Os04g0677800
| Gene Name |
Os04g0677800 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, RanBP2-type domain containing protein |
| Version |
NM_001060803.1 GI:115461335 GeneID:4337409 |
| Length |
4895 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os04g0677800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:35026239..35031133 |
| Sequence Coding Region |
35026402..35026530,35026614..35026748,35026861..35027100,35027346..35027514,35027604..35028094 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008397:35026239..35031133 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008397:35026239..35031133 source=RiceChromosome04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtttattcctgaattagataaccggtctgatcctcaggagccatcaagaaatcctggcatttggcaatgcaccatttgcgaacacggaaatgatgcaaaaaaaaaatcatgtgagcaatgcggtgttcttcgatatttctcgctgtatttcaataatgcccttgaagttgatggcagagctaaacggagagacaagcattatgcggtatctgtactggcaagaactcttttctcaccatccagtgccaagtcaaaagacgttgttctttctggtggctttaaagctagcagaaatgcaacaggaagtacacgagctacgttggatgcgctgcataagacatacatgacccgtaaagaacgccacattaacatagtgcctttcaagtttgatacaccatctccggatgacgtggtcgctacaggactaaaatcgtcgagaagttttagaaaagttgacacagatgctccccatgtcactgaaaagagggtgatggataatgatagttctacacctgagaaggatacaactgcagactcaaatttgcctgtaaagtcgaatgaattcggtgaaagtagtgagagtgtttctgttggtagtcaaaatgaaacactttgcttggaccatgagctacagcatttgagtttggagaggaagtcacaaaaaagtaaagccaatattaaaaagccagtttcttcatccctgtacaagccagaaccatggatgctccagcatgaagatgaaggcatccctagacaattaaatcttgctattgttggccatgtcgattctgggaaatcaactctatgtggtcgtttgttacatgccctggggaggatttcaaaaaagcaaatgcataaatatgagaaggaagctaaagaaaaggggaaaggatcatttgcatatgcttgggcaatggatgagagtgctgatgaaagggagcgtggcattacaatgactgtcggtgttgcatactttgacaccaaaaattaccatgttgttttgctggactcccctggccacaaagattttgttcctaatatgatatctggagcaacacaatctgatgcagctatcctagttattgacgcttctataggatcatttgaagcaggtatgggcatcaatgggattggacagacaaaggagcactcgcagcttgttagaagctttggcgtggataacttgatagttgttgttaacaagatggactcggtggaatattcaaaagagcgatttaattttatcaaatcacagcttggtgcttttctgcggtcatgcggttacaaagactcagcagttgcctgggttccaattagtgcaatggagaatgagaacttaatgacaacagcttcagatactcgactatcatcatggtatgatggaaattgcctgttgaaagccattgacacattaccgcctccttctcgtgatgtttcaaagccactgcgccttccaatttgtgatgtcttttcgtcacataagctggggcaagttgcaattggtggtaaagtagaggttggagcaacccgaagtggttctaagatcctcgtcatgccttttggggagttagctgtggtgaaaactattgagcggaattcctctagttgcaatttagcaagagctggggacaatgtcgctattggtttgcaagggattgaccctagtcatatcatgcctggcggagtcatatgccatccagattatcctgtgtccgtggcttcttgcttggagctaaaaattttggtcctagatatcactgtaccaatactggttggcttgcagtttgagctccacatccatcatgcgaaggtgtctgcaagcatggtgaaaatactgtcattgctggagcagaagaccggcaaagcctcaaagaagataccacgatttctcacctcgagacagactgctgtaatcgaggtgaagctggagaaagaggtatgcgtggaagaattctcaaacctgaaagcgctaggccgagtgttcctacgatctcagggaaacaccatcgcggttggcattgtgagccgagtacgagagcaggcttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MFIPELDNRSDPQEPSRNPGIWQCTICEHGNDAKKKSCEQCGVL