Os10g0142100
| Gene Name |
Os10g0142100 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, RING-type domain containing protein |
| Version |
NM_001070682.1 GI:115481107 GeneID:4348088 |
| Length |
4539 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0142100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:2546524..2551062 |
| Sequence Coding Region |
2548536..2548598,2549205..2549334,2549422..2549559,2550096..2550205,2550532..2550561 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:2546524..2551062 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggtggttgctgttgttcatcgacaagatctgcatccgtcggagcaccagtttatatctatcatcaacaaaatccggcctctacaattgttgcaatagacaaaaatctggatacatccactcctgacacttaccgagcaccacctacacctttgccttatgatgttggtctagtgttgaaagataaccctgatttggagaagacaggcatcaagaggaaaattcatgaacataaggagtccttaatgatggatgataatgagtcattgcaaaaatgtgtctctgaagataagcctgatgaggaggatgtttgcccaatctgtcttgaagaatatgatgaagaaaatccccgctctatgactaaatgtgagcatcattttcatctttgctgcatacttgagtggatggagcggagtgaaacttgcccagtttgtgaccagataaccatgataaatgcgatgtatgaatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGGCCCSSTRSASVGAPVYIYHQQNPASTIVAIDKNLDTSTPDT YRAPPTPLPYDVGLVLKDNPDLEKTGIKRKIHEHKESLMMDDNESLQKCVSEDKPDEE DVCPICLEEYDEENPRSMTKCEHHFHLCCILEWMERSETCPVCDQITMINAMYE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>2013..2075#2682..2811#2899..3036#3573..3682#4009..4038#actcccccacgccaccgctcgccgccgccgccggctcagcttctcctcctcctccgccgccgccgccgccgtcctcgggtacggaccactactaccgagtagtacggagtactactgatatcaccctttcccctcggccgccttctgttcgatccacggggcgggcgggtggcgtctgtctttggagttcgtctcgcgtgggggaatttttctccctgacttgtgtcgtcttctcacgcgatcttgtctttctcttctctttaggtgaagcagcgcagttcggaggagggaggcggagggggtttgttcgccaacctagctcgctcgctcagctgccgagctcttcttcgctggtatggtggcccgcttctcctcttccttttgtttccgtgtgaatctcctactactgctgctgctgctactactactactactaattctagtttttgctcccttcaatccaagcgctatgaatattcttggtgagtaagtttgtaatttttgtttttaactcttaattgtgaattgtgattgcttcctagttgaacggaccacggctcgcgcgatcagatcaagtttgtttgcgttctttgccactggtatacctagattgctttctgcggtcgaattgtgttgaaagatcggatcaactcggttgattcagtgcagcttcccgctgtaacgacgaattgcactgtttttgctttcgatctgcatttttgttcttcactgatgtttgctgtggtattctcagtgtgttctgattttttggtatctagagataggacgtattttggttttgtaacttgtatgacagtctatgaagatggatgcaagtaaaatgccaaggttatcattatcgaattggatgttcttgctgcctgcaggatttattttctagatactgctaacaaggaaaaggatttcttttgctaggaaacaggaaattttcattgccttgccacatttttatttctatcagtcagatgattatagttgccagggaagctgatgctgagtactagttttttttttgctatgcgaaaccttgaaacagagggactagattcatcatggtattcattctagtgctaagccattttagttccttcacataattgattgcagcgatagcagtgtaatcagagcaaatttcactactttaagacactaaatgctatatgtgacaaatttcactactttaagatggtactccatatgagtttctcaggcttcctcaaattccagacaatatcttgtccaatagaaagtggtttccttgttcaaggctttaaagctttggccctgaacccctccctggtaccctgtataattttaaatctgtcaatttatcccactttgttattcacaatatgagtatgccatatgctgggctcatgtgctggtaccctgtatagtatgtacatttttttatcctcatgtgctgggctgctggctctgttatttacccttttgtggtaaaacaaattagacaggacaaaacataatacatttctataatctatagaggatgatcttttgtgtcatcttgcttgggtggtggaactcagcatgtgatgttgtggttcctgaatgtaccctctggtcaatttctgtagtacacactctagtgagatgaattcctgtttcctggtctgattttcaggttttgatgttatgcggtaagtggagttgtcaaaattgaagtactatatttttgatagagcgagatatcaaaaatcatcagttcatcatcatcattataaccaatcgttaactataattccacatgggaacaacacttgctaagctctctgcacagttttatacatgtgtactgattggtgcttttttgtcatctcgttttatgtatactttatcttctaagcatgatgtacttttgtttttcctgcaccaatataagactgtttttgtgtaggtctttgagagatgaaattttagtgatatcagctgctagaggatagactgaagtaactttcaacaattatagaatgggtggttgctgttgttcatcgacaagatctgcatccgtcggagcaccagtttatatctatgtatgtagacctgctgaattttctttattaattatgttatctctcttttgttggcatcacgcttttgaaaattgcataacgattatgtcaaaaaattttggctgaattaatcagttagcagtgctttttgttcaccttttcttagctgcaagttagatgaaagccaaatgaactgctctgtgttaatgcgtctctggttccagcccctctgcttctgtaatgttctgagttctgatatttgagtgtatgctagaatttgctgaaatgttcactgcagattcgaacaaaaaccgaatgctagaaattttgtattacctctgtggtttcaatgcaacagaagaaatgccttttactactaggacgcatttccttttctttgcagtccttgattctttagcattacaaattttctagacaccatgcatttgtgttatttgttcttatatagttaatgtgataattgcatacatttttaaagaattacggtttattagtatgttgacatggggatggcttcttttactcgtcagcctttctactgtaaatccttggcttgtcatgtaagttagctcaaggatactgatattcttcaccttgtgttgtcagcatcaacaaaatccggcctctacaattgttgcaatagacaaaaatctggatacatccactcctgacacttaccgagcaccacctacacctttgccttatgatgttggtctagtgttgaaagataaccctggtaaaaattgattatctctgagaatgagcaatgcttaatgatctccatgttatggatcaatgcttagagttccacattcttatgtagatttggagaagacaggcatcaagaggaaaattcatgaacataaggagtccttaatgatggatgataatgagtcattgcaaaaatgtgtctctgaagataagcctgatgaggaggatgtttgcccaatctgtcttgaaggttctgtttctcttgagcataggataatttactttcaatttgaaaggatcttaattaaactatgtttacttggttggtatacgcatgctttactgctcttatttcccactgttgtttgcttaataggtcagttcactttagtgagaacataatcttatataagatgcattcagttgggtgtgatgacaaatggttaggaaataatgataaatccctgaaaagaatgcctagagtctgccaaatatgtaactgtctaactggcagtgctatgggcctatgattgttgttttcgtgcattacacgcaatacgcagcagtctgtaatcatataaactgattatcgacactaacgatggcttgaacacttgactggtttgtagatagagaatccgaaatagtggaacattttatgagttcttctataaattgtttgcttccttttctgatgtacatgtgctgtgatgatcctctaatacaccgattatcacttcaatctcaattgaattcctgtaataacagtttttcgttattcaccagaatatgatgaagaaaatccccgctctatgactaaatgtgagcatcattttcatctttgctgcatacttgagtggatggagcggagtgaaacttgcccagtttgtgaccaggttagtgcaccaaaaccaatttatgtcaggctaaacacatttttgttgtagcccatggatgtgttttctgttgtcatttcctttatggactatggaggttgttttttttgggtatggtaatccattctgaatgcttacaggggaagttggtagtcgatctgaagctaaagaatacaaattttgatgtttgagattgttctgatggtcttattaattatttttctgttaatctaaagcccctaagttgaatatttccatctttgaaagaaattatttgaggaatagatggcctttatttgctgtaagctgactataccttcttgcagataaccatgataaatgcgatgtatgaatagccttggtggccctggtggatcctctcttgaagctcatgcttattcagtcggtttggcagaagtcatttgatggggaagcacaatgagcaactgctctgctctcgacattggtttggtcttttttggtggaaggagtgaaattaaggagacaaatgacatgaaatgttctggccaacactgttttgtacctttgttgccaatctttggctaatttatagcaagtagcaacaggaggattaggaaaatgcttggatgcgatatacataccggtcacatgatcattcagtcattcggttcaaagtccaaacattaaaaatcagctctttttttgtttaaacttaggacgaatgttacttcacttctaatccagttagtgtctgtgtatatcatacataacataggtgaaaaagaaaaattggtcgtagtctctcagtctaggcttcatttgtataatacttctagttggacaagctcctgaatacatcccttcctatttcctat</dnaseqindica> |
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