtgcttgggctcaagtctgaagctgaaccaacaccggcaatgtgagttatcatgttcatggtatatttaagccattagtatctggtggctggtggagcgatggtattagataagtacattgatattggttgttatgtcgaattgctttgggctttgcttagaatgaactatttggttgcacagagcatcctattaactgtcacctgatacttacactgcgacagacatgacgcttgactcattatatattcactgtcaacttgtgtttcaggggagacgaaagcaacacactccgtgtacttgtggcaaccgattgccatctcggctacatggaaaaggacgagattcgtaggtttgattcatttgaggcgtttgaagagatatgctcattagcagagcagaataaggtttgtaggagctgcacatttttccattcttttctgcttgtgttgcaaaatttattggcctgctcattctgttgggggataaccttctatttatgaattatgaattataatatgatggaaatcatactgaattgcaggttgattttgtgctacttggtggtgaccttttccatgagaacaaaccttcacgttcaaccttagttaagaccattgagattctacggcgttactgcttgaatgaccagccagtgaagttccaggttgtcagtgatcagacaatcaactttccaaacaggttttgacgatgagttatatcactctatcatgccatttttttcttgagtgtactctaaatttggtgatccctcaatgtaatctttcataaaagtgtcacttttgctgaaatttaggtttgatatatcatacgtgtatgcagatatgcattttccccttaattttcttacatgaattttcttggtacaatcacagattcggccaagtaaattatgaagatccaaacttcaatgttggattgcctgtgttcactatccatggaaaccatgatgatccagctggtgtggtatgagaatctcgttctgacattctgttattatggttattatgcttatgatgggtgccagcttttctcatgcattcttgcccctctctgtaggataatctctctgcaattgatattctctcagcctgcaatcttgtaaattattttgggaagatggaccttggtggctctggtgttggtgaaatagcagtctatcctgtactcgtaaaaaaggtgcgctacttcagctgcaggcaaaccatgaactctcacatgttaatcctctgtttttcctgttatttcagggtacaacttttgttgcgctctatggccttggaaacattagagatgaacgattaaacaggatgtttcaggtgcatttccattgacttttctaagaatttgaagttaattcgcaacttggcagcactagagcaagaaactttcttgatcatttgaacattgatatcatatttttatatcaattattcagacacctcatgctgtacaatggatgcgacctgaaactcaagatggaatgtcagtatctgactggttcaatattcttgttcttcatcagaataggtatgggcggtgaatgaatggtgacaaactgtagtggaatgtcagtatctgactggttcaatattcttgttcatttttttataatcttcatgccgcttactgaaaagaaaattgaaacctgaaatcatacaggataaaaacaaaccctaaaagcgcaatcaatgagcatttcttaccacgttttctggactttatagtatggggccatgagcatgaatgccttattgatccccaggtaatgacttggattttatttgatttcttttttaaaaaataacgtgaatatgcacttgtcatatgatcaattgtttataggaggtacctgggatgggttttcacatcactcaaccaggctcatcagttgcaacctccctgattgatggtgaagcaaaaccaaagcatgttctcttgttagaaatcaaggtcctattgaaagctctcctcttcatgttgaacaaaacttcagtttggtgttttctcattccatttttattcttaaacagggaaaccagtataggccaaccaaaatacctttgagatccgttaggccctttcactatgctgaggtatgatacccctcatttcatgcttatttcagtgcttgggtctcactgtcctaatatataggttgtgttaaaagatgaagtggatgttgatcccaatgatcaggcctctgttcttgaacatttggataaaattgtgagttttcagttttccatgatttgttataatcttttccattttattgagaagcatggtggcatgctggtgtggaattggttcaacattggcttatttgcccgtttgttgtcagtctagttttctttgttgaatgaagtcgttaaccctcaatctcataatactcaattgtttcaggtaagaaatcttattaagaagagtagtcagccaacagccagtagaccagagaccaaacttccactaattagaatcaaggtaaaaaaaacagaagagatgtactccgcacaaattaatcaagacaggaacaatgaaagtgctcatattgttctgtaggtagattactctgggttttcaacaattaatccacaacgatttggtcagaagtatgtcgggaaggtatctgagtccctaattaggttcttactcagaattcttacctgaatgagcttatttgatagcttcttgttgtaaggttgcaaacccccaggatattcttatcttctcaaaatcagcaaaaaagcgtcagactactggaggtattcctttatgtttaagaaagacagtgcacaagttatttacatagtggcagaatgcatcaagctatgaggagcaacagatgccatgttattctgacttttttgtttaactgactatgtctatgtatatatacagtaggcaatattgatgactctgagaaacttcgtcccgaggaactaaaccaacaaactattgaagctttggttgccgaaaataacttggtacttcttgaaactacatattctgtattattttgcagttttgctcttctcctaggagaaataattgctgctatctgtttttcttgatgggattccatttagttgtatatatgatgatcataaatgtaaaacaaagatcttgcctttttcctatactgccttatgcactaaatggatggtaatgtgtttattcttgactcctacagtattaggctgaaatataattaaattttcagaaatataatggcaagaaaggtacttctggctaggaggcccattatggtagctattgaataacagccaataatttaatgagcgacatctctatctggtcccattacacttcaccatatgagctttttacaataatagcctgagactaacagtggtactgtgaaacaaggactatttaattgtcttagttgggtttgtgggtctggaattcctgattttgttctatagattctttggatagcttcttacatccttcttttttttaaaaaaaaatattagagtaacaatataagcttcatgacacaaatcttgtttccagaaaatggagattcttccagttgatgacttggacattgcattgcatgattttgtgagcaaggatgacaagatggcgttttatgcctgtttgcagcggaatcttgaagaaaccagagtatgctttgctacattttctattgttggttttagttctttttttttatcaaagggccgtagctctccatttccattaatagaaatgagactagaatacagaggtagccttttttagttcttatttgattgcttgctgcctgataaaattgcatgcatctaaaattgaaatcctttgttgaaacctgcagactaaattgaattcagaggcagataaatttaaaatagaggaagaagatataatagtcaaagttggcgagtgcatgcaggtatttggagcaatctactattgttcctatgaggttgtggggtgattaaaaggttaatatttttaactacttaggaacgtgtgaaggaaaggtccctccgctccaaggaagattcacggttcacgtcaagctctcaaaacttggtggtttcaatgtccttatgcccttaatgttgtatgccattttttcattgttgctgattgtttgttgctcttatgatacttgaccaggatactggaggtagatctgttacagctcaaagtaacctgaactctttcagtgatgatgaagacaccagggagatgcttctcggtgcaagaacaactaatgctggaaggaaagcatctggatttacaagaccctctaaagatgctaccgatgttgccaaaactggaacttccagaaggggcaggggaagagggacggcctcaatgaagcagaccactctgaatttcagccaatcaaggttattaaattaattgctaccttgcatttataccataactgtgcaacctatgccaaaatggaatagccatggtacagtctaatttgcatttgtgagtgttaaaggtgtttgaaatcgtgtgccctggttttaactctgcagtagatgctccaatgctaattttaccatccaatattttgcaggtcaagtgctgctatccgcagtgaggaagtgcaatcttcttcagatgaggaaaatgagactaatgaagcaaacgaagttgttgaatcttcagtatgatcatttcctctatttgtagttctgtactttttctgtattaatacgcataaatataatgtgcgcttttgctcgtggcaaatgacctggtgaactgaaacattgtatattcttgaatactcacaggaaccggaggagagtccccaacaaactggacggaaaagggcagctcctagaggtggtagaggtaggggtagaggcgctactgcaaaaaggggtagaaaagcagatatttcatccatccagagcatgctgatgagcaaagatgatgatgacgatgatgaagatgacaggccgaagaaacctccacctcgggtaagtgaatcaccttgacattttgtcagtttgacgggtcttcttgtggtttgtcattaaattgtttgcattgtgttgtgtacacgcactgatactacaaaccgttggttttacgacctacaaactgttttttttttagaatacgacctacaaactgttggttttacgactttgtgttactctgcaggtcactaggaactacggagctgttaggaggagatgacctcttgttagtctaagtctgcctggcaaattaagtttccaatgaactactggaacgccaactcgcgtgatttgtacattccttagcctcatggatttacgtgcttgtagctgctaaatgctggatgtcagtttgtacattggcaacatgacattcatgcgggcacaagggattctcatcatc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