RYFSLYFNNALEVDGRAKRRDKHYAVSVLARTLFSPSSAKSKDVVLSGGFKASRNATG STRATLDALHKTYMTRKERHINIVPFKFDTPSPDDVVATGLKSSRSFRKVDTDAPHVT EKRVMDNDSSTPEKDTTADSNLPVKSNEFGESSESVSVGSQNETLCLDHELQHLSLER KSQKSKANIKKPVSSSLYKPEPWMLQHEDEGIPRQLNLAIVGHVDSGKSTLCGRLLHA LGRISKKQMHKYEKEAKEKGKGSFAYAWAMDESADERERGITMTVGVAYFDTKNYHVV LLDSPGHKDFVPNMISGATQSDAAILVIDASIGSFEAGMGINGIGQTKEHSQLVRSFG VDNLIVVVNKMDSVEYSKERFNFIKSQLGAFLRSCGYKDSAVAWVPISAMENENLMTT ASDTRLSSWYDGNCLLKAIDTLPPPSRDVSKPLRLPICDVFSSHKLGQVAIGGKVEVG ATRSGSKILVMPFGELAVVKTIERNSSSCNLARAGDNVAIGLQGIDPSHIMPGGVICH PDYPVSVASCLELKILVLDITVPILVGLQFELHIHHAKVSASMVKILSLLEQKTGKAS KKIPRFLTSRQTAVIEVKLEKEVCVEEFSNLKALGRVFLRSQGNTIAVGIVSRVREQA </aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>4604..4732#4386..4520#4034..4273#3620..3788#3040..3530#2841..2951#2402..2721#1929..2006#1174..1368#862..1039#703..705#gctcgtcgtcgcgggcgcaatcgggtaggtcgccggcggccgcggttgggtgcgcgagagcggcggcggggtcgctctctttggcctggagtatcctcggttggaatcaggtaagcgcgctcgtctctgatggctctctcatctctattactgcacgcgatgcgtcgatcctagtgtggagcttgggactctgagactgtgactgccggcggcgggagcttgctgctcggaggaggtcggggggaaggagcggcggcggaggatctcgggcggagtcctcttatcgcgattccgattcagaaacgctctgaatttggtttcttctccatgttgagcttcatgagccctattagtattttgtcttgtttggtggtgaatggtataggtaggggagtttccagtgcttgctatctgcgcccccattactcttttaatgttgcctgctggttaatgcccaatggagtttccttctctatatatatattgagaaaattcatagttctgagttctgattgactggctcatatagcaatagcagatctgtttttgactgcttgaatgatggaattgcatattatggtagggcttctgttgcataatcaggcagagtttaacatggttgatatcaacccagattctgacggtgcgtgtggtctggtggcaatcctagagacagtaaagttgatgatctcatcataagagatggtgagttactactagagtgcttttgctacctttgccttcattgatgggtgtttggatttacggaatttacttggtgctcactttttttttctcagaatcacaagtatttcatgaaaacatctagatagggtttgcttggtactaactcctctctagtttattcctgaattagataaccggtctgatcctcaggagccatcaagaaatcctggcatttggcaatgcaccatttgcgaacacggaaatgatgcaaaaaaaaaatcatgtgagcaatgcggtgttcttcgatatttctcgctgtatttcaataatgcccttgaagttgatggcagaggtatagtgtattccttgttgttccattccctggtatggttagttttttgttgcactgttgacttatggctttgattagatatatttatgttttctagcctgttaatttatttatttttctatcatgacatccagctaaacggagagacaagcattatgcggtatctgtactggcaagaactcttttctcaccatccagtgccaagtcaaaagacgttgttctttctggtggctttaaagctagcagaaatgcaacaggaagtacacgagctacgttggatgcgctgcataagacatacatgacccgtaaagaacgccacattaacataggtacactgcatttgtacatcaagcgcttttggtaatttgatttgtttaatttatggcattatccaaattcttgtagttatatgtacttgctgctatatataaaccagatatttaatgttgtatgattctatatatgctagtcatttgcatagcttaactctcaattgcctcattgtgcatctggtgtgactaccattttgggtgtaaaattttcctgtttcaaaaccaagtgactgtctgaactataagcttagctagcctgccatggtccttctgcaaacaaacaaactgaagcacatatgtgggaggtagcttacaggtcttgggagtttacagggttttatataatttggtttacctgaactttgaaatatgaagatagtcagtgtaaattttaacctacttatgaatgttcagttcttcccctgaattagggtaagcattcagttgacccgtgtttttccaatgggagatccatatgttgaacttatgtttcatttatttattagacttcctgatggagaaatctgtaatatgactgcatatcttcatgttcacagtgcctttcaagtttgatacaccatctccggatgacgtggtcgctacaggactaaaatcgtcgagaagttttagaaaaggtattatctctgcattcccccactcccatgtagttagactaactcagactagtgaaaaggatgcatcttaacaacttaacattaacatctatatgtgaaacctttattttcttttctatgcgcgagtctttgtggaaccttttcagttaattagtttgattagagtttatgctgaatgagttagtctggtcagatagagaactactgtgtgccaacacacttgaacatttgaactgttccttgttatagatattgttattttcaaaatttatgtggttggtaccaatgaaaggttatgctaagatagttttctaaacaaagtttcttttccacacttgaataattttggttgtgcagtgcgtgctatagttccatagtaacttgattcacatcagttgacacagatgctccccatgtcactgaaaagagggtgatggataatgatagttctacacctgagaaggatacaactgcagactcaaatttgcctgtaaagtcgaatgaattcggtgaaagtagtgagagtgtttctgttggtagtcaaaatgaaacactttgcttggaccatgagctacagcatttgagtttggagaggaagtcacaaaaaagtaaagccaatattaaaaagccagtttcttcatccctgtacaagccagaaccatggatgctccagcatgaagatgaaggcatccctagacaattaaatcttgctattgtaagcaactacatatctatatatacacgatatatttgatgtatccatcattttgcttattacttgtttgccttctatctgcctatctttatgaataactcaaaccagaaacatgctaggttggccatgtcgattctgggaaatcaactctatgtggtcgtttgttacatgccctggggaggatttcaaaaaagcaaatgcataaatatgagaaggaagctaaagaaaaggttctcttattttaatgattgatgttatctcagtatgtgccttttatgcatcttgggagctgttcatatataacgtttcttcttccaggggaaaggatcatttgcatatgcttgggcaatggatgagagtgctgatgaaagggagcgtggcattacaatgactgtcggtgttgcatactttgacaccaaaaattaccatgttgttttgctggactcccctggccacaaagattttgttcctaatatgatatctggagcaacacaatctgatgcagctatcctagttattgacgcttctataggatcatttgaagcaggtatgggcatcaatgggattggacagacaaaggagcactcgcagcttgttagaagctttggcgtggataacttgatagttgttgttaacaagatggactcggtggaatattcaaaagagcgatttaattttatcaaatcacagcttggtgcttttctgcggtcatgcggttacaaagactcagcagttgcctgggttccaattagtgcaatggagaatgagaacttaatgacaacagcttcagatactcgactatcatcatggtaatagatattccctatggtaaacctgcatatcccttgaccttaaaacctggtggttgttcgccaacgtaattgatgcatggtgtcaggtatgatggaaattgcctgttgaaagccattgacacattaccgcctccttctcgtgatgtttcaaagccactgcgccttccaatttgtgatgtcttttcgtcacataagctggggcaagttgcaattggtggtaaagtagaggttggagcaacccgaagtggttctaaggtatcaccctgctgttattctaagcacatactacaatacatttgtctttgtttcttatattgccttagtgcgagatatttatgtatggttgaacatcacttgtgttctaactatatcttttgcactgttttcgttgtcctaccacttttccgtctaaataatgttgtgctcaatgattaaataactatgcttttgcctgtaagatgttcaagcagtttcctgatttcatggtactcttgtttcagatcctcgtcatgccttttggggagttagctgtggtgaaaactattgagcggaattcctctagttgcaatttagcaagagctggggacaatgtcgctattggtttgcaagggattgaccctagtcatatcatgcctggcggagtcatatgccatccagattatcctgtgtccgtggcttcttgcttggagctaaaaattttggtcctagatatcactgtaccaatactggttggcttgcaggtaagcaaaagaggggagcatatctcttcaactgttcatgcttcatttattttttaaagagaacttcaggcctaatatcgacaccttacatggtcgctacccatgtttctagtttgagctccacatccatcatgcgaaggtgtctgcaagcatggtgaaaatactgtcattgctggagcagaagaccggcaaagcctcaaagaagataccacgatttctcacctcgagacagactgctgtaatcgaggtaagcttacagcagatggatggggtagttttgttgctgatatcatgtttgttgtctctgtaacgcttggtgttttctttcaggtgaagctggagaaagaggtatgcgtggaagaattctcaaacctgaaagcgctaggccgagtgttcctacgatctcagggaaacaccatcgcggttggcattgtgagccgagtacgagagcaggcttagttccagtggtttaatcaaacataacatgtatacaagttgtatgtggtagatcagtacgttataatcagtaatacggagtagaaaacgtgctggttattcacgtcgaggtgaaaagggccctgtcatgaaacaataacaaacttcatcgtaactaacttaacgc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
